| Definition | Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008816 |
| Length | 1,669,886 |
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The map label for this gene is 123969143
Identifier: 123969143
GI number: 123969143
Start: 1366887
End: 1368494
Strand: Direct
Name: 123969143
Synonym: A9601_16111
Alternate gene names: NA
Gene position: 1366887-1368494 (Clockwise)
Preceding gene: 123969142
Following gene: 123969144
Centisome position: 81.86
GC content: 22.08
Gene sequence:
>1608_bases ATGATGAACCTAAAAGAAGAAAATTTAGTTATCAATAAAAGGCTTATATTTTTTTTAATATCTATTCTTCTTTTGGTTTC TTTTTGTTCAATATTTTTTATCGAGAATCATAGTTTAGTGGCTCACGATGAGTCTCTTTATGCTAATCGAGCAAAATTAA TAATAGATTCTAATAATTGGTTCACACCTTTTGAAAAGGCACATCATAAAACTATTGGTTCATATTGGTTAATTGCATTG AGTTTTAAAATGTTCGGAATCAGTGAATTTTCAGCAAGATTACCAAGTTATATATTCTCAATACTTTCTTCATTTGTATT GTTCAAAATAATTAAAGATATAAGTACTTTAGAAATTGGATTAATATCCATTTTTACATTATCTTCATCATTTCTTTGGT TCAGCTACGGCAAATATTGTAGTCCTGATACACTTTATATCTTTTTAAACTTATTAGGTATTTTATTTTTACTAAAAACA AGTAATTCTTTAAAAGAAAAAAATAAAAATAAATTTCTATTTTTAAGCGGTTTTTTTCTGTCACTTCCATTTTTTGTAAG AAGTTATTTACAACTATTACCTTTAGTCAGTATATTTCCATTGATTTATTTCAAAATAAAAAAACTAAGATATAGAAATA CGAGATATTTGATTATTGGATTTTTTGTAGGTTTAATACCTCTAATTATTTTTTACTACATTTCATATCGAACATATGGA GTTGATTCGTTAATAAGGCCATATATGTTATTAAAGGCAAAAACATTAACTGAAAATAACATATTAGAGGGTTTTTTATT TTATCCAAGGAATCTAATTTTACTATCTACACCTTTCTTTATTTTTTTAATTAATGGGACTAGATATATCCTAAAGAATA AATCCAGAGAAATTCAAATTTTATTAGTTTTTACTCCTTTTATAAATATTGTTCTCCTGATGTTTACAGCTTCAAAATAT TCTCATTATGGATTATTTACTATTCCTTTATTGGCATCAAATGCCTCTTTTGGAATTTATGAATCATTTAAAAAAAAATC ATATGAATCAAAATTGATCTTAAGAATATTTGGAGGATTAATGTTGATAATAAGTTCCTTAATATTTTTCATATCAATAT TAAATTTTCATTTAAAAATCTTTAATCAATTCTACTTAATTGAAGGATTTATAATTTCCTTTTTATCATTAATATCACTG ATTCTATCTTTAAATCTAATATATAAAACTAATTCAAAATCTATTAATATAAATAATATATTATCAATATTTTTTATCCA AATTTTTATACTAAATACGCTTTTTATTAATGGTACAATAGGAAACCCAAATACTGAAATAAAAGATTTTATTTATCAGC CCGATATAAAAAAAATAATTAATAATAACCAGATATTTATTATAGGTGAATTAGATAATAAAAATTTAAATTTATTGAAA TTTTATCTCCCACAGGCCAGGATAATTAAAAAAGAGCAAATCCCTAAAATAGAGCCAATTTATGGAATTATAAATAACAA AGATATGAAAAAATTAAATAATTCAATAAGAACTGAATTTATAAATTTGAAAGAATTTAAAGATATTAACCTCATAAAAA TAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GATATTTCTTTTTATAAAAGCTAATGTTTAAAAAAATGTATTTACCTTTAACTTCCTTTAATAAAAAACATTATTGGATA ATGAATTTTTTTTATAAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTATGGTTTGTTATAAAATTAATCAAATCTTGATTCGGTTATGAACAAAGTATTTAACTTAATCAATAGCAAATAAT TTAAAAATAAAATATCACTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535
Protein sequence:
>535_residues MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNWFTPFEKAHHKTIGSYWLIAL SFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIGLISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKT SNSLKEKNKNKFLFLSGFFLSLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQILLVFTPFINIVLLMFTASKY SHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGLMLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISL ILSLNLIYKTNSKSININNILSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN
Sequences:
>Translated_535_residues MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNWFTPFEKAHHKTIGSYWLIAL SFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIGLISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKT SNSLKEKNKNKFLFLSGFFLSLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQILLVFTPFINIVLLMFTASKY SHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGLMLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISL ILSLNLIYKTNSKSININNILSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN >Mature_535_residues MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNWFTPFEKAHHKTIGSYWLIAL SFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIGLISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKT SNSLKEKNKNKFLFLSGFFLSLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQILLVFTPFINIVLLMFTASKY SHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGLMLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISL ILSLNLIYKTNSKSININNILSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN
Specific function: Unknown
COG id: COG1807
COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62541; Mature: 62541
Theoretical pI: Translated: 10.26; Mature: 10.26
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNW CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEECHHHHCCCEEEEEECCCC FTPFEKAHHKTIGSYWLIALSFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKTSNSLKEKNKNKFLFLSGFFL HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEHHHH SLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEECCEEEEEECCCCEEEE LLVFTPFINIVLLMFTASKYSHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGL EEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH MLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISLILSLNLIYKTNSKSININNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHH LSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEE FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN EECCHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEEC >Mature Secondary Structure MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNW CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEECHHHHCCCEEEEEECCCC FTPFEKAHHKTIGSYWLIALSFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKTSNSLKEKNKNKFLFLSGFFL HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEHHHH SLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEECCEEEEEECCCCEEEE LLVFTPFINIVLLMFTASKYSHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGL EEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH MLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISLILSLNLIYKTNSKSININNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHH LSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEE FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN EECCHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA