| Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008709 |
| Length | 4,559,598 |
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The map label for this gene is 119946471
Identifier: 119946471
GI number: 119946471
Start: 3499183
End: 3501852
Strand: Reverse
Name: 119946471
Synonym: Ping_2846
Alternate gene names: NA
Gene position: 3501852-3499183 (Counterclockwise)
Preceding gene: 119946472
Following gene: 119946470
Centisome position: 76.8
GC content: 48.13
Gene sequence:
>2670_bases ATGAATGAACTGAATATATTAAGAAAAATGGCTGAACAGCAGCAACATGGCCCGTTAAAAGAAATGGCTGAAAGCCTGTA TCAGCAAACTGAAAATCCGGCTATTTTACCGTTATTGGCAACTGCCTGTGCCCATCTGGGCTTGAAACAGCAGACAGAAA TACGTTATGAGCAGGCATTTGAGTCTTTGGCTGAGCTGGACTGCGATGGCCGTTGCGATCTGGCTGCGGTGTTAATTGTG ATGCAGCGACTCGAACAGGCTAATAGCATGCTCACGGAGATTCTGATTGAGCAGCCGATGCATGCGCTGGCGTATGCGCG TCTGGGTTATTGCTGTTTATTACAGGACAATCTTAGCAGTGCGCAACAGCATTTTGAGCAGTCGCTGGCATTGCAGCCTT CACGGCTAGTGGTGCATGGTAATCTGCTTAACTTGTATTTGAATCAGGCCCACTATCAACAGGCGCAGGGGCAGCTGGAC GAGGCTTTTGAGCAGCTTGAGCAACAGTATGACGAGCTGCTTACCGGCATTTATCAGCAGTACTGGTTACAGTTTAATAC TGTGCAGCTGCAGCTTTGGTTAAAAAATGAAGACTTTGCCCAAGCCGAAGACTGGCTGCAGCAGTTGTGTGAGCAGCAGC AGGCGGGAGAGTGCGAAGAAGCATTGTTTATTCATTGCCTTAAACAGTACAGCCGTTTACTGGCCGAGTCGGATTTACAT CAGCAGGCCAGCGATATTCTGCGCGAGTATTTTAAGCAGTATTCAGGCAACAGTGACTTATGCCTGACCCTGTCGGAACT CGCGCAGGTGCAGGGACACTTTATGCAGGCGGTCAATCTGCTTCAGAATGCGCTTAAAAATGATGATCAAAACATTAATC TCTGGGTGCAGCTCTCTAGCGCCTGTGTGCACCGGTTTGATCAAAAAGCGCGCAAAGCGGCCGAAAAAGCCGTGGCATTG GCGCAGGCATTGACAGAAACACCCGAGCAGCCGCTTGCGGAGATAAAGTGGCTACGGGCGCAAGCCAGTAATGTGCTGGC GCAGGTAGAAAGTCAGGAGCAGAATTTTGACCTCTCGGAAAAACTCTACCGTGATATTCTTACCGAACACGCGCATTTTC TGCCTGCACTGCAGGGGCTAGCACAACAGCTGATGCAGCAGGGCCATATTGATGAAGCCCTTGAACTGTTTGAGCGGGTT AAACAAATTGATCCGATCAAAGGTCATTCGGCGCTGATCAATGCAAGGCGTTTTCCCGAAGATGTCGAGACCCTCGATAA AATGGCCGCCGCCGCTAAGCAACCGAGCATTGAAGGCAGCCTGAAAGCGGGCATTTTGTTTCAGTTGGCCTCAGCCTGGG AAAAACGCAAGGAATTTGATAAGGCGTTTGGCTTTGCAAATCAGGCTAATGCTGCCAGTAAACAATTTTTGCCCTATGAC GGTAAAGCGCACCGCAAACAGTGCGCGCGTCTGCGCCATGCTTTTTGTAAGCCATTATTTGAACATCGAAAAGACAGTGG TATTGATTCGAATGTGCCCGTTTATGTCCTGGGCATGCCGCGTTCGGGCACCACGCTGGTTGAGCAGATTTTATCGGGCC ACAGTGATATTTTTGGCGCCGGTGAGCTGGGAGTGATCCCCCAGGTTGTACAGGGACTTAGCCGCTGGGAACGTCACGTT GGTTCGGGACGCAGTTATCCCGACTGCATCGATGATATCAATGCTTATACCAGTTCAGGCATTGCCAATAATGTCCTTAC AGAGCTTATCGAACTGGCCGCTGAGGAGAAACCCGATGCCAAACATATCGTTGATAAATTGCCCCATAATTTTGAAAATA TCGGTCTGATCAAATTTCTTTTTCCTAATGCTAAAATAATTTCGGTGCGCCGCGACCCGCGTGATATTGCCATTTCCAAT TATTTTACCGATTATCAGGCTAAACACGGTGGTATGGGGTTTGCTTATGACCTTGAAACCATCGGTGAGCAACTGGCCGA CCACAATCTGTTAATGCATCATTGGCAGCAGACCTTTCCCGGTGAAATTTTGGAGGTCAACTACGAAGATGTGGTCGATG ATCTGGAAGGCTCTGCGCGTAAGATGCTTGATTATATCGGCGTGCAGTGGCAGCCGCAGGTGCTTAAGTTTAATGAACTT GAACGGACTGTTAAGACCGCAAGTGTCTGGCAGGTGCGCCAGCCTATCTATAAAACTTCGAAAGCGAAATGGAAGCGTTA TAAAAACCATCTGCAGCCGTTAATTAAAGGCACCAATGCTAAAATCATTGCCCCTCCGATTGACGATATGCTGACCTTAC CCAAAGCGGGATTTTTAACCGAAGGTGTGGCGCTGTATAAAGAAAACGATTTAGATGGGGCTGAGCTGAACTTTAAAAAG ATGCTGCATCACAATCCTGAACATGCGGCGTGCAATTATATGCTGGGCTTGGTTTATTTAAGTAAAAATCACTTTGATGA TGGTATCGTGCTGCTTGAAAAAGCGCTTGAAAAAGCGCCCTGGCATAAAGAGTGGCGGGATAATTTAATTAAAGCGTACC AGCTAAATGGTGAGACAGAAAAAGTGCAAGCGCTGCAAGCTGCTCAGGATCCTCAGGCTGCGGATTCGCAAATCGATAAT AATGATTTTGCAGTCCCTAACAGCCTGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CCATAATTACAAAAAATCGGAGCACCTCCTGCGGGTTATGTTATTAGTAGGGTGCATTCCATGCACCACAAGCGCTATAT ATCTGATAAGTGAACGCTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCACAAGTGAATTAGGCTGGTAAATGTCACCCTTTAGCTGCTTTTTTGAGTGAGATCTTAAAGCTGCTAGTGGTTGTGCT AGATGGACTGATTTTCCTGC
Product: sulfotransferase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 889; Mature: 889
Protein sequence:
>889_residues MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAFESLAELDCDGRCDLAAVLIV MQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSSAQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLD EAFEQLEQQYDELLTGIYQQYWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSSACVHRFDQKARKAAEKAVAL AQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSEKLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERV KQIDPIKGHSALINARRFPEDVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGAGELGVIPQVVQGLSRWERHV GSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDAKHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISN YFTDYQAKHGGMGFAYDLETIGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLTEGVALYKENDLDGAELNFKK MLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAPWHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDN NDFAVPNSL
Sequences:
>Translated_889_residues MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAFESLAELDCDGRCDLAAVLIV MQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSSAQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLD EAFEQLEQQYDELLTGIYQQYWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSSACVHRFDQKARKAAEKAVAL AQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSEKLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERV KQIDPIKGHSALINARRFPEDVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGAGELGVIPQVVQGLSRWERHV GSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDAKHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISN YFTDYQAKHGGMGFAYDLETIGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLTEGVALYKENDLDGAELNFKK MLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAPWHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDN NDFAVPNSL >Mature_889_residues MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAFESLAELDCDGRCDLAAVLIV MQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSSAQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLD EAFEQLEQQYDELLTGIYQQYWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSSACVHRFDQKARKAAEKAVAL AQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSEKLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERV KQIDPIKGHSALINARRFPEDVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGAGELGVIPQVVQGLSRWERHV GSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDAKHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISN YFTDYQAKHGGMGFAYDLETIGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLTEGVALYKENDLDGAELNFKK MLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAPWHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDN NDFAVPNSL
Specific function: Unknown
COG id: COG0457
COG function: function code R; FOG: TPR repeat
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 8 TPR repeats [H]
Homologues:
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992370, Length=253, Percent_Identity=24.1106719367589, Blast_Score=68, Evalue=3e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000863 - InterPro: IPR001440 - InterPro: IPR011717 - InterPro: IPR013026 - InterPro: IPR011990 - InterPro: IPR019734 [H]
Pfam domain/function: PF00685 Sulfotransfer_1; PF00515 TPR_1; PF07721 TPR_4 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 100883; Mature: 100883
Theoretical pI: Translated: 5.31; Mature: 5.31
Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH ESLAELDCDGRCDLAAVLIVMQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSS HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHH AQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLDEAFEQLEQQYDELLTGIYQQ HHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH HHHEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSS HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHH ACVHRFDQKARKAAEKAVALAQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH KLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERVKQIDPIKGHSALINARRFPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCH DVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC GELGVIPQVVQGLSRWERHVGSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH KHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISNYFTDYQAKHGGMGFAYDLET HHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH IGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHCCCCCHHH EGVALYKENDLDGAELNFKKMLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAP HCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC WHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDNNDFAVPNSL CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH ESLAELDCDGRCDLAAVLIVMQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSS HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHH AQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLDEAFEQLEQQYDELLTGIYQQ HHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH HHHEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSS HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHH ACVHRFDQKARKAAEKAVALAQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH KLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERVKQIDPIKGHSALINARRFPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCH DVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC GELGVIPQVVQGLSRWERHVGSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH KHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISNYFTDYQAKHGGMGFAYDLET HHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH IGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHCCCCCHHH EGVALYKENDLDGAELNFKKMLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAP HCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC WHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDNNDFAVPNSL CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9537320 [H]