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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 126699144

GI number: 126699144

Start: 1787453

End: 1789333

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: CD1540

Alternate gene names: 126699144

Gene position: 1787453-1789333 (Clockwise)

Preceding gene: 126699143

Following gene: 126699145

Centisome position: 41.66

GC content: 23.29

Gene sequence:

>1881_bases
GTGGATTTTAGAAAGTTTGCTTATAATAATATAGTTAGAAATTTCAGGGCATATTTAGCATATTTTTTAAGTTCTGTTTT
TTCTATAATGATATTTTTTGTTTTTGCAGTGTCTATGTTCCATCCAATTATAACAAAATCTGGAATGCAGAGTGGTTCTA
CTGCATTTATGGCTCTTATGACTTCAGAATTAATAATATTCGGTTTTAGTCTACTTTTTATATTGTACTCTTTAGGAAAT
TTCTTAAAATATAGATTGAAAGATTTTGGAGTATTGATGATAATTGGAATGAGTAACAGACAACTGAAAAAATTGATATT
AATTGAAAATTTGATAATAGGATTTTTAGCAGTGATGTTAGGAATATTACTTGGTTTATCAATTTCAAAATTGTTTTTAT
TGTATTTAAGCAAACTGTTTTATATGAATTTAACTGAATTTTATTTTCCAGTAAAAGCAATGCTATTGACTATTGTATCA
TTTATGATTTTATTTTTGATAACAGGACCAATGAGCTTAAAATTATTGAGTAAAAAGAGTATTTTAGAGCTTTTAGTAGG
TACAAAAAAGCCTAAAAAAGAGATAAAATCTTCAAAGCTATTTGGAATAATTGGTGCAGTGTGTCTTATATTAGGATATG
CTATGATAATATTTGGCAATAAGTTAAAAATAAATGGAGGTATGTATACAACAGCACTATTAATTACTTTGGGGATATTT
TTATTTTTTTCTCAATTTACTATTTTGATATTAAAGTATTTAAAAAATAAAGAAAAATTTTATAAGAACAAAGTAAATAT
GTTACTTATAAGTAATTTGATATATAAATTAAAGGATAATACACGATTGTTATTTTTAATAACAATACTTTTATCGGCTA
CTTTAGTAGCATTTACAACAACTTCAACACTTGTAAGTTCTCAAGGAGAAGCTTCTAAAAATAATTTCCCAATGGTTTAC
TCATATTTTTCAGAGCATAATAATGAAAAAGAATATGAAGAACTACAACAAATTAGAGAAGCAATCAAAGGATATGATTA
TAAGGAGTTAAGTTTTCCTGTACTTAAATATAATAGGGAAGTCTTACTAAGTGTAAAGAATTATAACAAATTATCAAAGG
AATTGGGATTAGATAAAATTAGTTCAAAGTTAGAAAAATATGAAGGGATTATAATTCCTAGTAGCAATTCGCAAGAACAT
ATAAATTCTTTAAAACAATTAAAAAATTATAGTATAAAAAATTTAAATATAGAAGTAAAAAAATCAAAAAATAAAATAAT
TTTTCCTACAGGACTGTTTAGTAAAGTTGTAGTTATAAGTGATGACTTATACAATGAAGTAAAAGGTGAATTTTCAAAAA
TTAATTTTCATGGATTTGATTATAAAAACTGGCAAAGCAGTGCACAGATAACTGAAAATTTAAAAGAAAAACATTTTAAT
TTGGATAGAGAATATAACAGGTCATATTTTTTAACATTACCAGATATGTATTTAGTAGAGTTACAACAAAGTAAAATTCT
TCAATTTATGGGTGTTTTTATAGGAGTGATATTATTTATAGCAGTTTTTAGTTTTTTATACTTTAGATTATATACAGACG
AGATAGAAGATAATGTAAAGTACAAAAAACTATCAAAAATAGGTCTATCTTTTAAAAATATGAATAAGATTGTTAGTATA
GAGATAGGTACATTGTTTTTTATACCGTATTTTATAGCAATTATAAATAGCATAATTTCTTTACTGTTTTTAAATCAAGT
ATTAAATAATAGTTTTAAGTTAGAAAATTTGGGTATATTACTACTGATATCATCTATATATTCACTTTATTTTTACTTAT
TAAAAAAAATTTATACTAGAAAAGTTTGGTTTTTTGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATGGTTGTATATATACAGAAATAAAAAAATCTGAAAGCAGTAATTCTTTCTATTCTGATATACTAGCTGTTTTGTCT
CAAATAGGAGGTGTAAGATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTGGTATATAATAGATATATAAATTAATATTTAAAAAGTAGTTAATATTAGGGGAGGGCATTTGCACCTCCCTTGTAAT
ATGTGGAAAATTGAATATTA

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 626

Protein sequence:

>626_residues
MDFRKFAYNNIVRNFRAYLAYFLSSVFSIMIFFVFAVSMFHPIITKSGMQSGSTAFMALMTSELIIFGFSLLFILYSLGN
FLKYRLKDFGVLMIIGMSNRQLKKLILIENLIIGFLAVMLGILLGLSISKLFLLYLSKLFYMNLTEFYFPVKAMLLTIVS
FMILFLITGPMSLKLLSKKSILELLVGTKKPKKEIKSSKLFGIIGAVCLILGYAMIIFGNKLKINGGMYTTALLITLGIF
LFFSQFTILILKYLKNKEKFYKNKVNMLLISNLIYKLKDNTRLLFLITILLSATLVAFTTTSTLVSSQGEASKNNFPMVY
SYFSEHNNEKEYEELQQIREAIKGYDYKELSFPVLKYNREVLLSVKNYNKLSKELGLDKISSKLEKYEGIIIPSSNSQEH
INSLKQLKNYSIKNLNIEVKKSKNKIIFPTGLFSKVVVISDDLYNEVKGEFSKINFHGFDYKNWQSSAQITENLKEKHFN
LDREYNRSYFLTLPDMYLVELQQSKILQFMGVFIGVILFIAVFSFLYFRLYTDEIEDNVKYKKLSKIGLSFKNMNKIVSI
EIGTLFFIPYFIAIINSIISLLFLNQVLNNSFKLENLGILLLISSIYSLYFYLLKKIYTRKVWFFD

Sequences:

>Translated_626_residues
MDFRKFAYNNIVRNFRAYLAYFLSSVFSIMIFFVFAVSMFHPIITKSGMQSGSTAFMALMTSELIIFGFSLLFILYSLGN
FLKYRLKDFGVLMIIGMSNRQLKKLILIENLIIGFLAVMLGILLGLSISKLFLLYLSKLFYMNLTEFYFPVKAMLLTIVS
FMILFLITGPMSLKLLSKKSILELLVGTKKPKKEIKSSKLFGIIGAVCLILGYAMIIFGNKLKINGGMYTTALLITLGIF
LFFSQFTILILKYLKNKEKFYKNKVNMLLISNLIYKLKDNTRLLFLITILLSATLVAFTTTSTLVSSQGEASKNNFPMVY
SYFSEHNNEKEYEELQQIREAIKGYDYKELSFPVLKYNREVLLSVKNYNKLSKELGLDKISSKLEKYEGIIIPSSNSQEH
INSLKQLKNYSIKNLNIEVKKSKNKIIFPTGLFSKVVVISDDLYNEVKGEFSKINFHGFDYKNWQSSAQITENLKEKHFN
LDREYNRSYFLTLPDMYLVELQQSKILQFMGVFIGVILFIAVFSFLYFRLYTDEIEDNVKYKKLSKIGLSFKNMNKIVSI
EIGTLFFIPYFIAIINSIISLLFLNQVLNNSFKLENLGILLLISSIYSLYFYLLKKIYTRKVWFFD
>Mature_626_residues
MDFRKFAYNNIVRNFRAYLAYFLSSVFSIMIFFVFAVSMFHPIITKSGMQSGSTAFMALMTSELIIFGFSLLFILYSLGN
FLKYRLKDFGVLMIIGMSNRQLKKLILIENLIIGFLAVMLGILLGLSISKLFLLYLSKLFYMNLTEFYFPVKAMLLTIVS
FMILFLITGPMSLKLLSKKSILELLVGTKKPKKEIKSSKLFGIIGAVCLILGYAMIIFGNKLKINGGMYTTALLITLGIF
LFFSQFTILILKYLKNKEKFYKNKVNMLLISNLIYKLKDNTRLLFLITILLSATLVAFTTTSTLVSSQGEASKNNFPMVY
SYFSEHNNEKEYEELQQIREAIKGYDYKELSFPVLKYNREVLLSVKNYNKLSKELGLDKISSKLEKYEGIIIPSSNSQEH
INSLKQLKNYSIKNLNIEVKKSKNKIIFPTGLFSKVVVISDDLYNEVKGEFSKINFHGFDYKNWQSSAQITENLKEKHFN
LDREYNRSYFLTLPDMYLVELQQSKILQFMGVFIGVILFIAVFSFLYFRLYTDEIEDNVKYKKLSKIGLSFKNMNKIVSI
EIGTLFFIPYFIAIINSIISLLFLNQVLNNSFKLENLGILLLISSIYSLYFYLLKKIYTRKVWFFD

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72546; Mature: 72546

Theoretical pI: Translated: 10.15; Mature: 10.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDFRKFAYNNIVRNFRAYLAYFLSSVFSIMIFFVFAVSMFHPIITKSGMQSGSTAFMALM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
TSELIIFGFSLLFILYSLGNFLKYRLKDFGVLMIIGMSNRQLKKLILIENLIIGFLAVML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GILLGLSISKLFLLYLSKLFYMNLTEFYFPVKAMLLTIVSFMILFLITGPMSLKLLSKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ILELLVGTKKPKKEIKSSKLFGIIGAVCLILGYAMIIFGNKLKINGGMYTTALLITLGIF
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
LFFSQFTILILKYLKNKEKFYKNKVNMLLISNLIYKLKDNTRLLFLITILLSATLVAFTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSTLVSSQGEASKNNFPMVYSYFSEHNNEKEYEELQQIREAIKGYDYKELSFPVLKYNRE
HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCHH
VLLSVKNYNKLSKELGLDKISSKLEKYEGIIIPSSNSQEHINSLKQLKNYSIKNLNIEVK
HEEEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEE
KSKNKIIFPTGLFSKVVVISDDLYNEVKGEFSKINFHGFDYKNWQSSAQITENLKEKHFN
ECCCEEEEECCHHHHEEEEEHHHHHHHCCCHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
LDREYNRSYFLTLPDMYLVELQQSKILQFMGVFIGVILFIAVFSFLYFRLYTDEIEDNVK
CCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
YKKLSKIGLSFKNMNKIVSIEIGTLFFIPYFIAIINSIISLLFLNQVLNNSFKLENLGIL
HHHHHHHCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
LLISSIYSLYFYLLKKIYTRKVWFFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDFRKFAYNNIVRNFRAYLAYFLSSVFSIMIFFVFAVSMFHPIITKSGMQSGSTAFMALM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
TSELIIFGFSLLFILYSLGNFLKYRLKDFGVLMIIGMSNRQLKKLILIENLIIGFLAVML
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GILLGLSISKLFLLYLSKLFYMNLTEFYFPVKAMLLTIVSFMILFLITGPMSLKLLSKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ILELLVGTKKPKKEIKSSKLFGIIGAVCLILGYAMIIFGNKLKINGGMYTTALLITLGIF
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
LFFSQFTILILKYLKNKEKFYKNKVNMLLISNLIYKLKDNTRLLFLITILLSATLVAFTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSTLVSSQGEASKNNFPMVYSYFSEHNNEKEYEELQQIREAIKGYDYKELSFPVLKYNRE
HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCHH
VLLSVKNYNKLSKELGLDKISSKLEKYEGIIIPSSNSQEHINSLKQLKNYSIKNLNIEVK
HEEEEHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEE
KSKNKIIFPTGLFSKVVVISDDLYNEVKGEFSKINFHGFDYKNWQSSAQITENLKEKHFN
ECCCEEEEECCHHHHEEEEEHHHHHHHCCCHHEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
LDREYNRSYFLTLPDMYLVELQQSKILQFMGVFIGVILFIAVFSFLYFRLYTDEIEDNVK
CCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
YKKLSKIGLSFKNMNKIVSIEIGTLFFIPYFIAIINSIISLLFLNQVLNNSFKLENLGIL
HHHHHHHCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
LLISSIYSLYFYLLKKIYTRKVWFFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]