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The map label for this gene is 126697596

Identifier: 126697596

GI number: 126697596

Start: 49299

End: 51476

Strand: Direct

Name: 126697596

Synonym: CD0030

Alternate gene names: NA

Gene position: 49299-51476 (Clockwise)

Preceding gene: 126697595

Following gene: 126697598

Centisome position: 1.15

GC content: 27.04

Gene sequence:

>2178_bases
ATGAGAAAAAAGATTATATCTTTCTTAGCAACATTTATCATAATATTAACATCAGCAAGTCAGTATAGTTTTGCAGATGA
TATATCAACACGTGGAAAAGTAATATTTATAGATATGAATAGAACTAGTATGAGTAATATGTTAAGAATAAAATCATTAA
GAGAAGAACTAGACAATAGAGGGTATATTGGCTTGATGAATATAAGAGGCGATAAAGGAAGTGATGATAGAAGGTCATAT
GCTAGTATGGGTGCTGGTGGTAGAGCTAATGTGGCTAATGAAGAAGATATTAATTTTGAAAGCTCGAATAAGGATAGAAA
TATAGTTTTTGAATCAGCTACAGGAAAAAGTGCAAAAGGTATAAATAATTTAACTATAAATAAGTCTATAAATGAAAATT
TAAACTTTGGAGAGTATGGTTCTGTATTAGGGTCATTAGGACAAAGTTTATCTGATAATGGATTAAAAGCATCTGTATTG
GGTAATTCAGATATAATTGAAAATGGTCAACTTATAAAAAATAGAAACTTATGTCTAACTGCAATGGATGAATATGGAAG
AATACCTAATGGAAATGTAGATACTATAAATAAAAAAGACTTATCTATGCCTTATGGAATATCAACTGATTATGATAAAT
TGATTGTAGAGACTAAAGAAGCTTACAAAAATAATGATGTGATTTTTGTGGAGCTTGGAGACACATATAGATTAGATTTA
TATAAACCAAATTTAAATGAAAAAACATATGAGAGTATGAAAGATAACATAGAAAAAAATATAGATATATATTTAAAAAA
TATATTTTCTATGGTTGAAGAAAATGACACTATCTACATAGCAAGTGCATTTCCAAGTGATTTAGATTATAAAAATAAAA
GAAGACTTTCTCCAATAATAAAATTAAATGGAGAAGGGAAAGGTATATTATCATCTTCAACTACTAGAAGAGAAGGTATT
GTAACAAATTTAGATGTTGGGGTTGAAATATTAGACAACTTTAATATAAAAAATCAAAATATGGTTGGAAGAAAATATGA
ACTTATTAACAGAGATGATAATAAAGAATTTTTGATGGATGAATATCAAAAGATAGTATCTATTTCAAGCATAAGGTCTA
CAATACTGAATGGTTTTGTAAGTATAGTTTTCTTGTCATGGATAGTTGCTATGATTGCAATTTTATTTAGAAAGCATATA
TCAAAAAATTATAAAGAAACAACATTTTTTATATTAAAGGAACTTTTAAAAATAGGAATAGTAATGCCACTGTCATTTAT
GATAACACCAATAATGAATTTCAAAACACCATTAGCAATATCTTTAGGAATAATTATAATAACACTTACTATATATCTTA
TAAGTAAAGTTTTAATAAAGAACGATTTAAAAAACATGCTGTTTTTTACTGGATTAACCATAGTAATTATGGTTATTGAT
GCTGGGTTTGGCTCATATTTAATGAAAAGCAATGTTATGAGTTATGATTGTATAATTGGAGCTAGATATTATGGAGTAGG
AAATGAGTATCAAGGTGTGGCAATCGGTAGTGCAATATTTACATTTGCAATTTTACTTACATATAAAAATATACCAAAGT
GGTCTATAATAGTTTTTTCTTTGGTTATCTTAATTACAAGTGCATCTCCAATTATGGGAGCAAATGTTGGAAGTGCTATT
TCTGAATGTGTTGCATTTTTACTATTTATACTATTGATATATAATGTAAAGATAGATTTCAAAAAAATCGTATTATTAGG
TATAGCAGTAGTATTTGTATTAGGAGTTTTTGTAGCAATAGATATGATTTTGGGAAGTAATTCACATTTAGGTATGTTTG
TAAAAGAAATTTACTTTAATGGACCAGGAGAAATAATACAAACATTTAGTAGAAAGATAGAGATGAATTTAAAGCTAGCT
CAAACCAGTGCATGGGTAAATATACTGTTAACTGGAATAGGTGTAATTTTAGTTCTTATGATTAATCAGATTAGATACTT
TAAGCAACTGATGGATGAGTATCCAATTGTATTTAAAGGATTTATAGCATCAATAGCAGGATGTTTAGTAACTCTTTTAG
TGAATGACTCTGGGATTGTGTCATCAGCTACAGCCTTTATTTATGTAATTGTACCTATGATAACATTAAGTATAAATCTT
ACAGCATTAAAAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTTATTTTAAATAGATGGTCCAAATTTATTTATTTATAACGATAATGTTTAATGTATTCTTAAAGATGGGGATTTAAA
TCAGAAAGCAGGGAGAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTACTGTATGAATAATATGTAAATATTAATACATTAATTTAACTTCTTTATTTACAAAATAAAGAAGAAAGTTTATAAAA
AATAAATTATAATAAAAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 725; Mature: 725

Protein sequence:

>725_residues
MRKKIISFLATFIIILTSASQYSFADDISTRGKVIFIDMNRTSMSNMLRIKSLREELDNRGYIGLMNIRGDKGSDDRRSY
ASMGAGGRANVANEEDINFESSNKDRNIVFESATGKSAKGINNLTINKSINENLNFGEYGSVLGSLGQSLSDNGLKASVL
GNSDIIENGQLIKNRNLCLTAMDEYGRIPNGNVDTINKKDLSMPYGISTDYDKLIVETKEAYKNNDVIFVELGDTYRLDL
YKPNLNEKTYESMKDNIEKNIDIYLKNIFSMVEENDTIYIASAFPSDLDYKNKRRLSPIIKLNGEGKGILSSSTTRREGI
VTNLDVGVEILDNFNIKNQNMVGRKYELINRDDNKEFLMDEYQKIVSISSIRSTILNGFVSIVFLSWIVAMIAILFRKHI
SKNYKETTFFILKELLKIGIVMPLSFMITPIMNFKTPLAISLGIIIITLTIYLISKVLIKNDLKNMLFFTGLTIVIMVID
AGFGSYLMKSNVMSYDCIIGARYYGVGNEYQGVAIGSAIFTFAILLTYKNIPKWSIIVFSLVILITSASPIMGANVGSAI
SECVAFLLFILLIYNVKIDFKKIVLLGIAVVFVLGVFVAIDMILGSNSHLGMFVKEIYFNGPGEIIQTFSRKIEMNLKLA
QTSAWVNILLTGIGVILVLMINQIRYFKQLMDEYPIVFKGFIASIAGCLVTLLVNDSGIVSSATAFIYVIVPMITLSINL
TALKE

Sequences:

>Translated_725_residues
MRKKIISFLATFIIILTSASQYSFADDISTRGKVIFIDMNRTSMSNMLRIKSLREELDNRGYIGLMNIRGDKGSDDRRSY
ASMGAGGRANVANEEDINFESSNKDRNIVFESATGKSAKGINNLTINKSINENLNFGEYGSVLGSLGQSLSDNGLKASVL
GNSDIIENGQLIKNRNLCLTAMDEYGRIPNGNVDTINKKDLSMPYGISTDYDKLIVETKEAYKNNDVIFVELGDTYRLDL
YKPNLNEKTYESMKDNIEKNIDIYLKNIFSMVEENDTIYIASAFPSDLDYKNKRRLSPIIKLNGEGKGILSSSTTRREGI
VTNLDVGVEILDNFNIKNQNMVGRKYELINRDDNKEFLMDEYQKIVSISSIRSTILNGFVSIVFLSWIVAMIAILFRKHI
SKNYKETTFFILKELLKIGIVMPLSFMITPIMNFKTPLAISLGIIIITLTIYLISKVLIKNDLKNMLFFTGLTIVIMVID
AGFGSYLMKSNVMSYDCIIGARYYGVGNEYQGVAIGSAIFTFAILLTYKNIPKWSIIVFSLVILITSASPIMGANVGSAI
SECVAFLLFILLIYNVKIDFKKIVLLGIAVVFVLGVFVAIDMILGSNSHLGMFVKEIYFNGPGEIIQTFSRKIEMNLKLA
QTSAWVNILLTGIGVILVLMINQIRYFKQLMDEYPIVFKGFIASIAGCLVTLLVNDSGIVSSATAFIYVIVPMITLSINL
TALKE
>Mature_725_residues
MRKKIISFLATFIIILTSASQYSFADDISTRGKVIFIDMNRTSMSNMLRIKSLREELDNRGYIGLMNIRGDKGSDDRRSY
ASMGAGGRANVANEEDINFESSNKDRNIVFESATGKSAKGINNLTINKSINENLNFGEYGSVLGSLGQSLSDNGLKASVL
GNSDIIENGQLIKNRNLCLTAMDEYGRIPNGNVDTINKKDLSMPYGISTDYDKLIVETKEAYKNNDVIFVELGDTYRLDL
YKPNLNEKTYESMKDNIEKNIDIYLKNIFSMVEENDTIYIASAFPSDLDYKNKRRLSPIIKLNGEGKGILSSSTTRREGI
VTNLDVGVEILDNFNIKNQNMVGRKYELINRDDNKEFLMDEYQKIVSISSIRSTILNGFVSIVFLSWIVAMIAILFRKHI
SKNYKETTFFILKELLKIGIVMPLSFMITPIMNFKTPLAISLGIIIITLTIYLISKVLIKNDLKNMLFFTGLTIVIMVID
AGFGSYLMKSNVMSYDCIIGARYYGVGNEYQGVAIGSAIFTFAILLTYKNIPKWSIIVFSLVILITSASPIMGANVGSAI
SECVAFLLFILLIYNVKIDFKKIVLLGIAVVFVLGVFVAIDMILGSNSHLGMFVKEIYFNGPGEIIQTFSRKIEMNLKLA
QTSAWVNILLTGIGVILVLMINQIRYFKQLMDEYPIVFKGFIASIAGCLVTLLVNDSGIVSSATAFIYVIVPMITLSINL
TALKE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80908; Mature: 80908

Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92

Prosite motif: PS00962 RIBOSOMAL_S2_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKKIISFLATFIIILTSASQYSFADDISTRGKVIFIDMNRTSMSNMLRIKSLREELDNR
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GYIGLMNIRGDKGSDDRRSYASMGAGGRANVANEEDINFESSNKDRNIVFESATGKSAKG
CCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC
INNLTINKSINENLNFGEYGSVLGSLGQSLSDNGLKASVLGNSDIIENGQLIKNRNLCLT
CCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEECCCEEEE
AMDEYGRIPNGNVDTINKKDLSMPYGISTDYDKLIVETKEAYKNNDVIFVELGDTYRLDL
EHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEECCEEEEEE
YKPNLNEKTYESMKDNIEKNIDIYLKNIFSMVEENDTIYIASAFPSDLDYKNKRRLSPII
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEE
KLNGEGKGILSSSTTRREGIVTNLDVGVEILDNFNIKNQNMVGRKYELINRDDNKEFLMD
EECCCCCEEECCCCCCCCCCEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHH
EYQKIVSISSIRSTILNGFVSIVFLSWIVAMIAILFRKHISKNYKETTFFILKELLKIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMPLSFMITPIMNFKTPLAISLGIIIITLTIYLISKVLIKNDLKNMLFFTGLTIVIMVID
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGFGSYLMKSNVMSYDCIIGARYYGVGNEYQGVAIGSAIFTFAILLTYKNIPKWSIIVFS
CCCHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
LVILITSASPIMGANVGSAISECVAFLLFILLIYNVKIDFKKIVLLGIAVVFVLGVFVAI
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMILGSNSHLGMFVKEIYFNGPGEIIQTFSRKIEMNLKLAQTSAWVNILLTGIGVILVLM
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INQIRYFKQLMDEYPIVFKGFIASIAGCLVTLLVNDSGIVSSATAFIYVIVPMITLSINL
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
TALKE
EEECC
>Mature Secondary Structure
MRKKIISFLATFIIILTSASQYSFADDISTRGKVIFIDMNRTSMSNMLRIKSLREELDNR
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GYIGLMNIRGDKGSDDRRSYASMGAGGRANVANEEDINFESSNKDRNIVFESATGKSAKG
CCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC
INNLTINKSINENLNFGEYGSVLGSLGQSLSDNGLKASVLGNSDIIENGQLIKNRNLCLT
CCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEECCCEEEE
AMDEYGRIPNGNVDTINKKDLSMPYGISTDYDKLIVETKEAYKNNDVIFVELGDTYRLDL
EHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEECCEEEEEE
YKPNLNEKTYESMKDNIEKNIDIYLKNIFSMVEENDTIYIASAFPSDLDYKNKRRLSPII
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEE
KLNGEGKGILSSSTTRREGIVTNLDVGVEILDNFNIKNQNMVGRKYELINRDDNKEFLMD
EECCCCCEEECCCCCCCCCCEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHH
EYQKIVSISSIRSTILNGFVSIVFLSWIVAMIAILFRKHISKNYKETTFFILKELLKIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMPLSFMITPIMNFKTPLAISLGIIIITLTIYLISKVLIKNDLKNMLFFTGLTIVIMVID
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGFGSYLMKSNVMSYDCIIGARYYGVGNEYQGVAIGSAIFTFAILLTYKNIPKWSIIVFS
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LVILITSASPIMGANVGSAISECVAFLLFILLIYNVKIDFKKIVLLGIAVVFVLGVFVAI
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMILGSNSHLGMFVKEIYFNGPGEIIQTFSRKIEMNLKLAQTSAWVNILLTGIGVILVLM
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INQIRYFKQLMDEYPIVFKGFIASIAGCLVTLLVNDSGIVSSATAFIYVIVPMITLSINL
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
TALKE
EEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA