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The map label for this gene is ybbP [H]

Identifier: 120598435

GI number: 120598435

Start: 1844114

End: 1846609

Strand: Direct

Name: ybbP [H]

Synonym: Sputw3181_1618

Alternate gene names: 120598435

Gene position: 1844114-1846609 (Clockwise)

Preceding gene: 120598434

Following gene: 120598439

Centisome position: 39.17

GC content: 47.52

Gene sequence:

>2496_bases
ATGGAGTTAAGTCTGGCATGGCGCCTATTTAAACGTGAGTTACAGCAAGGGCAATTGTTACTGATTATCCTCGCTATCAC
GCTCGCAGTATTGTCTGTGAGTGGTTTAGCGCGGGTGAGCGAGCGCTTGCAAGTGGCAATTAATGGAGAGGCTGCTGCGT
TTATTGCAGCCGATCGTATTATCGATTCACCCGTGATAATTGATCCCACTATTTTAGCTAAAGCCGAAGAGCTTGGGCTT
AAGCATGTGACTAACATGCAATTTAATTCCATGGTCTATTCGGGAGATAAATTCCAGTTAGTGACAGTGCGCGCTGTTGA
GGTGGGTTATCCACTCAAAGGTGAAATTGAGCTTACCACTGGTAAAACAAAAGCGTTACCTAAAGCGGATGAAATCTGGT
TTGAGACGCGTTTAGGTGGGCTTTTGGGATATCCCAAATCCATAGAGTTAGGTAACAGTGAGTTTGTGCTCAGCAATGAG
ATCAGCCGTTTGCCCGACGCAGGGTTTAATCCTTTTGCTTCATCCCCTATTGTGTTGATGCGAATGGAAGATGTGGCAAA
AACGGGGGTTATTCAACCGGGGAGCCGCGTCACGTATTTATATCAATTTGCAGGAGATGAAGCTGCCCTCATCGCTTTTG
AGCAAAGTGCCAAACCGCTGCTGAATAGCACCCAACGCTGGGTCGATGTGCAATCTGGCGATTCGCCTATAGCAGGCGCT
GTTAAGCGAGCAGAACGTTTCTTGCTGTTAGCCAGTTTAATGGGTATTGCACTGGCTTGCGCTGCGATAGGTATTGCTGC
TCAGCGTTATTGTCAGCGCCATTACGATGTGGTGGCCATGCTGAAAACCTTCGGTGCCTCAGCAAAACAAATTCGTCTGC
TGTTTGGCATGCATTTATTACTTGTGACGTTATTGGGAATAGGCTTAGGTCTTATCGGTGGTGGGTTACTGGATTTTGGG
ATCAGTTATCTATTGCCACCCGAAATTGCTGCTTATTCACCGCCACTGACTCGACCATTATTGCTCGGGATAAGCACAGG
GCTTATCAGCGCCTTTATGTTTTCAGCCTACCCTTTGATGCGGTTACTGGCGATTCCGCCACTAAGGGTGCTGCAGCGTC
AGTTAGAAGGTCTGCAACTTGGCATGTGGTTGCATTTGCTACTGAGTTTAGGGGCGATGGCGTTACTGGGATATTTGTAT
TCCCAAAGTTGGGCTTTGACACTAACGGTCGTTGCGGCTGTCTTACTGCTTGGTGTGTTACTGAGTGTGCTGGGTTTTGT
GATGATACGTGCAGGTCACAGCATAGGTATGAAAACGACCAATCCCTTACAATTGGCGCTAGCGGGGCTAAGGCGTCGTG
CGCGGCAAAATGCGGTGCAATTGGTCGGTTTTAGCGCGGCACTCGTGTTGTTATTGACCATTTTGGCGCTCAGGCAAGAT
TTACTTAACGAATGGCAAAAACAGCTACCCGAAAATGCGCCGAACTACTTTTTAGTCAATATTGCCCCCGATGATGCTAA
GCCTTTACATGATTTTATGTCGGCAAATGGCATTACTGCGACGGATATTTATCCGGTGATCCGTGGACGTCTAACCCAAA
TCAACGGGGAAACCTTGATTTCTAATGAACAGCGGGAGGCTGGTGAAAAGGGGCGCGTCGGGATTTCTCGTGAGCTCAAT
CTCACATGGCGTAATACCTTACCCGCCAATAACGAGTTAATAGAAGGGCAGTTTAATCAAGCTACCGATGAAGTGTCAGT
CGAGTCAGGTGTGGCGGAGCGTTTAGGTATTGGTCTTGGCGATAAGTTGACTTATATCATCGATAATCAGGAGCTTACCG
TAAAAGTTGCGAGTATTCGTACCGTGCACTGGGAAACTCTGCAACCAAACTTCTTTATGATCTTTACCCAAGAAGCACTT
GCACCTTTTGCGTATACCTCGATGGCGAGCTTCTTTCTAGATGAAAAAGGTCTTGATGATCAGGCGACGAATGCGGATAG
TTCACCTAAGGATGCGGTGATTTTGGCGCTTATTCAGCAATTTCCGACGGTTTCCATCATAGATGTGGGCGCTATGGTAG
GGCAGTTGCGTCAGATTATTGAGCAAGTCTCCCTGTCGTTGACCTTAGTGCTAGTCTTAGTGTTATTAGCCAGTGGCTTA
GTGTTGATTGCACAGACGGAAGCTGGCATGGCGACTCGGCAGCGGGAACTTGCTGTACTGCGTACTTTTGGTGCTTCAGG
ATGGTTATTACGCAGTGCAACGGGTTTAGAGTTTGCTTTACTGGGCGGTATTGCAGGTGTGTTAGCAGTGATAGTAGCCG
AATTTGCGCTCTATCTACTAAAAACTCAAGTGTTTGAACTTAATGTGTATATGCATTGGCCTTGGTGGGCAATTGCTCCT
GTATCCGGTGCATTGCTGGTGGCCTTGCTTGGGGTGTGGCGTTGCCGTCAATTACTGAATCAATCCTGCTCTGAGTTACT
AAAAGCAGGGAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGATGGATAATGGCCATTTACAGGAAGATAACGCCAGAGCTGTTGTCTCAACCCCATCCGTTGCTCCCGATATACTCGCT
AATGCTAAGGAGGCTTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCGTTTATTACTTAAGAAAAGCACTGGGTGATCTCAGTGCTTTTTGATTGGATAAGCTACATAATAAAACTTAAATAAC
CTTGCAAGACAATTAAGTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 831

Protein sequence:

>831_residues
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAINGEAAAFIAADRIIDSPVIIDPTILAKAEELGL
KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVEVGYPLKGEIELTTGKTKALPKADEIWFETRLGGLLGYPKSIELGNSEFVLSNE
ISRLPDAGFNPFASSPIVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEAALIAFEQSAKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASAKQIRLLFGMHLLLVTLLGIGLGLIGGGLLDFG
ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGISTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY
SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRAGHSIGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
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LTWRNTLPANNELIEGQFNQATDEVSVESGVAERLGIGLGDKLTYIIDNQELTVKVASIRTVHWETLQPNFFMIFTQEAL
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VLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWPWWAIAP
VSGALLVALLGVWRCRQLLNQSCSELLKAGS

Sequences:

>Translated_831_residues
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAINGEAAAFIAADRIIDSPVIIDPTILAKAEELGL
KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVEVGYPLKGEIELTTGKTKALPKADEIWFETRLGGLLGYPKSIELGNSEFVLSNE
ISRLPDAGFNPFASSPIVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEAALIAFEQSAKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASAKQIRLLFGMHLLLVTLLGIGLGLIGGGLLDFG
ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGISTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY
SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRAGHSIGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLHDFMSANGITATDIYPVIRGRLTQINGETLISNEQREAGEKGRVGISRELN
LTWRNTLPANNELIEGQFNQATDEVSVESGVAERLGIGLGDKLTYIIDNQELTVKVASIRTVHWETLQPNFFMIFTQEAL
APFAYTSMASFFLDEKGLDDQATNADSSPKDAVILALIQQFPTVSIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLVLVLLASGL
VLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWPWWAIAP
VSGALLVALLGVWRCRQLLNQSCSELLKAGS
>Mature_831_residues
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAINGEAAAFIAADRIIDSPVIIDPTILAKAEELGL
KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVEVGYPLKGEIELTTGKTKALPKADEIWFETRLGGLLGYPKSIELGNSEFVLSNE
ISRLPDAGFNPFASSPIVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEAALIAFEQSAKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASAKQIRLLFGMHLLLVTLLGIGLGLIGGGLLDFG
ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGISTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY
SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRAGHSIGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLHDFMSANGITATDIYPVIRGRLTQINGETLISNEQREAGEKGRVGISRELN
LTWRNTLPANNELIEGQFNQATDEVSVESGVAERLGIGLGDKLTYIIDNQELTVKVASIRTVHWETLQPNFFMIFTQEAL
APFAYTSMASFFLDEKGLDDQATNADSSPKDAVILALIQQFPTVSIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLVLVLLASGL
VLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWPWWAIAP
VSGALLVALLGVWRCRQLLNQSCSELLKAGS

Specific function: Unknown

COG id: COG3127

COG function: function code Q; Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786704, Length=810, Percent_Identity=36.6666666666667, Blast_Score=459, Evalue=1e-130,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90364; Mature: 90364

Theoretical pI: Translated: 6.53; Mature: 6.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAINGEAAAFIAADRI
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEEEHHHH
IDSPVIIDPTILAKAEELGLKHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVEVGYPLKGEIELTT
CCCCCEECCHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEC
GKTKALPKADEIWFETRLGGLLGYPKSIELGNSEFVLSNEISRLPDAGFNPFASSPIVLM
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEE
RMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEAALIAFEQSAKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
EEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCHHHCCHHHEEEECCCCCCHHHH
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASAKQIRLLFGMHLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
LVTLLGIGLGLIGGGLLDFGISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGISTGLISAFMFSAYPLM
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHCHHHCCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLYSQSWALTLTVVAAVLLLGVL
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSVLGFVMIRAGHSIGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLHDFMSANGITATDIYPVIRGRLTQINGETLI
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCHHEEECCCCEE
SNEQREAGEKGRVGISRELNLTWRNTLPANNELIEGQFNQATDEVSVESGVAERLGIGLG
CCCHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHCHHHHHCCCCC
DKLTYIIDNQELTVKVASIRTVHWETLQPNFFMIFTQEALAPFAYTSMASFFLDEKGLDD
CCEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
QATNADSSPKDAVILALIQQFPTVSIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLVLVLLASGL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCE
VLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLL
EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTQVFELNVYMHWPWWAIAPVSGALLVALLGVWRCRQLLNQSCSELLKAGS
HHHEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEEEHHHH
IDSPVIIDPTILAKAEELGLKHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVEVGYPLKGEIELTT
CCCCCEECCHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEC
GKTKALPKADEIWFETRLGGLLGYPKSIELGNSEFVLSNEISRLPDAGFNPFASSPIVLM
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEE
RMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEAALIAFEQSAKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
EEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCHHHCCHHHEEEECCCCCCHHHH
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASAKQIRLLFGMHLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
LVTLLGIGLGLIGGGLLDFGISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGISTGLISAFMFSAYPLM
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RLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLYSQSWALTLTVVAAVLLLGVL
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LSVLGFVMIRAGHSIGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
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HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCHHEEECCCCEE
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EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTQVFELNVYMHWPWWAIAPVSGALLVALLGVWRCRQLLNQSCSELLKAGS
HHHEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]