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The map label for this gene is 117920465

Identifier: 117920465

GI number: 117920465

Start: 2412921

End: 2416034

Strand: Direct

Name: 117920465

Synonym: Shewana3_2020

Alternate gene names: NA

Gene position: 2412921-2416034 (Clockwise)

Preceding gene: 117920464

Following gene: 117920469

Centisome position: 48.53

GC content: 33.46

Gene sequence:

>3114_bases
ATGGTTGAAGTTAAAATCAGTTCTTTCATAAATGATTTAATTATTAAAGATGAAAGGCATCCTTTATATCAAGAGACATT
AGTTGCCTATTTAGCTAAAAATTGTCATACCATTTGTGATGAGTCAAAAGGAGTTGATACTAAAAAAATATTTTATTCAC
TATATAAAAACTTGCTAGGACATTTGAAAAATCATTTCCTGTTATCAGAGACTAATTTTATCCAAGAAGAGTTAGAATCT
TTAATTTCTCATTTAAAGCCAGATGTTATTGGAAAACAAACCCAGCTGCTAATATTGCAAGCACTGCTTAATTATGCAAA
AAAACAATTTAATTTTGACTCTCCAAATATACCTGTCATAGTGACATTAAAACGTGATAAACCAATACTATCTCCAGTTG
AACTTATTAAACTTCCTATTGTAGAACAGCTTAATACTATCATAGATAGTGAACTTAACGTACCCAGTAGGATGCTAACT
GTGGATGCTAAACTAGGTCGAACTGCTTTATTAGTATATTGGACCGTAGGGTTGAGTAAAACCGAAGAATTGATTTCGAT
TCTTGAATTCCCGCAAAATATTTTTTATGTTGGTGGTCTTTGTTATTGGCAGTCAGAGAAGAGATATACATACTCGACTA
GGTTCATATTAAGTGATGTTGCAGTAGTTGCCTTGCAACAATGGAATGTTTTAAATGTAAATAAATCTTTTAAGGTTATG
GATTTAGTAGTAAAATATTTAAATTTTGTATCTGATTTCGATTGGTCAGCGTTATCTATTCTAAAATTAAGAACATTACG
GAAAATAGATAATGTCTTGCGCTACGGTCCAGTGCAGTATCAGATGTATATTCTACCAAGGGTCAGTCAAGCATTGCCTG
AGCATGCGTTTTGTCGTTTGCTAACGGACAAAGCCTGTCGTAATTTAGAACCTCGTATCTTAGAACCTAGTAGCGATAAT
TTAATCCTGTCTAAACCCTGGAAAATGATCAATGCTGGAGATACCCCCTTCATCGATATCAAAATCATATTAAAAAATTT
GGACAAACTTTTTGAGCGACTACTGAAATTTAGGTTAGAGAACAATGTTCGAGAAAAATGTATTAAATTTTTGAAAAACA
CTATAAAAAAACCAGAAATCGCCGCCGTACCTTACTTTTGGCTTTTATGTTCATGGTTATACTCTTTGTTAAAGCATGGA
GGAACTTCTAAAAGTCGTTTAAAACTATCTACTATTATCGACTACGTTAAAAGTCTTAGTAAGCCTTTTCTAACAGTTTT
TAGCACCTGTAATATTGGATTGTTATCTGGTGAAGATTGGGTTAGTAAATTGAATGATTCGGCTGAATTATTTTCTTCAG
CACAACGTAAAAAATATGTCTATTACTTTGCACAATTTTTGATTGACAACAGGTTAGTTCGGGATCTATGCCTTTCTGAT
ATCGATATAATAGGCAGTTCAAGTCAAGTTGATGCGAACATGATATCTCCTACCCACATTGATGAAATTTTGAACTATTT
AACTCAACATTTTAATGATGGACTAGTTTATCATTATGCGTATTTTTTATTGTGCTTCTGCTTTTTTAGCGGTTTGCGCA
GAAATGAAGCTGCAAAATTAACGTGGTCGGATTTTTCATTTTCAATTTTATTTCCATCTAAGCATGAGTTTGATTATGTT
AAGCTATCAGTAAGACCTAACCAGCATAGAACGTTGAAAACATCTTCTGCTCGTAGAGAGATACCATTAGATGCATTTTG
GCCTAAAATCGCGATAGAAAAACTTAGAAAAAAGTATCAAATTCATCATAAAATGAAACAAAGTAAAAACGCCCTACTAT
TTGATAATCAAAAAGTTGCAAATCAAGCTTATGATTTAATAACCGATTTAATGCGTCATTATACTCATGACTATAGCTTA
CGCGTTCACCATCTACGACATAGTTTTGCCAATTGGTCATGGTGTCGCTTGAATCCTCATATTATCGAGATAGGAAAAAT
TCAGCTTAAGTTATTTAATCATGAGATCTTTAGTGCAGAATATTTAAGCCGCTTACAGAATCGATTATGTTACAGTAACA
ATACTCGGAAAAAAATGTTTATTCTATCCCATTTGTTAGGGCATAAAGATGTTTATTCGACGCTAAATAGTTACCTGCAT
CTCAAGGATGTATTGCATTACTTAGAATTGCAACCTCGATTTACTTTAACTAAGTACTTTTGTTCAGAGTGTATAGGTCG
ATCTACATTAATGGAGCAGGAGCAGGAATTAAGTCTGGCAGAGAGAATACAGTATTATACTAAAGATACTGAAACTAAGT
TGAGCATTAAACCTGCGCCATTAATTTCATCATTAAAAATTCCGACTTTAGCAAACTTTGTTAAGGAAATTCACCCTACT
ATAAAAGTCAGTAGTTTGACATGGGCTAAAGCACTCGCTGCTTTAAAATTCTGTTCGATAGTTGACTCATCTCATACTTT
CAATGTCCCAGTTGAACAATTACAGCAAATTCTTACTAATGCCGAGCAAGTACATAACAACTACCCTCGAATAGGAAAAC
CTCTCCCGTTAATTCCTAACTTTCCAAGACTTATTCATTCATCAGATTCGAACAACACTAATAGTTATTTAGCTAAATCA
GGTAAAGTATTTGCTTATCTATGTAATAAATTTGATAAAAGTATCGAAGCGGAATCTTTGACGCTGGCCAATGTTAGGTT
AAGCATGAGTATTTTGAAATATGCAGTGCCGGGGAAGGGTTATGCTTTGCGATGCCCTGAGTCCAACGTTTCTAGGATGT
TTGTCCGTTTTTGTCAGTTACTGGGACTAAAAGACCGCCATTTAAGGTTTAAATATCATAGAGCAGATCTCACTCTTGAA
GCTTCAAATAGAATAGAAGATAGATGGATAAAAACCATTGTGGATTATGGGTTTAGTGAGAAAAACTTTACTATTGCGAG
TGAAAGTGAAGGTCGATTTTTAGGAAAGCATGATGGAAATGGATTTCTTGAGATATTGCTAGTTAACAATGCGTACAAAC
GTGTACAGCGACATCAAAGTCTGTTTAGTTTCTTACACTTAATATTAATTTTTAGCTACAATGAAAAGAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGCGGGAGAAGTACCACTAGGGTACTATTCAGCATTAAGCCATATCGGAGTCATTAATGACATTGTTCCTGTACTTGAT
GAATTGTTTAAGGAGGTAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATTTTATGTGAGTTTAATAAAGCAAATTTTAGTGTTTTAAAAATGACCATAAATTATGACATCCATTGATTTAACTT
TATTGGATTGACATGTTGTA

Product: phage integrase family protein

Products: NA

Alternate protein names: Integrase Family Protein

Number of amino acids: Translated: 1037; Mature: 1037

Protein sequence:

>1037_residues
MVEVKISSFINDLIIKDERHPLYQETLVAYLAKNCHTICDESKGVDTKKIFYSLYKNLLGHLKNHFLLSETNFIQEELES
LISHLKPDVIGKQTQLLILQALLNYAKKQFNFDSPNIPVIVTLKRDKPILSPVELIKLPIVEQLNTIIDSELNVPSRMLT
VDAKLGRTALLVYWTVGLSKTEELISILEFPQNIFYVGGLCYWQSEKRYTYSTRFILSDVAVVALQQWNVLNVNKSFKVM
DLVVKYLNFVSDFDWSALSILKLRTLRKIDNVLRYGPVQYQMYILPRVSQALPEHAFCRLLTDKACRNLEPRILEPSSDN
LILSKPWKMINAGDTPFIDIKIILKNLDKLFERLLKFRLENNVREKCIKFLKNTIKKPEIAAVPYFWLLCSWLYSLLKHG
GTSKSRLKLSTIIDYVKSLSKPFLTVFSTCNIGLLSGEDWVSKLNDSAELFSSAQRKKYVYYFAQFLIDNRLVRDLCLSD
IDIIGSSSQVDANMISPTHIDEILNYLTQHFNDGLVYHYAYFLLCFCFFSGLRRNEAAKLTWSDFSFSILFPSKHEFDYV
KLSVRPNQHRTLKTSSARREIPLDAFWPKIAIEKLRKKYQIHHKMKQSKNALLFDNQKVANQAYDLITDLMRHYTHDYSL
RVHHLRHSFANWSWCRLNPHIIEIGKIQLKLFNHEIFSAEYLSRLQNRLCYSNNTRKKMFILSHLLGHKDVYSTLNSYLH
LKDVLHYLELQPRFTLTKYFCSECIGRSTLMEQEQELSLAERIQYYTKDTETKLSIKPAPLISSLKIPTLANFVKEIHPT
IKVSSLTWAKALAALKFCSIVDSSHTFNVPVEQLQQILTNAEQVHNNYPRIGKPLPLIPNFPRLIHSSDSNNTNSYLAKS
GKVFAYLCNKFDKSIEAESLTLANVRLSMSILKYAVPGKGYALRCPESNVSRMFVRFCQLLGLKDRHLRFKYHRADLTLE
ASNRIEDRWIKTIVDYGFSEKNFTIASESEGRFLGKHDGNGFLEILLVNNAYKRVQRHQSLFSFLHLILIFSYNEKK

Sequences:

>Translated_1037_residues
MVEVKISSFINDLIIKDERHPLYQETLVAYLAKNCHTICDESKGVDTKKIFYSLYKNLLGHLKNHFLLSETNFIQEELES
LISHLKPDVIGKQTQLLILQALLNYAKKQFNFDSPNIPVIVTLKRDKPILSPVELIKLPIVEQLNTIIDSELNVPSRMLT
VDAKLGRTALLVYWTVGLSKTEELISILEFPQNIFYVGGLCYWQSEKRYTYSTRFILSDVAVVALQQWNVLNVNKSFKVM
DLVVKYLNFVSDFDWSALSILKLRTLRKIDNVLRYGPVQYQMYILPRVSQALPEHAFCRLLTDKACRNLEPRILEPSSDN
LILSKPWKMINAGDTPFIDIKIILKNLDKLFERLLKFRLENNVREKCIKFLKNTIKKPEIAAVPYFWLLCSWLYSLLKHG
GTSKSRLKLSTIIDYVKSLSKPFLTVFSTCNIGLLSGEDWVSKLNDSAELFSSAQRKKYVYYFAQFLIDNRLVRDLCLSD
IDIIGSSSQVDANMISPTHIDEILNYLTQHFNDGLVYHYAYFLLCFCFFSGLRRNEAAKLTWSDFSFSILFPSKHEFDYV
KLSVRPNQHRTLKTSSARREIPLDAFWPKIAIEKLRKKYQIHHKMKQSKNALLFDNQKVANQAYDLITDLMRHYTHDYSL
RVHHLRHSFANWSWCRLNPHIIEIGKIQLKLFNHEIFSAEYLSRLQNRLCYSNNTRKKMFILSHLLGHKDVYSTLNSYLH
LKDVLHYLELQPRFTLTKYFCSECIGRSTLMEQEQELSLAERIQYYTKDTETKLSIKPAPLISSLKIPTLANFVKEIHPT
IKVSSLTWAKALAALKFCSIVDSSHTFNVPVEQLQQILTNAEQVHNNYPRIGKPLPLIPNFPRLIHSSDSNNTNSYLAKS
GKVFAYLCNKFDKSIEAESLTLANVRLSMSILKYAVPGKGYALRCPESNVSRMFVRFCQLLGLKDRHLRFKYHRADLTLE
ASNRIEDRWIKTIVDYGFSEKNFTIASESEGRFLGKHDGNGFLEILLVNNAYKRVQRHQSLFSFLHLILIFSYNEKK
>Mature_1037_residues
MVEVKISSFINDLIIKDERHPLYQETLVAYLAKNCHTICDESKGVDTKKIFYSLYKNLLGHLKNHFLLSETNFIQEELES
LISHLKPDVIGKQTQLLILQALLNYAKKQFNFDSPNIPVIVTLKRDKPILSPVELIKLPIVEQLNTIIDSELNVPSRMLT
VDAKLGRTALLVYWTVGLSKTEELISILEFPQNIFYVGGLCYWQSEKRYTYSTRFILSDVAVVALQQWNVLNVNKSFKVM
DLVVKYLNFVSDFDWSALSILKLRTLRKIDNVLRYGPVQYQMYILPRVSQALPEHAFCRLLTDKACRNLEPRILEPSSDN
LILSKPWKMINAGDTPFIDIKIILKNLDKLFERLLKFRLENNVREKCIKFLKNTIKKPEIAAVPYFWLLCSWLYSLLKHG
GTSKSRLKLSTIIDYVKSLSKPFLTVFSTCNIGLLSGEDWVSKLNDSAELFSSAQRKKYVYYFAQFLIDNRLVRDLCLSD
IDIIGSSSQVDANMISPTHIDEILNYLTQHFNDGLVYHYAYFLLCFCFFSGLRRNEAAKLTWSDFSFSILFPSKHEFDYV
KLSVRPNQHRTLKTSSARREIPLDAFWPKIAIEKLRKKYQIHHKMKQSKNALLFDNQKVANQAYDLITDLMRHYTHDYSL
RVHHLRHSFANWSWCRLNPHIIEIGKIQLKLFNHEIFSAEYLSRLQNRLCYSNNTRKKMFILSHLLGHKDVYSTLNSYLH
LKDVLHYLELQPRFTLTKYFCSECIGRSTLMEQEQELSLAERIQYYTKDTETKLSIKPAPLISSLKIPTLANFVKEIHPT
IKVSSLTWAKALAALKFCSIVDSSHTFNVPVEQLQQILTNAEQVHNNYPRIGKPLPLIPNFPRLIHSSDSNNTNSYLAKS
GKVFAYLCNKFDKSIEAESLTLANVRLSMSILKYAVPGKGYALRCPESNVSRMFVRFCQLLGLKDRHLRFKYHRADLTLE
ASNRIEDRWIKTIVDYGFSEKNFTIASESEGRFLGKHDGNGFLEILLVNNAYKRVQRHQSLFSFLHLILIFSYNEKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 120518; Mature: 120518

Theoretical pI: Translated: 9.67; Mature: 9.67

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVEVKISSFINDLIIKDERHPLYQETLVAYLAKNCHTICDESKGVDTKKIFYSLYKNLLG
CEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
HLKNHFLLSETNFIQEELESLISHLKPDVIGKQTQLLILQALLNYAKKQFNFDSPNIPVI
HHHHCEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE
VTLKRDKPILSPVELIKLPIVEQLNTIIDSELNVPSRMLTVDAKLGRTALLVYWTVGLSK
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCC
TEELISILEFPQNIFYVGGLCYWQSEKRYTYSTRFILSDVAVVALQQWNVLNVNKSFKVM
HHHHHHHHHCCCHHEEECEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHH
DLVVKYLNFVSDFDWSALSILKLRTLRKIDNVLRYGPVQYQMYILPRVSQALPEHAFCRL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHHHH
LTDKACRNLEPRILEPSSDNLILSKPWKMINAGDTPFIDIKIILKNLDKLFERLLKFRLE
HHHHHHCCCCCCEECCCCCCEEEECCCCEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNVREKCIKFLKNTIKKPEIAAVPYFWLLCSWLYSLLKHGGTSKSRLKLSTIIDYVKSLS
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
KPFLTVFSTCNIGLLSGEDWVSKLNDSAELFSSAQRKKYVYYFAQFLIDNRLVRDLCLSD
CHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDIIGSSSQVDANMISPTHIDEILNYLTQHFNDGLVYHYAYFLLCFCFFSGLRRNEAAKL
HHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
TWSDFSFSILFPSKHEFDYVKLSVRPNQHRTLKTSSARREIPLDAFWPKIAIEKLRKKYQ
EECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHHKMKQSKNALLFDNQKVANQAYDLITDLMRHYTHDYSLRVHHLRHSFANWSWCRLNPH
HHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHCCCEEEECCCC
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EEEECEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
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LISSLKIPTLANFVKEIHPTIKVSSLTWAKALAALKFCSIVDSSHTFNVPVEQLQQILTN
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AEQVHNNYPRIGKPLPLIPNFPRLIHSSDSNNTNSYLAKSGKVFAYLCNKFDKSIEAESL
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TLANVRLSMSILKYAVPGKGYALRCPESNVSRMFVRFCQLLGLKDRHLRFKYHRADLTLE
EEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCEEEE
ASNRIEDRWIKTIVDYGFSEKNFTIASESEGRFLGKHDGNGFLEILLVNNAYKRVQRHQS
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LFSFLHLILIFSYNEKK
HHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVEVKISSFINDLIIKDERHPLYQETLVAYLAKNCHTICDESKGVDTKKIFYSLYKNLLG
CEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
HLKNHFLLSETNFIQEELESLISHLKPDVIGKQTQLLILQALLNYAKKQFNFDSPNIPVI
HHHHCEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEE
VTLKRDKPILSPVELIKLPIVEQLNTIIDSELNVPSRMLTVDAKLGRTALLVYWTVGLSK
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCC
TEELISILEFPQNIFYVGGLCYWQSEKRYTYSTRFILSDVAVVALQQWNVLNVNKSFKVM
HHHHHHHHHCCCHHEEECEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCHHHH
DLVVKYLNFVSDFDWSALSILKLRTLRKIDNVLRYGPVQYQMYILPRVSQALPEHAFCRL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHHHHH
LTDKACRNLEPRILEPSSDNLILSKPWKMINAGDTPFIDIKIILKNLDKLFERLLKFRLE
HHHHHHCCCCCCEECCCCCCEEEECCCCEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNVREKCIKFLKNTIKKPEIAAVPYFWLLCSWLYSLLKHGGTSKSRLKLSTIIDYVKSLS
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KPFLTVFSTCNIGLLSGEDWVSKLNDSAELFSSAQRKKYVYYFAQFLIDNRLVRDLCLSD
CHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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EECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IHHKMKQSKNALLFDNQKVANQAYDLITDLMRHYTHDYSLRVHHLRHSFANWSWCRLNPH
HHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHCCCEEEECCCC
IIEIGKIQLKLFNHEIFSAEYLSRLQNRLCYSNNTRKKMFILSHLLGHKDVYSTLNSYLH
EEEECEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LKDVLHYLELQPRFTLTKYFCSECIGRSTLMEQEQELSLAERIQYYTKDTETKLSIKPAP
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCC
LISSLKIPTLANFVKEIHPTIKVSSLTWAKALAALKFCSIVDSSHTFNVPVEQLQQILTN
CHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
AEQVHNNYPRIGKPLPLIPNFPRLIHSSDSNNTNSYLAKSGKVFAYLCNKFDKSIEAESL
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCE
TLANVRLSMSILKYAVPGKGYALRCPESNVSRMFVRFCQLLGLKDRHLRFKYHRADLTLE
EEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCEEEE
ASNRIEDRWIKTIVDYGFSEKNFTIASESEGRFLGKHDGNGFLEILLVNNAYKRVQRHQS
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCEEECCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHH
LFSFLHLILIFSYNEKK
HHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA