Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is 119946471

Identifier: 119946471

GI number: 119946471

Start: 3499183

End: 3501852

Strand: Reverse

Name: 119946471

Synonym: Ping_2846

Alternate gene names: NA

Gene position: 3501852-3499183 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119946472

Following gene: 119946470

Centisome position: 76.8

GC content: 48.13

Gene sequence:

>2670_bases
ATGAATGAACTGAATATATTAAGAAAAATGGCTGAACAGCAGCAACATGGCCCGTTAAAAGAAATGGCTGAAAGCCTGTA
TCAGCAAACTGAAAATCCGGCTATTTTACCGTTATTGGCAACTGCCTGTGCCCATCTGGGCTTGAAACAGCAGACAGAAA
TACGTTATGAGCAGGCATTTGAGTCTTTGGCTGAGCTGGACTGCGATGGCCGTTGCGATCTGGCTGCGGTGTTAATTGTG
ATGCAGCGACTCGAACAGGCTAATAGCATGCTCACGGAGATTCTGATTGAGCAGCCGATGCATGCGCTGGCGTATGCGCG
TCTGGGTTATTGCTGTTTATTACAGGACAATCTTAGCAGTGCGCAACAGCATTTTGAGCAGTCGCTGGCATTGCAGCCTT
CACGGCTAGTGGTGCATGGTAATCTGCTTAACTTGTATTTGAATCAGGCCCACTATCAACAGGCGCAGGGGCAGCTGGAC
GAGGCTTTTGAGCAGCTTGAGCAACAGTATGACGAGCTGCTTACCGGCATTTATCAGCAGTACTGGTTACAGTTTAATAC
TGTGCAGCTGCAGCTTTGGTTAAAAAATGAAGACTTTGCCCAAGCCGAAGACTGGCTGCAGCAGTTGTGTGAGCAGCAGC
AGGCGGGAGAGTGCGAAGAAGCATTGTTTATTCATTGCCTTAAACAGTACAGCCGTTTACTGGCCGAGTCGGATTTACAT
CAGCAGGCCAGCGATATTCTGCGCGAGTATTTTAAGCAGTATTCAGGCAACAGTGACTTATGCCTGACCCTGTCGGAACT
CGCGCAGGTGCAGGGACACTTTATGCAGGCGGTCAATCTGCTTCAGAATGCGCTTAAAAATGATGATCAAAACATTAATC
TCTGGGTGCAGCTCTCTAGCGCCTGTGTGCACCGGTTTGATCAAAAAGCGCGCAAAGCGGCCGAAAAAGCCGTGGCATTG
GCGCAGGCATTGACAGAAACACCCGAGCAGCCGCTTGCGGAGATAAAGTGGCTACGGGCGCAAGCCAGTAATGTGCTGGC
GCAGGTAGAAAGTCAGGAGCAGAATTTTGACCTCTCGGAAAAACTCTACCGTGATATTCTTACCGAACACGCGCATTTTC
TGCCTGCACTGCAGGGGCTAGCACAACAGCTGATGCAGCAGGGCCATATTGATGAAGCCCTTGAACTGTTTGAGCGGGTT
AAACAAATTGATCCGATCAAAGGTCATTCGGCGCTGATCAATGCAAGGCGTTTTCCCGAAGATGTCGAGACCCTCGATAA
