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The map label for this gene is glnA [H]

Identifier: 119947087

GI number: 119947087

Start: 4312455

End: 4314629

Strand: Direct

Name: glnA [H]

Synonym: Ping_3485

Alternate gene names: 119947087

Gene position: 4312455-4314629 (Clockwise)

Preceding gene: 119947086

Following gene: 119947088

Centisome position: 94.58

GC content: 42.85

Gene sequence:

>2175_bases
ATGAGTGGAAACCAAAATCGCCTTAAAGCAATTGAGAAAATTACTAATCGTGCACCCAATATGGTCGACAAACCTGAGCC
ATTAAGTAAAATTTGGGCAGAAGACGTTTTTAATCTTCATAAAATGGAAGAAGCATTACCAAAAAATGCTTTTAAAGCGA
TTAAAAAAACGGTTCAAACTGGCTGTGCTTTAGAGCCGGCAACGGCTGATGTTGTTGCTGCAGCGATGAAGGATTGGGCG
CTTAGTAAAGGCGTTAAATTCTACTCACATATCTTTTACCCTATGACTAACATTACCGCAGAAAAGCATGATGGTTTTAT
TATTACCAATTCTGATGGTGGTGCAATTACTGAATTTACCGGTAGCCTGTTAATCAAAGGGGAGCCAGATGGTTCCTCTT
TCCCTAACGGTAGCTTGCGTATGACTAATGCTGCCCGTGGTTATACCGCTTGGGATCCGACCAGCCCTGCCTACGTTATG
CATACGGCTAATGGCTCGACTTTAATGATCCCAAGTGTGTTTATGTCCTGGACGGGTGAAGCATTAGATAAAAAAATTCC
ACTACTACGCTCAATTTCAGCAATGGACGAAGCCGGGCAAAAAGTACTTAAATTAATGGGTGAGACTGATACCGCACCAC
TTAATTCAAGCTGCGGCGCTGAGCAAGAGTACTTCCTCGTTGATGAAAACTTTGCCAATGCACGCCCCGATTTGTTACTT
GCAGGCAGAACCTTATTCGGTGCTCCTCCCGCTAAAGGTCAACAATTTGATGATCACTACTTTGGTGCAATCCCTGAACG
CGTTCAAGTGTTTATGCAGGATTTTGAAAACAAACTTTACAAGTTAGGTATCCCGGCTAAAACTCACCACAACGAAGTGG
CTCCGGGTCAATTTGAAATTGCACCTTATTATGAAGCGGCTAATGTCGCCGCCGATCATCAGCAACTTTTGATGACGGTG
ATGAAGAGCACTGCAAAAGAGCATGGCTTTCTATGTTTATTACATGAAAAACCCTTTGCTGGTATTAATGGCTCGGGTAA
ACATGTTAACTGGTCGGTGGGCAACAGCACCCAGGGTAACCTGCTAGATCCAGGCAGCACACCACATGATAATCTTAATT
TCTTACTTTTCTGCGGTGCCGTTATTCGCGGTGTGCATAAATATGGCCCGTTATTACGCGCTGTTATTGCATCAGCTTCT
AACGACCACCGGCTTGGTGCTAACGAAGCACCACCGGCTATTCTTTCTGTTTATTTAGGCGAGCAGTTAGAAGGGCTATT
TAATGACATTAAAAATGGCAAGCTGTTAACTTGTGCTGATGCCGGTTTAATGGATTCTGGTTTATCGCAAATCCTGCACT
TTGAACGAGATCCGGGTGACCGTAACAGAACCTCTCCCTTTGCATTTACAGGTAACCGTTTTGAGTTCCGCGCTGTTGGC
TCATCACAATCAGTATCTGGTCCATTGGTTGCTATGAATACAATGCTTGCTGATTCATTAAACTGGATTGCTGAAAAGTT
AGAAGTGGCTTTAGCAGAATCTGAGAACCAAAATATTGCCGTTATATCTGTATTAAAAGAACTAATGGAACTGCATGGCA
ATATTGTATTTGGTGGTGACGGTTACTCGAAAGAATGGCACACAATGGCGGTTGAAGAGCGTGGTTTACAAAATATTCCA
ACAACAGCCGATGCCTTACCTGCATTTCGTGAAGAGTCAATCGTTAAACTTTTTGAAAGCACTGGGGTATTCTCACCCAT
TGAATTAGAAAGCCGCTATCAAGTTTATGCTGAGCAATACATTCTTTCGATTGAGGTAGAAGCTAAATTAGTGATTGATA
TGGCAACGACCACTATTTATCCTGCTGCTATGAGTTACTTATCACAGCTTGGTCTAACGACTTCGACAATGATTGGACTC
GATATCGCGCTTGATACTTCGCTCACATCTGAAATCGCAGTTGAGACCAATGCGCTTATGACAGCTGTCACTAAACTTAA
ACAAGCAGTCGCAACACATGACTTTGTCGATGTAGAGGCGCATATGCATTTCTGTGCTGATGTTATTCGTGGCTTAATGG
ATCAAACACGCGAGCACGCTGATGCGCTTGAAACACTTGTTGCCGATGAATTATGGCCGTTGCCTAAGTATCAGGAAATG
TTATTTATCAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGCACAATTATTGCTTAATATCTTTCTATTATCTTTTAAATTTAAAAATAACCAAGCTGATCCCATCCAGCCTCTATTT
TATAAGTCAAGGAGCCCCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTATTTAGGATTAGTAGGCTCATAAATAAACACTAATAAAAAGGCTCACTTTTTATGTATAAAAAATGAGCCCTTT
TATTTTGAGTGATATAACTT

Product: glutamine synthetase, type III

Products: NA

Alternate protein names: GS; Glutamate--ammonia ligase [H]

Number of amino acids: Translated: 724; Mature: 723

Protein sequence:

>724_residues
MSGNQNRLKAIEKITNRAPNMVDKPEPLSKIWAEDVFNLHKMEEALPKNAFKAIKKTVQTGCALEPATADVVAAAMKDWA
LSKGVKFYSHIFYPMTNITAEKHDGFIITNSDGGAITEFTGSLLIKGEPDGSSFPNGSLRMTNAARGYTAWDPTSPAYVM
HTANGSTLMIPSVFMSWTGEALDKKIPLLRSISAMDEAGQKVLKLMGETDTAPLNSSCGAEQEYFLVDENFANARPDLLL
AGRTLFGAPPAKGQQFDDHYFGAIPERVQVFMQDFENKLYKLGIPAKTHHNEVAPGQFEIAPYYEAANVAADHQQLLMTV
MKSTAKEHGFLCLLHEKPFAGINGSGKHVNWSVGNSTQGNLLDPGSTPHDNLNFLLFCGAVIRGVHKYGPLLRAVIASAS
NDHRLGANEAPPAILSVYLGEQLEGLFNDIKNGKLLTCADAGLMDSGLSQILHFERDPGDRNRTSPFAFTGNRFEFRAVG
SSQSVSGPLVAMNTMLADSLNWIAEKLEVALAESENQNIAVISVLKELMELHGNIVFGGDGYSKEWHTMAVEERGLQNIP
TTADALPAFREESIVKLFESTGVFSPIELESRYQVYAEQYILSIEVEAKLVIDMATTTIYPAAMSYLSQLGLTTSTMIGL
DIALDTSLTSEIAVETNALMTAVTKLKQAVATHDFVDVEAHMHFCADVIRGLMDQTREHADALETLVADELWPLPKYQEM
LFIK

Sequences:

>Translated_724_residues
MSGNQNRLKAIEKITNRAPNMVDKPEPLSKIWAEDVFNLHKMEEALPKNAFKAIKKTVQTGCALEPATADVVAAAMKDWA
LSKGVKFYSHIFYPMTNITAEKHDGFIITNSDGGAITEFTGSLLIKGEPDGSSFPNGSLRMTNAARGYTAWDPTSPAYVM
HTANGSTLMIPSVFMSWTGEALDKKIPLLRSISAMDEAGQKVLKLMGETDTAPLNSSCGAEQEYFLVDENFANARPDLLL
AGRTLFGAPPAKGQQFDDHYFGAIPERVQVFMQDFENKLYKLGIPAKTHHNEVAPGQFEIAPYYEAANVAADHQQLLMTV
MKSTAKEHGFLCLLHEKPFAGINGSGKHVNWSVGNSTQGNLLDPGSTPHDNLNFLLFCGAVIRGVHKYGPLLRAVIASAS
NDHRLGANEAPPAILSVYLGEQLEGLFNDIKNGKLLTCADAGLMDSGLSQILHFERDPGDRNRTSPFAFTGNRFEFRAVG
SSQSVSGPLVAMNTMLADSLNWIAEKLEVALAESENQNIAVISVLKELMELHGNIVFGGDGYSKEWHTMAVEERGLQNIP
TTADALPAFREESIVKLFESTGVFSPIELESRYQVYAEQYILSIEVEAKLVIDMATTTIYPAAMSYLSQLGLTTSTMIGL
DIALDTSLTSEIAVETNALMTAVTKLKQAVATHDFVDVEAHMHFCADVIRGLMDQTREHADALETLVADELWPLPKYQEM
LFIK
>Mature_723_residues
SGNQNRLKAIEKITNRAPNMVDKPEPLSKIWAEDVFNLHKMEEALPKNAFKAIKKTVQTGCALEPATADVVAAAMKDWAL
SKGVKFYSHIFYPMTNITAEKHDGFIITNSDGGAITEFTGSLLIKGEPDGSSFPNGSLRMTNAARGYTAWDPTSPAYVMH
TANGSTLMIPSVFMSWTGEALDKKIPLLRSISAMDEAGQKVLKLMGETDTAPLNSSCGAEQEYFLVDENFANARPDLLLA
GRTLFGAPPAKGQQFDDHYFGAIPERVQVFMQDFENKLYKLGIPAKTHHNEVAPGQFEIAPYYEAANVAADHQQLLMTVM
KSTAKEHGFLCLLHEKPFAGINGSGKHVNWSVGNSTQGNLLDPGSTPHDNLNFLLFCGAVIRGVHKYGPLLRAVIASASN
DHRLGANEAPPAILSVYLGEQLEGLFNDIKNGKLLTCADAGLMDSGLSQILHFERDPGDRNRTSPFAFTGNRFEFRAVGS
SQSVSGPLVAMNTMLADSLNWIAEKLEVALAESENQNIAVISVLKELMELHGNIVFGGDGYSKEWHTMAVEERGLQNIPT
TADALPAFREESIVKLFESTGVFSPIELESRYQVYAEQYILSIEVEAKLVIDMATTTIYPAAMSYLSQLGLTTSTMIGLD
IALDTSLTSEIAVETNALMTAVTKLKQAVATHDFVDVEAHMHFCADVIRGLMDQTREHADALETLVADELWPLPKYQEML
FIK

Specific function: Unknown

COG id: COG3968

COG function: function code R; Uncharacterized protein related to glutamine synthetase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the glutamine synthetase family. Type 3 subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014746
- InterPro:   IPR008146
- InterPro:   IPR022147 [H]

Pfam domain/function: PF00120 Gln-synt_C; PF12437 GSIII_N [H]

EC number: =6.3.1.2 [H]

Molecular weight: Translated: 79223; Mature: 79092

Theoretical pI: Translated: 4.99; Mature: 4.99

Prosite motif: PS00181 GLNA_ATP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSGNQNRLKAIEKITNRAPNMVDKPEPLSKIWAEDVFNLHKMEEALPKNAFKAIKKTVQT
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GCALEPATADVVAAAMKDWALSKGVKFYSHIFYPMTNITAEKHDGFIITNSDGGAITEFT
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCEEEECCCCCEEEEEC
GSLLIKGEPDGSSFPNGSLRMTNAARGYTAWDPTSPAYVMHTANGSTLMIPSVFMSWTGE
CEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHCHH
ALDKKIPLLRSISAMDEAGQKVLKLMGETDTAPLNSSCGAEQEYFLVDENFANARPDLLL
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEE
AGRTLFGAPPAKGQQFDDHYFGAIPERVQVFMQDFENKLYKLGIPAKTHHNEVAPGQFEI
ECCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCEEEE
APYYEAANVAADHQQLLMTVMKSTAKEHGFLCLLHEKPFAGINGSGKHVNWSVGNSTQGN
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC
LLDPGSTPHDNLNFLLFCGAVIRGVHKYGPLLRAVIASASNDHRLGANEAPPAILSVYLG
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
EQLEGLFNDIKNGKLLTCADAGLMDSGLSQILHFERDPGDRNRTSPFAFTGNRFEFRAVG
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEECC
SSQSVSGPLVAMNTMLADSLNWIAEKLEVALAESENQNIAVISVLKELMELHGNIVFGGD
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCC
GYSKEWHTMAVEERGLQNIPTTADALPAFREESIVKLFESTGVFSPIELESRYQVYAEQY
CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHE
ILSIEVEAKLVIDMATTTIYPAAMSYLSQLGLTTSTMIGLDIALDTSLTSEIAVETNALM
EEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
TAVTKLKQAVATHDFVDVEAHMHFCADVIRGLMDQTREHADALETLVADELWPLPKYQEM
HHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
LFIK
EECC
>Mature Secondary Structure 
SGNQNRLKAIEKITNRAPNMVDKPEPLSKIWAEDVFNLHKMEEALPKNAFKAIKKTVQT
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GCALEPATADVVAAAMKDWALSKGVKFYSHIFYPMTNITAEKHDGFIITNSDGGAITEFT
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCEEEECCCCCEEEEEC
GSLLIKGEPDGSSFPNGSLRMTNAARGYTAWDPTSPAYVMHTANGSTLMIPSVFMSWTGE
CEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHCHH
ALDKKIPLLRSISAMDEAGQKVLKLMGETDTAPLNSSCGAEQEYFLVDENFANARPDLLL
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEE
AGRTLFGAPPAKGQQFDDHYFGAIPERVQVFMQDFENKLYKLGIPAKTHHNEVAPGQFEI
ECCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCEEEE
APYYEAANVAADHQQLLMTVMKSTAKEHGFLCLLHEKPFAGINGSGKHVNWSVGNSTQGN
ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC
LLDPGSTPHDNLNFLLFCGAVIRGVHKYGPLLRAVIASASNDHRLGANEAPPAILSVYLG
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
EQLEGLFNDIKNGKLLTCADAGLMDSGLSQILHFERDPGDRNRTSPFAFTGNRFEFRAVG
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEECC
SSQSVSGPLVAMNTMLADSLNWIAEKLEVALAESENQNIAVISVLKELMELHGNIVFGGD
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCC
GYSKEWHTMAVEERGLQNIPTTADALPAFREESIVKLFESTGVFSPIELESRYQVYAEQY
CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHE
ILSIEVEAKLVIDMATTTIYPAAMSYLSQLGLTTSTMIGLDIALDTSLTSEIAVETNALM
EEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
TAVTKLKQAVATHDFVDVEAHMHFCADVIRGLMDQTREHADALETLVADELWPLPKYQEM
HHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
LFIK
EECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2576872 [H]