Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 119357920

Identifier: 119357920

GI number: 119357920

Start: 2467402

End: 2470149

Strand: Reverse

Name: 119357920

Synonym: Cpha266_2135

Alternate gene names: NA

Gene position: 2470149-2467402 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119357921

Following gene: 119357917

Centisome position: 78.82

GC content: 26.89

Gene sequence:

>2748_bases
ATGAATAAATTTATCGATCATTTTGTTAGAGTAGTGTTTTTTATTCTTTTTTTATTTATATCCAATTTATCTGTTTCTTA
CGCAAGAGTTATAAAGAATATTCAGGGTAAAAATTTTGAGGTAATTGATTCAGTTGCAGTTAAACATATGGATCTTATAG
AATTAATTCTTAAAACAGAATCAATGGATGATAATGAGAGGCAATATTGGCTAGATGTTTTGCCATACATGACCAAAGCT
CAAGTGGATCGATTGTATCATATTCTTGAAAAAGAAAGAACGGCATTATTTGATCTCGAAAAAAAATACCAAGATGCCCT
TAAGGCTATAAATAACAAATATATGGGTAAGTATTTGAAGATAAAATATGACCAACATTCCAAATTAAGCAAAAAACCAC
TTTTTTTTGTAGAGAAAATCGATTGTGAAGGAAATAAATTCGTGATAAAAAAATATTCTAATAATAAAAATATAGATTCG
AGAATTTTTATTGGTCTTAGTGAGTTAAATGATTTGTATTATGATAAATTATTAAGTGCAGGAGATAAATTTAATATTCT
GATATTTATTCAATACATTATTAATGATTATAATGAATATGCTCATATTTATGAACGAGATGATATTATGAAGCTTTTTA
AAATTACATTTCACATCGCATTTGATTTTGATGATCTGAAGATTTTAGATGATATGCTTTTAATGATGAAAAAAGATAAA
GATACTTTTTCTGATATAGAAAAAAATTATTATTTGTATAAGTATCATGTTTTTAAAAAAGAACATAGTAAGGCATTGGG
GGTAATCGAAAAGGTTTTTGATGGATTGATCGATAACAAAAATATGACAAAAATATGGATAAATGATTGTTTGTATATCC
CGCATATAATGTTAGGTGAAATGTACGGAAAAAATAGTGCTTTTAATGAAATGGTTATAAAAAAATATATAAAACTTATT
TTGAGTTCTCCCGGTGGTTTAGATTATTCTGTGAAGAAAGGCGATGTTCAATCAAGACTTATTTTACTGGATATTTTCAG
AAAAATATATGCAGATATGTTTACTGATAAAGAAAAAATAATGGTTGATAATTACCTAAAGAAAAAAATTGATGAAAAAT
CATATTTTAAAAATAGCCGTGATTCTGAGTGGTATTACATCTTAAATCAAGCATATTTTAAAGGAGATATTGGAAAACTA
TATAATGATCATAAGAAAAATATATTAGAAAAAAAGCAGAGAGGCTACATGCTTGATGGTGTAATCATAGAGTCAGGTGT
TTTTTATGCATTTAAGCTATACGAACAAAAAAAATATACAGAAGCTCTAAATATTTTAGATGACTTGAAAATTATTGGTG
AAAGTGTTAAGTCACCAGCTAAAGGTTACGTGGAGAAATATTTAGCAGAGGCGCTAAATATTAAAATTCAAGAAAAGCTA
TCTTTTACTGGGCAGTTAACTTCGCTTATGAATTCCTTTTTCGCACTCAATTCAGCTTATATTACATCAATACTGTCTTT
TTTGATTTTTGTTATAATATATCTACTATATATTATATTTCCATACTGGGATCTTTTTCAAATAAAGGTATTAAACGATT
ACATTTTTAATAAAATTATTTTCTTGCCGGCAACACCTTTAATAATTACTAGGATTTTGAGATATCTAGAAAATAAATCA
TATCCCCTGATTCCTTTTATACCATATGATTATCGATTAAATAAATATGAATTCCAAGCTTGTTATATTCCGATTTCACT
CATTGACAGTGACCAGTATGTGCATTCATCTGTTTTTGAAAATATCACCTCAAAAAATGCGAGCATAGTGACGCTATATG
GTGAAGGTGGAATGGGAAAAACCCTTACAGCTCAAAAGGTTTGCTTTGACCTTTCAAAAAAAGGGTATCTACCTGTTTTC
TTAGAAGAAAAAATATTGGGAGAAGATATAGATGAGAATAAGTTGGAAATGCTTATAGGGAGTTTTTATAAAAATAAAAG
GTTGATTGAGACTTTAAGCAAAATGGCGTTTTCTAAATATGTATTTGTTATAGATGATATAATGTCAAAGAATACTTATA
GCATAATAATGAAGATAAGAGCAATACAGCAAAAGGCAATATTTATTCTTACTACAAGAAATGAGGAAATAATAGAAAAA
TCTGATTTCTCTGTTCAGTTAAATTCATCAAATGTTGATTTTGGTAAATACATTAAAACAGGGATGGGAGATCGTATAAA
AGCATATGAGTCATTTGTGATGCAAATTAAAAACACTTTATTAATATCGATAATAATAAAAAACGATATAGATCTTACAG
ATATAATAAGAAATAAGCCATCAGGTTTGGATATGGAAAGAATAATACTTAAAAAATATATTGATTATCAAATAGAACTT
ATATGCAAAAAATATAATCCTGATTTGAAAATTAACTACTCAACATATCTTCTAAAAAAAACATTATGCTATTTAGCTCA
TTCAGTGAGTCAATCATTGCCCGTGAATAACTGTTTATGCGAAATGGACAAAAATCAAAAAAATGATCAATACTATCGCG
ATATAATGAATCTGGATAATAATAAGCAAAAAAATAACCTTCAAATACTTGATTCAATGCAAAACTCGGCTATTGTTTAT
ATAGATTCATCAAATAATATAAAGTTTACGCATGACCTAATAGGTAAATATATGTTGGAGACATGCGAAAAAAATAACAT
ACAAAACTTGGTAACGAATGATAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAGTTTTATGACTCAGCAAAAGCAGGTAATATAAAAATATGCGAATGATTTAGTCTTGGAGTTCGAGCTATTTAAATCT
CGTATTAATAAGATAAGATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCCCGACAGAAAACTCCTTATTTATGAAAATTCAGTCAATAGCGAGATCGTACAATACATTTTTAATTGAACAAATATC
TGCGTATAACCCGTTCTTTA

Product: tetratricopeptide TPR_3

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 915; Mature: 915

Protein sequence:

>915_residues
MNKFIDHFVRVVFFILFLFISNLSVSYARVIKNIQGKNFEVIDSVAVKHMDLIELILKTESMDDNERQYWLDVLPYMTKA
QVDRLYHILEKERTALFDLEKKYQDALKAINNKYMGKYLKIKYDQHSKLSKKPLFFVEKIDCEGNKFVIKKYSNNKNIDS
RIFIGLSELNDLYYDKLLSAGDKFNILIFIQYIINDYNEYAHIYERDDIMKLFKITFHIAFDFDDLKILDDMLLMMKKDK
DTFSDIEKNYYLYKYHVFKKEHSKALGVIEKVFDGLIDNKNMTKIWINDCLYIPHIMLGEMYGKNSAFNEMVIKKYIKLI
LSSPGGLDYSVKKGDVQSRLILLDIFRKIYADMFTDKEKIMVDNYLKKKIDEKSYFKNSRDSEWYYILNQAYFKGDIGKL
YNDHKKNILEKKQRGYMLDGVIIESGVFYAFKLYEQKKYTEALNILDDLKIIGESVKSPAKGYVEKYLAEALNIKIQEKL
SFTGQLTSLMNSFFALNSAYITSILSFLIFVIIYLLYIIFPYWDLFQIKVLNDYIFNKIIFLPATPLIITRILRYLENKS
YPLIPFIPYDYRLNKYEFQACYIPISLIDSDQYVHSSVFENITSKNASIVTLYGEGGMGKTLTAQKVCFDLSKKGYLPVF
LEEKILGEDIDENKLEMLIGSFYKNKRLIETLSKMAFSKYVFVIDDIMSKNTYSIIMKIRAIQQKAIFILTTRNEEIIEK
SDFSVQLNSSNVDFGKYIKTGMGDRIKAYESFVMQIKNTLLISIIIKNDIDLTDIIRNKPSGLDMERIILKKYIDYQIEL
ICKKYNPDLKINYSTYLLKKTLCYLAHSVSQSLPVNNCLCEMDKNQKNDQYYRDIMNLDNNKQKNNLQILDSMQNSAIVY
IDSSNNIKFTHDLIGKYMLETCEKNNIQNLVTNDN

Sequences:

>Translated_915_residues
MNKFIDHFVRVVFFILFLFISNLSVSYARVIKNIQGKNFEVIDSVAVKHMDLIELILKTESMDDNERQYWLDVLPYMTKA
QVDRLYHILEKERTALFDLEKKYQDALKAINNKYMGKYLKIKYDQHSKLSKKPLFFVEKIDCEGNKFVIKKYSNNKNIDS
RIFIGLSELNDLYYDKLLSAGDKFNILIFIQYIINDYNEYAHIYERDDIMKLFKITFHIAFDFDDLKILDDMLLMMKKDK
DTFSDIEKNYYLYKYHVFKKEHSKALGVIEKVFDGLIDNKNMTKIWINDCLYIPHIMLGEMYGKNSAFNEMVIKKYIKLI
LSSPGGLDYSVKKGDVQSRLILLDIFRKIYADMFTDKEKIMVDNYLKKKIDEKSYFKNSRDSEWYYILNQAYFKGDIGKL
YNDHKKNILEKKQRGYMLDGVIIESGVFYAFKLYEQKKYTEALNILDDLKIIGESVKSPAKGYVEKYLAEALNIKIQEKL
SFTGQLTSLMNSFFALNSAYITSILSFLIFVIIYLLYIIFPYWDLFQIKVLNDYIFNKIIFLPATPLIITRILRYLENKS
YPLIPFIPYDYRLNKYEFQACYIPISLIDSDQYVHSSVFENITSKNASIVTLYGEGGMGKTLTAQKVCFDLSKKGYLPVF
LEEKILGEDIDENKLEMLIGSFYKNKRLIETLSKMAFSKYVFVIDDIMSKNTYSIIMKIRAIQQKAIFILTTRNEEIIEK
SDFSVQLNSSNVDFGKYIKTGMGDRIKAYESFVMQIKNTLLISIIIKNDIDLTDIIRNKPSGLDMERIILKKYIDYQIEL
ICKKYNPDLKINYSTYLLKKTLCYLAHSVSQSLPVNNCLCEMDKNQKNDQYYRDIMNLDNNKQKNNLQILDSMQNSAIVY
IDSSNNIKFTHDLIGKYMLETCEKNNIQNLVTNDN
>Mature_915_residues
MNKFIDHFVRVVFFILFLFISNLSVSYARVIKNIQGKNFEVIDSVAVKHMDLIELILKTESMDDNERQYWLDVLPYMTKA
QVDRLYHILEKERTALFDLEKKYQDALKAINNKYMGKYLKIKYDQHSKLSKKPLFFVEKIDCEGNKFVIKKYSNNKNIDS
RIFIGLSELNDLYYDKLLSAGDKFNILIFIQYIINDYNEYAHIYERDDIMKLFKITFHIAFDFDDLKILDDMLLMMKKDK
DTFSDIEKNYYLYKYHVFKKEHSKALGVIEKVFDGLIDNKNMTKIWINDCLYIPHIMLGEMYGKNSAFNEMVIKKYIKLI
LSSPGGLDYSVKKGDVQSRLILLDIFRKIYADMFTDKEKIMVDNYLKKKIDEKSYFKNSRDSEWYYILNQAYFKGDIGKL
YNDHKKNILEKKQRGYMLDGVIIESGVFYAFKLYEQKKYTEALNILDDLKIIGESVKSPAKGYVEKYLAEALNIKIQEKL
SFTGQLTSLMNSFFALNSAYITSILSFLIFVIIYLLYIIFPYWDLFQIKVLNDYIFNKIIFLPATPLIITRILRYLENKS
YPLIPFIPYDYRLNKYEFQACYIPISLIDSDQYVHSSVFENITSKNASIVTLYGEGGMGKTLTAQKVCFDLSKKGYLPVF
LEEKILGEDIDENKLEMLIGSFYKNKRLIETLSKMAFSKYVFVIDDIMSKNTYSIIMKIRAIQQKAIFILTTRNEEIIEK
SDFSVQLNSSNVDFGKYIKTGMGDRIKAYESFVMQIKNTLLISIIIKNDIDLTDIIRNKPSGLDMERIILKKYIDYQIEL
ICKKYNPDLKINYSTYLLKKTLCYLAHSVSQSLPVNNCLCEMDKNQKNDQYYRDIMNLDNNKQKNNLQILDSMQNSAIVY
IDSSNNIKFTHDLIGKYMLETCEKNNIQNLVTNDN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107683; Mature: 107683

Theoretical pI: Translated: 8.82; Mature: 8.82

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKFIDHFVRVVFFILFLFISNLSVSYARVIKNIQGKNFEVIDSVAVKHMDLIELILKTE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SMDDNERQYWLDVLPYMTKAQVDRLYHILEKERTALFDLEKKYQDALKAINNKYMGKYLK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
IKYDQHSKLSKKPLFFVEKIDCEGNKFVIKKYSNNKNIDSRIFIGLSELNDLYYDKLLSA
EEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCC
GDKFNILIFIQYIINDYNEYAHIYERDDIMKLFKITFHIAFDFDDLKILDDMLLMMKKDK
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DTFSDIEKNYYLYKYHVFKKEHSKALGVIEKVFDGLIDNKNMTKIWINDCLYIPHIMLGE
CHHHHHHCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH
MYGKNSAFNEMVIKKYIKLILSSPGGLDYSVKKGDVQSRLILLDIFRKIYADMFTDKEKI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVDNYLKKKIDEKSYFKNSRDSEWYYILNQAYFKGDIGKLYNDHKKNILEKKQRGYMLDG
HHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEC
VIIESGVFYAFKLYEQKKYTEALNILDDLKIIGESVKSPAKGYVEKYLAEALNIKIQEKL
EEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEHHHH
SFTGQLTSLMNSFFALNSAYITSILSFLIFVIIYLLYIIFPYWDLFQIKVLNDYIFNKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEE
FLPATPLIITRILRYLENKSYPLIPFIPYDYRLNKYEFQACYIPISLIDSDQYVHSSVFE
ECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHH
NITSKNASIVTLYGEGGMGKTLTAQKVCFDLSKKGYLPVFLEEKILGEDIDENKLEMLIG
HHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCHHHHHHHH
SFYKNKRLIETLSKMAFSKYVFVIDDIMSKNTYSIIMKIRAIQQKAIFILTTRNEEIIEK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHCC
SDFSVQLNSSNVDFGKYIKTGMGDRIKAYESFVMQIKNTLLISIIIKNDIDLTDIIRNKP
CCCEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCHHHHHCCCC
SGLDMERIILKKYIDYQIELICKKYNPDLKINYSTYLLKKTLCYLAHSVSQSLPVNNCLC
CCCCHHHHHHHHHHCHHEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
EMDKNQKNDQYYRDIMNLDNNKQKNNLQILDSMQNSAIVYIDSSNNIKFTHDLIGKYMLE
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHH
TCEKNNIQNLVTNDN
HHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKFIDHFVRVVFFILFLFISNLSVSYARVIKNIQGKNFEVIDSVAVKHMDLIELILKTE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SMDDNERQYWLDVLPYMTKAQVDRLYHILEKERTALFDLEKKYQDALKAINNKYMGKYLK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
IKYDQHSKLSKKPLFFVEKIDCEGNKFVIKKYSNNKNIDSRIFIGLSELNDLYYDKLLSA
EEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCC
GDKFNILIFIQYIINDYNEYAHIYERDDIMKLFKITFHIAFDFDDLKILDDMLLMMKKDK
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DTFSDIEKNYYLYKYHVFKKEHSKALGVIEKVFDGLIDNKNMTKIWINDCLYIPHIMLGE
CHHHHHHCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH
MYGKNSAFNEMVIKKYIKLILSSPGGLDYSVKKGDVQSRLILLDIFRKIYADMFTDKEKI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVDNYLKKKIDEKSYFKNSRDSEWYYILNQAYFKGDIGKLYNDHKKNILEKKQRGYMLDG
HHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEC
VIIESGVFYAFKLYEQKKYTEALNILDDLKIIGESVKSPAKGYVEKYLAEALNIKIQEKL
EEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCEEEHHHH
SFTGQLTSLMNSFFALNSAYITSILSFLIFVIIYLLYIIFPYWDLFQIKVLNDYIFNKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEE
FLPATPLIITRILRYLENKSYPLIPFIPYDYRLNKYEFQACYIPISLIDSDQYVHSSVFE
ECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHH
NITSKNASIVTLYGEGGMGKTLTAQKVCFDLSKKGYLPVFLEEKILGEDIDENKLEMLIG
HHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHCCCCCCHHHHHHHH
SFYKNKRLIETLSKMAFSKYVFVIDDIMSKNTYSIIMKIRAIQQKAIFILTTRNEEIIEK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHCC
SDFSVQLNSSNVDFGKYIKTGMGDRIKAYESFVMQIKNTLLISIIIKNDIDLTDIIRNKP
CCCEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCHHHHHCCCC
SGLDMERIILKKYIDYQIELICKKYNPDLKINYSTYLLKKTLCYLAHSVSQSLPVNNCLC
CCCCHHHHHHHHHHCHHEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
EMDKNQKNDQYYRDIMNLDNNKQKNNLQILDSMQNSAIVYIDSSNNIKFTHDLIGKYMLE
CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHH
TCEKNNIQNLVTNDN
HHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA