| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13357604
GI number: 13357604
Start: 57794
End: 59284
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU048
Alternate gene names: NA
Gene position: 57794-59284 (Clockwise)
Preceding gene: 13357603
Following gene: 13357605
Centisome position: 7.69
GC content: 22.27
Gene sequence:
>1491_bases ATGATGAATACAAAAACATTTACTTCCGTTAATAGAGTAATTTATGATGATAACTATTCGCTAAAGCAACAACAAAAAAG TAGCTTTATCAATCAATTTTTAAAAGGATTGTTATCTGCTATTACTTTATTATTCTTTATTTTACTTTTAATCTTTGCTG AAAATACGTTGTTTGGTTTAGGTTTTGGTGATGAGAATAAATCAATGATGATTTCAAAATCGCTAAATGCTTTTTTTGAT TTACACAGCCCTAAATATTTACAACTTAACTTTTTAATTGTATTTCGCTTTTTTATTTTAAGTTTTACACTGTTTTATAC CTTAATCAAAAATTTCACAAATCTTTATTGGCATCGAGCAACCATTAAAAAATACTTACCATGATTCGTTTTATATTTAG TGATTGCAACAATTAGTTTCTTACTATTTTTTACTTTTTTTAGTGTTTGACCAAAAGAAGTTTTTAATTTAGTATTTTTA CTATTAGTGTTATTTTTATTAAATTTAAGTTATGAAATATTTAATTATTTTATTTCTAAAAAAACTAACCCTTTATTATA CGATAATTATAAAAATTTAATTATTGCCATGGTTTTTCAAGCGTTATTACTATTATTTGTAATAATTACCCCCCTTGTAT GAATTAATACAGGTAAAAGTCCTAACTTTTTATTTGTTGATAATCGTTTCTACACACGCATAGTTGATATCTTCACTGTT CAATCAGGTAAAAATTTTATTATTTTAATTGCTTTCTTCTTCTTTTTAATTACATTTATTGTTTTAGCAAATACTAATTT TTTCGCTTTAGTAATTAATAAACGTTACGATCGTAATTATGTTAAGAATAATTTATGATTTATTTTACTTTTATTTAGTG CTATATTTATTTGATTATTAAGAGTTTTTGCATATAAGCACGAAAATGAAAATCTACCGGTTGGTAACAACCATTTATTA TGAGTTTATATTTTACAAAGTTTTTTTGCAATAATCATATTAATACTATATATGGTATTCACTTTAAAAAAACGCTTAAG CGTAAAGAGTAGTTTAAATACTTTATTAAATTTAGTAGTCACTCAAACAATTCTAAGTTTAAGCTTGTTTTTAGTAACAT TATTTAATTCTAAGAGTGTGGTTTCTTTAATTAATGTTTTTATTACAATTACTGTACAAATGAGTGTGTTTGGAATCTAC ATATTTCAAAATAAAAACATTTCAACTAAATTATTGGTGCTATTAAAGGTTATTATGATTTTAATTATTTTAACCGCAGC AATTGTAGGTTTTGATTATTTATTAACATCTGATCATCATAATAACTATTTATTCTCAAACATTCAACCGAAAATGAATT TAGTACAAATCATGTTGTTATTAAATTTTAGTTTGAATTTTACTTTAATTAGTTATTTAACAATTAAATTTGCAATGGTA ATTTTTAAAATCAATAAGCTAAATAAGGAGTTAAACAATGAAAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGCAACCGCTTTATTCCCTAATGGTTTTGGTGAAGATCAAATCCCCAGTGCTTTTAAATTTAAAAATTAATTAACTTTT ATATTGAATTAGAAAATTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATCTAATCTGACACCTACAACAAATTATTTTGATGTATTTAATACTTATAAAGAGAAAAAAGCAAGTGTTGATTTAATTA CATATGAAGAATTAATGGCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 496; Mature: 496
Protein sequence:
>496_residues MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFD LHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLPWFVLYLVIATISFLLFFTFFSVWPKEVFNLVFL LLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVWINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTV QSGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLWFILLLFSAIFIWLLRVFAYKHENENLPVGNNHLL WVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIY IFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMV IFKINKLNKELNNEKK
Sequences:
>Translated_496_residues MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFD LHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFL LLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTV QSGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL *VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIY IFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMV IFKINKLNKELNNEKK >Mature_496_residues MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFD LHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFL LLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTV QSGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL *VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIY IFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMV IFKINKLNKELNNEKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57126; Mature: 57126
Theoretical pI: Translated: 10.38; Mature: 10.38
Prosite motif: PS00146 BETA_LACTAMASE_A
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGL CCCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE GFGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRA ECCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSG CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCC KNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAY CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILS HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINK HHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNKELNNEKK HHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGL CCCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE GFGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRA ECCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSG CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCC KNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAY CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILS HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINK HHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNKELNNEKK HHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11048724 [H]