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The map label for this gene is 125625037

Identifier: 125625037

GI number: 125625037

Start: 2230238

End: 2232016

Strand: Reverse

Name: 125625037

Synonym: llmg_2272

Alternate gene names: NA

Gene position: 2232016-2230238 (Counterclockwise)

Preceding gene: 125625040

Following gene: 125625036

Centisome position: 88.24

GC content: 32.88

Gene sequence:

>1779_bases
ATGGTGAGAAAAAAAGCTAATCGACCATTCGGTTTGATTTTTAAATATTTACGAGAGTTTTCAAAATTTTGGTTTGAATA
TATCTCGGTTTTTATAGGAACAACTTTAGCAATTACTTTTGTGATTATTCCTCTGTTAGAATCAATCTCGGGCCTTATTA
TGCGTCTGTCAGGAATTCCCTATGTTTCTTATAATAATCTGGGGAATTTGATTCAAAATCATTTCTTGGGCGTTCTGGGA
CTTCTAATCATTTTATTTTTATTAATTTTTCTAGTCTATGTTCAATTTATTGTTCAATTTAAAGGAATTCGATTGATTCA
GTCAAGAAGTTTGACTTTGAAAAATTTGTTTAAGGAAGTTGTCTCATCTGCGAAAAAGGTTAAAATTCAACAGTTAGGCT
TTTTCTTATTTTATTTTCTACTAATTATTCCTTTTGGGAGATATGTTTTTAGTACACCGCTTTTGTCAAAAATCAAGATT
CCGGTTTTTACACTTGAATTTTTCCTAAAAAGTTGGCAAAATATGCTGATTTTAGTGTTATTTTATGCTATTACTTTCTG
GATTAGCACGCGTTTGATTTTAACTCTTCCGCTTATGATTCTAAAAGGTCAACCCTTGAAATTGGCGATAAAAGAGAGTT
TAAAACGGACCAAGGGAGTTAGAAAATTCTTTAGACTTTCTGTTTATTTTGGACTTATCGGTTTATTTAGTATAATAATG
CAGGGGCTTCTTTTTATGGGGGGCTACTTTGCGCAAGATTATCTTGATAAAACTTCCTTTGCTTTGATTGGGGCAGTTTC
TATATTGGATTTGATTTGGTTGGGAAGCTTGATTATTTCTACTTTGAGTTTGATGATGCTTTTTAGTTATTTGATTAATG
AAGCTCAAATGGAAAGCTTTGAAGTTCCTAAAAAAGCGCCTAAAGGCCGCTTGAAGTATAAGGTGATTTTTTCTAGTTTG
ACGATTTTACTTTTTGCTTTAGTGAGTTGGACTTATGTAGAAGGATTTATGGATACTGTTCCGCTGACAATTTCTCATCG
AGGAGTTGATGAGGAAAATGGTGTGCAAAATACTATCCCAGCATTAGAAGCAACAGCAAAAGCAAAACCAGATTATGTTG
AAATTGATATTCAAGAAACGAAAGATCATCAATTTGTCGTCTTTCATGACCCAACATTAAAAGATTTAGCTGGAATTGAT
AGTCCGCCGCAAAAACTTACCTTGGCAGAATTGACAAATACGGTCGTTTCTGAAAATGGTAAAAAAGCTTTAATTCCAAG
TTTTGATGATTATTTATCGGCCGCTGAAAAAATAAATCAAAAATTATTGGTTGAGATTAAAGTATCTCCATTAGACTCTC
CAAAGATGGTTGAAAACTTTAGTAAAAGATATGGTGCAAGACTTTTAAAGGATAAAGCAATGATTCATTCTTTAGATTAT
AATGCGCTCTTGATTGAACAAAAAATTAATCCGAAGATTAAAGTCAGTTTTATCCTTCCTTTCAATCTTCTTTTTCCCCA
AACTAAAATGTCTGCTTATACAATGGAAGCGACGACACTTACCAGTAGTTTTGTGGACAAAGCACAGGCTAAACATCAAA
TGGTTTTCGCTTGGACAGTTAACGATGAAACGGATATGAGAGAACAAATGTTTAATGGAGTGAACGGGATTATCACTGAT
AATCTTGATGACTTAAAAGGCGTCATTTCCGAAGATGATGAAAGTCCAAGTTATGCACAACGTATTTTAAGAATGACTTC
ACTAATGGAAATAGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAAGCACTTTTTATTTTATAAATTTGATATAATGTAATAAAATTTATTCCACCTAGATAGAGGTGGGGAAGGATATA
AAGGATGGGAGTTAAAAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTTAAAAGAGGAATATATGTTAAAAGTAACAAATTTAACGGGTGGATATTTGGGACACCCTGTCTTAAAAGAACTTAA
TTTTGAAATTAAAGAAGGAG

Product: hypothetical protein

Products: alcohol; sn-glycerol 3-phosphate

Alternate protein names: Glycerophosphodiester Phosphodiesterase; Glycerophosphoryl Diester Phosphodiesterase Family Protein; Glycerophosphodiester Phosphodiesterase Family Protein; Periplasmic Glycerophosphoryl Diester Phosphodiesterase; Glycerophosphodiesterase; GLPQ Related Phosphodiesterase; Ypothetical Protein SMU.

Number of amino acids: Translated: 592; Mature: 592

Protein sequence:

>592_residues
MVRKKANRPFGLIFKYLREFSKFWFEYISVFIGTTLAITFVIIPLLESISGLIMRLSGIPYVSYNNLGNLIQNHFLGVLG
LLIILFLLIFLVYVQFIVQFKGIRLIQSRSLTLKNLFKEVVSSAKKVKIQQLGFFLFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKI
PVFTLEFFLKSWQNMLILVLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQPLKLAIKESLKRTKGVRKFFRLSVYFGLIGLFSIIM
QGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALIGAVSILDLIWLGSLIISTLSLMMLFSYLINEAQMESFEVPKKAPKGRLKYKVIFSSL
TILLFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPALEATAKAKPDYVEIDIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGID
SPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALIPSFDDYLSAAEKINQKLLVEIKVSPLDSPKMVENFSKRYGARLLKDKAMIHSLDY
NALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLTSSFVDKAQAKHQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVNGIITD
NLDDLKGVISEDDESPSYAQRILRMTSLMEIE

Sequences:

>Translated_592_residues
MVRKKANRPFGLIFKYLREFSKFWFEYISVFIGTTLAITFVIIPLLESISGLIMRLSGIPYVSYNNLGNLIQNHFLGVLG
LLIILFLLIFLVYVQFIVQFKGIRLIQSRSLTLKNLFKEVVSSAKKVKIQQLGFFLFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKI
PVFTLEFFLKSWQNMLILVLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQPLKLAIKESLKRTKGVRKFFRLSVYFGLIGLFSIIM
QGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALIGAVSILDLIWLGSLIISTLSLMMLFSYLINEAQMESFEVPKKAPKGRLKYKVIFSSL
TILLFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPALEATAKAKPDYVEIDIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGID
SPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALIPSFDDYLSAAEKINQKLLVEIKVSPLDSPKMVENFSKRYGARLLKDKAMIHSLDY
NALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLTSSFVDKAQAKHQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVNGIITD
NLDDLKGVISEDDESPSYAQRILRMTSLMEIE
>Mature_592_residues
MVRKKANRPFGLIFKYLREFSKFWFEYISVFIGTTLAITFVIIPLLESISGLIMRLSGIPYVSYNNLGNLIQNHFLGVLG
LLIILFLLIFLVYVQFIVQFKGIRLIQSRSLTLKNLFKEVVSSAKKVKIQQLGFFLFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKI
PVFTLEFFLKSWQNMLILVLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQPLKLAIKESLKRTKGVRKFFRLSVYFGLIGLFSIIM
QGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALIGAVSILDLIWLGSLIISTLSLMMLFSYLINEAQMESFEVPKKAPKGRLKYKVIFSSL
TILLFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPALEATAKAKPDYVEIDIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGID
SPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALIPSFDDYLSAAEKINQKLLVEIKVSPLDSPKMVENFSKRYGARLLKDKAMIHSLDY
NALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLTSSFVDKAQAKHQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVNGIITD
NLDDLKGVISEDDESPSYAQRILRMTSLMEIE

Specific function: Unknown

COG id: COG4781

COG function: function code C; Membrane domain of membrane-anchored glycerophosphoryl diester phosphodiesterase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: 3.1.4.46

Molecular weight: Translated: 67524; Mature: 67524

Theoretical pI: Translated: 9.81; Mature: 9.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVRKKANRPFGLIFKYLREFSKFWFEYISVFIGTTLAITFVIIPLLESISGLIMRLSGIP
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YVSYNNLGNLIQNHFLGVLGLLIILFLLIFLVYVQFIVQFKGIRLIQSRSLTLKNLFKEV
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHH
VSSAKKVKIQQLGFFLFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTLEFFLKSWQNMLILVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYAITFWISTRLILTLPLMILKGQPLKLAIKESLKRTKGVRKFFRLSVYFGLIGLFSIIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALIGAVSILDLIWLGSLIISTLSLMMLFSYLINEAQMESF
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
EVPKKAPKGRLKYKVIFSSLTILLFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIP
CCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHH
ALEATAKAKPDYVEIDIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDSPPQKLTLAELTNTVVSENG
HHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
KKALIPSFDDYLSAAEKINQKLLVEIKVSPLDSPKMVENFSKRYGARLLKDKAMIHSLDY
CEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLTSSFVDKAQAKHQMVFAWTV
CEEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHCCCHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC
NDETDMREQMFNGVNGIITDNLDDLKGVISEDDESPSYAQRILRMTSLMEIE
CCCHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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CCCHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: glycerophosphodiester; H2O

Specific reaction: A glycerophosphodiester + H2O = an alcohol + sn-glycerol 3-phosphate

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA