| Definition | Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008816 |
| Length | 1,669,886 |
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The map label for this gene is trkG [H]
Identifier: 123967634
GI number: 123967634
Start: 101023
End: 102426
Strand: Direct
Name: trkG [H]
Synonym: A9601_00971
Alternate gene names: 123967634
Gene position: 101023-102426 (Clockwise)
Preceding gene: 123967633
Following gene: 123967635
Centisome position: 6.05
GC content: 33.05
Gene sequence:
>1404_bases GTGAAATTCACAAGCAAGGTTTATAAGTTAAAAGATGCTTACAAAAAGCTATCTGTACCTCAATTTACTATTGTTACAGG CTTGTTTATTATTTGCCTTGGAACTTTAATTTTGAGCTCTCCATTATGTTCATCTTCAAAGGTTGGTTTGTGGGAAGCAT TTTTTACATCTACTTCTGCAATAACCGTTACTGGCTTAACCATAATAGATATTGGTAATGATTTAAATTTCTTTGGCCAA GTTTTCTTAGCTTTTATGCTTTTATCAGGAGGTCTAGGATTAATGGCTATTACAACATTTTTACAAGGGTTTGTTGTAAA GGGGACAAAGTTAAGAACTAGATTAGATAAAGGAAAGACTTTAGATGAATTTGGAGTTGGAGGAATTGGTCGAACTTTTC AAAGCATTGCTATTACTGCGATTATTATTATATCTTTGGGCGCAATTGTCTTATATTCTTTTGGATTTGTAGACATTCAA AACAATTGGGAAAGACTATGGTCCTCGATTTTTCACAGCATTTCTGCCTATAACAATGCAGGATTTTCGTTAATGTCAAA TAGTCTTCAAGACTATAGGACAAATTATTTGGTGAATAGTGTTTTTGTTTTTCTCATTGTTATGGGTGGATTGGGTTGGC GGGTTATTGATGATATTTGGAGTCATAAAAAAAGTCTTTCTTATAAGAAATTAAGCCTTCATTCCAGACTAGTTATTAGG ACAAGTTTGTCTCTAATATTGTTCGGATCATTTGGATTCTTTATCACTGAATCACTACTAAATAGTCAATTTTTTAATGA TTTAAATTTGTTTGAACGGTTAATGTCATCTATCTTCGAAACAGTTAGTGCAAGAACTGCAGGCTTTACAAATTTTCCGA TTTCTTTGAACTCTATCTCAGATACGGGCCTCTTATTATTAATGACGCTTATGTTTATTGGAGCAAGTACAGGAGGTACT GGTGGAGGCATAAAAACAACTACATTTATTGCTTTAATGGCTGCAACCAGATCAACTTTAAGAGGTCAGAAAGATGTAAT TATTAGCAATAGATTAATTTCAGATAAAGTTATTCTTAAGGCAGTTGGAATCACAGTTGGATCTTTGCTTTTTGTTCTTT TAATGGCAATGTTGCTTAGTACAACTAATACTTTTGTTAAAAAAGAATCATTCACATTTCTAGAAATTCTGTTCACTTGC ATATCAGCATTTGCAACAGTTGGTTTTGATATTGGTTTAACCTCAAAATTAAATCATTTTGGTCAATTTATTCTTATTGT GGGTATGTTTGTGGGCAGACTCGGGATCCTTTTGCTTTTAAGTGCACTTTGGCAGGCTCTTTATAAGAGTAGAATAGATA GGCAAAAGAGAATTGGCTATCCTAGGGCTGATCTATACGTTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AGATATAGATTTTTTGATATCGCAAAATACGGCGCAGGATTAACACTTATAATGTCTTTTACTGTGCCAGCATTGATAAT TTTAAATTACGGATAATATC
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTGACTGAGTTTTATTATGGCTGATTGGTGGAAGTGGACTCAAAAGAAAGAAAATGAAGAACTCACTTTTGCAGTTGT CGGCGTTGGAAGATTTGGAA
Product: Trk family sodium transporter
Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrB [H]
Number of amino acids: Translated: 467; Mature: 467
Protein sequence:
>467_residues MKFTSKVYKLKDAYKKLSVPQFTIVTGLFIICLGTLILSSPLCSSSKVGLWEAFFTSTSAITVTGLTIIDIGNDLNFFGQ VFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLRTRLDKGKTLDEFGVGGIGRTFQSIAITAIIIISLGAIVLYSFGFVDIQ NNWERLWSSIFHSISAYNNAGFSLMSNSLQDYRTNYLVNSVFVFLIVMGGLGWRVIDDIWSHKKSLSYKKLSLHSRLVIR TSLSLILFGSFGFFITESLLNSQFFNDLNLFERLMSSIFETVSARTAGFTNFPISLNSISDTGLLLLMTLMFIGASTGGT GGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILKAVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTC ISAFATVGFDIGLTSKLNHFGQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV
Sequences:
>Translated_467_residues MKFTSKVYKLKDAYKKLSVPQFTIVTGLFIICLGTLILSSPLCSSSKVGLWEAFFTSTSAITVTGLTIIDIGNDLNFFGQ VFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLRTRLDKGKTLDEFGVGGIGRTFQSIAITAIIIISLGAIVLYSFGFVDIQ NNWERLWSSIFHSISAYNNAGFSLMSNSLQDYRTNYLVNSVFVFLIVMGGLGWRVIDDIWSHKKSLSYKKLSLHSRLVIR TSLSLILFGSFGFFITESLLNSQFFNDLNLFERLMSSIFETVSARTAGFTNFPISLNSISDTGLLLLMTLMFIGASTGGT GGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILKAVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTC ISAFATVGFDIGLTSKLNHFGQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV >Mature_467_residues MKFTSKVYKLKDAYKKLSVPQFTIVTGLFIICLGTLILSSPLCSSSKVGLWEAFFTSTSAITVTGLTIIDIGNDLNFFGQ VFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLRTRLDKGKTLDEFGVGGIGRTFQSIAITAIIIISLGAIVLYSFGFVDIQ NNWERLWSSIFHSISAYNNAGFSLMSNSLQDYRTNYLVNSVFVFLIVMGGLGWRVIDDIWSHKKSLSYKKLSLHSRLVIR TSLSLILFGSFGFFITESLLNSQFFNDLNLFERLMSSIFETVSARTAGFTNFPISLNSISDTGLLLLMTLMFIGASTGGT GGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILKAVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTC ISAFATVGFDIGLTSKLNHFGQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV
Specific function: Integral membrane subunit of the KtrAB potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]
COG id: COG0168
COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003445 - InterPro: IPR004772 [H]
Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51450; Mature: 51450
Theoretical pI: Translated: 10.42; Mature: 10.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKFTSKVYKLKDAYKKLSVPQFTIVTGLFIICLGTLILSSPLCSSSKVGLWEAFFTSTSA CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCE ITVTGLTIIDIGNDLNFFGQVFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLRTRLDKGKT EEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC LDEFGVGGIGRTFQSIAITAIIIISLGAIVLYSFGFVDIQNNWERLWSSIFHSISAYNNA HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFSLMSNSLQDYRTNYLVNSVFVFLIVMGGLGWRVIDDIWSHKKSLSYKKLSLHSRLVIR CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH TSLSLILFGSFGFFITESLLNSQFFNDLNLFERLMSSIFETVSARTAGFTNFPISLNSIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC DTGLLLLMTLMFIGASTGGTGGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILK CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHH AVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTCISAFATVGFDIGLTSKLNHF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH GQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKFTSKVYKLKDAYKKLSVPQFTIVTGLFIICLGTLILSSPLCSSSKVGLWEAFFTSTSA CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCE ITVTGLTIIDIGNDLNFFGQVFLAFMLLSGGLGLMAITTFLQGFVVKGTKLRTRLDKGKT EEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCC LDEFGVGGIGRTFQSIAITAIIIISLGAIVLYSFGFVDIQNNWERLWSSIFHSISAYNNA HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GFSLMSNSLQDYRTNYLVNSVFVFLIVMGGLGWRVIDDIWSHKKSLSYKKLSLHSRLVIR CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH TSLSLILFGSFGFFITESLLNSQFFNDLNLFERLMSSIFETVSARTAGFTNFPISLNSIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCC DTGLLLLMTLMFIGASTGGTGGGIKTTTFIALMAATRSTLRGQKDVIISNRLISDKVILK CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHH AVGITVGSLLFVLLMAMLLSTTNTFVKKESFTFLEILFTCISAFATVGFDIGLTSKLNHF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH GQFILIVGMFVGRLGILLLLSALWQALYKSRIDRQKRIGYPRADLYV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]