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The map label for this gene is 126173077

Identifier: 126173077

GI number: 126173077

Start: 936285

End: 937754

Strand: Direct

Name: 126173077

Synonym: Sbal_0832

Alternate gene names: NA

Gene position: 936285-937754 (Clockwise)

Preceding gene: 126173076

Following gene: 126173078

Centisome position: 18.26

GC content: 49.93

Gene sequence:

>1470_bases
ATGAAATTACAGCGGTTGTTTAAAGGCAGTGGAATGGCGTTGTGGAGTCTATTCTGCGTTGCAATATTGAGCGGATTCTC
ACCTGCAGCATGGGCTATGACAGAAGGGGCAGATCGGCTTAATTTAACCGCCGCGAGCGTGGGTTATGTCGCTGTCTGTG
TGTTTGTGCTGGCTTATGTACTTGTGATGGCCGAGGAGACATTACATTTACGCAAGTCGAAACCTGTGCTCGTTGCGGCA
GGGATCATCTGGGGCATGATAGGTTTTGTCTATATGCAAAACGGCATGTCCGAAGTGTCGGAAGCGGCATTCAAGCAAAA
CTTGCTCGAGTACGCCGAGCTACTGCTCTTCTTGCTGGTGGCGATGACGTATATCAATGCCATGGAAGAACGTAATCTGT
TCGATGCGATCCGCGGCTGGCTTGTGGGCCGTGGTTTTAGCCTACGAACCGTGTTTTGGTTAACGGGCTTTATGGCGTTT
TTCATCTCGCCCGTGGCCGATAACTTAACCACTGCTTTACTGATGTGCGCTGTGGTGATGAAGGTTGGGGCAGGGCAACG
CAAGTTTATAACCCTTGCCAGTATCAACATTGTCGTAGCGGCCAACGCGGGTGGCGCGTTTAGCCCCTTTGGTGACATCA
CGACCTTAATGGTATGGCAAAAGGGCCTAGTGCACTTTGGCGATTTCTTTAATCTGTTCATTCCCGCCCTCGTTAACTTT
GCCTTACCCGCCGCCATTATGAGTGTGTTTATCCCGCATTTTGTGCCTGAGCCTGAAAAAGAGCATGTGTACACTAAGCC
TGGTGCTAAGCGTATTGTAGGGCTGTTTTTACTTACCATTGCTACGGCAGTGAGTGCCCATTCCTTCTTAGGTATGCCGC
CTGTACTGGGCATGATGACGGGATTAGGCTTCCTGCAATTCTTTGGATTTTACCTGCGTAAAACCTTCAATCGTTCCGTT
GCCCGCGAACGTGAAAAGGCGGAATTAAGACAAGACAAATTACGCCTGCAGCAACTTGGTAGTGTGGTGCCATTTGATGT
GTTCAGTCGCATTTCCCGTGCCGAGTGGGATACTTTGCTGTTCTTTTATGGCGTGGTGTTATGTGTCGGCGGCCTAGGTT
TTATGGGATATTTGAGCTTAGTGTCTGAGGCCATGTACTCGCACTGGGATGTCACCTATGCCAACGTTGCCGTGGGTTTA
CTCTCGTCAGTGATTGATAATATTCCTGTGATGTTTGCGGTATTGACCATGAATCCCGATATGGCATTGGGACAGTGGTT
ATTGGTTACCCTGACAGCGGGTGTGGGCGGTAGTTTGCTCTCGATTGGGAGTGCTGCAGGGGTTGCTCTAATGGGGCAAG
CACGCGGCATTTACACCTTTGGGGCGCATCTACGGTGGACGCCTGTGATAGCTTTAGGTTATGTGGCGAGTATTTTAGTG
CACATGTGGTTAAACGCCGCGATGTTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGTTATAGGGTAATGCATAGAAAGTTGCGTTTTATCAACATTTGCTATGCCGAAGCTATGGTAATTTTCGACTAATTTC
CTACGTAGAGATGAACTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACTGCGTTAGCTTGATTATCGTTTATCGAGACAGGCTTGTCTCACGAAAATTAACTATTTGCTGGCTTGGGTTAGCAAG
ATCACATTAATCATTGGTTG

Product: citrate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 489; Mature: 489

Protein sequence:

>489_residues
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYVLVMAEETLHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLASINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVSAHSFLGMPPVLGMMTGLGFLQFFGFYLRKTFNRSV
AREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGL
LSSVIDNIPVMFAVLTMNPDMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYVASILV
HMWLNAAMF

Sequences:

>Translated_489_residues
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYVLVMAEETLHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLASINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVSAHSFLGMPPVLGMMTGLGFLQFFGFYLRKTFNRSV
AREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGL
LSSVIDNIPVMFAVLTMNPDMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYVASILV
HMWLNAAMF
>Mature_489_residues
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYVLVMAEETLHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLASINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVSAHSFLGMPPVLGMMTGLGFLQFFGFYLRKTFNRSV
AREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGL
LSSVIDNIPVMFAVLTMNPDMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYVASILV
HMWLNAAMF

Specific function: Unknown

COG id: COG1055

COG function: function code P; Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CitM (TC 2.A.11) transporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000802
- InterPro:   IPR004680 [H]

Pfam domain/function: PF03600 CitMHS [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53453; Mature: 53453

Theoretical pI: Translated: 9.02; Mature: 9.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
5.1 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
5.1 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYV
CCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVMAEETLHLRKSKPVLVAAGIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLV
HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAFFISPVADNLTTALLMCAVVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVGAGQRKFITLASINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
HHCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVSAHSFLGMPPVLGMMT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
GLGFLQFFGFYLRKTFNRSVAREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGLLSSVIDNIPVMFAVLTMNPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEECCCC
MALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYVASILV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
HMWLNAAMF
HHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYV
CCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVMAEETLHLRKSKPVLVAAGIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLV
HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAFFISPVADNLTTALLMCAVVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVGAGQRKFITLASINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
HHCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVSAHSFLGMPPVLGMMT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
GLGFLQFFGFYLRKTFNRSVAREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGLLSSVIDNIPVMFAVLTMNPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEECCCC
MALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIALGYVASILV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
HMWLNAAMF
HHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]