Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is dtpB [H]

Identifier: 134302011

GI number: 134302011

Start: 985075

End: 986532

Strand: Direct

Name: dtpB [H]

Synonym: FTW_1040

Alternate gene names: 134302011

Gene position: 985075-986532 (Clockwise)

Preceding gene: 134302010

Following gene: 134302012

Centisome position: 51.89

GC content: 31.69

Gene sequence:

>1458_bases
ATGCCGATGAGTATTACTTTGTTTAAAAAAGCTTCCAGACTTTTGCTAATAACTCAACTATTTTCAACTCTTAGCTTTGC
TGTTTTATATTCAACCTTAGTATTATTTATGACTCAAGCTCTTGGTTTTACTGTTACTAAAGCTAGTGCTGTTATGGGAG
TATTTGTCGCCTTTAATTATGGCTTACATATATTAGGTGGCTATATTGGTGGGCGCTTAATAAGTTATCGAGTGCTATTT
TTATTAGGAATGGTATTACAAATATTTGCTTGTTTATTTTTAGCATCTCCATCAACAGAACATCTTTATATAGCTTTAGC
ACTATTTTTAACAGGGTGCAGTTTAAATGTTCCTTGTATAAATATGATGTTAACTCAGCAATTTGAGAATAATGATGGTG
ATAGAGAAAGTGCGTTTTTCTGGAATTATGCTGGTATGAATATCGGCTTTTTTATCGGTTTTACAATTGCTGGAATATAT
CAAGGCAAACAAAGTTATAATACCTTATTTCTTATAACAACTATTACCAACATTATTGCTTTTTTACTCTTAGCAACAAG
TTGGAAGACAGTCGCGGATAGAACTACCCCACTAGTCAAAAAAATTCAACAAAAAGGTAACAATATATTACTCAAAAATA
ATTTTTTTGCTTTATTGATAATTTTTATTACAGTACTACTATTATTTATTGCATTGCAGTATCCACTTAATACCAACTAT
ATTGCCCTTGTGGTCGGAATATTACTATTATTAATGTTTATCCCTATAGCTAGAGCTCAAAATATTAAAGAGCAAAAGAA
TAAAGTTTATGCTTATGTGATATTAGCAACTTTTGGCTTAGTCTTTTGGTCAGCATATCAACTTGCTCCAATGGCATTAA
CGGTATTTGCTGAAGCAAATATAGATAAACACTTACTAGGTTTTACAATTCAAACACAATGGTTTCAGAATGTAAATACA
GTAGTGATAGCTGTCGGGGGTATGTTGCTTCCAAGTATATTATTAATTATACGTAAGCGTTTTATCTTTTCATTTCCAAT
GCAATTCTGTTTTAGCCTTATTTTTATTGCAATTGGTTTTGCAATGCTAATTATTGGAATATTATGTGCTAATAGTTATG
GCTACACAGCTGCGATTTGGCTAATATTAAGTTATGTATTTCAGTCTATAGGAAAATTACTAATAGGCCCTACTGGCTAT
GCTATGGTTGGTAAACTTGCTAAACCAAAACTTCAAGGTTTAATGATGGGATCTTGGATGGTTGTCACTGGAAGTACATT
TGGAGTTATTGCTAGCTTACTATCAATACTAGTAGCGTCACCAGATATTAATGCAGCACCTATTGAAACAAACTCTAGTT
ATTTGACACTATTTACTGGTCTAACAATAGTTGCTGCTGTTGCTGCGTTTATTATGTATCTAATAATTCCTAAAATTAGA
AAGCTTGCATATATCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATAACTAAGCTGATTTTATATTTTTTTTACGCGTAATATATATATATTTCCTTGTGTTATGACGATAAAATCTTGTTT
ACTATTTTATCAACTTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAATAATAACTATATTTTCCTAAACATATATCTTATAATCTTTGCATTCTAAACGATTATCTTAATATCATTTATCAA
TGACTATTAGAGAAAAATAC

Product: amino acid transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 485; Mature: 484

Protein sequence:

>485_residues
MPMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNYGLHILGGYIGGRLISYRVLF
LLGMVLQIFACLFLASPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCINMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIY
QGKQSYNTLFLITTITNIIAFLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEANIDKHLLGFTIQTQWFQNVNT
VVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGFAMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGKLLIGPTGY
AMVGKLAKPKLQGLMMGSWMVVTGSTFGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIIPKIR
KLAYI

Sequences:

>Translated_485_residues
MPMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNYGLHILGGYIGGRLISYRVLF
LLGMVLQIFACLFLASPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCINMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIY
QGKQSYNTLFLITTITNIIAFLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEANIDKHLLGFTIQTQWFQNVNT
VVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGFAMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGKLLIGPTGY
AMVGKLAKPKLQGLMMGSWMVVTGSTFGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIIPKIR
KLAYI
>Mature_484_residues
PMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNYGLHILGGYIGGRLISYRVLFL
LGMVLQIFACLFLASPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCINMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIYQ
GKQSYNTLFLITTITNIIAFLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNYI
ALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEANIDKHLLGFTIQTQWFQNVNTV
VIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGFAMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGKLLIGPTGYA
MVGKLAKPKLQGLMMGSWMVVTGSTFGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIIPKIRK
LAYI

Specific function: Proton-dependent permease that transports di- and tripeptides [H]

COG id: COG3104

COG function: function code E; Dipeptide/tripeptide permease

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the PTR2/POT transporter (TC 2.A.17) family. DtpB subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789911, Length=491, Percent_Identity=25.4582484725051, Blast_Score=130, Evalue=2e-31,
Organism=Escherichia coli, GI1787922, Length=489, Percent_Identity=24.3353783231084, Blast_Score=127, Evalue=1e-30,
Organism=Escherichia coli, GI1786927, Length=452, Percent_Identity=22.5663716814159, Blast_Score=107, Evalue=1e-24,
Organism=Escherichia coli, GI1790572, Length=443, Percent_Identity=21.6704288939052, Blast_Score=96, Evalue=7e-21,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR000109
- InterPro:   IPR005279
- InterPro:   IPR018456 [H]

Pfam domain/function: PF00854 PTR2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53641; Mature: 53510

Theoretical pI: Translated: 10.03; Mature: 10.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNY
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLHILGGYIGGRLISYRVLFLLGMVLQIFACLFLASPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
NMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIYQGKQSYNTLFLITTITNIIA
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
FLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
HHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
IDKHLLGFTIQTQWFQNVNTVVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGF
CCHHHHHHEEEHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGKLLIGPTGYAMVGKLAKPKLQGLMMGSWM
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHEEECCEE
VVTGSTFGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIIPKIR
EEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLAYI
HHCCC
>Mature Secondary Structure 
PMSITLFKKASRLLLITQLFSTLSFAVLYSTLVLFMTQALGFTVTKASAVMGVFVAFNY
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLHILGGYIGGRLISYRVLFLLGMVLQIFACLFLASPSTEHLYIALALFLTGCSLNVPCI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
NMMLTQQFENNDGDRESAFFWNYAGMNIGFFIGFTIAGIYQGKQSYNTLFLITTITNIIA
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHH
FLLLATSWKTVADRTTPLVKKIQQKGNNILLKNNFFALLIIFITVLLLFIALQYPLNTNY
HHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
IALVVGILLLLMFIPIARAQNIKEQKNKVYAYVILATFGLVFWSAYQLAPMALTVFAEAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
IDKHLLGFTIQTQWFQNVNTVVIAVGGMLLPSILLIIRKRFIFSFPMQFCFSLIFIAIGF
CCHHHHHHEEEHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMLIIGILCANSYGYTAAIWLILSYVFQSIGKLLIGPTGYAMVGKLAKPKLQGLMMGSWM
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHEEECCEE
VVTGSTFGVIASLLSILVASPDINAAPIETNSSYLTLFTGLTIVAAVAAFIMYLIIPKIR
EEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLAYI
HHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA