| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
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The map label for this gene is salY [H]
Identifier: 118478473
GI number: 118478473
Start: 3013427
End: 3015397
Strand: Direct
Name: salY [H]
Synonym: BALH_2845
Alternate gene names: 118478473
Gene position: 3013427-3015397 (Clockwise)
Preceding gene: 118478472
Following gene: 118478474
Centisome position: 57.32
GC content: 29.17
Gene sequence:
>1971_bases GTGGGATTATTTACAATTGCAAAAAAGAATTTAAAGAATAACTTCTCCTTCTATTCATTCTATTTTATTTCAGTAGCTTT TGTACTGATGGTATTTTTCTCCTTTATCTCTTTTTCCATGAACGACATTGTTATGGAAAAGATTTCGTCTGACGGTAGAG TAGAAACAATGTCCAAAACGGTGGCGATCTTTGTTATGACATTTGTACTATTCTATATGTCATACTCTAATACATTTTTT ATGAAAAAAAGAATGTACGAGCTCGGCATTTACTCCCTTTTAGGATATAGAAAATCAACGATGCTAAAACTGTTAACTTT TGAAAATATTATCATTTGCTTTGTTGCCTTACTTGTAGGAATTATTTTTGGTGCTATTGCTCATAAAGGAATTGTAGGAG CGATAATTAAAATATTAAAATTACAAATAGATACTTCTACAGTACCATTTATTAACCTTGATGCAGTACTATTCTCCTTT GCTTTTATCTTTGCTGTTCTTTTTATTTTATCTTTATCAAATTGGATTATCCTTCGAAAAAGTTCCTTACTAACTTTAGT ACGTATGGAACAAAAGGAAGAAAATAAAGTGAAAATTAATGTAGCTTTTTCACTACTAGGATTATCTTTAATTTTAATTG GCTATTTCTTAGCTCTCGATATTACAAGAGGCATGCAATCCTTGTGGAAAACAATTGGCTTTTCACCAATCGCTCTCTTA ACAATGTTCAGTGTCATATTAGGGACAATCTTCTTTATTCATTCCTTTTTACCATATGCGATTCAAAAGCTGAAGAAAAA TAAAATATGGTTTTATAAAGAATCCAATATTATTGTCATCCCAAACTTTATATTTAAAATCCGTTCAAAAGCAAAAACAT TAATTTTGTTAACCTTATTAACCGCTGGAACTTTAGCTATTTTCAGTTCTACTTTACTGACACTTTACTATCCAGTTGCC GCTACAGAACGTATCGTACCTTCAGCTATTGAATTCCCATTAGAAGATAAAGAAATAGCCAATAAATCACTACAAACTGT ACAAAAAACTGTCGGTAAAGAAAGTATAAACTATACTGAAACAACCATTATTAACGTGAAAGCTAATTCAGAGAGTTTAC CAAAAGAATATAGTATAAAAAAGGAGCGCGGATTTGATCTTATCTCTGAGTCTGATTACAGAGAGTTAATACATGTTCAA GATAAAAATGTAGAATTTAATCATTTAGCTAAAGATGAAAGCATCCTAGTAAAATATCGACCTGAAAAAGAAGACCTAGA TAAAGGGAAAAGATATACTTTAAACGTAACTCCTACAACTAATATAGACGTTAAAGTGAAAGACACTACATTACTTAACC CCATTGGATTTGTAAATAGTGTAGGAACACTTATTATCTCGGATCAACTGTATAAAGAAATAAAAACTTTAGAGCTACCA CAAAAAACGATTGTGAGTTTTAATGGAAAAGATATGAGGAATAATAAAGCTGTTTATGAAAACTTAGCCCCACTATTTAA AAATAATATGTATTTTACAAGCAGTTATCAAAAAAATGATTATATTATTCAGCAAAATAGTTCAACGTTCTTGCTCATTA GTTTCGTTACTATCATTTTCTTTATTGCAACAGGCAGTATTCTCTATTTTCATAACCTTTCAAGCATGATGTCAAATAAA AATGAATTTATTATCTTAAATAGAATGGGCTATAACCAAAAGAAGATAAAAAAAATGATAAGTAAAGAGATTTTCACCTT ATTTAGCATTCCTTACATAATAGGATTAACACATAGCATTTTTGCATTAGTTGCCTATAAAACCGCGTTAATGGATGACC TATTAGGAAAAAGTAGTGCGTTTATATTACCAATTCTTTTCGCCGTAATCATTTTTACTGTTGTATATATCGTTTATTAT TTGTTAACAAAAAGAGCATGTTATAAAATTATATTTAATAAGAAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAAGCAAAATAGAAAAGAATTTTTTGAAGAAATATTAAAAGAAATCTCTAAAATTGGTGAAAATCGATATAACTAGAAA TATGAAAGGAAGATTGAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATCTACAGATAAAGCTGATGATAGGCAACAAACATCAGCTTTATCTGTATGTAATCTAACAAAGGTAAGTGAATTTA TGAAAAACTACTATGAGCAA
Product: ABC transporter permease associated with salivaricin lantibiotic
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 655
Protein sequence:
>656_residues MGLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKTVAIFVMTFVLFYMSYSNTFF MKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVGIIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSF AFIFAVLFILSLSNWIILRKSSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLLTAGTLAIFSSTLLTLYYPVA ATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTETTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQ DKNVEFNHLAKDESILVKYRPEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIFFIATGSILYFHNLSSMMSNK NEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSIFALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYY LLTKRACYKIIFNKKN
Sequences:
>Translated_656_residues MGLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKTVAIFVMTFVLFYMSYSNTFF MKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVGIIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSF AFIFAVLFILSLSNWIILRKSSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLLTAGTLAIFSSTLLTLYYPVA ATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTETTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQ DKNVEFNHLAKDESILVKYRPEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIFFIATGSILYFHNLSSMMSNK NEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSIFALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYY LLTKRACYKIIFNKKN >Mature_655_residues GLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKTVAIFVMTFVLFYMSYSNTFFM KKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVGIIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSFA FIFAVLFILSLSNWIILRKSSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALLT MFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLLTAGTLAIFSSTLLTLYYPVAA TERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTETTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQD KNVEFNHLAKDESILVKYRPEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELPQ KTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIFFIATGSILYFHNLSSMMSNKN EFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSIFALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYYL LTKRACYKIIFNKKN
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75127; Mature: 74996
Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKT CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH VAIFVMTFVLFYMSYSNTFFMKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVG HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSFAFIFAVLFILSLSNWIILRK HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEC SSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL CHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAGTLAIFSSTLLTLYYPVAATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE TTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQDKNVEFNHLAKDESILVKYR EEEEEEECCCCCCCCHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEC PEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP CCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCC QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIF HHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCEEHHHHHHHHH FIATGSILYFHNLSSMMSNKNEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSI HHHHCCEEEEECHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYYLLTKRACYKIIFNKKN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC >Mature Secondary Structure GLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKT CCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH VAIFVMTFVLFYMSYSNTFFMKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVG HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSFAFIFAVLFILSLSNWIILRK HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEC SSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL CHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAGTLAIFSSTLLTLYYPVAATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE TTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQDKNVEFNHLAKDESILVKYR EEEEEEECCCCCCCCHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEC PEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP CCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCC QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIF HHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCEEHHHHHHHHH FIATGSILYFHNLSSMMSNKNEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSI HHHHCCEEEEECHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYYLLTKRACYKIIFNKKN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10086842; 11058132 [H]