Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

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The map label for this gene is 126698428

Identifier: 126698428

GI number: 126698428

Start: 1023611

End: 1025146

Strand: Direct

Name: 126698428

Synonym: CD0848

Alternate gene names: NA

Gene position: 1023611-1025146 (Clockwise)

Preceding gene: 126698427

Following gene: 126698429

Centisome position: 23.86

GC content: 24.22

Gene sequence:

>1536_bases
ATGTTAAATAATTTAAGTAATATTAATATAAACGAAAATAATTTAATAAAGAACCAATATTCCATATCTCTACTTAAGGA
ATGTCTAAATTGTAAAGTGATAGATGAAAGAGAAGTATATAATATACAACAAGAAATATCTCTAATACTTATGGATTTGA
TTAAAAAATATACAAATGGTCAAAGCACATCAGTAAAAACAGAAGTTGCCGAAAAACTGTTGATTTCAATATGGTATGCT
ATTGATGCATATATAAATAAGCTTGGAGATATAGAAAAAAGAGTTGTGGAGTTGACTGCTAAGAATGTTAAAAAAGTGTA
CCTTGGAGGCATTGAAATATTAGAGGAAGAGTTAGTTAGGCTAAAAGATTTTTATAAACTAATGATGAGTAGAAAATTGG
ATACTAATTCAATAGCATATAATGATACCTTGATGGAGTTATCAAGTTTCTTTAAAAGTTATATTGTAAAATTTGAAGCT
CAGGACGTTCCAGTAAGTATAGATTATCCATTGGCACTAGATGATATGGATGTTAAGGGTATTTATTATGTGAAGAATTA
TATTGAGAGTATAGATATAGAAAATAGATTTTGTAACCTATTTAAGAAAAAAGATAGAGAAAAATTATTTTATGACTATG
GGGTGACTTATAAAATAGATTGTGATGTTATACTTGTAAATTTATTTGAACTTATTATAAATAATTGTATTTTTTCTACT
ATTTTAGGAAATGAAGTGACTAATTTAGAAATTTCAAAATATGAGTATGAATTTTTAGAAAAACAATTTAAAAATATGTA
CAATAATATTACTGAAGATGAAGTTATAGGCTCTGAAGAAAGTAATATAATTGAATTGATTGAAGTAGATGATAGTTTTA
ACACTGAAGTAGATAGTAATTTGGATTATAATGATTTTGAAGAAATTAACAGAGAAATTAGAATAAATAAAAAAATAACT
TTACTACTTATGGAAGCAATTGAAGTATTAATAAAAAGATTAAGCATAGAAGATGAAGATGTAATAAGATATATTAAAAA
ATATGAAAAGATATTTATTGAATCTGTGCTAAGCTCAATAAAAAGTAACACTTTTAAAAGTATGGTAACTGTGAGTAAAA
ATAAAAAGGAACACTTAGAAGATTATATTGTTGATGATGAAAGTAAATTGGATGATGAATCGTTTAGAGAGATATTCAAT
GAGATATTAGATAGTACATCTATAATTGAAAAAATAAGAATAATAAAGGAAAATATCAATGCTAAAAAAGACTTTATCGA
TATTCTTGAATCTGAATGTTTATTTGGAGAAGAGTATTTAATGTTGTTTGCATCATTAAGTGAATTAGAATTGGCAATAT
TGGGTAGTGTAGTATTTTATGAAGATATTAGAATGAGAGAAATTAATATATTAGAATTTATGTTAAATGAGAAAACTGAA
ACTACTTTATGGAAGATAGAGTACATTAAATTTATGAAGAGGCAAAGTGAAGATAAGATATACTCCATAGAAGAGCATAT
GAATAAAATTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTTCAGGCAATATGGACAATGTAAGAGGAGAAGCAGACGAATTTGCAAAGAAATTTAAATTTGGAGAAGTTTAATA
TATGATAGGAGAGATTTTGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAAATTGTGAATAAATAGAATGTTAGTATATAATATAATCTGTAAAGCATATCAAAAATACATATATTTGGAGGAAA
ATTATGAAAGAGTATATCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 511; Mature: 511

Protein sequence:

>511_residues
MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNGQSTSVKTEVAEKLLISIWYA
IDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVRLKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEA
QDVPVSIDYPLALDDMDVKGIYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST
ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSNLDYNDFEEINREIRINKKIT
LLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSIKSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFN
EILDSTSIIEKIRIIKENINAKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE
TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN

Sequences:

>Translated_511_residues
MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNGQSTSVKTEVAEKLLISIWYA
IDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVRLKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEA
QDVPVSIDYPLALDDMDVKGIYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST
ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSNLDYNDFEEINREIRINKKIT
LLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSIKSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFN
EILDSTSIIEKIRIIKENINAKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE
TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN
>Mature_511_residues
MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNGQSTSVKTEVAEKLLISIWYA
IDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVRLKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEA
QDVPVSIDYPLALDDMDVKGIYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST
ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSNLDYNDFEEINREIRINKKIT
LLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSIKSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFN
EILDSTSIIEKIRIIKENINAKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE
TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60315; Mature: 60315

Theoretical pI: Translated: 4.35; Mature: 4.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNG
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QSTSVKTEVAEKLLISIWYAIDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEAQDVPVSIDYPLALDDMDVKG
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEECCCEEECCCCCCH
IYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSN
HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC
LDYNDFEEINREIRINKKITLLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSI
CCCCHHHHHCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFNEILDSTSIIEKIRIIKENIN
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNG
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QSTSVKTEVAEKLLISIWYAIDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEAQDVPVSIDYPLALDDMDVKG
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEECCCEEECCCCCCH
IYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSN
HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC
LDYNDFEEINREIRINKKITLLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSI
CCCCHHHHHCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFNEILDSTSIIEKIRIIKENIN
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
AKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA