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The map label for this gene is csaA [H]

Identifier: 118476528

GI number: 118476528

Start: 911805

End: 913325

Strand: Direct

Name: csaA [H]

Synonym: BALH_0797

Alternate gene names: 118476528

Gene position: 911805-913325 (Clockwise)

Preceding gene: 118476525

Following gene: 118476529

Centisome position: 17.34

GC content: 35.17

Gene sequence:

>1521_bases
ATGAATAATAAGTTTGTGAAAGGCGCTGCGATTTTAACGATTACAACGTTTCTATCGAAAGTGTTGGGAAGTTTTTTTCA
AATCCCATTACAAAATATAGCAGGAGATGAAGTGCTTGGGATTTTCCGCCTTGTTTTTCCTGTGTATATGATAGCTTTAA
CATTATCAGTAGCGGGAGTACCGCTAGCTATATCAAAGTTAATCGCTGAACTTCATGAGAAGAATGACCAGGACGGAATT
GCCAAACTATTTACTTCAGCATCTATTATTGGAGTAATATTTGGAGTGCTTGGATTTTCAGTTATTATGATTGGATCGAG
TATGTTTGCAAATATGCTTGGTGGACAAGATACAAGACTCCCATTAATTGTCACTTCGTTTGCGTTATTAATCGCACCGT
ATATGGCGGTATATCGAGGGTATTTCCAAGGTTTTGGAGATATGATTCCTACCGGGGTGTCACAAGTAATTGAGCAGTTC
ATCCGTGTTTTCTTTATGTTAGCAATTGCATTCTTATTTGTATATTGGAATAAAGAGAGTGATGTTGTAACAGGCGGCGC
AATGATTGGCTCTTGTCTTGGGGTAATTACGTCACTGATCTATTTGAGATTGAAGTATGTAAAAAGTATATATCGTTATA
AAAGTAATACATATTCACTACAAGATTTTAAAGATAATGCAAAAAAGATACTTCAGGTTTCGATTCCAATTGCAATTGGG
GCATTGTCGATGCCGGTGTTAAATTTAGTTGATTCTGTAACGATTCCACATATGTTGCATGAATCCACTACGACGATTCA
AGAACAATTTGGTATATATAGTCGTGGCTTTGCATTTACACAATTAATTGTCGTGTTTGCAAGTGCGATGGTATTTCCAT
TAATTCCGTTGTTAACAGCTGCATTAACAAAGAAAGATGTAGCGTTAGCCAAACAAACAATTGAACGAACAAATGAGCTT
GCTCATGTTTTAACAACGCCGATAACAATCTGGCTCATAGCACTTACAATCCCATTAAATGTTGGATTGTTTACAGATGC
TAAAGGGAGTGGAATGTTAGCTATTTTAATTGGTAGTTCGTATTTTACGTCACTTATGGTATTATCAATAGGAATTTTGC
AAGGAATTAACCGTTCTAAGCAAGCGGCGTGGATAGTTGTTGGAGCGAGTTTTGTAAAAGTCATATTAAATATAGTACTT
GTAAGTCAATTTGGCATAACTGGTGCGGCTTATAGTACACTCATCATATATATCATGATTTGTATCGTAAATTATATATA
CATTCGAAAAGAATTGGCTTATTCGATTCACATGGGGAGATTTTTTGCTGTAATTTGGGTATCTAGTATAGTAGGTATAG
GATTATATTTCACATCTACTTTCATAAATGTGGTAGATTCTAGACTTATTGCAATAATATATAGTGGTTTAGCGTTTTGT
GTAGCCTCATTCATATATGGCATATGCGCATTAAAGTTGAACTGGATATCCAAAAAGCAAATCCCATTTTTACGTAAGTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGATAAAGTGAAATTTTTCAAAAAAGAGAAGAATATAGCTATCTCGTTTTATGATGTAATATGTATAGAAATTATATAT
TGAAAGAAAAGAGCTAGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGTCCATAAATGAGTATGGCTATTTATATGTTTGTGAAAGAAATCAATTTGAAGTTATCCAACTTTTCTTATTAAAG
AGTTGATAGCAATTTGTTGC

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 506

Protein sequence:

>506_residues
MNNKFVKGAAILTITTFLSKVLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDQDGI
AKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQF
IRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRLKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAIG
ALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASAMVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNEL
AHVLTTPITIWLIALTIPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVL
VSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIWVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRLIAIIYSGLAFC
VASFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK

Sequences:

>Translated_506_residues
MNNKFVKGAAILTITTFLSKVLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDQDGI
AKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQF
IRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRLKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAIG
ALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASAMVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNEL
AHVLTTPITIWLIALTIPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVL
VSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIWVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRLIAIIYSGLAFC
VASFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK
>Mature_506_residues
MNNKFVKGAAILTITTFLSKVLGSFFQIPLQNIAGDEVLGIFRLVFPVYMIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDQDGI
AKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQF
IRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRLKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAIG
ALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASAMVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNEL
AHVLTTPITIWLIALTIPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVL
VSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIWVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRLIAIIYSGLAFC
VASFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55526; Mature: 55526

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]