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The map label for this gene is ydbH [C]

Identifier: 119944390

GI number: 119944390

Start: 800395

End: 802416

Strand: Direct

Name: ydbH [C]

Synonym: Ping_0618

Alternate gene names: 119944390

Gene position: 800395-802416 (Clockwise)

Preceding gene: 119944389

Following gene: 119944391

Centisome position: 17.55

GC content: 38.72

Gene sequence:

>2022_bases
GTGAGTGTGCTTTGCAGCAGAAAGTTTTATCTCATTATTTTTTTCAGCTATGGTTTGCTGTTGCTAAGCAAACCATTAGC
GAATGCCAATGAGTTGAAGGAAATGACGGAACAAGAGTTGTCATTCTTAACCTGGCTTCCTCTTCTGTCGAGCAGTTTAA
AACGTTTACAACCGGATATTCACTGCCCGCAAAATCAGATGACTGATATTCAAGTGATTAAAGAAAAAGATAAGATCAAC
AGCTCTATCGGCTCGATTGATTGGGACTTAAACTGTCAACGCTCTAATGCAGGGCAAAATCCCTCACTAACCTTAAACAA
ATCTCAAACGACTTCTCAACTCGCTCAGCTCTTAACATTTCTGGCGCGATTACCCGATACTGAGATAATGGTTAAATCGG
TTAATTTGAGATCAGCACGGCTTAAGAAAAAACTGTCATTTAATGTGCATCTCAACAAAACCAAACAAGCGGTGTTTATT
CGCTTATCAAATGAATCCGGGCAGCTAACGGTCAATGTGGATCTTTTAAAGAAAGAGCTTCATTTAAAGACAGTATTTAA
AGCAGAAAAATTTATTCAATATATTAAACTGCCGGAAGCTTACTTTGATTTAATTAAAGGGTCATTCACCTTCAGCTATT
CAGCCGATTTGAAAAAATGGGAACAGGGTCAGTTTGTTTTAAATTCTAGCGCAGATATGACCCTTTTAGCTGAAAAAATG
GTGATGAAGTTGGTGGGAGAGTTTAATATTTTAACCGGGCAGGTGAGTTTACAGAAAATGGACTTAGGCTTAACGAAAAT
TAATTATGCACTAACAAATAACATCCTATTGAAAACGCCTTACGTGAAACTGACACTGCCAGAACCTGCGAGTATAAATT
TATCTGACGGCATAAATATTAATACTTTACCGCTGCACCTGCGTATTGGCGGCGGTGCTATGCAAACAAAAATGGAACCA
CTTATAAAGTCCAGCATTCGAACTAAAACGCAGAGATTTCCACCGCTGCTTGCTAATATTAAAGTGCATGGCAGGACTAA
TAATCTCAATATTGACTGGTCTCTGTCTTTAATAAACAGCGCTATTGCAGGTTCCCTTAACTACCATTCCAAACTACTCA
CGGCGAACATAAAAAATGGACAGCTCTCAGCGCCCGTGCTTATTGATGGACTGCAGAGTTATGTGCCTGCAGTGCAAAAT
TGGTCTGTTGAAAAAGGGTCAATTAACTACCAGCTAAATGCAAGCTATAATTTGCAAAAAAAAACCGGTTATGTGAAAAG
TTCACTGCAGGGACAGGATATCGCGGGGCAAAAAGGAACTATTTTATTTGATGGTTTGACCTTTAACAGCGATACTGATT
TTGAAATTAAAAGCGCCAATGTTCATATCAAACAGGGCCAACAGCAGTTAATGGTGGATAATTTGTTTGTGGGAGTACCC
ATTCAGGCGATGCAGATAGATGCTCATAACAGCGCCGGAATCACTGTAATTGATGAATTTAGCGCACATTTACTAGGTGG
AGAGGTCACCCTTGAAAATCTTAAAATACAACCGCAAAGTAGCAGTTCGCTCAAGCTTTCCGGTTTAAGTTTGAGCGAGA
TAATCAAATATAGTGCCTATCCGGCGATTACCGCAAACGGTCTCCTTGATGGTGTTTTACCTTTAACATTAACTTCCAAA
GGTCTAAATATAAAAAAAGGTGTTATTTTTGCACGGGCACCTGGTGGATATATTAAGGTTCCACAGGATGACGTGGTGAA
AAAAATGGCCAGCACACATCCGACATTTGCATTTACTTTACGGTTATTATCTAATTTTCAGTTTGATACTTTGCAGGGAA
AGATAGGTTATACTGCAGATGGTGAAATCGATATTAACGCTGAAATTCACGGTGTAAATCCCGATGTGAGTGGTGTACAA
CCGGTTAAATTTAATTATTCTCATACTGAAAATATGTTAAAACTGTTGGAGAGTTTACGTTTTTCTGATGAATTAACGCG
TCAAATACAGGAGAACTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCTGAAGAATTGATGCGTGAAAAACATATTAAGTGGCTGGTGGTGAGTGAAGATGGTAAAAAACTTGATGGTATTATTG
AGTGGGTGCAATAAGTCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAAAACGAATTATTATTTTATTTCCATTGATTATTATTATGTCGGCATGCACACCTCGCGTGGAGTTGGCAATGCCG
AGCGAACCTATTACAATTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 673; Mature: 672

Protein sequence:

>673_residues
MSVLCSRKFYLIIFFSYGLLLLSKPLANANELKEMTEQELSFLTWLPLLSSSLKRLQPDIHCPQNQMTDIQVIKEKDKIN
SSIGSIDWDLNCQRSNAGQNPSLTLNKSQTTSQLAQLLTFLARLPDTEIMVKSVNLRSARLKKKLSFNVHLNKTKQAVFI
RLSNESGQLTVNVDLLKKELHLKTVFKAEKFIQYIKLPEAYFDLIKGSFTFSYSADLKKWEQGQFVLNSSADMTLLAEKM
VMKLVGEFNILTGQVSLQKMDLGLTKINYALTNNILLKTPYVKLTLPEPASINLSDGININTLPLHLRIGGGAMQTKMEP
LIKSSIRTKTQRFPPLLANIKVHGRTNNLNIDWSLSLINSAIAGSLNYHSKLLTANIKNGQLSAPVLIDGLQSYVPAVQN
WSVEKGSINYQLNASYNLQKKTGYVKSSLQGQDIAGQKGTILFDGLTFNSDTDFEIKSANVHIKQGQQQLMVDNLFVGVP
IQAMQIDAHNSAGITVIDEFSAHLLGGEVTLENLKIQPQSSSSLKLSGLSLSEIIKYSAYPAITANGLLDGVLPLTLTSK
GLNIKKGVIFARAPGGYIKVPQDDVVKKMASTHPTFAFTLRLLSNFQFDTLQGKIGYTADGEIDINAEIHGVNPDVSGVQ
PVKFNYSHTENMLKLLESLRFSDELTRQIQENY

Sequences:

>Translated_673_residues
MSVLCSRKFYLIIFFSYGLLLLSKPLANANELKEMTEQELSFLTWLPLLSSSLKRLQPDIHCPQNQMTDIQVIKEKDKIN
SSIGSIDWDLNCQRSNAGQNPSLTLNKSQTTSQLAQLLTFLARLPDTEIMVKSVNLRSARLKKKLSFNVHLNKTKQAVFI
RLSNESGQLTVNVDLLKKELHLKTVFKAEKFIQYIKLPEAYFDLIKGSFTFSYSADLKKWEQGQFVLNSSADMTLLAEKM
VMKLVGEFNILTGQVSLQKMDLGLTKINYALTNNILLKTPYVKLTLPEPASINLSDGININTLPLHLRIGGGAMQTKMEP
LIKSSIRTKTQRFPPLLANIKVHGRTNNLNIDWSLSLINSAIAGSLNYHSKLLTANIKNGQLSAPVLIDGLQSYVPAVQN
WSVEKGSINYQLNASYNLQKKTGYVKSSLQGQDIAGQKGTILFDGLTFNSDTDFEIKSANVHIKQGQQQLMVDNLFVGVP
IQAMQIDAHNSAGITVIDEFSAHLLGGEVTLENLKIQPQSSSSLKLSGLSLSEIIKYSAYPAITANGLLDGVLPLTLTSK
GLNIKKGVIFARAPGGYIKVPQDDVVKKMASTHPTFAFTLRLLSNFQFDTLQGKIGYTADGEIDINAEIHGVNPDVSGVQ
PVKFNYSHTENMLKLLESLRFSDELTRQIQENY
>Mature_672_residues
SVLCSRKFYLIIFFSYGLLLLSKPLANANELKEMTEQELSFLTWLPLLSSSLKRLQPDIHCPQNQMTDIQVIKEKDKINS
SIGSIDWDLNCQRSNAGQNPSLTLNKSQTTSQLAQLLTFLARLPDTEIMVKSVNLRSARLKKKLSFNVHLNKTKQAVFIR
LSNESGQLTVNVDLLKKELHLKTVFKAEKFIQYIKLPEAYFDLIKGSFTFSYSADLKKWEQGQFVLNSSADMTLLAEKMV
MKLVGEFNILTGQVSLQKMDLGLTKINYALTNNILLKTPYVKLTLPEPASINLSDGININTLPLHLRIGGGAMQTKMEPL
IKSSIRTKTQRFPPLLANIKVHGRTNNLNIDWSLSLINSAIAGSLNYHSKLLTANIKNGQLSAPVLIDGLQSYVPAVQNW
SVEKGSINYQLNASYNLQKKTGYVKSSLQGQDIAGQKGTILFDGLTFNSDTDFEIKSANVHIKQGQQQLMVDNLFVGVPI
QAMQIDAHNSAGITVIDEFSAHLLGGEVTLENLKIQPQSSSSLKLSGLSLSEIIKYSAYPAITANGLLDGVLPLTLTSKG
LNIKKGVIFARAPGGYIKVPQDDVVKKMASTHPTFAFTLRLLSNFQFDTLQGKIGYTADGEIDINAEIHGVNPDVSGVQP
VKFNYSHTENMLKLLESLRFSDELTRQIQENY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74703; Mature: 74572

Theoretical pI: Translated: 9.71; Mature: 9.71

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSVLCSRKFYLIIFFSYGLLLLSKPLANANELKEMTEQELSFLTWLPLLSSSLKRLQPDI
CCCEECCCEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
HCPQNQMTDIQVIKEKDKINSSIGSIDWDLNCQRSNAGQNPSLTLNKSQTTSQLAQLLTF
CCCCCCCCHHEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHH
LARLPDTEIMVKSVNLRSARLKKKLSFNVHLNKTKQAVFIRLSNESGQLTVNVDLLKKEL
HHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHH
HLKTVFKAEKFIQYIKLPEAYFDLIKGSFTFSYSADLKKWEQGQFVLNSSADMTLLAEKM
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHH
VMKLVGEFNILTGQVSLQKMDLGLTKINYALTNNILLKTPYVKLTLPEPASINLSDGINI
HHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCEEEECCEEEEECCCCCEEECCCCCEE
NTLPLHLRIGGGAMQTKMEPLIKSSIRTKTQRFPPLLANIKVHGRTNNLNIDWSLSLINS
EEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHH
AIAGSLNYHSKLLTANIKNGQLSAPVLIDGLQSYVPAVQNWSVEKGSINYQLNASYNLQK
HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHH
KTGYVKSSLQGQDIAGQKGTILFDGLTFNSDTDFEIKSANVHIKQGQQQLMVDNLFVGVP
HCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECEEECCCCCEEEEECEEEEECCCHHHHHHHEEECCC
IQAMQIDAHNSAGITVIDEFSAHLLGGEVTLENLKIQPQSSSSLKLSGLSLSEIIKYSAY
EEEEEEECCCCCCEEEEECCCHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCC
PAITANGLLDGVLPLTLTSKGLNIKKGVIFARAPGGYIKVPQDDVVKKMASTHPTFAFTL
CCEEECCHHCCCEEEEEECCCCCEECCEEEEECCCCEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
RLLSNFQFDTLQGKIGYTADGEIDINAEIHGVNPDVSGVQPVKFNYSHTENMLKLLESLR
HHHHCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHC
FSDELTRQIQENY
CCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SVLCSRKFYLIIFFSYGLLLLSKPLANANELKEMTEQELSFLTWLPLLSSSLKRLQPDI
CCEECCCEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
HCPQNQMTDIQVIKEKDKINSSIGSIDWDLNCQRSNAGQNPSLTLNKSQTTSQLAQLLTF
CCCCCCCCHHEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHH
LARLPDTEIMVKSVNLRSARLKKKLSFNVHLNKTKQAVFIRLSNESGQLTVNVDLLKKEL
HHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHH
HLKTVFKAEKFIQYIKLPEAYFDLIKGSFTFSYSADLKKWEQGQFVLNSSADMTLLAEKM
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHH
VMKLVGEFNILTGQVSLQKMDLGLTKINYALTNNILLKTPYVKLTLPEPASINLSDGINI
HHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCEEEECCEEEEECCCCCEEECCCCCEE
NTLPLHLRIGGGAMQTKMEPLIKSSIRTKTQRFPPLLANIKVHGRTNNLNIDWSLSLINS
EEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHH
AIAGSLNYHSKLLTANIKNGQLSAPVLIDGLQSYVPAVQNWSVEKGSINYQLNASYNLQK
HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHH
KTGYVKSSLQGQDIAGQKGTILFDGLTFNSDTDFEIKSANVHIKQGQQQLMVDNLFVGVP
HCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECEEECCCCCEEEEECEEEEECCCHHHHHHHEEECCC
IQAMQIDAHNSAGITVIDEFSAHLLGGEVTLENLKIQPQSSSSLKLSGLSLSEIIKYSAY
EEEEEEECCCCCCEEEEECCCHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHCCC
PAITANGLLDGVLPLTLTSKGLNIKKGVIFARAPGGYIKVPQDDVVKKMASTHPTFAFTL
CCEEECCHHCCCEEEEEECCCCCEECCEEEEECCCCEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
RLLSNFQFDTLQGKIGYTADGEIDINAEIHGVNPDVSGVQPVKFNYSHTENMLKLLESLR
HHHHCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHC
FSDELTRQIQENY
CCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA