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The map label for this gene is 117922002

Identifier: 117922002

GI number: 117922002

Start: 4276585

End: 4278051

Strand: Direct

Name: 117922002

Synonym: Shewana3_3566

Alternate gene names: NA

Gene position: 4276585-4278051 (Clockwise)

Preceding gene: 117922001

Following gene: 117922005

Centisome position: 86.01

GC content: 29.93

Gene sequence:

>1467_bases
ATGGATAAGTTTGACAACGAAAAAAAGCACATATGGAATAAATTTGCTGACATTGAAAGACTTATAGATGAAAAATTCTC
AACACTAGAAAGTGAAATTTTAAAATCAGCTTCAGAGGCCCAAAGAGACGCAAATTACTCCTCAAGAAAAGTAACTGAAT
ACAAAAATAGAGCTTTGGAATCAAAAAATGAAGCAATTAAAACAAGCGAAGAAATTCTAATTATAAAAAACAAAGTAACA
AATGAGTTTATAATTTTCCAAGACACGGTAACAAACGCAAGTTCTTTAGCCTCAGACGCAGAAAAACTTCACTCCAGCGC
AGAAATTAAAATAAAAGAATTGGATGAATGGATTGAATGCAGTCAAGATAAGTATTCATCAATATCAGAAATATTAGAAA
AATACACAGACCTTGAAAATATTTTAGAGAATACAGTCTCATCTGCTAATCTAATACAAACAAATAGTAACAAGGTAAAA
TCCATTGTTACATCTTCTATGGAATTAAAAAACAAGATTGATGAAGCTTACACTGAAATATATGGTTTCGAGGAAGAAGA
TGAAGATGGAAACATTTCGGTTAATGAGGGTAAACTAGCACTACTCGAAAATGTATATGAAGAACTAAATGAAAAAATTT
CAACATTAGACACAGAGTTATCAAAATATAAAAAGACTAACACTGAAGAGCTAAACTCGATTATAAGCACAAGCATTAAT
AAAATTGATAAATTTATAACAGAAAAAGAAGAGTTAATAAAATCAATCGAGGGGAAGATAAACTCTTTACTGCCAAGAGC
ATTAACAACTGGTCTAAGCTCTGCATATCAAGCTAAAAAAGAGGCGGAAGAGGAAAATTACCTAAATTTAAGCAAAACAT
TCGTAAAATGTATTTTAGGCCTAATGGCAATATCATTAATCCCTATAGGAATTAATATTTTCATGGTAATAAATGGCAAG
GAATTAACTGAAGCATTAAAAGATACACCGCAGGTCATTTTAGGTTTACTGCCAGCTTACCTACCTATTATGTGGCTTGC
TATTTCAAATAACAAGAAAATAAATCTATCAAAAAGATTAATAGAAGAATACACCCATAAAGAAGTGTTAAGTAAAACAT
ATGAAGGCTTATCAACCCAAATAAACAATATAAAAGAAGAAATATCTCACTCTCAATTAAAAAACAAACTATTATTTAAT
TTATTAGATGTAAACGCAGAAAACCCAGGAAAACTAATATCAAACTATGACAAAAGTGACCATCCTTTGATGGAGGTTTT
AGATAGAAGCTCTCAGTTAGCTACTTCAATAGAAAAATTATCAAAAATACCAGGAGTACGAAAGGTAGCTCAAAAATTAG
TTGAAAAAAATACACATCAGCTAAAAGAACAAGATAGTAAAGTTAATGAAGCTATAGACTCTTTGAATGACGAAAAAGAT
TTACTCGATGATAATCAAAAGAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTATCGGCAAATTTATTCCTAAATCAGGTGCGGAAAGTCGGTTAAATGCAAATTAACCAATCTTACAAAACAACAAAAC
CACCTTAAAAAGGCAATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTCACTCAAAGAAATTTAACAAGCAACCCTTCTAAAAGATGTCGTGGTCAATGAAAGATGTGCAGGTATAACTCTTCA
TTCAATGGTTACACCAAAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MDKFDNEKKHIWNKFADIERLIDEKFSTLESEILKSASEAQRDANYSSRKVTEYKNRALESKNEAIKTSEEILIIKNKVT
NEFIIFQDTVTNASSLASDAEKLHSSAEIKIKELDEWIECSQDKYSSISEILEKYTDLENILENTVSSANLIQTNSNKVK
SIVTSSMELKNKIDEAYTEIYGFEEEDEDGNISVNEGKLALLENVYEELNEKISTLDTELSKYKKTNTEELNSIISTSIN
KIDKFITEKEELIKSIEGKINSLLPRALTTGLSSAYQAKKEAEEENYLNLSKTFVKCILGLMAISLIPIGINIFMVINGK
ELTEALKDTPQVILGLLPAYLPIMWLAISNNKKINLSKRLIEEYTHKEVLSKTYEGLSTQINNIKEEISHSQLKNKLLFN
LLDVNAENPGKLISNYDKSDHPLMEVLDRSSQLATSIEKLSKIPGVRKVAQKLVEKNTHQLKEQDSKVNEAIDSLNDEKD
LLDDNQKR

Sequences:

>Translated_488_residues
MDKFDNEKKHIWNKFADIERLIDEKFSTLESEILKSASEAQRDANYSSRKVTEYKNRALESKNEAIKTSEEILIIKNKVT
NEFIIFQDTVTNASSLASDAEKLHSSAEIKIKELDEWIECSQDKYSSISEILEKYTDLENILENTVSSANLIQTNSNKVK
SIVTSSMELKNKIDEAYTEIYGFEEEDEDGNISVNEGKLALLENVYEELNEKISTLDTELSKYKKTNTEELNSIISTSIN
KIDKFITEKEELIKSIEGKINSLLPRALTTGLSSAYQAKKEAEEENYLNLSKTFVKCILGLMAISLIPIGINIFMVINGK
ELTEALKDTPQVILGLLPAYLPIMWLAISNNKKINLSKRLIEEYTHKEVLSKTYEGLSTQINNIKEEISHSQLKNKLLFN
LLDVNAENPGKLISNYDKSDHPLMEVLDRSSQLATSIEKLSKIPGVRKVAQKLVEKNTHQLKEQDSKVNEAIDSLNDEKD
LLDDNQKR
>Mature_488_residues
MDKFDNEKKHIWNKFADIERLIDEKFSTLESEILKSASEAQRDANYSSRKVTEYKNRALESKNEAIKTSEEILIIKNKVT
NEFIIFQDTVTNASSLASDAEKLHSSAEIKIKELDEWIECSQDKYSSISEILEKYTDLENILENTVSSANLIQTNSNKVK
SIVTSSMELKNKIDEAYTEIYGFEEEDEDGNISVNEGKLALLENVYEELNEKISTLDTELSKYKKTNTEELNSIISTSIN
KIDKFITEKEELIKSIEGKINSLLPRALTTGLSSAYQAKKEAEEENYLNLSKTFVKCILGLMAISLIPIGINIFMVINGK
ELTEALKDTPQVILGLLPAYLPIMWLAISNNKKINLSKRLIEEYTHKEVLSKTYEGLSTQINNIKEEISHSQLKNKLLFN
LLDVNAENPGKLISNYDKSDHPLMEVLDRSSQLATSIEKLSKIPGVRKVAQKLVEKNTHQLKEQDSKVNEAIDSLNDEKD
LLDDNQKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55474; Mature: 55474

Theoretical pI: Translated: 4.75; Mature: 4.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKFDNEKKHIWNKFADIERLIDEKFSTLESEILKSASEAQRDANYSSRKVTEYKNRALE
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SKNEAIKTSEEILIIKNKVTNEFIIFQDTVTNASSLASDAEKLHSSAEIKIKELDEWIEC
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
SQDKYSSISEILEKYTDLENILENTVSSANLIQTNSNKVKSIVTSSMELKNKIDEAYTEI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGFEEEDEDGNISVNEGKLALLENVYEELNEKISTLDTELSKYKKTNTEELNSIISTSIN
HCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
KIDKFITEKEELIKSIEGKINSLLPRALTTGLSSAYQAKKEAEEENYLNLSKTFVKCILG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMAISLIPIGINIFMVINGKELTEALKDTPQVILGLLPAYLPIMWLAISNNKKINLSKRL
HHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH
IEEYTHKEVLSKTYEGLSTQINNIKEEISHSQLKNKLLFNLLDVNAENPGKLISNYDKSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCC
HPLMEVLDRSSQLATSIEKLSKIPGVRKVAQKLVEKNTHQLKEQDSKVNEAIDSLNDEKD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
LLDDNQKR
HCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDKFDNEKKHIWNKFADIERLIDEKFSTLESEILKSASEAQRDANYSSRKVTEYKNRALE
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SKNEAIKTSEEILIIKNKVTNEFIIFQDTVTNASSLASDAEKLHSSAEIKIKELDEWIEC
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
SQDKYSSISEILEKYTDLENILENTVSSANLIQTNSNKVKSIVTSSMELKNKIDEAYTEI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGFEEEDEDGNISVNEGKLALLENVYEELNEKISTLDTELSKYKKTNTEELNSIISTSIN
HCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
KIDKFITEKEELIKSIEGKINSLLPRALTTGLSSAYQAKKEAEEENYLNLSKTFVKCILG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMAISLIPIGINIFMVINGKELTEALKDTPQVILGLLPAYLPIMWLAISNNKKINLSKRL
HHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH
IEEYTHKEVLSKTYEGLSTQINNIKEEISHSQLKNKLLFNLLDVNAENPGKLISNYDKSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCC
HPLMEVLDRSSQLATSIEKLSKIPGVRKVAQKLVEKNTHQLKEQDSKVNEAIDSLNDEKD
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
LLDDNQKR
HCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA