| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
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The map label for this gene is spoIIE [H]
Identifier: 118475833
GI number: 118475833
Start: 64854
End: 67325
Strand: Direct
Name: spoIIE [H]
Synonym: BALH_0060
Alternate gene names: 118475833
Gene position: 64854-67325 (Clockwise)
Preceding gene: 118475832
Following gene: 118475834
Centisome position: 1.23
GC content: 36.97
Gene sequence:
>2472_bases ATGCCTAAAGCAGGAAGGAATACTATGAATACAAGTGCATTGGCAATGAATGAAGGTCAGCTTGGAGGAGTAAAGTGGAC GAGTAAGTTGCGAATGAAGTTTGAGCAAGTTTTCTTTAGATGGGGATTTATTATTGTTGTTATTGGTTTTCTTTTAGGAC GAGCATATATATTAACAAACATTTTACCGTTTGCACTGCCGTTTTTTGCTGCTGTTTATGTTATGAAGCGGGATAAAATG CCGCTTGCATTCTTGGCCCTAATGGGGGGCGCACTGTCAGTTTCGATAGATAATTTATTCTTTACCTTTGCATCTATTTT TACTTTCTTCATTTATAATATCTTCTTTAGTCGGTTTACACGTAAAACTGTTGGACTTGTTCCATTCCAAGTATTTATCT CCGCATTAACCGCACATTTAGTTGTCGTATATTTTGCGCAACAAACAGTCACCATGTACGATTTACTTGTTAGTACAATT GAGGCCGGGCTTAGCTTCGTATTAACTATGATATTTTTACAAAGTGTCCCGCTTTTAGTAGAAAGAAAAGGGAAACAACA AGCCTTAGAGACAGAAGAAATTGTTTGTTTAATTATATTACTAGCATCTGTTTTAACAGGTACAACAGATTGGTTCGTAT ATGACGCTTCTATTCAACATATTTTTACTAGGTATTTAGTGCTTGTATTTGCGTTTATCGCAGGAGCGGCTACAGGATCT ACAGTAGGGGTCGTCACTGGGTTAATATTAAGTTTAGCAAATGTCTCCAGTTTGTCCCAACTTAGTCTGCTTGCTTTTTC TGGATTGCTTGGTGGTTTGTTAAAAGAAGGGAAGCGCATAGGTGTTAGTTTAGGTTTATTAATTGGGACAAGCTTGATTA CGCTATATGTAGACAAGCAAACAAACATTGTGACAACTTTAATCGAATCTGGTGTGGCGATTGCTTTCTTCTTATTAACA CCGAAACTTGTTATGGATCGTATTGCTAAATTTATGCCAGGCACACAGGAGCATTCGCAAGATCAACAACAGTATTTAAG AAGGATGCGTGATGTTACAGCGAATAAAATTAATCAATTTGCTAATGTGTTTGCTGCTTTATCTAATAGCTTTTCTGTAT ATGGATACGTGGAGGAAGAAGATAAAGAGACGGAGGCAGATCTGTTCTTAAGTACAATTACTGCAAAAACATGTCAAACA TGCTTTAAAAAGGACCAATGCTGGGTAGTTAATTTCGATAAAACATACGATTATATGAAACAAATAATGAGTGAAACAGA AGAGGGGACGTTACAGCATAATCGGAAGTTAGTTCGTGAATGGGATAAGCATTGTGTGAGAGGAAAGAAAGTGACGGATT TAGTGGCAGGCGAATTAGATCACTTCTATGAGGGACAAAAATTAAGAAAACAAATGAAAGAAAATCGTAGAATAGTAGCG GAGCAACTATTGGGTGTATCAAAAGTTATGGAGGATTTTGCTAAGGAGATACAAAGAGAGCGAGAAAACCATCAAGTACA GGAAGAACAGATTCTGCAAGCGTTTCGTGATTTTGGTGTAGAAATAGAGCATGTTGATATTTATTGTTTAGATAGAGGAA GTATTGATATTGAAATGTTGATTCCAGTTGCATCTAATGAACACGGAGAGTGTGAAAAATTAGTTGCACCGATGCTTTCT GATATTCTAAAGGAAAATATCGTTGTTAAGCATGAAGAAAAATCTTCTTATCCGAATGGCCACAGCTTAATATCATTTGG TTCAGCAAAAACGTATTCTCTTGATACGGGCTTAGCCACAGCTGCAAAAGGCGGTGGGTTTGTTTCAGGTGATTCTTATG CGATGATGGATTTAAGTGTTGGTAAATATGCTCTTGCGATTAGTGATGGTATGGGAAATGGGCAAAGAGCTCATATGGAG AGTAAAGAAACAGTGAAATTATTACAAAAAATACTTCAATCAGGCATTGATGAAGAAATAGCGATTAAGTCTATTAACTC TATTCTTTCTTTAAGAACAACAGAAGAGATGTTTACTACGTTAGATTTAGCTATGGTAGATTTGCGGGATGCGAGTGCGA AGTTTTTAAAGATTGGATCGACGCCGAGTTTTGTTAAACGCGCAAACAATATTTTGAAAATTGAAGCAAGTAATTTGCCG ATGGGAATAATTGAGGATGTTGAAGTTGATGTAGTGGGTGAGCAATTAAAAACAGGCGATATCCTTATTATGATGAGCGA TGGGATTTTTGAGGGAGCGCAACATGTGGAGAATCATGAATTATGGATGAAGCGTAAAATTAAAGAGTTGCAAACTGAAG ATCCGCAAGAAATCGCTGATATCATCATGGAAGAGGTAATTCGCTCTGGTGATGGTTATATAAATGATGATATGACTATT GTAGTGGCAAAAGTGAAGAAAAATATGCCGAAGTGGGCTACCATTCCAATTGTGGGAATGCAGGCACAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTCGAACGATTATAAAAGTGAAAACTGTTGTTTTGACAAAAATCCCAATAATCATCTTTTATAATGACAGTAATTAAACT ATGCAGGTGGTGTTAAAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTTGAAGTGTAAGGTTTCTTTATCGCTTTTTCTTTCTAAAAACCTAGGTGAATACCTAGGTTTTTTTGCTTTATAACAT AATGTTATTATTTTTGTGAA
Product: serine/threonine specific protein phosphatase
Products: NA
Alternate protein names: Stage II sporulation protein H [H]
Number of amino acids: Translated: 823; Mature: 822
Protein sequence:
>823_residues MPKAGRNTMNTSALAMNEGQLGGVKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTNILPFALPFFAAVYVMKRDKM PLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFTRKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTI EAGLSFVLTMIFLQSVPLLVERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRIGVSLGLLIGTSLITLYVDKQTNIVTTLIESGVAIAFFLLT PKLVMDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQFANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQT CFKKDQCWVVNFDKTYDYMKQIMSETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQILQAFRDFGVEIEHVDIYCLDRGSIDIEMLIPVASNEHGECEKLVAPMLS DILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLATAAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHME SKETVKLLQKILQSGIDEEIAIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASAKFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIADIIMEEVIRSGDGYINDDMTI VVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ
Sequences:
>Translated_823_residues MPKAGRNTMNTSALAMNEGQLGGVKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTNILPFALPFFAAVYVMKRDKM PLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFTRKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTI EAGLSFVLTMIFLQSVPLLVERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRIGVSLGLLIGTSLITLYVDKQTNIVTTLIESGVAIAFFLLT PKLVMDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQFANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQT CFKKDQCWVVNFDKTYDYMKQIMSETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQILQAFRDFGVEIEHVDIYCLDRGSIDIEMLIPVASNEHGECEKLVAPMLS DILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLATAAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHME SKETVKLLQKILQSGIDEEIAIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASAKFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIADIIMEEVIRSGDGYINDDMTI VVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ >Mature_822_residues PKAGRNTMNTSALAMNEGQLGGVKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTNILPFALPFFAAVYVMKRDKMP LAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFTRKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTIE AGLSFVLTMIFLQSVPLLVERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGST VGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRIGVSLGLLIGTSLITLYVDKQTNIVTTLIESGVAIAFFLLTP KLVMDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQFANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQTC FKKDQCWVVNFDKTYDYMKQIMSETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVAE QLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQILQAFRDFGVEIEHVDIYCLDRGSIDIEMLIPVASNEHGECEKLVAPMLSD ILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLATAAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHMES KETVKLLQKILQSGIDEEIAIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASAKFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLPM GIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIADIIMEEVIRSGDGYINDDMTIV VAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ
Specific function: Normally needed for pro-sigma E processing during sporulation but can be bypassed in vegetative cells. Activates spoIIAA by dephosphorylation [H]
COG id: COG2208
COG function: function code TK; Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Note=Polar septum [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 PP2C-like domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001932 - InterPro: IPR014221 - InterPro: IPR010822 [H]
Pfam domain/function: PF07228 SpoIIE [H]
EC number: =3.1.3.16 [H]
Molecular weight: Translated: 91978; Mature: 91847
Theoretical pI: Translated: 5.83; Mature: 5.83
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 3.9 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 3.8 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPKAGRNTMNTSALAMNEGQLGGVKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTN CCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILPFALPFFAAVYVMKRDKMPLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTIEAGLSFVLTMIFLQSVPLLV HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH ERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRIGVSLGLLIGTSLITLYVDKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCC TNIVTTLIESGVAIAFFLLTPKLVMDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQF CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQTCFKKDQCWVVNFDKTYDYMK HHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHH QIMSETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQILQAFRDFGVEIEHVDIYCLDRGSIDIEML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCEEEEEE IPVASNEHGECEKLVAPMLSDILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLAT EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHH AAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHMESKETVKLLQKILQSGIDEEI HCCCCCEECCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH AIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASAKFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCEEEEEECCCC MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIAD CCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH IIMEEVIRSGDGYINDDMTIVVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ HHHHHHHHCCCCEECCCCEEEEEEHHCCCCCEEEEEEEECCCC >Mature Secondary Structure PKAGRNTMNTSALAMNEGQLGGVKWTSKLRMKFEQVFFRWGFIIVVIGFLLGRAYILTN CCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILPFALPFFAAVYVMKRDKMPLAFLALMGGALSVSIDNLFFTFASIFTFFIYNIFFSRFT HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKTVGLVPFQVFISALTAHLVVVYFAQQTVTMYDLLVSTIEAGLSFVLTMIFLQSVPLLV HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH ERKGKQQALETEEIVCLIILLASVLTGTTDWFVYDASIQHIFTRYLVLVFAFIAGAATGS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TVGVVTGLILSLANVSSLSQLSLLAFSGLLGGLLKEGKRIGVSLGLLIGTSLITLYVDKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCC TNIVTTLIESGVAIAFFLLTPKLVMDRIAKFMPGTQEHSQDQQQYLRRMRDVTANKINQF CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ANVFAALSNSFSVYGYVEEEDKETEADLFLSTITAKTCQTCFKKDQCWVVNFDKTYDYMK HHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHH QIMSETEEGTLQHNRKLVREWDKHCVRGKKVTDLVAGELDHFYEGQKLRKQMKENRRIVA HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH EQLLGVSKVMEDFAKEIQRERENHQVQEEQILQAFRDFGVEIEHVDIYCLDRGSIDIEML HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEECCCCEEEEEE IPVASNEHGECEKLVAPMLSDILKENIVVKHEEKSSYPNGHSLISFGSAKTYSLDTGLAT EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHH AAKGGGFVSGDSYAMMDLSVGKYALAISDGMGNGQRAHMESKETVKLLQKILQSGIDEEI HCCCCCEECCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH AIKSINSILSLRTTEEMFTTLDLAMVDLRDASAKFLKIGSTPSFVKRANNILKIEASNLP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHCCCEEEEEECCCC MGIIEDVEVDVVGEQLKTGDILIMMSDGIFEGAQHVENHELWMKRKIKELQTEDPQEIAD CCCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH IIMEEVIRSGDGYINDDMTIVVAKVKKNMPKWATIPIVGMQAQ HHHHHHHHCCCCEECCCCEEEEEEHHCCCCCEEEEEEEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7584024; 8830262; 9384377; 2832371; 8113187; 7570023 [H]