| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 118480260
GI number: 118480260
Start: 4964394
End: 4966481
Strand: Reverse
Name: yhgE [H]
Synonym: BALH_4718
Alternate gene names: 118480260
Gene position: 4966481-4964394 (Counterclockwise)
Preceding gene: 118480262
Following gene: 118480258
Centisome position: 94.47
GC content: 38.07
Gene sequence:
>2088_bases ATGTATTATACAGTATGGAAATGGACGTGTATAGTAAATCTGTTAAACCATTCTAATGGTGTTAAATTTGGAGAAGGAGT ATGTTTCATGAAAGGAATTCAACTTATATTTAAAGATTGGAAAGCGATGTGGCACCATAAACATGGACGTATCGCTTTAA TTTTTTTATTAATCGTTCCTTTAATTTATTCGGGATTCTTTTTAGCTGGATATTGGGATCCGTACGGACGATTAGATAAA TTACCTGTTGCGATTGTAAATTTAGATAAAGGTGCCGCGATGGATGAGAAAACAATTCGTGCAGGAGACGATTTCGTAAA AAATTTAAAAGAGAATAAGGAACTGGCTTTTCATTTCGTATCAGAAAAAAATGCTGATGAAGGACTAAAAGAAGATAAGT ACTATATGGTTGTTACAATTCCAGAGGATTTCTCTAAAAAGGTAAGTACACTTATGGATGAGAAACCAGAGCCAGCGCAG CTTCAGTACAAAGTAAATCCGGGTAAAAACTTTGTAGCAGCGCAAATTGGAACGACAGCTGTTGAAAATATGAAAACAAA AATTTCAAATAGTATTACGAAATCTTATACAGAAGGTATCTTTTCAAAGTTTCAAGACTTAGCACAAGGATTGAGTGATG CAAGTAATGGTGCTGGAAAGTTACATGAAGGAACGACAGATGCAAGAAACGGAGCAAATCAGCTTGCAGATGGTATTCAT CGTTTAAGTGACGGGACATCAAAAGTGAAAGAGGGAAGTGACAAACTTGCTTCTAGCCAATCAGCTTTAACTGGCGGAGC GAATGAGCTGAGTGAAGGGGCAAAATCCCTTCATAGTGGTATGGAGTTATTAGCACAAGGTGAAAAAAACTTACAATCAG GGGTTAGTGAATTAAGTGCTGGTACAAATGAATGGGTGAACGGAAGTGAGAAACTTGCTGATGGGCAAGTGAAAGCGGAC AATGCAGCAAATAATGTAAAACAACAATTAGAAGAGTACGTGAAAAGTCATCCAGAAGTGCAGCAAGATCCTGCTTTTCA AAAGATTATTGCTACGTCTAATGGATTAGCTAAAGCAACAAACACCTTAAATAATAGCCAGCAACAATTGACGCAAGGTG CAAAGAAGCTTGCGGATGGTCAACATAAGATTGAAGAAGGTATAAATACATTCGGAGTTAAGTTAAATGAGGCTACTGCT GGAACGAAAAAGATAGCAGATGGTGCGGCGAATTTAGCTAGTGGATTTACGAAATGGGGAACTGGATTTACATCATTACA AGAAGGTGTCAATCGACTTGCGGGTGGCGGAACAGAGCTGAATCATGGTGTTGATCAGTTAACGAACGGACTTGTTAAAC TTGACGATGGTGCGAAAGAACTTTCTACGAAATTAGGAGAGGGCGCAGCGAAGATAGCAGATGTTCGCAATGATGATGCA CGCAATACGATGTTCTCAGAGCCGGTTCAATTAGTGAAGTCAACAGTTTCTGACGTACCTAATTATGGTTCAGGTATTGC ACCATATTTCTTATCGCTTGCGTTTTATGTTGGCGGAATTATGGCGTCGAATATTTTACCGCTTGGCCGTAGACAAAATA TGAAAGTAAGTGGAACAGTACATTTTATTAATAAATTAGGATTGGTATATGTAATTGGACTTATTCAAGCATTGCTTGTA GATGTAGTTGTGCTAGGAGTTATGAAATTAGAAGTTGCAAGTGTGCCACTCTTTGTTTTATCAAGTATCGTTATTTCCTT TACGTTTATGACGTTTATTCTTATGTTAGTAACAGTATTTGGTCTTGTTGGAAAGTTCTTAGCGGTAACGCTGCTTGTCC TGCAGTTAGCGACGAGCGGGGGTACTTTCCCAGGAGAATTAAATATAGCTGTTCTTAGCAAAATTGGACAATTTCTCCCA ATGTCTCATTCTCTTAGAGGACTACAAGATGTGATTTCTTTAGGAGATTGGTCGCAATTACAAATGCAAATTTTAATATT GTTATGCTATCTTGTTGTTGCCGGTGGAATTGCTTGGATCACGAGCCATATACAACATAGGGAAACGAATGCAGAACAAG TTTCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGCTCTAATCTTGCGACTGTTTGAAAGTATTTTAGTTGAAGAAGTTCCATTTTGATTCTCCTTTCTATAGACCAAAAG GAATGAATTGATAATTAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAAAAGAAGTTATCCGATTGTTTTGGATGACTTCTTTTTGTTTTGTTTATAGCAAAAAGTGTATTGCTTTATTTTTT TATACACTAGTTTCTATATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 695; Mature: 695
Protein sequence:
>695_residues MYYTVWKWTCIVNLLNHSNGVKFGEGVCFMKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDK LPVAIVNLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQ LQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGIFSKFQDLAQGLSDASNGAGKLHEGTTDARNGANQLADGIH RLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTGGANELSEGAKSLHSGMELLAQGEKNLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKAD NAANNVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATA GTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNRLAGGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDA RNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPYFLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLV DVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLP MSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRETNAEQVS
Sequences:
>Translated_695_residues MYYTVWKWTCIVNLLNHSNGVKFGEGVCFMKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDK LPVAIVNLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQ LQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGIFSKFQDLAQGLSDASNGAGKLHEGTTDARNGANQLADGIH RLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTGGANELSEGAKSLHSGMELLAQGEKNLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKAD NAANNVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATA GTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNRLAGGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDA RNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPYFLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLV DVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLP MSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRETNAEQVS >Mature_695_residues MYYTVWKWTCIVNLLNHSNGVKFGEGVCFMKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDK LPVAIVNLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQ LQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGIFSKFQDLAQGLSDASNGAGKLHEGTTDARNGANQLADGIH RLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTGGANELSEGAKSLHSGMELLAQGEKNLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLADGQVKAD NAANNVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATA GTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNRLAGGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDA RNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPYFLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLV DVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLP MSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRETNAEQVS
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75083; Mature: 75083
Theoretical pI: Translated: 7.08; Mature: 7.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYYTVWKWTCIVNLLNHSNGVKFGEGVCFMKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVP CCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFV HHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHH SEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTA CCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHH VENMKTKISNSITKSYTEGIFSKFQDLAQGLSDASNGAGKLHEGTTDARNGANQLADGIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHH RLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTGGANELSEGAKSLHSGMELLAQGEKNLQSGVSELSA HHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHC GTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANNVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKAT CCCHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHH NTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWG HHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGFTSLQEGVNRLAGGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDA CCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCH RNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPYFLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHH HFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHH QMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRETNAEQVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCC >Mature Secondary Structure MYYTVWKWTCIVNLLNHSNGVKFGEGVCFMKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVP CCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH LIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIVNLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFV HHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHH SEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTA CCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHH VENMKTKISNSITKSYTEGIFSKFQDLAQGLSDASNGAGKLHEGTTDARNGANQLADGIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHH RLSDGTSKVKEGSDKLASSQSALTGGANELSEGAKSLHSGMELLAQGEKNLQSGVSELSA HHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHC GTNEWVNGSEKLADGQVKADNAANNVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAKAT CCCHHCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHH NTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWG HHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGFTSLQEGVNRLAGGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDA CCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCH RNTMFSEPVQLVKSTVSDVPNYGSGIAPYFLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHH HFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHH QMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRETNAEQVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]