Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13357604

GI number: 13357604

Start: 57794

End: 59284

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: UU048

Alternate gene names: NA

Gene position: 57794-59284 (Clockwise)

Preceding gene: 13357603

Following gene: 13357605

Centisome position: 7.69

GC content: 22.27

Gene sequence:

>1491_bases
ATGATGAATACAAAAACATTTACTTCCGTTAATAGAGTAATTTATGATGATAACTATTCGCTAAAGCAACAACAAAAAAG
TAGCTTTATCAATCAATTTTTAAAAGGATTGTTATCTGCTATTACTTTATTATTCTTTATTTTACTTTTAATCTTTGCTG
AAAATACGTTGTTTGGTTTAGGTTTTGGTGATGAGAATAAATCAATGATGATTTCAAAATCGCTAAATGCTTTTTTTGAT
TTACACAGCCCTAAATATTTACAACTTAACTTTTTAATTGTATTTCGCTTTTTTATTTTAAGTTTTACACTGTTTTATAC
CTTAATCAAAAATTTCACAAATCTTTATTGGCATCGAGCAACCATTAAAAAATACTTACCATGATTCGTTTTATATTTAG
TGATTGCAACAATTAGTTTCTTACTATTTTTTACTTTTTTTAGTGTTTGACCAAAAGAAGTTTTTAATTTAGTATTTTTA
CTATTAGTGTTATTTTTATTAAATTTAAGTTATGAAATATTTAATTATTTTATTTCTAAAAAAACTAACCCTTTATTATA
CGATAATTATAAAAATTTAATTATTGCCATGGTTTTTCAAGCGTTATTACTATTATTTGTAATAATTACCCCCCTTGTAT
GAATTAATACAGGTAAAAGTCCTAACTTTTTATTTGTTGATAATCGTTTCTACACACGCATAGTTGATATCTTCACTGTT
CAATCAGGTAAAAATTTTATTATTTTAATTGCTTTCTTCTTCTTTTTAATTACATTTATTGTTTTAGCAAATACTAATTT
TTTCGCTTTAGTAATTAATAAACGTTACGATCGTAATTATGTTAAGAATAATTTATGATTTATTTTACTTTTATTTAGTG
CTATATTTATTTGATTATTAAGAGTTTTTGCATATAAGCACGAAAATGAAAATCTACCGGTTGGTAACAACCATTTATTA
TGAGTTTATATTTTACAAAGTTTTTTTGCAATAATCATATTAATACTATATATGGTATTCACTTTAAAAAAACGCTTAAG
CGTAAAGAGTAGTTTAAATACTTTATTAAATTTAGTAGTCACTCAAACAATTCTAAGTTTAAGCTTGTTTTTAGTAACAT
TATTTAATTCTAAGAGTGTGGTTTCTTTAATTAATGTTTTTATTACAATTACTGTACAAATGAGTGTGTTTGGAATCTAC
ATATTTCAAAATAAAAACATTTCAACTAAATTATTGGTGCTATTAAAGGTTATTATGATTTTAATTATTTTAACCGCAGC
AATTGTAGGTTTTGATTATTTATTAACATCTGATCATCATAATAACTATTTATTCTCAAACATTCAACCGAAAATGAATT
TAGTACAAATCATGTTGTTATTAAATTTTAGTTTGAATTTTACTTTAATTAGTTATTTAACAATTAAATTTGCAATGGTA
ATTTTTAAAATCAATAAGCTAAATAAGGAGTTAAACAATGAAAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCAACCGCTTTATTCCCTAATGGTTTTGGTGAAGATCAAATCCCCAGTGCTTTTAAATTTAAAAATTAATTAACTTTT
ATATTGAATTAGAAAATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCTAATCTGACACCTACAACAAATTATTTTGATGTATTTAATACTTATAAAGAGAAAAAAGCAAGTGTTGATTTAATTA
CATATGAAGAATTAATGGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 496; Mature: 496

Protein sequence:

>496_residues
MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFD
LHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLPWFVLYLVIATISFLLFFTFFSVWPKEVFNLVFL
LLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVWINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTV
QSGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLWFILLLFSAIFIWLLRVFAYKHENENLPVGNNHLL
WVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIY
IFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMV
IFKINKLNKELNNEKK

Sequences:

>Translated_496_residues
MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFD
LHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFL
LLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTV
QSGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL
*VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIY
IFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMV
IFKINKLNKELNNEKK
>Mature_496_residues
MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGLGFGDENKSMMISKSLNAFFD
LHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRATIKKYLP*FVLYLVIATISFLLFFTFFSV*PKEVFNLVFL
LLVLFLLNLSYEIFNYFISKKTNPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLV*INTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTV
QSGKNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNL*FILLLFSAIFI*LLRVFAYKHENENLPVGNNHLL
*VYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILSLSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIY
IFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTAAIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMV
IFKINKLNKELNNEKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57126; Mature: 57126

Theoretical pI: Translated: 10.38; Mature: 10.38

Prosite motif: PS00146 BETA_LACTAMASE_A

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGL
CCCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
GFGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRA
ECCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSG
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCC
KNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAY
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILS
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINK
HHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNKELNNEKK
HHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MMNTKTFTSVNRVIYDDNYSLKQQQKSSFINQFLKGLLSAITLLFFILLLIFAENTLFGL
CCCCCHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
GFGDENKSMMISKSLNAFFDLHSPKYLQLNFLIVFRFFILSFTLFYTLIKNFTNLYWHRA
ECCCCCCCEEHHHHHHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIKKYLPFVLYLVIATISFLLFFTFFSVPKEVFNLVFLLLVLFLLNLSYEIFNYFISKKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NPLLYDNYKNLIIAMVFQALLLLFVIITPLVINTGKSPNFLFVDNRFYTRIVDIFTVQSG
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHEECCC
KNFIILIAFFFFLITFIVLANTNFFALVINKRYDRNYVKNNLFILLLFSAIFILLRVFAY
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHENENLPVGNNHLLVYILQSFFAIIILILYMVFTLKKRLSVKSSLNTLLNLVVTQTILS
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSLFLVTLFNSKSVVSLINVFITITVQMSVFGIYIFQNKNISTKLLVLLKVIMILIILTA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIVGFDYLLTSDHHNNYLFSNIQPKMNLVQIMLLLNFSLNFTLISYLTIKFAMVIFKINK
HHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNKELNNEKK
HHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11048724 [H]