| Definition | Prochlorococcus marinus str. NATL1A, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008819 |
| Length | 1,864,731 |
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The map label for this gene is mntH
Identifier: 124025611
GI number: 124025611
Start: 838781
End: 840094
Strand: Reverse
Name: mntH
Synonym: NATL1_09041
Alternate gene names: NA
Gene position: 840094-838781 (Counterclockwise)
Preceding gene: 124025613
Following gene: 124025607
Centisome position: 45.05
GC content: 35.69
Gene sequence:
>1314_bases ATGGACAAATTAATCTCTAGTAAATCCATTGGTTATAGAAAAAGTCTTGGCCCTGGAATCCTTTTAGCGGCAGCATGCAT AGGCGGATCACACCTAATGTCATCTACTACAGCTGGAGCTAAATTTGGATTTTCTCTTATTGGCCTTATTTTATTGACAA ATCTAGTTAAATATCCATTTTTACTTGTCGGAACAAGATTTACAGCTGTTACTGGATTATCACTTTTAGAGGGATTTCAA AAACGTAATAAATTTTATTTGCCTATATATTTAATTGTTGGATTAATTACTGGAACCTTTACTATTTCTGCCGTTAGTTT TGTTACAGGACTCCTTTTAAAAAATATAGTAATATTTTCATCCTTCCCTCCTCTAGATTTAGCTATAGGGATATTAATAG TATGTTCATTAATATTATTTATAGGCCAATATAAAGCCCTTGATAGGATATCTAAAATTCTTGTATTTTTGCTTACAGTA TTAACATTTTTTGCTGTTATATCTTTACTTTTTAAAGGCCCTGCTGGAGATATCAATATTTCATTCTTGAATAGCACTCC TTCTCCCTGGACTCTCTCAAACCTTGGTTTTCTAATTCCTCTTATGGGTTGGATGCCTGGTCCAGTAGAGCTTTGTATAT GGCCATCACTATGGATGTTTTCAAGAGCCAAAGATACGGATCACACCGCTACGCTAAAAGAAGCAGAATTCGATTTCAAT CTTGGATATTTCATCACTGTTTTAACTGCTATTTTCTTTCTAATTCTTGGTGCATACACAATGTATGGCACTGGGGATGA AATGCTTACAGGATCAGGGGTTAGTTTTGCTCAGAATTTAATTCGCTTGTATACAGAATCCATTGGTGGGTGGGCAAAGT GGATAATTGTACCTGCAGCTTTTGCTGCAATGTTTAGCACCACGCTTACATGTCTAGATGCATATCCCAGGAGCATCTCA TCAGCTCATGGTTTGATAGCTCGCTCAGACAAGGGAAATAGCTCTACTTTGAGTGAAAAAAAACGTCTCAAAAAATGGAT CATTTTTCATGTTTTTGCCTCACTTTGTGCACTTCTTATTGCCAAATCTGGAGGAATTGGTGTTAAAGACTATGTTTTCG GTGCTATGACCGGTAGTTTCCTGACAGCTCCTTTGTTTGCCTGGATGGCTATGGATACTATGAATAGCTCATTAGTAAAA AGTCAATTTCGTTATGGAATTGTTCTAAAAACAATTTGCTGGTTTGGTATTTCATTCCTCTCAGTCTTTAGTTTATTATT CATATTCAACTCATTCTTTGGTATTGGACAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTTAATAAAAAGATAGATATACCTAAAATAATAAACTTTATGTACTTAAATTGAAAAAATTAATTTAATTGTAAAAAT AATAACAACTTCTCAAATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCTCATAATTTATAATTTCGTTAAAATAAAAATAGTTAATGAAGTTAATTAAATAATTAACTTGAGGCAGAAGTATAATG TTTAAGAGCAAATTTCCAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 437; Mature: 437
Protein sequence:
>437_residues MDKLISSKSIGYRKSLGPGILLAAACIGGSHLMSSTTAGAKFGFSLIGLILLTNLVKYPFLLVGTRFTAVTGLSLLEGFQ KRNKFYLPIYLIVGLITGTFTISAVSFVTGLLLKNIVIFSSFPPLDLAIGILIVCSLILFIGQYKALDRISKILVFLLTV LTFFAVISLLFKGPAGDINISFLNSTPSPWTLSNLGFLIPLMGWMPGPVELCIWPSLWMFSRAKDTDHTATLKEAEFDFN LGYFITVLTAIFFLILGAYTMYGTGDEMLTGSGVSFAQNLIRLYTESIGGWAKWIIVPAAFAAMFSTTLTCLDAYPRSIS SAHGLIARSDKGNSSTLSEKKRLKKWIIFHVFASLCALLIAKSGGIGVKDYVFGAMTGSFLTAPLFAWMAMDTMNSSLVK SQFRYGIVLKTICWFGISFLSVFSLLFIFNSFFGIGQ
Sequences:
>Translated_437_residues MDKLISSKSIGYRKSLGPGILLAAACIGGSHLMSSTTAGAKFGFSLIGLILLTNLVKYPFLLVGTRFTAVTGLSLLEGFQ KRNKFYLPIYLIVGLITGTFTISAVSFVTGLLLKNIVIFSSFPPLDLAIGILIVCSLILFIGQYKALDRISKILVFLLTV LTFFAVISLLFKGPAGDINISFLNSTPSPWTLSNLGFLIPLMGWMPGPVELCIWPSLWMFSRAKDTDHTATLKEAEFDFN LGYFITVLTAIFFLILGAYTMYGTGDEMLTGSGVSFAQNLIRLYTESIGGWAKWIIVPAAFAAMFSTTLTCLDAYPRSIS SAHGLIARSDKGNSSTLSEKKRLKKWIIFHVFASLCALLIAKSGGIGVKDYVFGAMTGSFLTAPLFAWMAMDTMNSSLVK SQFRYGIVLKTICWFGISFLSVFSLLFIFNSFFGIGQ >Mature_437_residues MDKLISSKSIGYRKSLGPGILLAAACIGGSHLMSSTTAGAKFGFSLIGLILLTNLVKYPFLLVGTRFTAVTGLSLLEGFQ KRNKFYLPIYLIVGLITGTFTISAVSFVTGLLLKNIVIFSSFPPLDLAIGILIVCSLILFIGQYKALDRISKILVFLLTV LTFFAVISLLFKGPAGDINISFLNSTPSPWTLSNLGFLIPLMGWMPGPVELCIWPSLWMFSRAKDTDHTATLKEAEFDFN LGYFITVLTAIFFLILGAYTMYGTGDEMLTGSGVSFAQNLIRLYTESIGGWAKWIIVPAAFAAMFSTTLTCLDAYPRSIS SAHGLIARSDKGNSSTLSEKKRLKKWIIFHVFASLCALLIAKSGGIGVKDYVFGAMTGSFLTAPLFAWMAMDTMNSSLVK SQFRYGIVLKTICWFGISFLSVFSLLFIFNSFFGIGQ
Specific function: Unknown
COG id: COG1914
COG function: function code P; Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47680; Mature: 47680
Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDKLISSKSIGYRKSLGPGILLAAACIGGSHLMSSTTAGAKFGFSLIGLILLTNLVKYPF CCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH LLVGTRFTAVTGLSLLEGFQKRNKFYLPIYLIVGLITGTFTISAVSFVTGLLLKNIVIFS HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SFPPLDLAIGILIVCSLILFIGQYKALDRISKILVFLLTVLTFFAVISLLFKGPAGDINI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE SFLNSTPSPWTLSNLGFLIPLMGWMPGPVELCIWPSLWMFSRAKDTDHTATLKEAEFDFN EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEECCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCC LGYFITVLTAIFFLILGAYTMYGTGDEMLTGSGVSFAQNLIRLYTESIGGWAKWIIVPAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH FAAMFSTTLTCLDAYPRSISSAHGLIARSDKGNSSTLSEKKRLKKWIIFHVFASLCALLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKSGGIGVKDYVFGAMTGSFLTAPLFAWMAMDTMNSSLVKSQFRYGIVLKTICWFGISFL HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SVFSLLFIFNSFFGIGQ HHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MDKLISSKSIGYRKSLGPGILLAAACIGGSHLMSSTTAGAKFGFSLIGLILLTNLVKYPF CCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH LLVGTRFTAVTGLSLLEGFQKRNKFYLPIYLIVGLITGTFTISAVSFVTGLLLKNIVIFS HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SFPPLDLAIGILIVCSLILFIGQYKALDRISKILVFLLTVLTFFAVISLLFKGPAGDINI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE SFLNSTPSPWTLSNLGFLIPLMGWMPGPVELCIWPSLWMFSRAKDTDHTATLKEAEFDFN EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEECCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCC LGYFITVLTAIFFLILGAYTMYGTGDEMLTGSGVSFAQNLIRLYTESIGGWAKWIIVPAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH FAAMFSTTLTCLDAYPRSISSAHGLIARSDKGNSSTLSEKKRLKKWIIFHVFASLCALLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKSGGIGVKDYVFGAMTGSFLTAPLFAWMAMDTMNSSLVKSQFRYGIVLKTICWFGISFL HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SVFSLLFIFNSFFGIGQ HHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11248100 [H]