AATGGCCGCCGCCGCTAAGCAACCGAGCATTGAAGGCAGCCTGAAAGCGGGCATTTTGTTTCAGTTGGCCTCAGCCTGGG
AAAAACGCAAGGAATTTGATAAGGCGTTTGGCTTTGCAAATCAGGCTAATGCTGCCAGTAAACAATTTTTGCCCTATGAC
GGTAAAGCGCACCGCAAACAGTGCGCGCGTCTGCGCCATGCTTTTTGTAAGCCATTATTTGAACATCGAAAAGACAGTGG
TATTGATTCGAATGTGCCCGTTTATGTCCTGGGCATGCCGCGTTCGGGCACCACGCTGGTTGAGCAGATTTTATCGGGCC
ACAGTGATATTTTTGGCGCCGGTGAGCTGGGAGTGATCCCCCAGGTTGTACAGGGACTTAGCCGCTGGGAACGTCACGTT
GGTTCGGGACGCAGTTATCCCGACTGCATCGATGATATCAATGCTTATACCAGTTCAGGCATTGCCAATAATGTCCTTAC
AGAGCTTATCGAACTGGCCGCTGAGGAGAAACCCGATGCCAAACATATCGTTGATAAATTGCCCCATAATTTTGAAAATA
TCGGTCTGATCAAATTTCTTTTTCCTAATGCTAAAATAATTTCGGTGCGCCGCGACCCGCGTGATATTGCCATTTCCAAT
TATTTTACCGATTATCAGGCTAAACACGGTGGTATGGGGTTTGCTTATGACCTTGAAACCATCGGTGAGCAACTGGCCGA
CCACAATCTGTTAATGCATCATTGGCAGCAGACCTTTCCCGGTGAAATTTTGGAGGTCAACTACGAAGATGTGGTCGATG
ATCTGGAAGGCTCTGCGCGTAAGATGCTTGATTATATCGGCGTGCAGTGGCAGCCGCAGGTGCTTAAGTTTAATGAACTT
GAACGGACTGTTAAGACCGCAAGTGTCTGGCAGGTGCGCCAGCCTATCTATAAAACTTCGAAAGCGAAATGGAAGCGTTA
TAAAAACCATCTGCAGCCGTTAATTAAAGGCACCAATGCTAAAATCATTGCCCCTCCGATTGACGATATGCTGACCTTAC
CCAAAGCGGGATTTTTAACCGAAGGTGTGGCGCTGTATAAAGAAAACGATTTAGATGGGGCTGAGCTGAACTTTAAAAAG
ATGCTGCATCACAATCCTGAACATGCGGCGTGCAATTATATGCTGGGCTTGGTTTATTTAAGTAAAAATCACTTTGATGA
TGGTATCGTGCTGCTTGAAAAAGCGCTTGAAAAAGCGCCCTGGCATAAAGAGTGGCGGGATAATTTAATTAAAGCGTACC
AGCTAAATGGTGAGACAGAAAAAGTGCAAGCGCTGCAAGCTGCTCAGGATCCTCAGGCTGCGGATTCGCAAATCGATAAT
AATGATTTTGCAGTCCCTAACAGCCTGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCATAATTACAAAAAATCGGAGCACCTCCTGCGGGTTATGTTATTAGTAGGGTGCATTCCATGCACCACAAGCGCTATAT
ATCTGATAAGTGAACGCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCACAAGTGAATTAGGCTGGTAAATGTCACCCTTTAGCTGCTTTTTTGAGTGAGATCTTAAAGCTGCTAGTGGTTGTGCT
AGATGGACTGATTTTCCTGC

Product: sulfotransferase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 889; Mature: 889

Protein sequence:

>889_residues
MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAFESLAELDCDGRCDLAAVLIV
MQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSSAQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLD
EAFEQLEQQYDELLTGIYQQYWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH
QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSSACVHRFDQKARKAAEKAVAL
AQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSEKLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERV
KQIDPIKGHSALINARRFPEDVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD
GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGAGELGVIPQVVQGLSRWERHV
GSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDAKHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISN
YFTDYQAKHGGMGFAYDLETIGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL
ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLTEGVALYKENDLDGAELNFKK
MLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAPWHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDN
NDFAVPNSL

Sequences:

>Translated_889_residues
MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAFESLAELDCDGRCDLAAVLIV
MQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSSAQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLD
EAFEQLEQQYDELLTGIYQQYWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH
QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSSACVHRFDQKARKAAEKAVAL
AQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSEKLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERV
KQIDPIKGHSALINARRFPEDVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD
GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGAGELGVIPQVVQGLSRWERHV
GSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDAKHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISN
YFTDYQAKHGGMGFAYDLETIGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL
ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLTEGVALYKENDLDGAELNFKK
MLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAPWHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDN
NDFAVPNSL
>Mature_889_residues
MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAFESLAELDCDGRCDLAAVLIV
MQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSSAQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLD
EAFEQLEQQYDELLTGIYQQYWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH
QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSSACVHRFDQKARKAAEKAVAL
AQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSEKLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERV
KQIDPIKGHSALINARRFPEDVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD
GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGAGELGVIPQVVQGLSRWERHV
GSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDAKHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISN
YFTDYQAKHGGMGFAYDLETIGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL
ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLTEGVALYKENDLDGAELNFKK
MLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAPWHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDN
NDFAVPNSL

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 8 TPR repeats [H]

Homologues:

Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992370, Length=253, Percent_Identity=24.1106719367589, Blast_Score=68, Evalue=3e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000863
- InterPro:   IPR001440
- InterPro:   IPR011717
- InterPro:   IPR013026
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR019734 [H]

Pfam domain/function: PF00685 Sulfotransfer_1; PF00515 TPR_1; PF07721 TPR_4 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100883; Mature: 100883

Theoretical pI: Translated: 5.31; Mature: 5.31

Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAF
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ESLAELDCDGRCDLAAVLIVMQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSS
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHH
AQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLDEAFEQLEQQYDELLTGIYQQ
HHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH
HHHEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSS
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHH
ACVHRFDQKARKAAEKAVALAQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
KLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERVKQIDPIKGHSALINARRFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCH
DVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC
GELGVIPQVVQGLSRWERHVGSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
KHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISNYFTDYQAKHGGMGFAYDLET
HHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH
IGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHCCCCCHHH
EGVALYKENDLDGAELNFKKMLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAP
HCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
WHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDNNDFAVPNSL
CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNELNILRKMAEQQQHGPLKEMAESLYQQTENPAILPLLATACAHLGLKQQTEIRYEQAF
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ESLAELDCDGRCDLAAVLIVMQRLEQANSMLTEILIEQPMHALAYARLGYCCLLQDNLSS
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHH
AQQHFEQSLALQPSRLVVHGNLLNLYLNQAHYQQAQGQLDEAFEQLEQQYDELLTGIYQQ
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YWLQFNTVQLQLWLKNEDFAQAEDWLQQLCEQQQAGECEEALFIHCLKQYSRLLAESDLH
HHHEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQASDILREYFKQYSGNSDLCLTLSELAQVQGHFMQAVNLLQNALKNDDQNINLWVQLSS
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHH
ACVHRFDQKARKAAEKAVALAQALTETPEQPLAEIKWLRAQASNVLAQVESQEQNFDLSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
KLYRDILTEHAHFLPALQGLAQQLMQQGHIDEALELFERVKQIDPIKGHSALINARRFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCH
DVETLDKMAAAAKQPSIEGSLKAGILFQLASAWEKRKEFDKAFGFANQANAASKQFLPYD
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GKAHRKQCARLRHAFCKPLFEHRKDSGIDSNVPVYVLGMPRSGTTLVEQILSGHSDIFGA
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GELGVIPQVVQGLSRWERHVGSGRSYPDCIDDINAYTSSGIANNVLTELIELAAEEKPDA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
KHIVDKLPHNFENIGLIKFLFPNAKIISVRRDPRDIAISNYFTDYQAKHGGMGFAYDLET
HHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHH
IGEQLADHNLLMHHWQQTFPGEILEVNYEDVVDDLEGSARKMLDYIGVQWQPQVLKFNEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ERTVKTASVWQVRQPIYKTSKAKWKRYKNHLQPLIKGTNAKIIAPPIDDMLTLPKAGFLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHCCCCCHHH
EGVALYKENDLDGAELNFKKMLHHNPEHAACNYMLGLVYLSKNHFDDGIVLLEKALEKAP
HCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
WHKEWRDNLIKAYQLNGETEKVQALQAAQDPQAADSQIDNNDFAVPNSL
CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9537320 [H]