| Definition | Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009089 |
| Length | 4,290,252 |
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The map label for this gene is 126698410
Identifier: 126698410
GI number: 126698410
Start: 1004970
End: 1006154
Strand: Direct
Name: 126698410
Synonym: CD0830
Alternate gene names: NA
Gene position: 1004970-1006154 (Clockwise)
Preceding gene: 126698409
Following gene: 126698412
Centisome position: 23.42
GC content: 32.74
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATGTAGTAGCAAAAAATATTGCTAAAGAGAATACTATAGATAAGAATACTATAGATAATATATCTGCATGTTTATTAAGA TTATTTGCAAAATCTAATAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 394; Mature: 394
Protein sequence:
>394_residues MQKSVKKAKVTGSMLAIFGVASVLFSSHAGGGFATGNQETQYYVQYGWTAPLMAILAMIILTATMREVIIMYNNNNCRNY KDLFCELWRPYPKLEIIWEIYYYLMVLIAVSAVIAGAAAVFQSIGVNYFVAVFIIGVVLLVFTIFGAMLVSKAATAMTIA ILVCTLTIFIVGIKAKVPEITEILSNRTSFTPGYIKPILNTFIYAGFQSVVIPTLAGCSRPLLKNSKEATKAMIISFVMN AIALGLAVTMLMGWYREIIAAGQTTLPTLYVAGQSGNHTIYIIYNVALFLCLMSTGVTTIFGLVNRFEDHKALSFLSSRM KRRVFTACAIMVVSMLISLTGLSNIVKYGYGYCGYLGLFTIVIPFLTLGHYKNKKFAKENPEAKWPAELNENVN
Sequences:
>Translated_394_residues MQKSVKKAKVTGSMLAIFGVASVLFSSHAGGGFATGNQETQYYVQYGWTAPLMAILAMIILTATMREVIIMYNNNNCRNY KDLFCELWRPYPKLEIIWEIYYYLMVLIAVSAVIAGAAAVFQSIGVNYFVAVFIIGVVLLVFTIFGAMLVSKAATAMTIA ILVCTLTIFIVGIKAKVPEITEILSNRTSFTPGYIKPILNTFIYAGFQSVVIPTLAGCSRPLLKNSKEATKAMIISFVMN AIALGLAVTMLMGWYREIIAAGQTTLPTLYVAGQSGNHTIYIIYNVALFLCLMSTGVTTIFGLVNRFEDHKALSFLSSRM KRRVFTACAIMVVSMLISLTGLSNIVKYGYGYCGYLGLFTIVIPFLTLGHYKNKKFAKENPEAKWPAELNENVN >Mature_394_residues MQKSVKKAKVTGSMLAIFGVASVLFSSHAGGGFATGNQETQYYVQYGWTAPLMAILAMIILTATMREVIIMYNNNNCRNY KDLFCELWRPYPKLEIIWEIYYYLMVLIAVSAVIAGAAAVFQSIGVNYFVAVFIIGVVLLVFTIFGAMLVSKAATAMTIA ILVCTLTIFIVGIKAKVPEITEILSNRTSFTPGYIKPILNTFIYAGFQSVVIPTLAGCSRPLLKNSKEATKAMIISFVMN AIALGLAVTMLMGWYREIIAAGQTTLPTLYVAGQSGNHTIYIIYNVALFLCLMSTGVTTIFGLVNRFEDHKALSFLSSRM KRRVFTACAIMVVSMLISLTGLSNIVKYGYGYCGYLGLFTIVIPFLTLGHYKNKKFAKENPEAKWPAELNENVN
Specific function: Unknown
COG id: COG3949
COG function: function code S; Uncharacterized membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 43406; Mature: 43406
Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70
Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 4.3 %Met (Translated Protein) 6.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 4.3 %Met (Mature Protein) 6.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQKSVKKAKVTGSMLAIFGVASVLFSSHAGGGFATGNQETQYYVQYGWTAPLMAILAMII CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH LTATMREVIIMYNNNNCRNYKDLFCELWRPYPKLEIIWEIYYYLMVLIAVSAVIAGAAAV HHHHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FQSIGVNYFVAVFIIGVVLLVFTIFGAMLVSKAATAMTIAILVCTLTIFIVGIKAKVPEI HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH TEILSNRTSFTPGYIKPILNTFIYAGFQSVVIPTLAGCSRPLLKNSKEATKAMIISFVMN HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH AIALGLAVTMLMGWYREIIAAGQTTLPTLYVAGQSGNHTIYIIYNVALFLCLMSTGVTTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGLVNRFEDHKALSFLSSRMKRRVFTACAIMVVSMLISLTGLSNIVKYGYGYCGYLGLFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH IVIPFLTLGHYKNKKFAKENPEAKWPAELNENVN HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MQKSVKKAKVTGSMLAIFGVASVLFSSHAGGGFATGNQETQYYVQYGWTAPLMAILAMII CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHH LTATMREVIIMYNNNNCRNYKDLFCELWRPYPKLEIIWEIYYYLMVLIAVSAVIAGAAAV HHHHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FQSIGVNYFVAVFIIGVVLLVFTIFGAMLVSKAATAMTIAILVCTLTIFIVGIKAKVPEI HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH TEILSNRTSFTPGYIKPILNTFIYAGFQSVVIPTLAGCSRPLLKNSKEATKAMIISFVMN HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH AIALGLAVTMLMGWYREIIAAGQTTLPTLYVAGQSGNHTIYIIYNVALFLCLMSTGVTTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGLVNRFEDHKALSFLSSRMKRRVFTACAIMVVSMLISLTGLSNIVKYGYGYCGYLGLFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH IVIPFLTLGHYKNKKFAKENPEAKWPAELNENVN HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA