| Definition | Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009253 |
| Length | 3,608,104 |
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The map label for this gene is feoB [C]
Identifier: 134298529
GI number: 134298529
Start: 711926
End: 713911
Strand: Reverse
Name: feoB [C]
Synonym: Dred_0661
Alternate gene names: 134298529
Gene position: 713911-711926 (Counterclockwise)
Preceding gene: 134298530
Following gene: 134298528
Centisome position: 19.79
GC content: 43.15
Gene sequence:
>1986_bases ATGTCTCACTGCCATGGTTGCAGTATTCAAATTGATATTCCCGAAGGAGCTCGGCGCATTGTTTTGGCAGGCAACCCAAA TGCTGGTAAATCAGTATTTTTTAATTACTTAACTGGTATGTATGTGGATGTATCCAATTACCCCGGTACTACCCTGGAGA TATCCCACGGTCTTCTTCAAGGGGATGTCGTAATTGATACCCCGGGGGTTTATGGAATTTCTTCTTTTAATGACGAAGAA AGGGTGGCCCGGGATGTTATTTTAACAGCCGATGTGGTTATTAACGTTGTAAACGCGGTTTACCTAGAACGGGATTTATT CCTTACCCAACAAATTATAGATACTGGCGTTCCTGTAATCATTGCCCTGAATATGGTAGATGAAGCTGAAAAACAGGGTA TGACAATAAACAACCAATTATTAAGCCAATTGCTAGGTGTACCTGTTATTCCTACCGTGGCCATTAAAAAACAAGGCATG AAGGAAATAAAGGAAAACATTGGGCAGGCACGTTCAGGGCAGTCAGATACAGAACTCCAAAAAGAAATGGATAAACTGGT TAACCGGGTAGGTTCCCGTGGTGAAGCCCTGTTGATTATGGAAGGCGATGCTACAGTTGCCGAACGTCATGGTCTTGAAC CCCTAAATAAAAGGGAGGATATTTACCTGCAGCGAAGACAGCGTGTTAACCAAATTGTTACTCATGTGGTCAAGGATATC AGTAAAAAAACCGCTTTCAGTAATATCTTAAGCCGTATGATGATCAAACCTTTAACCGGAATTCCCATTCTATTTTTAGC ACTCTATACCATGTATCAGATAATTGGGGTCTTTGTGGCCGGTACAGTTGTAGGGTTTACAGAGGAAACCCTTATGATCG GACACTTCGAACCTGCTGTACGTTCCTTTGTTGGTAACTTTATCAGTGAACAGTCCACTTTGGGAACGATCCTTATTGGC GAATTTGGCCTCCTTACAATGACTTTTACCTATGTGCTGGGGTTATTAATGCCCTTGGTTATAGGATTTTACTTTTTCCT GTCCTTGTTTGAAGATTCCGGTTACCTTCCCCGCCTAGCTACCCTGGTGGATAGACTTCTCACCAGCATTGGTTTAAATG GCCGGGCTGTTATTCCATTAATTCTTGGCCTGGGCTGTGTTACCATGGCTACTATTACCACTCGTCTGTTAGGTTCCGAG CGGGAGCGCCGCATTGCTATTTTTCTATTGGGGTTAGCGATCCCATGCTCTGCTCAATTGGGAGTCATTGCTGGAATGTT AGCCTCTGTGGGCCCTGAGTTTGTACTTCTGTATTCTTTAGTTATCTTTGCAGTTCTAGTGGTTGTGGGTACTTTAATGA ATTCGCTATTATCCGGTCAGTCTTCTGACCTCTTAATCGATCTACCACCGCTACGTGTGCCACGTATTCATAATGTAATG ACCAAGACTGGAATTAAATCTTATCAGTTCTTAAAGGAAGCTTTCCCCCTCTTTGCTCTTGGTGCTTTAATAATTAGTAC CTTTCAGGTTACTGGTATTCTGGTTGCCTTGCAAAACATCCTAGCTCCTTTGACGGTAAATTGGCTAGGGTTACCCAAGG AAGCTGCCACAGCCTTCATTATGGGTATTGTACGTCGAGATTTTGGTGCCGCGGGCTTGGCAGGTATGCCGTTGACATCC ATTCAAACAGTGATATCCTTAATTACCATTACCCTCTTTGTTCCTTGCATTGCTTCCATTTTAGTAATGTTTAAGGAACG CAACAAGAAGGAGGCACTCCTTATGTGGGTAAGTACCTGGGTAATTGCCTTCTTAATTGGTGGTATTGTTGCTCAACTTT CCGCTCTACTGGGAGTTGCTACACCGGCACAAGTATTTACCGTGATGGCAGTGGTTATCGCTCTAACAGCCCTGGTGATT GTGGGCGTAAGATTGTTTAAAAAGCAAAACATACAAAGTAATTCTACTTCAAAGGGCGTGGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAACCGTCAACAAATTGCCCTTGGCCGTCAACTGGCTAGATTAATTGATATTAGTCTAAATTAGTGCTTTATTTAAGAGA ATTGAAGGAGTGACAGCAGC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAAGGAAAAATCCAAAAACACATGCACTCAGGGCAAAACCTGCCCCCGCTGTGGATGCCCTGTTGATTTATTAACACT TGTCTGCCCCCGTTGCCGTG
Product: small GTP-binding protein
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 661; Mature: 660
Protein sequence:
>661_residues MSHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQGDVVIDTPGVYGISSFNDEE RVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVIIALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGM KEIKENIGQARSGQSDTELQKEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAVRSFVGNFISEQSTLGTILIG EFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLATLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSE RERRIAIFLLGLAIPCSAQLGVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFIMGIVRRDFGAAGLAGMPLTS IQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTWVIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVI VGVRLFKKQNIQSNSTSKGVV
Sequences:
>Translated_661_residues MSHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQGDVVIDTPGVYGISSFNDEE RVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVIIALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGM KEIKENIGQARSGQSDTELQKEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAVRSFVGNFISEQSTLGTILIG EFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLATLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSE RERRIAIFLLGLAIPCSAQLGVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFIMGIVRRDFGAAGLAGMPLTS IQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTWVIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVI VGVRLFKKQNIQSNSTSKGVV >Mature_660_residues SHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQGDVVIDTPGVYGISSFNDEER VARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVIIALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGMK EIKENIGQARSGQSDTELQKEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDIS KKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAVRSFVGNFISEQSTLGTILIGE FGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLATLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSER ERRIAIFLLGLAIPCSAQLGVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVMT KTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFIMGIVRRDFGAAGLAGMPLTSI QTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTWVIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVIV GVRLFKKQNIQSNSTSKGVV
Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=545, Percent_Identity=28.4403669724771, Blast_Score=177, Evalue=2e-45,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71711; Mature: 71580
Theoretical pI: Translated: 8.19; Mature: 8.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQ CCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEEEECCCEEE GDVVIDTPGVYGISSFNDEERVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVI CCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE IALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGMKEIKENIGQARSGQSDTELQ EEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH KEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHH RSFVGNFISEQSTLGTILIGEFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLA HHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH TLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSERERRIAIFLLGLAIPCSAQL HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHCCCCCHH GVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHH TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH MGIVRRDFGAAGLAGMPLTSIQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTW HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH VIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVIVGVRLFKKQNIQSNSTSKGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC V C >Mature Secondary Structure SHCHGCSIQIDIPEGARRIVLAGNPNAGKSVFFNYLTGMYVDVSNYPGTTLEISHGLLQ CCCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEEEECCCEEE GDVVIDTPGVYGISSFNDEERVARDVILTADVVINVVNAVYLERDLFLTQQIIDTGVPVI CCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE IALNMVDEAEKQGMTINNQLLSQLLGVPVIPTVAIKKQGMKEIKENIGQARSGQSDTELQ EEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH KEMDKLVNRVGSRGEALLIMEGDATVAERHGLEPLNKREDIYLQRRQRVNQIVTHVVKDI HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKKTAFSNILSRMMIKPLTGIPILFLALYTMYQIIGVFVAGTVVGFTEETLMIGHFEPAV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHH RSFVGNFISEQSTLGTILIGEFGLLTMTFTYVLGLLMPLVIGFYFFLSLFEDSGYLPRLA HHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH TLVDRLLTSIGLNGRAVIPLILGLGCVTMATITTRLLGSERERRIAIFLLGLAIPCSAQL HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHCCCCCHH GVIAGMLASVGPEFVLLYSLVIFAVLVVVGTLMNSLLSGQSSDLLIDLPPLRVPRIHNVM HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHH TKTGIKSYQFLKEAFPLFALGALIISTFQVTGILVALQNILAPLTVNWLGLPKEAATAFI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH MGIVRRDFGAAGLAGMPLTSIQTVISLITITLFVPCIASILVMFKERNKKEALLMWVSTW HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH VIAFLIGGIVAQLSALLGVATPAQVFTVMAVVIALTALVIVGVRLFKKQNIQSNSTSKGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC V C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]