| Definition | Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009089 |
| Length | 4,290,252 |
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The map label for this gene is 126698428
Identifier: 126698428
GI number: 126698428
Start: 1023611
End: 1025146
Strand: Direct
Name: 126698428
Synonym: CD0848
Alternate gene names: NA
Gene position: 1023611-1025146 (Clockwise)
Preceding gene: 126698427
Following gene: 126698429
Centisome position: 23.86
GC content: 24.22
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CAAAAAATTGTGAATAAATAGAATGTTAGTATATAATATAATCTGTAAAGCATATCAAAAATACATATATTTGGAGGAAA ATTATGAAAGAGTATATCAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 511; Mature: 511
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_511_residues MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNGQSTSVKTEVAEKLLISIWYA IDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVRLKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEA QDVPVSIDYPLALDDMDVKGIYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSNLDYNDFEEINREIRINKKIT LLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSIKSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFN EILDSTSIIEKIRIIKENINAKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN >Mature_511_residues MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNGQSTSVKTEVAEKLLISIWYA IDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVRLKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEA QDVPVSIDYPLALDDMDVKGIYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSNLDYNDFEEINREIRINKKIT LLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSIKSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFN EILDSTSIIEKIRIIKENINAKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60315; Mature: 60315
Theoretical pI: Translated: 4.35; Mature: 4.35
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNG CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC QSTSVKTEVAEKLLISIWYAIDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVR CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEAQDVPVSIDYPLALDDMDVKG HHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEECCCEEECCCCCCH IYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSN HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC LDYNDFEEINREIRINKKITLLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSI CCCCHHHHHCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFNEILDSTSIIEKIRIIKENIN HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLNNLSNININENNLIKNQYSISLLKECLNCKVIDEREVYNIQQEISLILMDLIKKYTNG CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC QSTSVKTEVAEKLLISIWYAIDAYINKLGDIEKRVVELTAKNVKKVYLGGIEILEEELVR CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKDFYKLMMSRKLDTNSIAYNDTLMELSSFFKSYIVKFEAQDVPVSIDYPLALDDMDVKG HHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEECCCEEECCCCCCH IYYVKNYIESIDIENRFCNLFKKKDREKLFYDYGVTYKIDCDVILVNLFELIINNCIFST HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILGNEVTNLEISKYEYEFLEKQFKNMYNNITEDEVIGSEESNIIELIEVDDSFNTEVDSN HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC LDYNDFEEINREIRINKKITLLLMEAIEVLIKRLSIEDEDVIRYIKKYEKIFIESVLSSI CCCCHHHHHCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSNTFKSMVTVSKNKKEHLEDYIVDDESKLDDESFREIFNEILDSTSIIEKIRIIKENIN HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AKKDFIDILESECLFGEEYLMLFASLSELELAILGSVVFYEDIRMREINILEFMLNEKTE CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH TTLWKIEYIKFMKRQSEDKIYSIEEHMNKIN HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA