Definition Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome.
Accession NC_008600
Length 5,257,091

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The map label for this gene is salY [H]

Identifier: 118478473

GI number: 118478473

Start: 3013427

End: 3015397

Strand: Direct

Name: salY [H]

Synonym: BALH_2845

Alternate gene names: 118478473

Gene position: 3013427-3015397 (Clockwise)

Preceding gene: 118478472

Following gene: 118478474

Centisome position: 57.32

GC content: 29.17

Gene sequence:

>1971_bases
GTGGGATTATTTACAATTGCAAAAAAGAATTTAAAGAATAACTTCTCCTTCTATTCATTCTATTTTATTTCAGTAGCTTT
TGTACTGATGGTATTTTTCTCCTTTATCTCTTTTTCCATGAACGACATTGTTATGGAAAAGATTTCGTCTGACGGTAGAG
TAGAAACAATGTCCAAAACGGTGGCGATCTTTGTTATGACATTTGTACTATTCTATATGTCATACTCTAATACATTTTTT
ATGAAAAAAAGAATGTACGAGCTCGGCATTTACTCCCTTTTAGGATATAGAAAATCAACGATGCTAAAACTGTTAACTTT
TGAAAATATTATCATTTGCTTTGTTGCCTTACTTGTAGGAATTATTTTTGGTGCTATTGCTCATAAAGGAATTGTAGGAG
CGATAATTAAAATATTAAAATTACAAATAGATACTTCTACAGTACCATTTATTAACCTTGATGCAGTACTATTCTCCTTT
GCTTTTATCTTTGCTGTTCTTTTTATTTTATCTTTATCAAATTGGATTATCCTTCGAAAAAGTTCCTTACTAACTTTAGT
ACGTATGGAACAAAAGGAAGAAAATAAAGTGAAAATTAATGTAGCTTTTTCACTACTAGGATTATCTTTAATTTTAATTG
GCTATTTCTTAGCTCTCGATATTACAAGAGGCATGCAATCCTTGTGGAAAACAATTGGCTTTTCACCAATCGCTCTCTTA
ACAATGTTCAGTGTCATATTAGGGACAATCTTCTTTATTCATTCCTTTTTACCATATGCGATTCAAAAGCTGAAGAAAAA
TAAAATATGGTTTTATAAAGAATCCAATATTATTGTCATCCCAAACTTTATATTTAAAATCCGTTCAAAAGCAAAAACAT
TAATTTTGTTAACCTTATTAACCGCTGGAACTTTAGCTATTTTCAGTTCTACTTTACTGACACTTTACTATCCAGTTGCC
GCTACAGAACGTATCGTACCTTCAGCTATTGAATTCCCATTAGAAGATAAAGAAATAGCCAATAAATCACTACAAACTGT
ACAAAAAACTGTCGGTAAAGAAAGTATAAACTATACTGAAACAACCATTATTAACGTGAAAGCTAATTCAGAGAGTTTAC
CAAAAGAATATAGTATAAAAAAGGAGCGCGGATTTGATCTTATCTCTGAGTCTGATTACAGAGAGTTAATACATGTTCAA
GATAAAAATGTAGAATTTAATCATTTAGCTAAAGATGAAAGCATCCTAGTAAAATATCGACCTGAAAAAGAAGACCTAGA
TAAAGGGAAAAGATATACTTTAAACGTAACTCCTACAACTAATATAGACGTTAAAGTGAAAGACACTACATTACTTAACC
CCATTGGATTTGTAAATAGTGTAGGAACACTTATTATCTCGGATCAACTGTATAAAGAAATAAAAACTTTAGAGCTACCA
CAAAAAACGATTGTGAGTTTTAATGGAAAAGATATGAGGAATAATAAAGCTGTTTATGAAAACTTAGCCCCACTATTTAA
AAATAATATGTATTTTACAAGCAGTTATCAAAAAAATGATTATATTATTCAGCAAAATAGTTCAACGTTCTTGCTCATTA
GTTTCGTTACTATCATTTTCTTTATTGCAACAGGCAGTATTCTCTATTTTCATAACCTTTCAAGCATGATGTCAAATAAA
AATGAATTTATTATCTTAAATAGAATGGGCTATAACCAAAAGAAGATAAAAAAAATGATAAGTAAAGAGATTTTCACCTT
ATTTAGCATTCCTTACATAATAGGATTAACACATAGCATTTTTGCATTAGTTGCCTATAAAACCGCGTTAATGGATGACC
TATTAGGAAAAAGTAGTGCGTTTATATTACCAATTCTTTTCGCCGTAATCATTTTTACTGTTGTATATATCGTTTATTAT
TTGTTAACAAAAAGAGCATGTTATAAAATTATATTTAATAAGAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAGCAAAATAGAAAAGAATTTTTTGAAGAAATATTAAAAGAAATCTCTAAAATTGGTGAAAATCGATATAACTAGAAA
TATGAAAGGAAGATTGAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATCTACAGATAAAGCTGATGATAGGCAACAAACATCAGCTTTATCTGTATGTAATCTAACAAAGGTAAGTGAATTTA
TGAAAAACTACTATGAGCAA

Product: ABC transporter permease associated with salivaricin lantibiotic

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 655

Protein sequence:

>656_residues
MGLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKTVAIFVMTFVLFYMSYSNTFF
MKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVGIIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSF
AFIFAVLFILSLSNWIILRKSSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL
TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLLTAGTLAIFSSTLLTLYYPVA
ATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTETTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQ
DKNVEFNHLAKDESILVKYRPEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP
QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIFFIATGSILYFHNLSSMMSNK
NEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSIFALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYY
LLTKRACYKIIFNKKN

Sequences:

>Translated_656_residues
MGLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKTVAIFVMTFVLFYMSYSNTFF
MKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVGIIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSF
AFIFAVLFILSLSNWIILRKSSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL
TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLLTAGTLAIFSSTLLTLYYPVA
ATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTETTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQ
DKNVEFNHLAKDESILVKYRPEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP
QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIFFIATGSILYFHNLSSMMSNK
NEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSIFALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYY
LLTKRACYKIIFNKKN
>Mature_655_residues
GLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKTVAIFVMTFVLFYMSYSNTFFM
KKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVGIIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSFA
FIFAVLFILSLSNWIILRKSSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALLT
MFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLLTAGTLAIFSSTLLTLYYPVAA
TERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTETTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQD
KNVEFNHLAKDESILVKYRPEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELPQ
KTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIFFIATGSILYFHNLSSMMSNKN
EFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSIFALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYYL
LTKRACYKIIFNKKN

Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75127; Mature: 74996

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKT
CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
VAIFVMTFVLFYMSYSNTFFMKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVG
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSFAFIFAVLFILSLSNWIILRK
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEC
SSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL
CHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAGTLAIFSSTLLTLYYPVAATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
TTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQDKNVEFNHLAKDESILVKYR
EEEEEEECCCCCCCCHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEC
PEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP
CCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCC
QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIF
HHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCEEHHHHHHHHH
FIATGSILYFHNLSSMMSNKNEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSI
HHHHCCEEEEECHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYYLLTKRACYKIIFNKKN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
>Mature Secondary Structure 
GLFTIAKKNLKNNFSFYSFYFISVAFVLMVFFSFISFSMNDIVMEKISSDGRVETMSKT
CCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
VAIFVMTFVLFYMSYSNTFFMKKRMYELGIYSLLGYRKSTMLKLLTFENIIICFVALLVG
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIFGAIAHKGIVGAIIKILKLQIDTSTVPFINLDAVLFSFAFIFAVLFILSLSNWIILRK
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEC
SSLLTLVRMEQKEENKVKINVAFSLLGLSLILIGYFLALDITRGMQSLWKTIGFSPIALL
CHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
TMFSVILGTIFFIHSFLPYAIQKLKKNKIWFYKESNIIVIPNFIFKIRSKAKTLILLTLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAGTLAIFSSTLLTLYYPVAATERIVPSAIEFPLEDKEIANKSLQTVQKTVGKESINYTE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
TTIINVKANSESLPKEYSIKKERGFDLISESDYRELIHVQDKNVEFNHLAKDESILVKYR
EEEEEEECCCCCCCCHHCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEC
PEKEDLDKGKRYTLNVTPTTNIDVKVKDTTLLNPIGFVNSVGTLIISDQLYKEIKTLELP
CCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHCCC
QKTIVSFNGKDMRNNKAVYENLAPLFKNNMYFTSSYQKNDYIIQQNSSTFLLISFVTIIF
HHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCEEHHHHHHHHH
FIATGSILYFHNLSSMMSNKNEFIILNRMGYNQKKIKKMISKEIFTLFSIPYIIGLTHSI
HHHHCCEEEEECHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALVAYKTALMDDLLGKSSAFILPILFAVIIFTVVYIVYYLLTKRACYKIIFNKKN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10086842; 11058132 [H]