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The map label for this gene is icaA [H]

Identifier: 125624041

GI number: 125624041

Start: 1181861

End: 1183993

Strand: Direct

Name: icaA [H]

Synonym: llmg_1215

Alternate gene names: 125624041

Gene position: 1181861-1183993 (Clockwise)

Preceding gene: 125624040

Following gene: 125624042

Centisome position: 46.72

GC content: 31.32

Gene sequence:

>2133_bases
TTGCTTTGTTGTGGATTGGCTTATTATGTTTCAACCAAAAAAAGATTAATCTATAATCTAGCCACACTGATTGCTTCCTT
GTGGTTTGTCACGCTTCCTATTATCATTTTTCAATTTCTCTTTAAATTATTAATTGAACATCAAGGCTTTGATTTCAGTA
TCGTCAGTAATATGGATATTCGTTATTTGATTGTTCCATTTATGCCGATTATGTATTTAAGTTTTTGTAAATTTACGGGA
ATTGATGTCAAACAATTAGGTAAAAATATCAAGTCTACCGTCTATGTTCTCTTGGTAATTTATTTGGTAGCCCTGGTTGT
TTATTCGGGAACTCAGATAAATATTACTTTTAATTTTGCTCAAGAAGGTTTCTTTAATAGTATTGAACTTAACTATAGTG
CTTTTCTAGCTCATTGGATAGAGGGTTTAACAGTAGTCTCTCAGTTTGTTCTACCGATTATAGCTTTTGCTTTGGTCATC
GGCTATAAAGGGGAGAAATCAAAGAGAAAAATATTCTCTTTAAAACCAATCTATGTTTTAATCTTGGTTGCACTTGGAGT
TTATGCCTATATCTTTCTACTCAATGCTCCAAGTAATTTTATCCAATTTAATGAAAAAATCTTTAATAGCTATTTTGCAT
TGCAAGTATTTGAAGTTGGTGTCATTATGCTTTTGACAATCTATACTGGATTGAAAAAGTTTATCAGACCTCGAACAAAA
ATATTGTTATATATCGGTTCAAGTCTTCCTTTTCTTTATTTATATATTGTAAGATATCACTATTGGAAACAGAGCTATTT
GGTGATTGATGTATTTGACCGAATCAATTACATTTTCTTTATCTTTTCAGTTTTTGTTTTCCTATACTATACAGTAGAAG
TTATCATTCTATGGTATTCTTACAATAAAAGACAAAGGGTCAATGCTTTGGACTTACGAACTGATGGGATTCAAAAACAA
TTTCACATTTATGTCCTGATTCCATGTCTGAACGAAGAGTTGGTCATTCAAACAACTTTAAGAAGTATTTTGAAAAATAA
TTATAAAAATTTAGTTGTCACAGTTATTGATGATGCAAGTGATGACCGAAGTTTAGAAAAGATATCAGAAATTAATGATT
CTCGTTTAAATGTTTTAAGGAGAATTAAACCAAATGCGCAAAAAGGAAAAGGAACCGCGCTTAATTGGGCCTATTATCAA
ATTAGTGAACAGATTCAAGCGAAAGGAATTGCTCCTGAGGAAGTATTGATAGCAATTATTGATGCTGATACAAAACTTGA
AACTGATTATTTTGAAAAAGTCAATCGTGCATTTAATTATGATGATAAGCTCACTGGTCTTCAATCAAAAGTTCGTGTCG
CCAATTTATTAAAGGATTCGTCGCAAGACCTTGAATTTTCCGAGATTATTAATGCCACTCAAATGTTTCGAACTTTGACT
AATACAGTTGCTTTTGGTGGGAACGGGCAGTTTTGTAAATTGAGCACTCTTCAAGCTTTAAATGAAGAACCGTGGACAGA
TTCACTTGTGGAAGATTTTGATTTATCAACACGCCTTTTTCTCTCAGATATTGAAATGAAAAATGCACAATATGATGATA
TTTATATTGAACAAACTGGAATTATCAATGATAATGAAGCTTTGGTCAAGCAACGAGTCCGTTGGGCTCAGGGTAATATT
CAATCATCAAAATATATTGTACCAACGATTCGTTCGAAAAATCTGGTTTGGAAACAAAAATTTGAGATACTGATGACTTT
ATTTAAACCTTGGTTAATGGGAATTGAGTATATCATTGTAATTTATACTATGATTATGATTATCAATTCTGCGATTTTAA
CGGGAATTACTCAATCACTTAAAATTGTTGTTATCCTTTTTATTGTGATGTCTATTTACATTATCATTGTCAACTTTGTT
TGGGCTCTGCTTTATAATAGAGGGAAAAACAATGAAAAAATGAAGGCTTGGGATGTCCTGAAAGATACGACTAATTTAAC
TAAATTCTTATTGATTTTGACTCAAATCTATCCGCAGTCAGCGATTCGGTTTTTCAACTCTAAAAATGACTGGGTGAAAA
CAAATCGTCAAGAGGAAAGTATTGATAAAAATTTGAATGAAGACAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGGCTCAAATCGGTTAATCGTATCTTTAACTTATTTAATTGGTGGAGAATTTGCTGTTCCTCAACTTTTCCTTTTCGCT
TTTTAATTGCCTTATTCACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTAAAAACCCTACCGTTTCGGTGGGTTTTTTCTTCTTAAATTTATTAAATCAGTATTTTTGCTATAAATATGCTAAACT
GGTTGTAGTTTCAAAAATAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: PNAG synthase; Poly-beta-1,6-GlcNAc synthase; Biofilm polysaccharide intercellular adhesin synthesis protein IcaA; Biofilm PIA synthesis protein IcaA; Intercellular adhesion protein A; N-acetylglucosaminyltransferase IcaA [H]

Number of amino acids: Translated: 710; Mature: 710

Protein sequence:

>710_residues
MLCCGLAYYVSTKKRLIYNLATLIASLWFVTLPIIIFQFLFKLLIEHQGFDFSIVSNMDIRYLIVPFMPIMYLSFCKFTG
IDVKQLGKNIKSTVYVLLVIYLVALVVYSGTQINITFNFAQEGFFNSIELNYSAFLAHWIEGLTVVSQFVLPIIAFALVI
GYKGEKSKRKIFSLKPIYVLILVALGVYAYIFLLNAPSNFIQFNEKIFNSYFALQVFEVGVIMLLTIYTGLKKFIRPRTK
ILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVIDVFDRINYIFFIFSVFVFLYYTVEVIILWYSYNKRQRVNALDLRTDGIQKQ
FHIYVLIPCLNEELVIQTTLRSILKNNYKNLVVTVIDDASDDRSLEKISEINDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQ
ISEQIQAKGIAPEEVLIAIIDADTKLETDYFEKVNRAFNYDDKLTGLQSKVRVANLLKDSSQDLEFSEIINATQMFRTLT
NTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEEPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEMKNAQYDDIYIEQTGIINDNEALVKQRVRWAQGNI
QSSKYIVPTIRSKNLVWKQKFEILMTLFKPWLMGIEYIIVIYTMIMIINSAILTGITQSLKIVVILFIVMSIYIIIVNFV
WALLYNRGKNNEKMKAWDVLKDTTNLTKFLLILTQIYPQSAIRFFNSKNDWVKTNRQEESIDKNLNEDKK

Sequences:

>Translated_710_residues
MLCCGLAYYVSTKKRLIYNLATLIASLWFVTLPIIIFQFLFKLLIEHQGFDFSIVSNMDIRYLIVPFMPIMYLSFCKFTG
IDVKQLGKNIKSTVYVLLVIYLVALVVYSGTQINITFNFAQEGFFNSIELNYSAFLAHWIEGLTVVSQFVLPIIAFALVI
GYKGEKSKRKIFSLKPIYVLILVALGVYAYIFLLNAPSNFIQFNEKIFNSYFALQVFEVGVIMLLTIYTGLKKFIRPRTK
ILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVIDVFDRINYIFFIFSVFVFLYYTVEVIILWYSYNKRQRVNALDLRTDGIQKQ
FHIYVLIPCLNEELVIQTTLRSILKNNYKNLVVTVIDDASDDRSLEKISEINDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQ
ISEQIQAKGIAPEEVLIAIIDADTKLETDYFEKVNRAFNYDDKLTGLQSKVRVANLLKDSSQDLEFSEIINATQMFRTLT
NTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEEPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEMKNAQYDDIYIEQTGIINDNEALVKQRVRWAQGNI
QSSKYIVPTIRSKNLVWKQKFEILMTLFKPWLMGIEYIIVIYTMIMIINSAILTGITQSLKIVVILFIVMSIYIIIVNFV
WALLYNRGKNNEKMKAWDVLKDTTNLTKFLLILTQIYPQSAIRFFNSKNDWVKTNRQEESIDKNLNEDKK
>Mature_710_residues
MLCCGLAYYVSTKKRLIYNLATLIASLWFVTLPIIIFQFLFKLLIEHQGFDFSIVSNMDIRYLIVPFMPIMYLSFCKFTG
IDVKQLGKNIKSTVYVLLVIYLVALVVYSGTQINITFNFAQEGFFNSIELNYSAFLAHWIEGLTVVSQFVLPIIAFALVI
GYKGEKSKRKIFSLKPIYVLILVALGVYAYIFLLNAPSNFIQFNEKIFNSYFALQVFEVGVIMLLTIYTGLKKFIRPRTK
ILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVIDVFDRINYIFFIFSVFVFLYYTVEVIILWYSYNKRQRVNALDLRTDGIQKQ
FHIYVLIPCLNEELVIQTTLRSILKNNYKNLVVTVIDDASDDRSLEKISEINDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQ
ISEQIQAKGIAPEEVLIAIIDADTKLETDYFEKVNRAFNYDDKLTGLQSKVRVANLLKDSSQDLEFSEIINATQMFRTLT
NTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEEPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEMKNAQYDDIYIEQTGIINDNEALVKQRVRWAQGNI
QSSKYIVPTIRSKNLVWKQKFEILMTLFKPWLMGIEYIIVIYTMIMIINSAILTGITQSLKIVVILFIVMSIYIIIVNFV
WALLYNRGKNNEKMKAWDVLKDTTNLTKFLLILTQIYPQSAIRFFNSKNDWVKTNRQEESIDKNLNEDKK

Specific function: N-acetylglucosaminyltransferase that catalyzes the polymerization of single monomer units of UDP-N-acetylglucosamine to produce the linear homopolymer poly-beta-1,6-N-acetyl-D- glucosamine (PNAG, also referred to as PIA), a biofilm adhesin polysaccharide.

COG id: COG1215

COG function: function code M; Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the glycosyltransferase 2 family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787259, Length=320, Percent_Identity=24.375, Blast_Score=70, Evalue=5e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001173 [H]

Pfam domain/function: PF00535 Glycos_transf_2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82594; Mature: 82594

Theoretical pI: Translated: 9.35; Mature: 9.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLCCGLAYYVSTKKRLIYNLATLIASLWFVTLPIIIFQFLFKLLIEHQGFDFSIVSNMDI
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
RYLIVPFMPIMYLSFCKFTGIDVKQLGKNIKSTVYVLLVIYLVALVVYSGTQINITFNFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEC
QEGFFNSIELNYSAFLAHWIEGLTVVSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKRKIFSLKPIYVL
CCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHH
ILVALGVYAYIFLLNAPSNFIQFNEKIFNSYFALQVFEVGVIMLLTIYTGLKKFIRPRTK
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHE
ILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVIDVFDRINYIFFIFSVFVFLYYTVEVIILWYS
EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
YNKRQRVNALDLRTDGIQKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLRSILKNNYKNLVVTVIDDAS
CCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCC
DDRSLEKISEINDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQAKGIAPEEVLIAII
CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEE
DADTKLETDYFEKVNRAFNYDDKLTGLQSKVRVANLLKDSSQDLEFSEIINATQMFRTLT
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEEPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEMKNAQYDDIYIEQTG
HHEEECCCCCEEEEHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECC
IINDNEALVKQRVRWAQGNIQSSKYIVPTIRSKNLVWKQKFEILMTLFKPWLMGIEYIIV
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYTMIMIINSAILTGITQSLKIVVILFIVMSIYIIIVNFVWALLYNRGKNNEKMKAWDVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
KDTTNLTKFLLILTQIYPQSAIRFFNSKNDWVKTNRQEESIDKNLNEDKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLCCGLAYYVSTKKRLIYNLATLIASLWFVTLPIIIFQFLFKLLIEHQGFDFSIVSNMDI
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
RYLIVPFMPIMYLSFCKFTGIDVKQLGKNIKSTVYVLLVIYLVALVVYSGTQINITFNFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEC
QEGFFNSIELNYSAFLAHWIEGLTVVSQFVLPIIAFALVIGYKGEKSKRKIFSLKPIYVL
CCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHH
ILVALGVYAYIFLLNAPSNFIQFNEKIFNSYFALQVFEVGVIMLLTIYTGLKKFIRPRTK
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHE
ILLYIGSSLPFLYLYIVRYHYWKQSYLVIDVFDRINYIFFIFSVFVFLYYTVEVIILWYS
EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
YNKRQRVNALDLRTDGIQKQFHIYVLIPCLNEELVIQTTLRSILKNNYKNLVVTVIDDAS
CCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCC
DDRSLEKISEINDSRLNVLRRIKPNAQKGKGTALNWAYYQISEQIQAKGIAPEEVLIAII
CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEE
DADTKLETDYFEKVNRAFNYDDKLTGLQSKVRVANLLKDSSQDLEFSEIINATQMFRTLT
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NTVAFGGNGQFCKLSTLQALNEEPWTDSLVEDFDLSTRLFLSDIEMKNAQYDDIYIEQTG
HHEEECCCCCEEEEHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECC
IINDNEALVKQRVRWAQGNIQSSKYIVPTIRSKNLVWKQKFEILMTLFKPWLMGIEYIIV
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYTMIMIINSAILTGITQSLKIVVILFIVMSIYIIIVNFVWALLYNRGKNNEKMKAWDVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
KDTTNLTKFLLILTQIYPQSAIRFFNSKNDWVKTNRQEESIDKNLNEDKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10496925 [H]