Definition Pediococcus pentosaceus ATCC 25745, complete genome.
Accession NC_008525
Length 1,832,387

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The map label for this gene is mgtE [H]

Identifier: 116492961

GI number: 116492961

Start: 1200609

End: 1201958

Strand: Reverse

Name: mgtE [H]

Synonym: PEPE_1200

Alternate gene names: 116492961

Gene position: 1201958-1200609 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116492962

Following gene: 116492958

Centisome position: 65.6

GC content: 35.7

Gene sequence:

>1350_bases
ATGGATAATACTCAAGCTATTTTTGAAAAATTAAAAATAGAATTATTAAAACATCATTCCAAAAAATTTAAAGAAGATTT
CCTTGATTTACATAATTATGATCAAGGTCGTTTTTTTGGTGAATTAACGCGTGAAGAACGTCTTCTCGTGTACAAGTATC
TAGACCCGGATGAGCTGGCGGATACGTTTGATGAACTTGATGATGAACCAGATTTAATTGCAGAATATCTGGACGAAATG
GCACCTAGTTATGCTGCAGCGTTGTTGAACGGGATGTATGATGATAACGAAGCGGATATTTTAGGAGCTGTTCGAAATGA
CAAGTTACATAAACTTCTATCATATATGCAACCCGTAGATGCTGCCCGAGTTCGCCAATTACTTAAGTATGAAGAAAAAA
CTGCTGGTGCGTTGATGACAACTGAATTCATTTCAGTTGCCGTAGATACAACGGTGGGCTCGGCTATGAATCAAGTTAAA
CAGGAAGCTCAATATGCGGAAACTATTTCATACATTTATGTGGTTAACGAATCTAATCAATTAATTGGAGTGATTTCAGT
TAAGGATTTAATTGTTAATCCGGATGATGTATTTATCAAACGAATTATGAATACGAACGTGGTATCTGTAAGAGATGATG
AGGATCAAACTGAAATTGCTGCCCAAATTCGTGATTATAACTTTATTGCAATTCCAGTTGTTGATGAACGTAATAAAATG
TTAGGAATTATCACGGTTGATGATATTATCGATGTTATTGACGAAGAGTCGGCACAGGATTATTCACGTTTAGCTGGGGT
TAATTCTGAAGATATGTCAGAAAATCCTTGGAAAGCTGTCAGAAGCCGAATTCCTTGGTTAGTAACTATGCTGTTTTTAG
GATTAATTAGTGCAATGGTTATTAGCCAATTTCAAAATGTACTCGATAAATTTGGCGTGTTGGCAGTATTTATCACTTTA
ATTACAGGTACTGCAGGGAACGCCGGTACACAAAGTTTAGCTGTAGCAATCCGCCGACTAGCTAATGATGAAGAAGGCGA
TAGTGTTTTTAAACTAATTTTGAATGAAGTTATTACCGGTATTTTAATTGGTCTATTAACAGGAATTGCTATTTTTGCGG
TGATTTTATTCTGGCAAAAAAACATGGTTTTAGGAATTATCGTTGGGGCGGCGATGAGTGGGGCAATCTTTGTTGCTAAC
CTTGTCGGAACTTTAATACCGATTATTATGGAAAAGTTAGGAATGGATCCGGTTGTAGCCAGTGGTCCGTTCATCTCAAC
TTTAAGTGATATAACTTCAATTTTGATTTACTTTAATATTGCTACAATATGTTTAGCAAACTTTTACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAACTTTTAAAAATGTTTTTACGGAAAAAATGATCGATATCAAAACGTCTATTCCAGATGATATGCTTGAATATTGGAA
TAAAGAGAAGGACGAAGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAAAAAGACATGGATCACGTAACAGTGATTGCATGTCTTTTTGTTTTAGATTAATTTTGAACCATGGAGTTCATGAAC
CCCTAACTCATTTTGAATAC

Product: transcriptional regulator

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 449; Mature: 449

Protein sequence:

>449_residues
MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELADTFDELDDEPDLIAEYLDEM
APSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVDAARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVK
QEAQYAETISYIYVVNESNQLIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM
LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMVISQFQNVLDKFGVLAVFITL
ITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITGILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVAN
LVGTLIPIIMEKLGMDPVVASGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY

Sequences:

>Translated_449_residues
MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELADTFDELDDEPDLIAEYLDEM
APSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVDAARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVK
QEAQYAETISYIYVVNESNQLIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM
LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMVISQFQNVLDKFGVLAVFITL
ITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITGILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVAN
LVGTLIPIIMEKLGMDPVVASGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY
>Mature_449_residues
MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELADTFDELDDEPDLIAEYLDEM
APSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVDAARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVK
QEAQYAETISYIYVVNESNQLIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM
LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMVISQFQNVLDKFGVLAVFITL
ITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITGILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVAN
LVGTLIPIIMEKLGMDPVVASGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY

Specific function: Acts as a magnesium transporter [H]

COG id: COG2239

COG function: function code P; Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 CBS domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013785
- InterPro:   IPR000644
- InterPro:   IPR006668
- InterPro:   IPR006667
- InterPro:   IPR006669 [H]

Pfam domain/function: PF00571 CBS; PF01769 MgtE; PF03448 MgtE_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49985; Mature: 49985

Theoretical pI: Translated: 4.16; Mature: 4.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHH
DTFDELDDEPDLIAEYLDEMAPSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVD
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVKQEAQYAETISYIYVVNESNQ
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCC
LIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM
EEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCE
LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMV
EEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
ISQFQNVLDKFGVLAVFITLITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVANLVGTLIPIIMEKLGMDPVVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEC
SGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHH
DTFDELDDEPDLIAEYLDEMAPSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVD
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVKQEAQYAETISYIYVVNESNQ
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCC
LIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM
EEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCE
LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMV
EEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
ISQFQNVLDKFGVLAVFITLITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVANLVGTLIPIIMEKLGMDPVVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEC
SGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12663927 [H]