Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 119946338

GI number: 119946338

Start: 3324453

End: 3325817

Strand: Reverse

Name: mepA [H]

Synonym: Ping_2709

Alternate gene names: 119946338

Gene position: 3325817-3324453 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119946339

Following gene: 119946337

Centisome position: 72.94

GC content: 42.56

Gene sequence:

>1365_bases
ATGAACAGAACGGAAATAATCGCCCTCGGAAGAGATATTTTTAAGCAAACTTGGCCAATGGTTTTTGGTATTTTGTCTTT
AATGAGTTTTCAACTCGCAGACAGTGCTTTTATAAGTCAACTTGGTGTTTTGCCATTAGCTGTACAGGGTTTTACCATGC
CATTACAGATGCTGTTTATTGGCCTGCAGGTGGGATTAGGTATTGCGACAACGGCGGTTATTTCAAGAATGTTAGGCCAA
AAAAAAGAAAATAGAGCCAGACAGATTGGCGGATTAGTCCTTATAATGGGCGCCGTTGGGGTCTTTGTCATCGCACTTCT
TATGTGGTTTATGCGCCAGCAAATATTAACCCTGTTGGGTGCCTCGGCGGAAGTGAATCCCTATATAAATGAATACTGGC
CTGTCTGGTTATGCAGTGCATGGTTAGGTGCCATGCTGTATTTTACTTATAGTATTTGCCGCTCTCATGGTAACAATTTT
TTCCCAGGTATATTAATGATGGCAACCAGTATTATTAATATTGCCCTGGATCCTATTTTTATCTTTTATTTTGATTTAGG
TTTGCAGGGGGCAGCGATCGCAAGTATCTGTTCATTCAGTATTGGCCTGTTTATTATTCTCCCCAAATTAGTGAGCAACA
ACTGGATCTCCTTTGATTGGGCTTCTCTGCCTGTCTGGACGTCAATTAAAGAGGTTAACGCAATAATGACGCCCGCTATG
ATGGGGCAATTATTACCGCCGCTTGCATCGGTTTTTGTGACTAAAATAGTGGCCGTTTTTGGGGTTGCTGCGGTTGCCGG
ATGGGCAATGGCATCGCGCATTGAGTTTTTTACTTTAGTTGTTGTGCTGGCGTTAACCATGTCACTGCCACCTATGGTTG
GGCGATTATATGGCGCCAAAGATTGCACAACAATTATTAGCTTAGTCAAAATAGTGGTTCTCTTCAGTCTTCTTTTGCAG
GCGGTATTAGCCGCTATTCTGTTTGTTTTTGCCGCGCCTTTGGCTGCATTTTTCAGCGCAGACAGTCAAGTTCAAAGCGT
TATTTATCAGTATTTGCTTCTGGTTCCCATTAGTTTAGGTTCATTGGGCATCTGCATGTTAATGGTTTCTGTCTGTAATT
CATTGGAAATGCCGATGCGCGCATTACTTATTTCAGCCTTACGTCTGTTCCTTTGCTACTTGCCTTTAGTCTGGATAGCC
AGCCAGTTGTGGTTGTTAGAAGGGGTTATTATTGGTGCCATGCTCGGCAATACTCTGGCCGGTTTAATGGCCTGGAGCCT
TTATTATAATGCTATTAAAAAGATCAAACCCGCTGTTCCGAAAATAGAACCTGTTTTGGAGTCTAGCCTCGACTTTAAAA
CCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAATAAACCGACCTTTGCGCGTTTTTTCCCCGATCCCTGCTTGATAATGCTATTATCTCCGGCTTGTCATTATTATTT
TAAGCAGCTTGAAGGTCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGCTATATACCCGTGATACTTCAAGATGCAAAGTCAGCAAGGAAAATTGTGCTGAGATGCTAGGCATAAAATTGAAGTA
CAATTATTCTACATAGCGAT

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 454; Mature: 454

Protein sequence:

>454_residues
MNRTEIIALGRDIFKQTWPMVFGILSLMSFQLADSAFISQLGVLPLAVQGFTMPLQMLFIGLQVGLGIATTAVISRMLGQ
KKENRARQIGGLVLIMGAVGVFVIALLMWFMRQQILTLLGASAEVNPYINEYWPVWLCSAWLGAMLYFTYSICRSHGNNF
FPGILMMATSIINIALDPIFIFYFDLGLQGAAIASICSFSIGLFIILPKLVSNNWISFDWASLPVWTSIKEVNAIMTPAM
MGQLLPPLASVFVTKIVAVFGVAAVAGWAMASRIEFFTLVVVLALTMSLPPMVGRLYGAKDCTTIISLVKIVVLFSLLLQ
AVLAAILFVFAAPLAAFFSADSQVQSVIYQYLLLVPISLGSLGICMLMVSVCNSLEMPMRALLISALRLFLCYLPLVWIA
SQLWLLEGVIIGAMLGNTLAGLMAWSLYYNAIKKIKPAVPKIEPVLESSLDFKT

Sequences:

>Translated_454_residues
MNRTEIIALGRDIFKQTWPMVFGILSLMSFQLADSAFISQLGVLPLAVQGFTMPLQMLFIGLQVGLGIATTAVISRMLGQ
KKENRARQIGGLVLIMGAVGVFVIALLMWFMRQQILTLLGASAEVNPYINEYWPVWLCSAWLGAMLYFTYSICRSHGNNF
FPGILMMATSIINIALDPIFIFYFDLGLQGAAIASICSFSIGLFIILPKLVSNNWISFDWASLPVWTSIKEVNAIMTPAM
MGQLLPPLASVFVTKIVAVFGVAAVAGWAMASRIEFFTLVVVLALTMSLPPMVGRLYGAKDCTTIISLVKIVVLFSLLLQ
AVLAAILFVFAAPLAAFFSADSQVQSVIYQYLLLVPISLGSLGICMLMVSVCNSLEMPMRALLISALRLFLCYLPLVWIA
SQLWLLEGVIIGAMLGNTLAGLMAWSLYYNAIKKIKPAVPKIEPVLESSLDFKT
>Mature_454_residues
MNRTEIIALGRDIFKQTWPMVFGILSLMSFQLADSAFISQLGVLPLAVQGFTMPLQMLFIGLQVGLGIATTAVISRMLGQ
KKENRARQIGGLVLIMGAVGVFVIALLMWFMRQQILTLLGASAEVNPYINEYWPVWLCSAWLGAMLYFTYSICRSHGNNF
FPGILMMATSIINIALDPIFIFYFDLGLQGAAIASICSFSIGLFIILPKLVSNNWISFDWASLPVWTSIKEVNAIMTPAM
MGQLLPPLASVFVTKIVAVFGVAAVAGWAMASRIEFFTLVVVLALTMSLPPMVGRLYGAKDCTTIISLVKIVVLFSLLLQ
AVLAAILFVFAAPLAAFFSADSQVQSVIYQYLLLVPISLGSLGICMLMVSVCNSLEMPMRALLISALRLFLCYLPLVWIA
SQLWLLEGVIIGAMLGNTLAGLMAWSLYYNAIKKIKPAVPKIEPVLESSLDFKT

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49689; Mature: 49689

Theoretical pI: Translated: 8.81; Mature: 8.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
5.3 %Met     (Translated Protein)
6.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
5.3 %Met     (Mature Protein)
6.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRTEIIALGRDIFKQTWPMVFGILSLMSFQLADSAFISQLGVLPLAVQGFTMPLQMLFI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLQVGLGIATTAVISRMLGQKKENRARQIGGLVLIMGAVGVFVIALLMWFMRQQILTLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ASAEVNPYINEYWPVWLCSAWLGAMLYFTYSICRSHGNNFFPGILMMATSIINIALDPIF
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFYFDLGLQGAAIASICSFSIGLFIILPKLVSNNWISFDWASLPVWTSIKEVNAIMTPAM
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
MGQLLPPLASVFVTKIVAVFGVAAVAGWAMASRIEFFTLVVVLALTMSLPPMVGRLYGAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCH
DCTTIISLVKIVVLFSLLLQAVLAAILFVFAAPLAAFFSADSQVQSVIYQYLLLVPISLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SLGICMLMVSVCNSLEMPMRALLISALRLFLCYLPLVWIASQLWLLEGVIIGAMLGNTLA
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLMAWSLYYNAIKKIKPAVPKIEPVLESSLDFKT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA