Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is 119944323

Identifier: 119944323

GI number: 119944323

Start: 701886

End: 705425

Strand: Direct

Name: 119944323

Synonym: Ping_0550

Alternate gene names: NA

Gene position: 701886-705425 (Clockwise)

Preceding gene: 119944322

Following gene: 119944324

Centisome position: 15.39

GC content: 41.55

Gene sequence:

>3540_bases
ATGACTGTGAAAAATATAAGTACTTTAGTAGATAAGGTACCAGAACAATTTCTTTCGCCAGAGGGCGATAAATCTTATCA
ATCCAAAAAAGTAGATCAGATGGAAAATTTATCAAATAGTGTTTCAGGGAAGTTTATTGCCATTGATGGCGATAAATACT
ATCAAATAAAAAATGTGGATCAGATGGCGCCCTTTTTTATCAGTGTTGTATCAGCCAGTGATCACTGGTTGTTTATTTCA
TCTACGGGCTGTTTATCTGCTGGTAGAATACGCCCAGAAAATGCTTTATTCCCCTATAAATCCGTAGATTATATCCACGA
GAGTGCCGAAAACACCGGCAGTAAAACCATTGTTAAAGTGCAGACTAAAAACGGTTGCAGAACATGGGAGCCCTTTAATC
TGCAGCACAATAGCCTTTATGAGGTACAGCGTAATCTTTATAAAAACATTGCTGGTGACAAGATTATTTTTGAAGAGATA
AACCTTGATTTGGGGCTGACCTTTAAATATCAATGGGCGACCAGTGACCAGTTTGGTTTTGTTAGAAGCTCAACGGTAAC
AAATAATGATCAGAAAGCCGTCGTATTTGAACTGCTTGATGGCATTCAAAATATTTTACCCCCTAACGCGCCGCTTTCCC
TTATGCAAACCAGCAGTGCATTAATTGATGCTTATAAGTGGAATGAATTACTGCCTGAATCCACACTCGCCACTTATAGT
TTGTATGCAAAATTAAGTGATCGAGCGGAGCCTGCTGAGTCACTGCTTGCCACATCAGTATTTAGTATTATTGATAATTG
TCAGTCGGTTTTATTGTCAAGTCGGCAGTTAGGCGCTTTCCGTCGCGGCCAACAAATTAATAATGAGGAATTGTGCCGTG
GCCTGAGAGGGGCATATTTTATTCATAAAAAATGTCAACTCAGTGCCGGTCAACAAGATAGCTGGCAGATTGTGGCTAAT
ATCGATCAATCTCATGCTGATATTGCTGCGCTAAAACAACATATTCAGGCTGATGATCTTATTAAAACCGCGGTAATAGG
GTCAGTTGAAGCTAACCATCAGGATCTTATTATGTTGATGGCGGGCAGCGATGCCTATCAGAAAACGGCAGAAGAGGAGA
CGACTGTCCACCACTATGCCAATGTGTTATTTAATAATATGCGTGGCGGTGTTGTTGTCGATCAATACTGGGTAGAAAAG
CCTGATTTTGTTAAAACGCTGACCAGTGCCAACAAGGTTGTTGCAGCGAATAATCGCGACTTTTTTGCAACGCTTCCTGA
ACGTATCGCTTATCAAGCCTTGCTTGCATCGGCTGCAGAGCAGAACGACCCTCAGCTTTTACGTCTTTGCCATGAATACC
TGCCGTTAACTTTTGGACGTCGTCATGGTGATCCCAGCCGTCCATGGAACCATTTTGAAATTAAGTTAAAAGATACGAAT
GGTGACCGATTATTATCTTATCAGGGTAACTGGCGTGATATTTTCCAAAACTGGGAAGCATTGGGCCTGAGTTATCCTCA
CTTTATTAAGTCGTTTATCTCAAAATTTGTTAACGCATCAACCATTGATGGCTATAATCCTTACCGTATTACCAAAGCAG
GGGTTGATTGGGAACAGCTGGAAGAAGATGATCTCTGGGGTAATATAGGTTACTGGGGTGATCACCAGATTATTTATCTG
CTTAAGTTTTTGGAATTATCAAAGAAATTCCAACCGCAAGAGCTTAAAGCGCTATTGAATGCTGATATTTTCAGCTATGC
CAATGTTCCCTATGAAATTAAAGACGTTGATCAATTATTTGCCGATCCTAAAAATACCGTTATCTTCAATAATGAAAAAC
AAGCTGTTATCGAAGCGAAAGTAGCACAATTGGGCAGTGATGGACGCTTGTTATTGAAGGCTGATGACAGTGTCTATCTG
GTTAATTTAACGGAGAAACTATTAATACCTTTGCTGGCGAAACTGGGCAACCTGGTGGTGGACGGTGGGATCTGGTTAAA
TACACAGCGCCCTGAATGGAATGATGCCAATAACGCCATTGTAGGCACGGGTCTATCGATGGTGACTTTGTACTACATGC
GTCGTTATATTGCCTTTTTACAAGCGTTACTTATTGATCATAGCGGTACAGTTGCGCTTTCTGCCGAGCTTGCAAAATGG
GTTAGCAGTACAGGCGAAATTCTGCAGCAAGCCGCTGTTCTGATTGATGATAATAAAATTAACAGTGAAGCACGTAACGA
TCTGCTCAGAAAACTTGCCGGTGCTGCGGGTGACTACCGCGCTGTTGTTTATAAAAATGGTTTCTCGGGTAAAATTGCGT
TTGACTGCTCGGTTATCAACGGAATGTTAAACGCCAGCCTGCAGGTGATTGATCAAAGCATTCAGACTAATCTGCGTCAG
GATGGCTTGTATAATGCCTATAACATTATTAATTGTACGCCTGATAATATTAATGTTGACGTGCTCTATCCGATGCTTGA
AGGTCAGGTAGCAGTTTTATCCTCGGGGGTATTAACACCGGAACAAGCTGTTACTTTAATAGATAATTTGTATGCGAGTG
ATATGTTCCGCGCGGATCAGCAAACTTTTATGCTCTATCCAGATCGTGATTTATCGTGCTTTGCCGCTAAAAACTGTATT
GATGGTACGCGTGTCAATGACAACCGGCTGCTTAAATTAATGGCTGAAAAAGGGGATCGCCGTTTAATTGAAGTCGATGC
TGAAGGTGTTTATCATTTTAATGCCAACTTTGAAAATGCGACTTTCCTAAAAAATGCGCTTCAGGAAGTTAAAGCTGATT
ACTTGAGTATTGAGAGTGCCACCTTCGCGGACGTTCTAATCTGCTATGAAGAGGTTTTTAATCACCAGGCATTTACAGGG
CGCTCAGGGACGATGTTCGGCTATGAAGGTTTGGGCAGTATCTACTGGCATATGGTCTCTAAGTTATTGCTTGCTGTTCA
GGAAAACTATTTTACAGCGTGGAACAACAATGCGGATTCTGAAGCGACTGGTAAGCTTGCGGAGTATTATTATAAAGTAC
GCGCCGGGATAGGTTTTAATAAAACCCCTGATGTTTATGGTGCGTTCCCGACCGACCCGTATTCTCATACACCCAAACAA
GCCGGTGCTCAACAGCCTGGTATGACCGGGCAGGTAAAAGAAGAGATCCTGACTCGTTTTGGTGAATTGGGGCTGCTGGT
TAAAAATGGTCAAATTTATTTCCAGCCAACGCTGCTTAAAGAAACGGAGTTTTTGTCTGTGGACGACGAATTTGAGTTTA
TTGATATTAACAGTGAATATAAAAAAATCTCGTTAGCACCACGTATGTTGGCATTTACTTACTGCCAAGTTCCTTTCGTG
TATGAGGTTGTAGGAGCTGAAGAGGCAGGCGTGACGGTTGAACATGAAAATGGTTCAACGCTGCAGTTTAATACATTAGC
ACTGAGCAACTTGATCAGTTCTCAAATATTTTCCCGTTGCGCTGAGATTGAACAGGTCAAGGTTTCTATTCCGGAAACTA
TGTTATTGAAAACATATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTTCATCCGATGTTTTAATATCTAAGACTATGCTGAAACTTAAATTTAAGTGTCAGCATAGTGTCAGATAAAGAAAGC
GCTTACTTAAGGTTTACTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGTGAGAGTGAATAGTCACCTGTTAGAGGTGTCTGAATACAATACGGCGGGCTATGCGCCCGTCGTTGATTTTCAGGCA
TGGCGAGTCGCAATACTTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1179; Mature: 1178

Protein sequence:

>1179_residues
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YEVVGAEEAGVTVEHENGSTLQFNTLALSNLISSQIFSRCAEIEQVKVSIPETMLLKTY

Sequences:

>Translated_1179_residues
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>Mature_1178_residues
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EVVGAEEAGVTVEHENGSTLQFNTLALSNLISSQIFSRCAEIEQVKVSIPETMLLKTY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 132395; Mature: 132264

Theoretical pI: Translated: 4.84; Mature: 4.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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LQFNTLALSNLISSQIFSRCAEIEQVKVSIPETMLLKTY
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEECC
>Mature Secondary Structure 
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EECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCE
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CCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCEEE
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ETEFLSVDDEFEFIDINSEYKKISLAPRMLAFTYCQVPFVYEVVGAEEAGVTVEHENGST
CCEEEECCCCEEEEECCCCHHEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEEECCCCCE
LQFNTLALSNLISSQIFSRCAEIEQVKVSIPETMLLKTY
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA