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The map label for this gene is 124026888

Identifier: 124026888

GI number: 124026888

Start: 1843102

End: 1844421

Strand: Reverse

Name: 124026888

Synonym: NATL1_21831

Alternate gene names: NA

Gene position: 1844421-1843102 (Counterclockwise)

Preceding gene: 124026889

Following gene: 124026885

Centisome position: 98.91

GC content: 34.62

Gene sequence:

>1320_bases
ATGATTAAAAATGTTTATTTCCTAAATTTAAAAAATAATTTTTCAGACAATGTTGGCTGGACTTGTTTTCAGTTAGGTGT
ATTTTGTTTGCCGTCCAGCGCGTTAATTTCTTGTGTATTTTTGCTTGTAGCTCTTTTTGAAGGAGGTCTTAAAAGAAGAG
ATCTCTATTGGAGGGAACATTGGAATTATCCGCTAGTGCTCGTAACTTTTTTGATGATAATTGGTTCAATTCGTTCTCAT
ACCGGCTGGCTAGCTTGGCTTGGTCTTTTTAATTGGTTGCCATTCTTCTTGTGTTTTTGGGGATTGCAACCATATTTGCT
AACTCCTGAAAGAAGAAAAAAATGTGCTTCTTGGCTTGTCTTCGGAAGTCTTCCTGTTTTAATAACTGGCTTTGGTCAGT
TATGGTTTGGGTGGGAGGGGCCTTGGCAGGTTTTTGATGGTTTAATAATTTGGTTTATTTCTCCAGGAGGAGAGCCGCTA
GGCAGATTGTCTGGTTTGTTTGATTACGCCAATATTGCTGCTGCATGGTTATCGGGTGTATGGCCATTCTGTTTGGCGTC
TGTTTTGCATCCTTTTATTCTTGGAAGAAACCGTGCTATTCCATTTGCTCTTTTAATTGCTTTTATTTCAGGAATGATTT
TGACTGACTCTAGAAATGCATGGGGTGCAATTTTTTTAGCCTTACCATTAGTTTTTGGTTCAGCATCATGGAGTTGGTTA
ATTCCTTTAATGCTTATTTGTTCTCTTCCGGTGATTATTGCGGTTTTACCATTTTTTGACTTTGGGATTCAACAATTTGC
AAGAAGTATTGTTCCTGAATCTATTTGGATGAGACTAAATGATATGCAATTCGTTGATACTAGACCTTTTGAAGCAACGC
GCATTGGTCAATGGAAAATAGCATTTAACTTAATTTTTGAGAAACCATGGTTTGGTTGGGGGGCAGCAGCTTTTTCAATT
ATTTATCCTTTAAGGACAGGCTTATCTCATGGACACTCTCATAATTTGCCTTTAGAATTAGCAATTAGTCATGGTATAAT
AGTCTCTTTTTTAATTAATATATTTGTGTTTAGCTTATTATTAATTTCTTCCTTCAAGAGAATATTTAACAATTTAAATC
TTCAACAAAATCTCATAGTAGATCGAGCTTGGTGGACCTCTACTTTAATTCTTATTTGTTTTCATGCGACAGATATTCCA
CTTTTTGATAGCAGAATTAATATCTTAGGTTGGATATTATTGATAGGTCTTAGATGTATGATCTATAATTCTACGAGCTA
CAATAATTCATTAAAACAATTTAATAATGTATTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAAGGGTAGAGATTTGGAGCGAGTCGCTTTAGCAAGAGCTTTAAGATTGCATTTAAAAAGACAAGTTATTGTTTATAGA
GGCAGAACGGCTGTATTTAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTCCTTCTTCAATTGTAATTTGTCTTTCATAAATTGAGTGTTCATTAAATATTCTGGCAGTTAAAAAGCTAGCTATAC
ATGTAATTAAGAGTGGTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 439; Mature: 439

Protein sequence:

>439_residues
MIKNVYFLNLKNNFSDNVGWTCFQLGVFCLPSSALISCVFLLVALFEGGLKRRDLYWREHWNYPLVLVTFLMIIGSIRSH
TGWLAWLGLFNWLPFFLCFWGLQPYLLTPERRKKCASWLVFGSLPVLITGFGQLWFGWEGPWQVFDGLIIWFISPGGEPL
GRLSGLFDYANIAAAWLSGVWPFCLASVLHPFILGRNRAIPFALLIAFISGMILTDSRNAWGAIFLALPLVFGSASWSWL
IPLMLICSLPVIIAVLPFFDFGIQQFARSIVPESIWMRLNDMQFVDTRPFEATRIGQWKIAFNLIFEKPWFGWGAAAFSI
IYPLRTGLSHGHSHNLPLELAISHGIIVSFLINIFVFSLLLISSFKRIFNNLNLQQNLIVDRAWWTSTLILICFHATDIP
LFDSRINILGWILLIGLRCMIYNSTSYNNSLKQFNNVLN

Sequences:

>Translated_439_residues
MIKNVYFLNLKNNFSDNVGWTCFQLGVFCLPSSALISCVFLLVALFEGGLKRRDLYWREHWNYPLVLVTFLMIIGSIRSH
TGWLAWLGLFNWLPFFLCFWGLQPYLLTPERRKKCASWLVFGSLPVLITGFGQLWFGWEGPWQVFDGLIIWFISPGGEPL
GRLSGLFDYANIAAAWLSGVWPFCLASVLHPFILGRNRAIPFALLIAFISGMILTDSRNAWGAIFLALPLVFGSASWSWL
IPLMLICSLPVIIAVLPFFDFGIQQFARSIVPESIWMRLNDMQFVDTRPFEATRIGQWKIAFNLIFEKPWFGWGAAAFSI
IYPLRTGLSHGHSHNLPLELAISHGIIVSFLINIFVFSLLLISSFKRIFNNLNLQQNLIVDRAWWTSTLILICFHATDIP
LFDSRINILGWILLIGLRCMIYNSTSYNNSLKQFNNVLN
>Mature_439_residues
MIKNVYFLNLKNNFSDNVGWTCFQLGVFCLPSSALISCVFLLVALFEGGLKRRDLYWREHWNYPLVLVTFLMIIGSIRSH
TGWLAWLGLFNWLPFFLCFWGLQPYLLTPERRKKCASWLVFGSLPVLITGFGQLWFGWEGPWQVFDGLIIWFISPGGEPL
GRLSGLFDYANIAAAWLSGVWPFCLASVLHPFILGRNRAIPFALLIAFISGMILTDSRNAWGAIFLALPLVFGSASWSWL
IPLMLICSLPVIIAVLPFFDFGIQQFARSIVPESIWMRLNDMQFVDTRPFEATRIGQWKIAFNLIFEKPWFGWGAAAFSI
IYPLRTGLSHGHSHNLPLELAISHGIIVSFLINIFVFSLLLISSFKRIFNNLNLQQNLIVDRAWWTSTLILICFHATDIP
LFDSRINILGWILLIGLRCMIYNSTSYNNSLKQFNNVLN

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50223; Mature: 50223

Theoretical pI: Translated: 8.96; Mature: 8.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKNVYFLNLKNNFSDNVGWTCFQLGVFCLPSSALISCVFLLVALFEGGLKRRDLYWREH
CCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHC
WNYPLVLVTFLMIIGSIRSHTGWLAWLGLFNWLPFFLCFWGLQPYLLTPERRKKCASWLV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHH
FGSLPVLITGFGQLWFGWEGPWQVFDGLIIWFISPGGEPLGRLSGLFDYANIAAAWLSGV
HCCCHHHHHCCHHHEECCCCHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
WPFCLASVLHPFILGRNRAIPFALLIAFISGMILTDSRNAWGAIFLALPLVFGSASWSWL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
IPLMLICSLPVIIAVLPFFDFGIQQFARSIVPESIWMRLNDMQFVDTRPFEATRIGQWKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCEEECCCCCCCCCCCCEEE
AFNLIFEKPWFGWGAAAFSIIYPLRTGLSHGHSHNLPLELAISHGIIVSFLINIFVFSLL
EEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISSFKRIFNNLNLQQNLIVDRAWWTSTLILICFHATDIPLFDSRINILGWILLIGLRCM
HHHHHHHHHHCCCCHHHHEEEHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYNSTSYNNSLKQFNNVLN
EECCCCCCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIKNVYFLNLKNNFSDNVGWTCFQLGVFCLPSSALISCVFLLVALFEGGLKRRDLYWREH
CCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHC
WNYPLVLVTFLMIIGSIRSHTGWLAWLGLFNWLPFFLCFWGLQPYLLTPERRKKCASWLV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHH
FGSLPVLITGFGQLWFGWEGPWQVFDGLIIWFISPGGEPLGRLSGLFDYANIAAAWLSGV
HCCCHHHHHCCHHHEECCCCHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
WPFCLASVLHPFILGRNRAIPFALLIAFISGMILTDSRNAWGAIFLALPLVFGSASWSWL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
IPLMLICSLPVIIAVLPFFDFGIQQFARSIVPESIWMRLNDMQFVDTRPFEATRIGQWKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHEECCCEEECCCCCCCCCCCCEEE
AFNLIFEKPWFGWGAAAFSIIYPLRTGLSHGHSHNLPLELAISHGIIVSFLINIFVFSLL
EEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISSFKRIFNNLNLQQNLIVDRAWWTSTLILICFHATDIPLFDSRINILGWILLIGLRCM
HHHHHHHHHHCCCCHHHHEEEHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYNSTSYNNSLKQFNNVLN
EECCCCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA