| Definition | Shewanella sp. ANA-3 chromosome chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008577 |
| Length | 4,972,204 |
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The map label for this gene is 117921081
Identifier: 117921081
GI number: 117921081
Start: 3151732
End: 3154080
Strand: Direct
Name: 117921081
Synonym: Shewana3_2640
Alternate gene names: NA
Gene position: 3151732-3154080 (Clockwise)
Preceding gene: 117921080
Following gene: 117921090
Centisome position: 63.39
GC content: 39.25
Gene sequence:
>2349_bases ATGGAAAGACTCAGTATTACAACACATTTGATGGCCATCCTCACAGCATTCTCAGCATTTACAATGCCTATAGCCCTAGA TGTTTTGAATCGCATCAGAGACCGCTATGGCTCCTCGCATTACATGAAAGTCATCGAAAACATAATGGGGTTTAAGGTTC ACCTTTTGTTCCGAGAACTCATTGTTACACTAGCGTCACTAATATTGTTCTCACTATTTGTTGCGCTAGCGAATCCACAT TATTTTACGGCGAGCTTGGTCTTGCTCTTTGAATACTTATTTTCCTTTGTTGTTCTTTTTTTGCTACATAAGGAATATCA ATTCATAAAGACAGTATTCAAAGCGACTCGCTCCGACAAATTGGTGACCAACCATTTAATTAGCATGATTTCCAAGCCCC CGATAAAGAATGAGCATCACTCGAAGGAGGTTGAGCTGCTAATTCAGATTGCATGTTACAACATTGAAAACGCAAAAATA TCAACGACCGACTCAATTCAGCAACGGTTATTCTCATTAGTTAATAAGTCTTATAGCGATGAAGCGGGAGCAATTGATGC CGATACCGCGAAAATGTTAATTAGCGGCCTAGCTGTGGTATTAACATCTGCAAGAAACAGCAATGACAGAGGCTTATACA TAACCTTACAAAGGTGCTATGCAAAACATCTGATAATGTTTTTTGATAGAAAATTAAAAGAATCTAGTATTTTTCATGGA TACAGCGAGGAGTTTTATGAAGAGTGCATAAAAGAACTTGGCTCCGACCAATACTGGTTAATGAAAGCTGACTTTCTAAT TAGTTTAAGAACATGGGACATTCAGAGCCCGCAAACAATTAAATTCATTGACGGAATTGTTCGGAATCTAATTGACTTCT CCGTAAAAATGAAGCCAGAACTCATCCCTGAAATTATTGACCGATACAGAAACCTTATTGGCTTTGATAGCTATTTTTGC GAAGACCTGCATAAGCTCCCAGCACTTTTTGGCGACTATAATGGTAAGCACTTCAAGGAAATAGTGGGATTAAAAGCTGG GTATAATGAGCATCTATCGTCTTCTCCAGAAAAAATATCTGAGCAGTTTGAAGAGCTTTTAAGCAAGCATACGATTGATG CCATGGCAGGCGCTAAATCCACTGAACAGATAGGCAAGATTGAAGAAAATGCTAAAATTTATGCAAGAGACATGATGCAG GAGCTAATTAAAGATATTGCCGCTAATGCCGCAAAAAGCACTGCTCAATACGCAATAAGGGTGCTTGCCGCGCAAAATTT ATGGGTACACATCCTAGATAGTCATGAGATTTTTTCCTCGGCAAGTTCCAACGTGCAATTACTTGGCGTTAACATCTTAC CTAGTTCACTAAGCTCAGTGATACATGAATTAGGCGAGGCTCATAGCATTTCAATGCGACGCTCGAGAGAGTTGCGCTCA TCTTACCAAAAAGCCGTGCCACTCCTGCTTATGTACAATCTATACTGCTGGAGAATTAAAAACCCGGAAAAATGCCTATT AGAAGGTGTGGGCAACCTAGCATCCTCATTCAGCGTTATCGGGAGAACTATAATGCAAATCAATGACACTCTCTCAAATA TGACGCTAGTCAGATATTTTTCGAAGTCACCCGAGTATTCTACAACCCTTTGCAATCACTTTAATATCAGTCACGAGACC AAAAGCTTTCATACAGGGGTGATAAGAATGATTGATGAAATCACCAAACGTCTTAATGAAGAGCTTTTAAACCTAATTAA AAACCAACCACTAAGTGAAGAGCTAAAGCGAAAATACATTAATGAAGCAACGACAATTCCAGAGGATTATGTGGAGATTT TCCCCTTGCTAAGCAAGGTTACTCTTGTACCTGAGAAGCAAAACCCTATCAATGTAGGGTTGCTCCAATATCCGCGAAAA ACCTTTTTAGACAACACTGGGGTTGCGACGATTTTCTTTAACAGAGAAATTATAAAGGCTGTGCATAACTCTATTGCTAA AAAGCATTTAACCACAGAGGGGCGGCCACTCAAAAATCTTCAAGTCTCTGAGCTTAAAGATGATGATTTACTCATAGTGA GTAACAGTGATTGGCACGCTTGGGCGAAATCGCAAACCCAATCAGCACTATCAAGCATTAAAGTTCACCTTGTTTACACT GAGTCCTCTTTAGGTAGTTACTATATTTACAACACTGCATCATCACTCCCTTTGGTTCGGCTTTACTCAGAGCACAACAA TTTAAACGACATCGATATGCACGAGCATTTAAGGAATGCTTTCGAGTTCAAATTTGAAGATAAGGATGGATTTGTAAGTA TCCTGATAAAGGCTCACATTTATTATTAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TTCCCATTAGTTGCGCATGTCATTTCTGGCACCAACCCAAGGCGTTAATAAGTTTAAGCATATTTTCAATCTTATAATCC TTACCGTACCTGTCGAAGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 782; Mature: 782
Protein sequence:
>782_residues MERLSITTHLMAILTAFSAFTMPIALDVLNRIRDRYGSSHYMKVIENIMGFKVHLLFRELIVTLASLILFSLFVALANPH YFTASLVLLFEYLFSFVVLFLLHKEYQFIKTVFKATRSDKLVTNHLISMISKPPIKNEHHSKEVELLIQIACYNIENAKI STTDSIQQRLFSLVNKSYSDEAGAIDADTAKMLISGLAVVLTSARNSNDRGLYITLQRCYAKHLIMFFDRKLKESSIFHG YSEEFYEECIKELGSDQYWLMKADFLISLRTWDIQSPQTIKFIDGIVRNLIDFSVKMKPELIPEIIDRYRNLIGFDSYFC EDLHKLPALFGDYNGKHFKEIVGLKAGYNEHLSSSPEKISEQFEELLSKHTIDAMAGAKSTEQIGKIEENAKIYARDMMQ ELIKDIAANAAKSTAQYAIRVLAAQNLWVHILDSHEIFSSASSNVQLLGVNILPSSLSSVIHELGEAHSISMRRSRELRS SYQKAVPLLLMYNLYCWRIKNPEKCLLEGVGNLASSFSVIGRTIMQINDTLSNMTLVRYFSKSPEYSTTLCNHFNISHET KSFHTGVIRMIDEITKRLNEELLNLIKNQPLSEELKRKYINEATTIPEDYVEIFPLLSKVTLVPEKQNPINVGLLQYPRK TFLDNTGVATIFFNREIIKAVHNSIAKKHLTTEGRPLKNLQVSELKDDDLLIVSNSDWHAWAKSQTQSALSSIKVHLVYT ESSLGSYYIYNTASSLPLVRLYSEHNNLNDIDMHEHLRNAFEFKFEDKDGFVSILIKAHIYY
Sequences:
>Translated_782_residues MERLSITTHLMAILTAFSAFTMPIALDVLNRIRDRYGSSHYMKVIENIMGFKVHLLFRELIVTLASLILFSLFVALANPH YFTASLVLLFEYLFSFVVLFLLHKEYQFIKTVFKATRSDKLVTNHLISMISKPPIKNEHHSKEVELLIQIACYNIENAKI STTDSIQQRLFSLVNKSYSDEAGAIDADTAKMLISGLAVVLTSARNSNDRGLYITLQRCYAKHLIMFFDRKLKESSIFHG YSEEFYEECIKELGSDQYWLMKADFLISLRTWDIQSPQTIKFIDGIVRNLIDFSVKMKPELIPEIIDRYRNLIGFDSYFC EDLHKLPALFGDYNGKHFKEIVGLKAGYNEHLSSSPEKISEQFEELLSKHTIDAMAGAKSTEQIGKIEENAKIYARDMMQ ELIKDIAANAAKSTAQYAIRVLAAQNLWVHILDSHEIFSSASSNVQLLGVNILPSSLSSVIHELGEAHSISMRRSRELRS SYQKAVPLLLMYNLYCWRIKNPEKCLLEGVGNLASSFSVIGRTIMQINDTLSNMTLVRYFSKSPEYSTTLCNHFNISHET KSFHTGVIRMIDEITKRLNEELLNLIKNQPLSEELKRKYINEATTIPEDYVEIFPLLSKVTLVPEKQNPINVGLLQYPRK TFLDNTGVATIFFNREIIKAVHNSIAKKHLTTEGRPLKNLQVSELKDDDLLIVSNSDWHAWAKSQTQSALSSIKVHLVYT ESSLGSYYIYNTASSLPLVRLYSEHNNLNDIDMHEHLRNAFEFKFEDKDGFVSILIKAHIYY >Mature_782_residues MERLSITTHLMAILTAFSAFTMPIALDVLNRIRDRYGSSHYMKVIENIMGFKVHLLFRELIVTLASLILFSLFVALANPH YFTASLVLLFEYLFSFVVLFLLHKEYQFIKTVFKATRSDKLVTNHLISMISKPPIKNEHHSKEVELLIQIACYNIENAKI STTDSIQQRLFSLVNKSYSDEAGAIDADTAKMLISGLAVVLTSARNSNDRGLYITLQRCYAKHLIMFFDRKLKESSIFHG YSEEFYEECIKELGSDQYWLMKADFLISLRTWDIQSPQTIKFIDGIVRNLIDFSVKMKPELIPEIIDRYRNLIGFDSYFC EDLHKLPALFGDYNGKHFKEIVGLKAGYNEHLSSSPEKISEQFEELLSKHTIDAMAGAKSTEQIGKIEENAKIYARDMMQ ELIKDIAANAAKSTAQYAIRVLAAQNLWVHILDSHEIFSSASSNVQLLGVNILPSSLSSVIHELGEAHSISMRRSRELRS SYQKAVPLLLMYNLYCWRIKNPEKCLLEGVGNLASSFSVIGRTIMQINDTLSNMTLVRYFSKSPEYSTTLCNHFNISHET KSFHTGVIRMIDEITKRLNEELLNLIKNQPLSEELKRKYINEATTIPEDYVEIFPLLSKVTLVPEKQNPINVGLLQYPRK TFLDNTGVATIFFNREIIKAVHNSIAKKHLTTEGRPLKNLQVSELKDDDLLIVSNSDWHAWAKSQTQSALSSIKVHLVYT ESSLGSYYIYNTASSLPLVRLYSEHNNLNDIDMHEHLRNAFEFKFEDKDGFVSILIKAHIYY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 89585; Mature: 89585
Theoretical pI: Translated: 7.35; Mature: 7.35
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MERLSITTHLMAILTAFSAFTMPIALDVLNRIRDRYGSSHYMKVIENIMGFKVHLLFREL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVTLASLILFSLFVALANPHYFTASLVLLFEYLFSFVVLFLLHKEYQFIKTVFKATRSDK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH LVTNHLISMISKPPIKNEHHSKEVELLIQIACYNIENAKISTTDSIQQRLFSLVNKSYSD HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCC EAGAIDADTAKMLISGLAVVLTSARNSNDRGLYITLQRCYAKHLIMFFDRKLKESSIFHG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC YSEEFYEECIKELGSDQYWLMKADFLISLRTWDIQSPQTIKFIDGIVRNLIDFSVKMKPE CHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH LIPEIIDRYRNLIGFDSYFCEDLHKLPALFGDYNGKHFKEIVGLKAGYNEHLSSSPEKIS HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHH EQFEELLSKHTIDAMAGAKSTEQIGKIEENAKIYARDMMQELIKDIAANAAKSTAQYAIR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLAAQNLWVHILDSHEIFSSASSNVQLLGVNILPSSLSSVIHELGEAHSISMRRSRELRS HHHHCCCEEEEECCHHHHHCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH SYQKAVPLLLMYNLYCWRIKNPEKCLLEGVGNLASSFSVIGRTIMQINDTLSNMTLVRYF HHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKSPEYSTTLCNHFNISHETKSFHTGVIRMIDEITKRLNEELLNLIKNQPLSEELKRKYI HCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH NEATTIPEDYVEIFPLLSKVTLVPEKQNPINVGLLQYPRKTFLDNTGVATIFFNREIIKA HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEECHHHCCHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHH VHNSIAKKHLTTEGRPLKNLQVSELKDDDLLIVSNSDWHAWAKSQTQSALSSIKVHLVYT HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE ESSLGSYYIYNTASSLPLVRLYSEHNNLNDIDMHEHLRNAFEFKFEDKDGFVSILIKAHI ECCCCCEEEEECCCCCCHHEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEEEEEHHC YY CC >Mature Secondary Structure MERLSITTHLMAILTAFSAFTMPIALDVLNRIRDRYGSSHYMKVIENIMGFKVHLLFREL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVTLASLILFSLFVALANPHYFTASLVLLFEYLFSFVVLFLLHKEYQFIKTVFKATRSDK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH LVTNHLISMISKPPIKNEHHSKEVELLIQIACYNIENAKISTTDSIQQRLFSLVNKSYSD HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCC EAGAIDADTAKMLISGLAVVLTSARNSNDRGLYITLQRCYAKHLIMFFDRKLKESSIFHG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC YSEEFYEECIKELGSDQYWLMKADFLISLRTWDIQSPQTIKFIDGIVRNLIDFSVKMKPE CHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH LIPEIIDRYRNLIGFDSYFCEDLHKLPALFGDYNGKHFKEIVGLKAGYNEHLSSSPEKIS HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHH EQFEELLSKHTIDAMAGAKSTEQIGKIEENAKIYARDMMQELIKDIAANAAKSTAQYAIR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLAAQNLWVHILDSHEIFSSASSNVQLLGVNILPSSLSSVIHELGEAHSISMRRSRELRS HHHHCCCEEEEECCHHHHHCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH SYQKAVPLLLMYNLYCWRIKNPEKCLLEGVGNLASSFSVIGRTIMQINDTLSNMTLVRYF HHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKSPEYSTTLCNHFNISHETKSFHTGVIRMIDEITKRLNEELLNLIKNQPLSEELKRKYI HCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH NEATTIPEDYVEIFPLLSKVTLVPEKQNPINVGLLQYPRKTFLDNTGVATIFFNREIIKA HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEECHHHCCHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHH VHNSIAKKHLTTEGRPLKNLQVSELKDDDLLIVSNSDWHAWAKSQTQSALSSIKVHLVYT HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE ESSLGSYYIYNTASSLPLVRLYSEHNNLNDIDMHEHLRNAFEFKFEDKDGFVSILIKAHI ECCCCCEEEEECCCCCCHHEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEEEEEHHC YY CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA