| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
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The map label for this gene is yfbI [C]
Identifier: 123966909
GI number: 123966909
Start: 1471666
End: 1473228
Strand: Direct
Name: yfbI [C]
Synonym: P9515_16761
Alternate gene names: 123966909
Gene position: 1471666-1473228 (Clockwise)
Preceding gene: 123966907
Following gene: 123966910
Centisome position: 86.36
GC content: 27.32
Gene sequence:
>1563_bases ATGATTGATAGAAATAAATTTTTTAAAAAAGTTTTAAAGATTTGTCTGTTTATTCCTCTGATTTTCTATTACGGGAAAAA AAGTTATATAGCCTTCGATGAGGGATTTTATGCTTTGCAAGCCCGATGGATACTAGAAAAAGGCAACTGGACAATTCCTT TATGGTGGGACGAATACGTTTTAGATAGAACAAATGGGTTACAAGTGTTAATCGCTAAATCACAAGAAATATTTGGCAAA AATCTTTTCGCTGCATATTTGCCAACAACAATTGCAGCAATATTGATGTTAATAATTACTTACAAATTACATGAAGAGTT TTTTGGTAAAAATCATGCAATCGTATCTCCACTAATACTTTCTACAACATATCTTTGGTTTGACTACTCTCATTTAGCAA CTCAAGATCTTATTTATTCCAGCTTGGTAACTATTGGAGTATTTTCTTTAGTTAAAATAAAAAAACATAAAAGCAATTTC TATATTTTACTTTTTGGTACTTGGATAGGTTTAGCTTTTATGATGAAGACTTTTCTTGTAGCTGTTCCTCTTGCGGCACT AACGCCATATATCTTATCAAAAAGAAAATTATTATTTAATACATTCTTTTGGCTTGGGTTATTAATTGGATTTATTCCAT ACCTAATATGGACTTATTCTATAAACACGTATTTAGATCAGAATATTATCTTTTACTTGTTTGGAAAATTTAATTTCCTT TCTAATAAAAACGATTCTACAAATCCTTTTTATTATTATTTGTGGAACATTCCAATAACCTTTTTACCATGGAGCATTTT TTCTATTATCGGTTTATCTTCAAATACTTTAGAAAATAAAAATGGAAATGAAAAATTAATTCTGATTTATTTTCCCTTAA TTTTAATATTAATACTTAGTATTTTTTCTACAAAAACTCCTTATTATCCATTGCAAATATCTTCAATCTTATCTTTAAAT TCATATATTGGCATAAAATATTTATTCAGTTCCAAAAGATATAAATCAATAGTAATTTTTATTACCTCGAGATTAATACC TTTATTTATCAGTGCTTTAGTAGTTACATATATTATTTTCTTCAAAAGTGTACTGAATTTAACTATAAAAGAAAATATAT TTATTATTTTAGGATTAATATCGTTTTCGATAGCTTGGTCATACATAAAAGATACAAGTAACCTCAAAAAGATTTTTACA ACTTTAATTATTGGTCCTTATCTATTGACTGCACTACTATTGCAGTCGGGTTTATTTACAGACAGATCAAGAGAATTAAG AGAAACTATGGAATATCTATCTTCATTAGATATCCTGAAGAATCAAGTCATTAAGGTTGACAAAAGGAACATTGGGAATG AAATAGCGCAATCAAAAATTATACGAATTTCTCTCCTAACTCCTAATTTAGGGGATGGAATTGAAAATTTAGAGAAAATG AACCCCTCAGATTTAGCATGGTCTAATTTGTCTTCAAAGGAACTTAGCGAAACTGATTCTTTTCAAATAATTTATGATTA TGAAATTTTATCTCCTTGGAAATTAATAAGAAAAAATCGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCGCCGGTATAGCTCAGAGGAAGAGCAACTGTTTCGTAAACAGAAGGTCATTGGTTCAATTCCGATTATCGGCATTTAAG TTTCATACATTTGCAATAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGTATATTAAGATTGTTTTGATAAAAATTAAATTTAATGAAATCTGTTAATACATGGAATCTTTCAAATAATAAAATTC ACCAATTATTTAAAAACGAT
Product: dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransferase
Products: NA
Alternate protein names: Dolichyl-Phosphate-Mannose-Proteinmannosyltransferase; Glycosyl Transferase Family Protein; Family; Glycosyltransferase
Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 520
Protein sequence:
>520_residues MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYVLDRTNGLQVLIAKSQEIFGK NLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLILSTTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNF YILLFGTWIGLAFMMKTFLVAVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILSIFSTKTPYYPLQISSILSLN SYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIFFKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFT TLIIGPYLLTALLLQSGLFTDRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR
Sequences:
>Translated_520_residues MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYVLDRTNGLQVLIAKSQEIFGK NLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLILSTTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNF YILLFGTWIGLAFMMKTFLVAVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILSIFSTKTPYYPLQISSILSLN SYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIFFKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFT TLIIGPYLLTALLLQSGLFTDRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR >Mature_520_residues MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYVLDRTNGLQVLIAKSQEIFGK NLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLILSTTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNF YILLFGTWIGLAFMMKTFLVAVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILSIFSTKTPYYPLQISSILSLN SYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIFFKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFT TLIIGPYLLTALLLQSGLFTDRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR
Specific function: Unknown
COG id: COG1807
COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family
Gene ontology:
Cell location: Integral membrane protein (Potential) [C]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60473; Mature: 60473
Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEHHHH LDRTNGLQVLIAKSQEIFGKNLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLIL HCCCCCCEEEEECCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH STTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNFYILLFGTWIGLAFMMKTFLV HHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH AVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEC SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILS CCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH IFSTKTPYYPLQISSILSLNSYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIF HHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFTTLIIGPYLLTALLLQSGLFT HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHC NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEHHHH LDRTNGLQVLIAKSQEIFGKNLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLIL HCCCCCCEEEEECCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH STTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNFYILLFGTWIGLAFMMKTFLV HHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH AVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEC SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILS CCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH IFSTKTPYYPLQISSILSLNSYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIF HHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFTTLIIGPYLLTALLLQSGLFT HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHC NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA