Definition Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome.
Accession NC_008816
Length 1,669,886

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The map label for this gene is 123969143

Identifier: 123969143

GI number: 123969143

Start: 1366887

End: 1368494

Strand: Direct

Name: 123969143

Synonym: A9601_16111

Alternate gene names: NA

Gene position: 1366887-1368494 (Clockwise)

Preceding gene: 123969142

Following gene: 123969144

Centisome position: 81.86

GC content: 22.08

Gene sequence:

>1608_bases
ATGATGAACCTAAAAGAAGAAAATTTAGTTATCAATAAAAGGCTTATATTTTTTTTAATATCTATTCTTCTTTTGGTTTC
TTTTTGTTCAATATTTTTTATCGAGAATCATAGTTTAGTGGCTCACGATGAGTCTCTTTATGCTAATCGAGCAAAATTAA
TAATAGATTCTAATAATTGGTTCACACCTTTTGAAAAGGCACATCATAAAACTATTGGTTCATATTGGTTAATTGCATTG
AGTTTTAAAATGTTCGGAATCAGTGAATTTTCAGCAAGATTACCAAGTTATATATTCTCAATACTTTCTTCATTTGTATT
GTTCAAAATAATTAAAGATATAAGTACTTTAGAAATTGGATTAATATCCATTTTTACATTATCTTCATCATTTCTTTGGT
TCAGCTACGGCAAATATTGTAGTCCTGATACACTTTATATCTTTTTAAACTTATTAGGTATTTTATTTTTACTAAAAACA
AGTAATTCTTTAAAAGAAAAAAATAAAAATAAATTTCTATTTTTAAGCGGTTTTTTTCTGTCACTTCCATTTTTTGTAAG
AAGTTATTTACAACTATTACCTTTAGTCAGTATATTTCCATTGATTTATTTCAAAATAAAAAAACTAAGATATAGAAATA
CGAGATATTTGATTATTGGATTTTTTGTAGGTTTAATACCTCTAATTATTTTTTACTACATTTCATATCGAACATATGGA
GTTGATTCGTTAATAAGGCCATATATGTTATTAAAGGCAAAAACATTAACTGAAAATAACATATTAGAGGGTTTTTTATT
TTATCCAAGGAATCTAATTTTACTATCTACACCTTTCTTTATTTTTTTAATTAATGGGACTAGATATATCCTAAAGAATA
AATCCAGAGAAATTCAAATTTTATTAGTTTTTACTCCTTTTATAAATATTGTTCTCCTGATGTTTACAGCTTCAAAATAT
TCTCATTATGGATTATTTACTATTCCTTTATTGGCATCAAATGCCTCTTTTGGAATTTATGAATCATTTAAAAAAAAATC
ATATGAATCAAAATTGATCTTAAGAATATTTGGAGGATTAATGTTGATAATAAGTTCCTTAATATTTTTCATATCAATAT
TAAATTTTCATTTAAAAATCTTTAATCAATTCTACTTAATTGAAGGATTTATAATTTCCTTTTTATCATTAATATCACTG
ATTCTATCTTTAAATCTAATATATAAAACTAATTCAAAATCTATTAATATAAATAATATATTATCAATATTTTTTATCCA
AATTTTTATACTAAATACGCTTTTTATTAATGGTACAATAGGAAACCCAAATACTGAAATAAAAGATTTTATTTATCAGC
CCGATATAAAAAAAATAATTAATAATAACCAGATATTTATTATAGGTGAATTAGATAATAAAAATTTAAATTTATTGAAA
TTTTATCTCCCACAGGCCAGGATAATTAAAAAAGAGCAAATCCCTAAAATAGAGCCAATTTATGGAATTATAAATAACAA
AGATATGAAAAAATTAAATAATTCAATAAGAACTGAATTTATAAATTTGAAAGAATTTAAAGATATTAACCTCATAAAAA
TAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATATTTCTTTTTATAAAAGCTAATGTTTAAAAAAATGTATTTACCTTTAACTTCCTTTAATAAAAAACATTATTGGATA
ATGAATTTTTTTTATAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTATGGTTTGTTATAAAATTAATCAAATCTTGATTCGGTTATGAACAAAGTATTTAACTTAATCAATAGCAAATAAT
TTAAAAATAAAATATCACTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535

Protein sequence:

>535_residues
MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNWFTPFEKAHHKTIGSYWLIAL
SFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIGLISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKT
SNSLKEKNKNKFLFLSGFFLSLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG
VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQILLVFTPFINIVLLMFTASKY
SHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGLMLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISL
ILSLNLIYKTNSKSININNILSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK
FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN

Sequences:

>Translated_535_residues
MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNWFTPFEKAHHKTIGSYWLIAL
SFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIGLISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKT
SNSLKEKNKNKFLFLSGFFLSLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG
VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQILLVFTPFINIVLLMFTASKY
SHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGLMLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISL
ILSLNLIYKTNSKSININNILSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK
FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN
>Mature_535_residues
MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNWFTPFEKAHHKTIGSYWLIAL
SFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIGLISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKT
SNSLKEKNKNKFLFLSGFFLSLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG
VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQILLVFTPFINIVLLMFTASKY
SHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGLMLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISL
ILSLNLIYKTNSKSININNILSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK
FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN

Specific function: Unknown

COG id: COG1807

COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62541; Mature: 62541

Theoretical pI: Translated: 10.26; Mature: 10.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNW
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEECHHHHCCCEEEEEECCCC
FTPFEKAHHKTIGSYWLIALSFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKTSNSLKEKNKNKFLFLSGFFL
HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEHHHH
SLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEECCEEEEEECCCCEEEE
LLVFTPFINIVLLMFTASKYSHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGL
EEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
MLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISLILSLNLIYKTNSKSININNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHH
LSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK
HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEE
FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN
EECCHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MMNLKEENLVINKRLIFFLISILLLVSFCSIFFIENHSLVAHDESLYANRAKLIIDSNNW
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEECHHHHCCCEEEEEECCCC
FTPFEKAHHKTIGSYWLIALSFKMFGISEFSARLPSYIFSILSSFVLFKIIKDISTLEIG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISIFTLSSSFLWFSYGKYCSPDTLYIFLNLLGILFLLKTSNSLKEKNKNKFLFLSGFFL
HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEHHHH
SLPFFVRSYLQLLPLVSIFPLIYFKIKKLRYRNTRYLIIGFFVGLIPLIIFYYISYRTYG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VDSLIRPYMLLKAKTLTENNILEGFLFYPRNLILLSTPFFIFLINGTRYILKNKSREIQI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEECCEEEEEECCCCEEEE
LLVFTPFINIVLLMFTASKYSHYGLFTIPLLASNASFGIYESFKKKSYESKLILRIFGGL
EEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
MLIISSLIFFISILNFHLKIFNQFYLIEGFIISFLSLISLILSLNLIYKTNSKSININNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHH
LSIFFIQIFILNTLFINGTIGNPNTEIKDFIYQPDIKKIINNNQIFIIGELDNKNLNLLK
HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEE
FYLPQARIIKKEQIPKIEPIYGIINNKDMKKLNNSIRTEFINLKEFKDINLIKIN
EECCHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA