Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is yfbI [C]

Identifier: 123966909

GI number: 123966909

Start: 1471666

End: 1473228

Strand: Direct

Name: yfbI [C]

Synonym: P9515_16761

Alternate gene names: 123966909

Gene position: 1471666-1473228 (Clockwise)

Preceding gene: 123966907

Following gene: 123966910

Centisome position: 86.36

GC content: 27.32

Gene sequence:

>1563_bases
ATGATTGATAGAAATAAATTTTTTAAAAAAGTTTTAAAGATTTGTCTGTTTATTCCTCTGATTTTCTATTACGGGAAAAA
AAGTTATATAGCCTTCGATGAGGGATTTTATGCTTTGCAAGCCCGATGGATACTAGAAAAAGGCAACTGGACAATTCCTT
TATGGTGGGACGAATACGTTTTAGATAGAACAAATGGGTTACAAGTGTTAATCGCTAAATCACAAGAAATATTTGGCAAA
AATCTTTTCGCTGCATATTTGCCAACAACAATTGCAGCAATATTGATGTTAATAATTACTTACAAATTACATGAAGAGTT
TTTTGGTAAAAATCATGCAATCGTATCTCCACTAATACTTTCTACAACATATCTTTGGTTTGACTACTCTCATTTAGCAA
CTCAAGATCTTATTTATTCCAGCTTGGTAACTATTGGAGTATTTTCTTTAGTTAAAATAAAAAAACATAAAAGCAATTTC
TATATTTTACTTTTTGGTACTTGGATAGGTTTAGCTTTTATGATGAAGACTTTTCTTGTAGCTGTTCCTCTTGCGGCACT
AACGCCATATATCTTATCAAAAAGAAAATTATTATTTAATACATTCTTTTGGCTTGGGTTATTAATTGGATTTATTCCAT
ACCTAATATGGACTTATTCTATAAACACGTATTTAGATCAGAATATTATCTTTTACTTGTTTGGAAAATTTAATTTCCTT
TCTAATAAAAACGATTCTACAAATCCTTTTTATTATTATTTGTGGAACATTCCAATAACCTTTTTACCATGGAGCATTTT
TTCTATTATCGGTTTATCTTCAAATACTTTAGAAAATAAAAATGGAAATGAAAAATTAATTCTGATTTATTTTCCCTTAA
TTTTAATATTAATACTTAGTATTTTTTCTACAAAAACTCCTTATTATCCATTGCAAATATCTTCAATCTTATCTTTAAAT
TCATATATTGGCATAAAATATTTATTCAGTTCCAAAAGATATAAATCAATAGTAATTTTTATTACCTCGAGATTAATACC
TTTATTTATCAGTGCTTTAGTAGTTACATATATTATTTTCTTCAAAAGTGTACTGAATTTAACTATAAAAGAAAATATAT
TTATTATTTTAGGATTAATATCGTTTTCGATAGCTTGGTCATACATAAAAGATACAAGTAACCTCAAAAAGATTTTTACA
ACTTTAATTATTGGTCCTTATCTATTGACTGCACTACTATTGCAGTCGGGTTTATTTACAGACAGATCAAGAGAATTAAG
AGAAACTATGGAATATCTATCTTCATTAGATATCCTGAAGAATCAAGTCATTAAGGTTGACAAAAGGAACATTGGGAATG
AAATAGCGCAATCAAAAATTATACGAATTTCTCTCCTAACTCCTAATTTAGGGGATGGAATTGAAAATTTAGAGAAAATG
AACCCCTCAGATTTAGCATGGTCTAATTTGTCTTCAAAGGAACTTAGCGAAACTGATTCTTTTCAAATAATTTATGATTA
TGAAATTTTATCTCCTTGGAAATTAATAAGAAAAAATCGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGCCGGTATAGCTCAGAGGAAGAGCAACTGTTTCGTAAACAGAAGGTCATTGGTTCAATTCCGATTATCGGCATTTAAG
TTTCATACATTTGCAATAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTATATTAAGATTGTTTTGATAAAAATTAAATTTAATGAAATCTGTTAATACATGGAATCTTTCAAATAATAAAATTC
ACCAATTATTTAAAAACGAT

Product: dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransferase

Products: NA

Alternate protein names: Dolichyl-Phosphate-Mannose-Proteinmannosyltransferase; Glycosyl Transferase Family Protein; Family; Glycosyltransferase

Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 520

Protein sequence:

>520_residues
MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYVLDRTNGLQVLIAKSQEIFGK
NLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLILSTTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNF
YILLFGTWIGLAFMMKTFLVAVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL
SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILSIFSTKTPYYPLQISSILSLN
SYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIFFKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFT
TLIIGPYLLTALLLQSGLFTDRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM
NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR

Sequences:

>Translated_520_residues
MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYVLDRTNGLQVLIAKSQEIFGK
NLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLILSTTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNF
YILLFGTWIGLAFMMKTFLVAVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL
SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILSIFSTKTPYYPLQISSILSLN
SYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIFFKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFT
TLIIGPYLLTALLLQSGLFTDRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM
NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR
>Mature_520_residues
MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYVLDRTNGLQVLIAKSQEIFGK
NLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLILSTTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNF
YILLFGTWIGLAFMMKTFLVAVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL
SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILSIFSTKTPYYPLQISSILSLN
SYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIFFKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFT
TLIIGPYLLTALLLQSGLFTDRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM
NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR

Specific function: Unknown

COG id: COG1807

COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family

Gene ontology:

Cell location: Integral membrane protein (Potential) [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60473; Mature: 60473

Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEHHHH
LDRTNGLQVLIAKSQEIFGKNLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLIL
HCCCCCCEEEEECCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
STTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNFYILLFGTWIGLAFMMKTFLV
HHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
AVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEC
SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILS
CCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
IFSTKTPYYPLQISSILSLNSYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIF
HHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFTTLIIGPYLLTALLLQSGLFT
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHC
NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR
CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MIDRNKFFKKVLKICLFIPLIFYYGKKSYIAFDEGFYALQARWILEKGNWTIPLWWDEYV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEHHHH
LDRTNGLQVLIAKSQEIFGKNLFAAYLPTTIAAILMLIITYKLHEEFFGKNHAIVSPLIL
HCCCCCCEEEEECCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
STTYLWFDYSHLATQDLIYSSLVTIGVFSLVKIKKHKSNFYILLFGTWIGLAFMMKTFLV
HHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
AVPLAALTPYILSKRKLLFNTFFWLGLLIGFIPYLIWTYSINTYLDQNIIFYLFGKFNFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEC
SNKNDSTNPFYYYLWNIPITFLPWSIFSIIGLSSNTLENKNGNEKLILIYFPLILILILS
CCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
IFSTKTPYYPLQISSILSLNSYIGIKYLFSSKRYKSIVIFITSRLIPLFISALVVTYIIF
HHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKSVLNLTIKENIFIILGLISFSIAWSYIKDTSNLKKIFTTLIIGPYLLTALLLQSGLFT
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DRSRELRETMEYLSSLDILKNQVIKVDKRNIGNEIAQSKIIRISLLTPNLGDGIENLEKM
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHC
NPSDLAWSNLSSKELSETDSFQIIYDYEILSPWKLIRKNR
CCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA