| Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008709 |
| Length | 4,559,598 |
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The map label for this gene is yyaM [H]
Identifier: 119944979
GI number: 119944979
Start: 1531541
End: 1532488
Strand: Direct
Name: yyaM [H]
Synonym: Ping_1230
Alternate gene names: 119944979
Gene position: 1531541-1532488 (Clockwise)
Preceding gene: 119944978
Following gene: 119944980
Centisome position: 33.59
GC content: 42.62
Gene sequence:
>948_bases ATGGAGATCGAATTGTCTAATCAACGTACTTTCTGGCTAGCCTTTTTAGGGTTAGTGCTCACCAATCTGTTTTGGGCGAT CAATGTAACCTTAGCCCGAGGTTATATTGATCAAGTCGCACCTATTGCGCTGAATCTATTTCGCTGGCTGGGGGCTTTTA TACTGCTTACTCCCTTTGCACTGCGAGGCACAATAAAAAGTTGGCCGATAATTCGCCCTAAGCTGCTGCCTTTGACGGGA CTTGCGATATTAAGCATTAGTTGCTATAACAGCCTACTCTATCTTGCTGCTAATTTTACCACTGCCGTCAATATAACGCT GATTAATACCTTAATACCTGTGGTGACCTTATTAATTGCCTGGCGAGTACTAGGCAATCGCCCTCGATTAATGCAACTGC TAGGCATAACAATATCGATAATCGGTGTTCTACTGATTCTAACCCAGGGACAACTGTTGCGATTACTGAGCCTTAGTCTC AGTCAGGGTGATTTATTGATGTTAGCAGCGGTAACTTGTTGGGCATTATTTACTGTCTTATTAAAAAAACTGTCCATTAA ACTCTCTCCCATTATCGTTCTTTACGTGTTAATCATGCTGGGTTTGCCCTTTTTGCTTTTTGCCTACGGGATTGAAGCGC TGTTTTTTAGATCCTATTGGCCCCCTTTGTCTCATTTGGGGTTGTTCGCTTATTTGTGGGTTTTCCCGTCGATTTTTGCT TATATTTTTTGGACCTATGGGGTGCAACATATTGGCGCTGAAGCGGCTTCATTATCAATCACCTTAATGCCTCTGTTTGG TGCCACATTGGCCATTACATTTTTAGGCGAATCAATATATTGGTTTCATATCGCAGGCGGCATATGCTCTCTTTTTGGCA TGATATTGGCCCTAGTTTCACCCGAGAGATTCACCAGAAAAACTCGCCAGAAAAGTTCAGCTTGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGCAAATAAAAATTATTTTTTATTGAAGTTTACAAAAGCAGAACAGATCTTTTACGGTCTTTTATTTGAATCACTACTA CTGTCACTTTAATTTTTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGATTCAAACGAGTTATACGAAAAGAAATACTTAAGATCACCCTTCAATTTCTTTTCGTATTAGCGAATGTATGTTTAAT TTTTCCTAGCAAAGGAGTGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 315; Mature: 315
Protein sequence:
>315_residues MEIELSNQRTFWLAFLGLVLTNLFWAINVTLARGYIDQVAPIALNLFRWLGAFILLTPFALRGTIKSWPIIRPKLLPLTG LAILSISCYNSLLYLAANFTTAVNITLINTLIPVVTLLIAWRVLGNRPRLMQLLGITISIIGVLLILTQGQLLRLLSLSL SQGDLLMLAAVTCWALFTVLLKKLSIKLSPIIVLYVLIMLGLPFLLFAYGIEALFFRSYWPPLSHLGLFAYLWVFPSIFA YIFWTYGVQHIGAEAASLSITLMPLFGATLAITFLGESIYWFHIAGGICSLFGMILALVSPERFTRKTRQKSSAC
Sequences:
>Translated_315_residues MEIELSNQRTFWLAFLGLVLTNLFWAINVTLARGYIDQVAPIALNLFRWLGAFILLTPFALRGTIKSWPIIRPKLLPLTG LAILSISCYNSLLYLAANFTTAVNITLINTLIPVVTLLIAWRVLGNRPRLMQLLGITISIIGVLLILTQGQLLRLLSLSL SQGDLLMLAAVTCWALFTVLLKKLSIKLSPIIVLYVLIMLGLPFLLFAYGIEALFFRSYWPPLSHLGLFAYLWVFPSIFA YIFWTYGVQHIGAEAASLSITLMPLFGATLAITFLGESIYWFHIAGGICSLFGMILALVSPERFTRKTRQKSSAC >Mature_315_residues MEIELSNQRTFWLAFLGLVLTNLFWAINVTLARGYIDQVAPIALNLFRWLGAFILLTPFALRGTIKSWPIIRPKLLPLTG LAILSISCYNSLLYLAANFTTAVNITLINTLIPVVTLLIAWRVLGNRPRLMQLLGITISIIGVLLILTQGQLLRLLSLSL SQGDLLMLAAVTCWALFTVLLKKLSIKLSPIIVLYVLIMLGLPFLLFAYGIEALFFRSYWPPLSHLGLFAYLWVFPSIFA YIFWTYGVQHIGAEAASLSITLMPLFGATLAITFLGESIYWFHIAGGICSLFGMILALVSPERFTRKTRQKSSAC
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 DUF6 domains [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000620 [H]
Pfam domain/function: PF00892 DUF6 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 35147; Mature: 35147
Theoretical pI: Translated: 10.21; Mature: 10.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEIELSNQRTFWLAFLGLVLTNLFWAINVTLARGYIDQVAPIALNLFRWLGAFILLTPFA CCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRGTIKSWPIIRPKLLPLTGLAILSISCYNSLLYLAANFTTAVNITLINTLIPVVTLLIA HHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WRVLGNRPRLMQLLGITISIIGVLLILTQGQLLRLLSLSLSQGDLLMLAAVTCWALFTVL HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LKKLSIKLSPIIVLYVLIMLGLPFLLFAYGIEALFFRSYWPPLSHLGLFAYLWVFPSIFA HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIFWTYGVQHIGAEAASLSITLMPLFGATLAITFLGESIYWFHIAGGICSLFGMILALVS HHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHC PERFTRKTRQKSSAC CHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MEIELSNQRTFWLAFLGLVLTNLFWAINVTLARGYIDQVAPIALNLFRWLGAFILLTPFA CCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRGTIKSWPIIRPKLLPLTGLAILSISCYNSLLYLAANFTTAVNITLINTLIPVVTLLIA HHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WRVLGNRPRLMQLLGITISIIGVLLILTQGQLLRLLSLSLSQGDLLMLAAVTCWALFTVL HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LKKLSIKLSPIIVLYVLIMLGLPFLLFAYGIEALFFRSYWPPLSHLGLFAYLWVFPSIFA HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIFWTYGVQHIGAEAASLSITLMPLFGATLAITFLGESIYWFHIAGGICSLFGMILALVS HHHHHHHHHHHCCHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHC PERFTRKTRQKSSAC CHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 7.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7584024; 9384377 [H]