Definition Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome, complete genome.
Accession NC_009253
Length 3,608,104

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The map label for this gene is feoB [C]

Identifier: 134298529

GI number: 134298529

Start: 711926

End: 713911

Strand: Reverse

Name: feoB [C]

Synonym: Dred_0661

Alternate gene names: 134298529

Gene position: 713911-711926 (Counterclockwise)

Preceding gene: 134298530

Following gene: 134298528

Centisome position: 19.79

GC content: 43.15

Gene sequence:

>1986_bases
ATGTCTCACTGCCATGGTTGCAGTATTCAAATTGATATTCCCGAAGGAGCTCGGCGCATTGTTTTGGCAGGCAACCCAAA
TGCTGGTAAATCAGTATTTTTTAATTACTTAACTGGTATGTATGTGGATGTATCCAATTACCCCGGTACTACCCTGGAGA
TATCCCACGGTCTTCTTCAAGGGGATGTCGTAATTGATACCCCGGGGGTTTATGGAATTTCTTCTTTTAATGACGAAGAA
AGGGTGGCCCGGGATGTTATTTTAACAGCCGATGTGGTTATTAACGTTGTAAACGCGGTTTACCTAGAACGGGATTTATT
CCTTACCCAACAAATTATAGATACTGGCGTTCCTGTAATCATTGCCCTGAATATGGTAGATGAAGCTGAAAAACAGGGTA
TGACAATAAACAACCAATTATTAAGCCAATTGCTAGGTGTACCTGTTATTCCTACCGTGGCCATTAAAAAACAAGGCATG
AAGGAAATAAAGGAAAACATTGGGCAGGCACGTTCAGGGCAGTCAGATACAGAACTCCAAAAAGAAATGGATAAACTGGT
TAACCGGGTAGGTTCCCGTGGTGAAGCCCTGTTGATTATGGAAGGCGATGCTACAGTTGCCGAACGTCATGGTCTTGAAC
CCCTAAATAAAAGGGAGGATATTTACCTGCAGCGAAGACAGCGTGTTAACCAAATTGTTACTCATGTGGTCAAGGATATC
AGTAAAAAAACCGCTTTCAGTAATATCTTAAGCCGTATGATGATCAAACCTTTAACCGGAATTCCCATTCTATTTTTAGC
ACTCTATACCATGTATCAGATAATTGGGGTCTTTGTGGCCGGTACAGTTGTAGGGTTTACAGAGGAAACCCTTATGATCG
GACACTTCGAACCTGCTGTACGTTCCTTTGTTGGTAACTTTATCAGTGAACAGTCCACTTTGGGAACGATCCTTATTGGC
GAATTTGGCCTCCTTACAATGACTTTTACCTATGTGCTGGGGTTATTAATGCCCTTGGTTATAGGATTTTACTTTTTCCT
GTCCTTGTTTGAAGATTCCGGTTACCTTCCCCGCCTAGCTACCCTGGTGGATAGACTTCTCACCAGCATTGGTTTAAATG
GCCGGGCTGTTATTCCATTAATTCTTGGCCTGGGCTGTGTTACCATGGCTACTATTACCACTCGTCTGTTAGGTTCCGAG
CGGGAGCGCCGCATTGCTATTTTTCTATTGGGGTTAGCGATCCCATGCTCTGCTCAATTGGGAGTCATTGCTGGAATGTT
AGCCTCTGTGGGCCCTGAGTTTGTACTTCTGTATTCTTTAGTTATCTTTGCAGTTCTAGTGGTTGTGGGTACTTTAATGA
ATTCGCTATTATCCGGTCAGTCTTCTGACCTCTTAATCGATCTACCACCGCTACGTGTGCCACGTATTCATAATGTAATG
ACCAAGACTGGAATTAAATCTTATCAGTTCTTAAAGGAAGCTTTCCCCCTCTTTGCTCTTGGTGCTTTAATAATTAGTAC
CTTTCAGGTTACTGGTATTCTGGTTGCCTTGCAAAACATCCTAGCTCCTTTGACGGTAAATTGGCTAGGGTTACCCAAGG
AAGCTGCCACAGCCTTCATTATGGGTATTGTACGTCGAGATTTTGGTGCCGCGGGCTTGGCAGGTATGCCGTTGACATCC
ATTCAAACAGTGATATCCTTAATTACCATTACCCTCTTTGTTCCTTGCATTGCTTCCATTTTAGTAATGTTTAAGGAACG
CAACAAGAAGGAGGCACTCCTTATGTGGGTAAGTACCTGGGTAATTGCCTTCTTAATTGGTGGTATTGTTGCTCAACTTT
CCGCTCTACTGGGAGTTGCTACACCGGCACAAGTATTTACCGTGATGGCAGTGGTTATCGCTCTAACAGCCCTGGTGATT
GTGGGCGTAAGATTGTTTAAAAAGCAAAACATACAAAGTAATTCTACTTCAAAGGGCGTGGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAACCGTCAACAAATTGCCCTTGGCCGTCAACTGGCTAGATTAATTGATATTAGTCTAAATTAGTGCTTTATTTAAGAGA
ATTGAAGGAGTGACAGCAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAGGAAAAATCCAAAAACACATGCACTCAGGGCAAAACCTGCCCCCGCTGTGGATGCCCTGTTGATTTATTAACACT
TGTCTGCCCCCGTTGCCGTG

Product: small GTP-binding protein

Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 661; Mature: 660

Protein sequence:

>661_residues
MSHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQGDVVIDTPGVYGISSFNDEE
RVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVIIALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGM
KEIKENIGQARSGQSDTELQKEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI
SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAVRSFVGNFISEQSTLGTILIG
EFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLATLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSE
RERRIAIFLLGLAIPCSAQLGVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM
TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFIMGIVRRDFGAAGLAGMPLTS
IQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTWVIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVI
VGVRLFKKQNIQSNSTSKGVV

Sequences:

>Translated_661_residues
MSHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQGDVVIDTPGVYGISSFNDEE
RVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVIIALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGM
KEIKENIGQARSGQSDTELQKEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI
SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAVRSFVGNFISEQSTLGTILIG
EFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLATLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSE
RERRIAIFLLGLAIPCSAQLGVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM
TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFIMGIVRRDFGAAGLAGMPLTS
IQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTWVIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVI
VGVRLFKKQNIQSNSTSKGVV
>Mature_660_residues
SHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQGDVVIDTPGVYGISSFNDEER
VARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVIIALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGMK
EIKENIGQARSGQSDTELQKEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDIS
KKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAVRSFVGNFISEQSTLGTILIGE
FGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLATLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSER
ERRIAIFLLGLAIPCSAQLGVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVMT
KTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFIMGIVRRDFGAAGLAGMPLTSI
QTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTWVIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVIV
GVRLFKKQNIQSNSTSKGVV

Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]

COG id: COG0370

COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=545, Percent_Identity=28.4403669724771, Blast_Score=177, Evalue=2e-45,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003373
- InterPro:   IPR011640
- InterPro:   IPR011619
- InterPro:   IPR011642
- InterPro:   IPR006073
- InterPro:   IPR002917
- InterPro:   IPR005225 [H]

Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71711; Mature: 71580

Theoretical pI: Translated: 8.19; Mature: 8.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQ
CCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEEEECCCEEE
GDVVIDTPGVYGISSFNDEERVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVI
CCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
IALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGMKEIKENIGQARSGQSDTELQ
EEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
KEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHH
RSFVGNFISEQSTLGTILIGEFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLA
HHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
TLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSERERRIAIFLLGLAIPCSAQL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHCCCCCHH
GVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHH
TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
MGIVRRDFGAAGLAGMPLTSIQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTW
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVIVGVRLFKKQNIQSNSTSKGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
V
C
>Mature Secondary Structure 
SHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQ
CCCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEEEECCCEEE
GDVVIDTPGVYGISSFNDEERVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVI
CCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
IALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGMKEIKENIGQARSGQSDTELQ
EEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
KEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHH
RSFVGNFISEQSTLGTILIGEFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLA
HHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
TLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSERERRIAIFLLGLAIPCSAQL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHCCCCCHH
GVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHH
TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
MGIVRRDFGAAGLAGMPLTSIQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTW
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVIVGVRLFKKQNIQSNSTSKGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
V
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]

Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]