Definition Shewanella sp. ANA-3 chromosome chromosome 1, complete sequence.
Accession NC_008577
Length 4,972,204

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The map label for this gene is 117921081

Identifier: 117921081

GI number: 117921081

Start: 3151732

End: 3154080

Strand: Direct

Name: 117921081

Synonym: Shewana3_2640

Alternate gene names: NA

Gene position: 3151732-3154080 (Clockwise)

Preceding gene: 117921080

Following gene: 117921090

Centisome position: 63.39

GC content: 39.25

Gene sequence:

>2349_bases
ATGGAAAGACTCAGTATTACAACACATTTGATGGCCATCCTCACAGCATTCTCAGCATTTACAATGCCTATAGCCCTAGA
TGTTTTGAATCGCATCAGAGACCGCTATGGCTCCTCGCATTACATGAAAGTCATCGAAAACATAATGGGGTTTAAGGTTC
ACCTTTTGTTCCGAGAACTCATTGTTACACTAGCGTCACTAATATTGTTCTCACTATTTGTTGCGCTAGCGAATCCACAT
TATTTTACGGCGAGCTTGGTCTTGCTCTTTGAATACTTATTTTCCTTTGTTGTTCTTTTTTTGCTACATAAGGAATATCA
ATTCATAAAGACAGTATTCAAAGCGACTCGCTCCGACAAATTGGTGACCAACCATTTAATTAGCATGATTTCCAAGCCCC
CGATAAAGAATGAGCATCACTCGAAGGAGGTTGAGCTGCTAATTCAGATTGCATGTTACAACATTGAAAACGCAAAAATA
TCAACGACCGACTCAATTCAGCAACGGTTATTCTCATTAGTTAATAAGTCTTATAGCGATGAAGCGGGAGCAATTGATGC
CGATACCGCGAAAATGTTAATTAGCGGCCTAGCTGTGGTATTAACATCTGCAAGAAACAGCAATGACAGAGGCTTATACA
TAACCTTACAAAGGTGCTATGCAAAACATCTGATAATGTTTTTTGATAGAAAATTAAAAGAATCTAGTATTTTTCATGGA
TACAGCGAGGAGTTTTATGAAGAGTGCATAAAAGAACTTGGCTCCGACCAATACTGGTTAATGAAAGCTGACTTTCTAAT
TAGTTTAAGAACATGGGACATTCAGAGCCCGCAAACAATTAAATTCATTGACGGAATTGTTCGGAATCTAATTGACTTCT
CCGTAAAAATGAAGCCAGAACTCATCCCTGAAATTATTGACCGATACAGAAACCTTATTGGCTTTGATAGCTATTTTTGC
GAAGACCTGCATAAGCTCCCAGCACTTTTTGGCGACTATAATGGTAAGCACTTCAAGGAAATAGTGGGATTAAAAGCTGG
GTATAATGAGCATCTATCGTCTTCTCCAGAAAAAATATCTGAGCAGTTTGAAGAGCTTTTAAGCAAGCATACGATTGATG
CCATGGCAGGCGCTAAATCCACTGAACAGATAGGCAAGATTGAAGAAAATGCTAAAATTTATGCAAGAGACATGATGCAG
GAGCTAATTAAAGATATTGCCGCTAATGCCGCAAAAAGCACTGCTCAATACGCAATAAGGGTGCTTGCCGCGCAAAATTT
ATGGGTACACATCCTAGATAGTCATGAGATTTTTTCCTCGGCAAGTTCCAACGTGCAATTACTTGGCGTTAACATCTTAC
CTAGTTCACTAAGCTCAGTGATACATGAATTAGGCGAGGCTCATAGCATTTCAATGCGACGCTCGAGAGAGTTGCGCTCA
TCTTACCAAAAAGCCGTGCCACTCCTGCTTATGTACAATCTATACTGCTGGAGAATTAAAAACCCGGAAAAATGCCTATT
AGAAGGTGTGGGCAACCTAGCATCCTCATTCAGCGTTATCGGGAGAACTATAATGCAAATCAATGACACTCTCTCAAATA
TGACGCTAGTCAGATATTTTTCGAAGTCACCCGAGTATTCTACAACCCTTTGCAATCACTTTAATATCAGTCACGAGACC
AAAAGCTTTCATACAGGGGTGATAAGAATGATTGATGAAATCACCAAACGTCTTAATGAAGAGCTTTTAAACCTAATTAA
AAACCAACCACTAAGTGAAGAGCTAAAGCGAAAATACATTAATGAAGCAACGACAATTCCAGAGGATTATGTGGAGATTT
TCCCCTTGCTAAGCAAGGTTACTCTTGTACCTGAGAAGCAAAACCCTATCAATGTAGGGTTGCTCCAATATCCGCGAAAA
ACCTTTTTAGACAACACTGGGGTTGCGACGATTTTCTTTAACAGAGAAATTATAAAGGCTGTGCATAACTCTATTGCTAA
AAAGCATTTAACCACAGAGGGGCGGCCACTCAAAAATCTTCAAGTCTCTGAGCTTAAAGATGATGATTTACTCATAGTGA
GTAACAGTGATTGGCACGCTTGGGCGAAATCGCAAACCCAATCAGCACTATCAAGCATTAAAGTTCACCTTGTTTACACT
GAGTCCTCTTTAGGTAGTTACTATATTTACAACACTGCATCATCACTCCCTTTGGTTCGGCTTTACTCAGAGCACAACAA
TTTAAACGACATCGATATGCACGAGCATTTAAGGAATGCTTTCGAGTTCAAATTTGAAGATAAGGATGGATTTGTAAGTA
TCCTGATAAAGGCTCACATTTATTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCATTAGAAAACAGATTAATGATTAGCTACTGCAAGTACCAACAAGCACCTCAAGACAGAAAAATATTTAGCCATAAG
AAATTAGAGCGGTCAGAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCCCATTAGTTGCGCATGTCATTTCTGGCACCAACCCAAGGCGTTAATAAGTTTAAGCATATTTTCAATCTTATAATCC
TTACCGTACCTGTCGAAGGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 782; Mature: 782

Protein sequence:

>782_residues
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Sequences:

>Translated_782_residues
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YFTASLVLLFEYLFSFVVLFLLHKEYQFIKTVFKATRSDKLVTNHLISMISKPPIKNEHHSKEVELLIQIACYNIENAKI
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>Mature_782_residues
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ESSLGSYYIYNTASSLPLVRLYSEHNNLNDIDMHEHLRNAFEFKFEDKDGFVSILIKAHIYY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89585; Mature: 89585

Theoretical pI: Translated: 7.35; Mature: 7.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MERLSITTHLMAILTAFSAFTMPIALDVLNRIRDRYGSSHYMKVIENIMGFKVHLLFREL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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VHNSIAKKHLTTEGRPLKNLQVSELKDDDLLIVSNSDWHAWAKSQTQSALSSIKVHLVYT
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ECCCCCEEEEECCCCCCHHEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEEEEEHHC
YY
CC
>Mature Secondary Structure
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YY
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA