Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 126209380

Identifier: 126209380

GI number: 126209380

Start: 2153314

End: 2155281

Strand: Direct

Name: 126209380

Synonym: APL_1920

Alternate gene names: NA

Gene position: 2153314-2155281 (Clockwise)

Preceding gene: 126209379

Following gene: 126209381

Centisome position: 94.67

GC content: 44.05

Gene sequence:

>1968_bases
ATGCCAAAAATAAACTTGAATGAAACGACCCTTTTACCCTTTGTCAGCCGGCAAATCGAACAAAACGATGCTTTTACTCT
GTTAAACGGATTATGTCAGTGGCTTAGAGCCGACAAGCCGGAACAAGCGGTCGAAAAATTAGAATTTTTTACCGATTTAC
TTAAACAACAACCGGAACTCGCTCAAGCGGTTGCTACGCTAATTTGCCGCTGGCTTTGTCAGCTACGTTTATATCCGATT
CTCGTCAGTAGCGGCATTTTAGGTCGCCAAGGTTTCGGGCGAGAAATGCGTAATCGCTTATATGAGAAACTCAACCCGTC
TTTTAAAGATGTGAATGATTTACGCGATGTGTTTATTCTCTTGTTTTGCGATCGGCATGATGTGGAATGGATTAATGCCA
TTCCGACTAAGAGCTGGTTAAATTTTCTCAATACGTTAGATCACAGTGTAAGCGAGCAGGATAGAGCTTGGCTGTATGAG
CATATTCGTCACGAAGGGTTATTTGCGATCAAAATGCTTTCGATTTGGATTGCGGCGGAGGATTTGGAACCGGAGTTAAT
TCGTTTGGATCGAACGCTGTTAGATGCCGATTCACCGTTTGTTGCATTGCAAAAAGAAGTGTTTTTATGGTTAGCGGCTC
GTCGTCAAAATCAATATTATGACGATAGCCACTTACAGGTGATGTTTAACCAATCACGCGAATTGGTGGATCGCTTACAG
AAAAAAGGATCGATAGCCGGTTCGTCACTTGGGGTGGCACATTTGCTTGAACGTTTAAGTCAAACCTTAGATCGTTTGGC
GATGTTGATGGAATTATTTTCTACCAACCGAGTCGCTCGTTTACGCGTGTTGCAAATTACTAAAATGTTGGCGGAAGCGG
CGGCAAAACAGCACAGTATTTCCGACTTATGGAAACAAAGTGTCAAAATGCTTTCTCGCAGTATTACCCAACACACCAGT
GATCACGGCGAGCACTATATTACTCGAGATAAAAAAGAATATTTCAGTATGTTTTATTCCGCTGCCGGCGGTGGCGTGCT
GATTGCGCTGATGGCGCTCTTTAAAGTGTATCTGGGTGGAATGATTGACGATAAAGTCTGGAAAGGTATTGCGGAAGGTT
TGAACTACGGCATCGGTTTTACCGTTATCTTTATGTTGCATTTTACAGTAGCAACCAAACAGCCGGCGATGACTGCCGCA
CGTTTTGCCGAAGCGGTCGAGAGAAACCCTCAGGGAAGTGCGGTGAATATGAAACTGGCGCAATTGTTGGTGGACGTATT
GCGTTCACAAAGCATTGCAGTACTGGGGAATGTGATTGTGTCGATGAGTGTAGCGGCATTAATTGCTTACGGCTATGCCG
AACACACCGGAAAAGCGTTATTAGACAGTGAAATGGTGCAATATCAGCTAAGCTCGATTGACCCGACCAAAGGAACCTTA
TGGTTTGCGGCTATTGCCGGTTTGTGGTTGTTCTGCTCGGGGATTATTTCCGGCTACTTTGACAACCGCAGCAACTATTT
AAATACCCGTATGCGGTTAAGACAGCACCCGTGGTTAAAGGCGATTTTGCCATTATCCATCCGAGAGAAATTTGCTGATT
ATGTGCATGATAATATCGGTTCGATTATCGGTAACTTAGGCTTCGGTATGTTGCTTGGTATTACCGGTGTGATTGGTTAT
TGGTTAGGATTACCGCTTGATATTCGCCACGTTGCCTTCTCTTCGGCGAATGTCGGCTATGCGGTGGTGAGTGAATCATT
AGGCTGGCAAGTATTACTGCAAAGCATCTGCTTTGTGTTGATTATCGGTGCGGTTAACTTGATTGTCAGTTTCTCTCTAA
CGCTATGGATTGCGCTGCGTTCACGCAATACCGAAATTGATAGCTGGCGGGAAATTTTAAAATGCTTATGGGAAATTATC
CGTAAGCGCCCGTTAAGTTTATTTTTGCCGGTTCAGTTAAATAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACGGTAAGGGAAACCTTACCGTTTTGTTTTGAACTTTTTTCCGTAAAACCAGCTCGGAATGATTAAAATTAATGAAAAAT
AGGAATAAATAGAATCAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAACGATACAAGCGGTCTAATTTGCAAAGATTTTTACAAATTAGACCGCTTTTTTTATCTCTTTTTAATATGTTTAAA
ACTTTAGTCATAAATTTTAG

Product: site-specific recombinase

Products: NA

Alternate protein names: Site-Specific Recombinase Transmembrane Protein; Site-Specific Recombinase Gcr; Site-Specific Recombinase Prophage Insertion; Site-Specific Recombinase-Like Protein; Site-Specific Recombinase Protein Gcr; Adventurous Gliding Motility Protein AgmG; Adventurous Gliding Motility Protein

Number of amino acids: Translated: 655; Mature: 654

Protein sequence:

>655_residues
MPKINLNETTLLPFVSRQIEQNDAFTLLNGLCQWLRADKPEQAVEKLEFFTDLLKQQPELAQAVATLICRWLCQLRLYPI
LVSSGILGRQGFGREMRNRLYEKLNPSFKDVNDLRDVFILLFCDRHDVEWINAIPTKSWLNFLNTLDHSVSEQDRAWLYE
HIRHEGLFAIKMLSIWIAAEDLEPELIRLDRTLLDADSPFVALQKEVFLWLAARRQNQYYDDSHLQVMFNQSRELVDRLQ
KKGSIAGSSLGVAHLLERLSQTLDRLAMLMELFSTNRVARLRVLQITKMLAEAAAKQHSISDLWKQSVKMLSRSITQHTS
DHGEHYITRDKKEYFSMFYSAAGGGVLIALMALFKVYLGGMIDDKVWKGIAEGLNYGIGFTVIFMLHFTVATKQPAMTAA
RFAEAVERNPQGSAVNMKLAQLLVDVLRSQSIAVLGNVIVSMSVAALIAYGYAEHTGKALLDSEMVQYQLSSIDPTKGTL
WFAAIAGLWLFCSGIISGYFDNRSNYLNTRMRLRQHPWLKAILPLSIREKFADYVHDNIGSIIGNLGFGMLLGITGVIGY
WLGLPLDIRHVAFSSANVGYAVVSESLGWQVLLQSICFVLIIGAVNLIVSFSLTLWIALRSRNTEIDSWREILKCLWEII
RKRPLSLFLPVQLNK

Sequences:

>Translated_655_residues
MPKINLNETTLLPFVSRQIEQNDAFTLLNGLCQWLRADKPEQAVEKLEFFTDLLKQQPELAQAVATLICRWLCQLRLYPI
LVSSGILGRQGFGREMRNRLYEKLNPSFKDVNDLRDVFILLFCDRHDVEWINAIPTKSWLNFLNTLDHSVSEQDRAWLYE
HIRHEGLFAIKMLSIWIAAEDLEPELIRLDRTLLDADSPFVALQKEVFLWLAARRQNQYYDDSHLQVMFNQSRELVDRLQ
KKGSIAGSSLGVAHLLERLSQTLDRLAMLMELFSTNRVARLRVLQITKMLAEAAAKQHSISDLWKQSVKMLSRSITQHTS
DHGEHYITRDKKEYFSMFYSAAGGGVLIALMALFKVYLGGMIDDKVWKGIAEGLNYGIGFTVIFMLHFTVATKQPAMTAA
RFAEAVERNPQGSAVNMKLAQLLVDVLRSQSIAVLGNVIVSMSVAALIAYGYAEHTGKALLDSEMVQYQLSSIDPTKGTL
WFAAIAGLWLFCSGIISGYFDNRSNYLNTRMRLRQHPWLKAILPLSIREKFADYVHDNIGSIIGNLGFGMLLGITGVIGY
WLGLPLDIRHVAFSSANVGYAVVSESLGWQVLLQSICFVLIIGAVNLIVSFSLTLWIALRSRNTEIDSWREILKCLWEII
RKRPLSLFLPVQLNK
>Mature_654_residues
PKINLNETTLLPFVSRQIEQNDAFTLLNGLCQWLRADKPEQAVEKLEFFTDLLKQQPELAQAVATLICRWLCQLRLYPIL
VSSGILGRQGFGREMRNRLYEKLNPSFKDVNDLRDVFILLFCDRHDVEWINAIPTKSWLNFLNTLDHSVSEQDRAWLYEH
IRHEGLFAIKMLSIWIAAEDLEPELIRLDRTLLDADSPFVALQKEVFLWLAARRQNQYYDDSHLQVMFNQSRELVDRLQK
KGSIAGSSLGVAHLLERLSQTLDRLAMLMELFSTNRVARLRVLQITKMLAEAAAKQHSISDLWKQSVKMLSRSITQHTSD
HGEHYITRDKKEYFSMFYSAAGGGVLIALMALFKVYLGGMIDDKVWKGIAEGLNYGIGFTVIFMLHFTVATKQPAMTAAR
FAEAVERNPQGSAVNMKLAQLLVDVLRSQSIAVLGNVIVSMSVAALIAYGYAEHTGKALLDSEMVQYQLSSIDPTKGTLW
FAAIAGLWLFCSGIISGYFDNRSNYLNTRMRLRQHPWLKAILPLSIREKFADYVHDNIGSIIGNLGFGMLLGITGVIGYW
LGLPLDIRHVAFSSANVGYAVVSESLGWQVLLQSICFVLIIGAVNLIVSFSLTLWIALRSRNTEIDSWREILKCLWEIIR
KRPLSLFLPVQLNK

Specific function: Unknown

COG id: COG4389

COG function: function code L; Site-specific recombinase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74393; Mature: 74261

Theoretical pI: Translated: 8.60; Mature: 8.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPKINLNETTLLPFVSRQIEQNDAFTLLNGLCQWLRADKPEQAVEKLEFFTDLLKQQPEL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
AQAVATLICRWLCQLRLYPILVSSGILGRQGFGREMRNRLYEKLNPSFKDVNDLRDVFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
LFCDRHDVEWINAIPTKSWLNFLNTLDHSVSEQDRAWLYEHIRHEGLFAIKMLSIWIAAE
HHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHC
DLEPELIRLDRTLLDADSPFVALQKEVFLWLAARRQNQYYDDSHLQVMFNQSRELVDRLQ
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKGSIAGSSLGVAHLLERLSQTLDRLAMLMELFSTNRVARLRVLQITKMLAEAAAKQHSI
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SDLWKQSVKMLSRSITQHTSDHGEHYITRDKKEYFSMFYSAAGGGVLIALMALFKVYLGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
MIDDKVWKGIAEGLNYGIGFTVIFMLHFTVATKQPAMTAARFAEAVERNPQGSAVNMKLA
CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
QLLVDVLRSQSIAVLGNVIVSMSVAALIAYGYAEHTGKALLDSEMVQYQLSSIDPTKGTL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
WFAAIAGLWLFCSGIISGYFDNRSNYLNTRMRLRQHPWLKAILPLSIREKFADYVHDNIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIIGNLGFGMLLGITGVIGYWLGLPLDIRHVAFSSANVGYAVVSESLGWQVLLQSICFVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
IIGAVNLIVSFSLTLWIALRSRNTEIDSWREILKCLWEIIRKRPLSLFLPVQLNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure 
PKINLNETTLLPFVSRQIEQNDAFTLLNGLCQWLRADKPEQAVEKLEFFTDLLKQQPEL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA