| Definition | Pediococcus pentosaceus ATCC 25745, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008525 |
| Length | 1,832,387 |
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The map label for this gene is mgtE [H]
Identifier: 116492961
GI number: 116492961
Start: 1200609
End: 1201958
Strand: Reverse
Name: mgtE [H]
Synonym: PEPE_1200
Alternate gene names: 116492961
Gene position: 1201958-1200609 (Counterclockwise)
Preceding gene: 116492962
Following gene: 116492958
Centisome position: 65.6
GC content: 35.7
Gene sequence:
>1350_bases ATGGATAATACTCAAGCTATTTTTGAAAAATTAAAAATAGAATTATTAAAACATCATTCCAAAAAATTTAAAGAAGATTT CCTTGATTTACATAATTATGATCAAGGTCGTTTTTTTGGTGAATTAACGCGTGAAGAACGTCTTCTCGTGTACAAGTATC TAGACCCGGATGAGCTGGCGGATACGTTTGATGAACTTGATGATGAACCAGATTTAATTGCAGAATATCTGGACGAAATG GCACCTAGTTATGCTGCAGCGTTGTTGAACGGGATGTATGATGATAACGAAGCGGATATTTTAGGAGCTGTTCGAAATGA CAAGTTACATAAACTTCTATCATATATGCAACCCGTAGATGCTGCCCGAGTTCGCCAATTACTTAAGTATGAAGAAAAAA CTGCTGGTGCGTTGATGACAACTGAATTCATTTCAGTTGCCGTAGATACAACGGTGGGCTCGGCTATGAATCAAGTTAAA CAGGAAGCTCAATATGCGGAAACTATTTCATACATTTATGTGGTTAACGAATCTAATCAATTAATTGGAGTGATTTCAGT TAAGGATTTAATTGTTAATCCGGATGATGTATTTATCAAACGAATTATGAATACGAACGTGGTATCTGTAAGAGATGATG AGGATCAAACTGAAATTGCTGCCCAAATTCGTGATTATAACTTTATTGCAATTCCAGTTGTTGATGAACGTAATAAAATG TTAGGAATTATCACGGTTGATGATATTATCGATGTTATTGACGAAGAGTCGGCACAGGATTATTCACGTTTAGCTGGGGT TAATTCTGAAGATATGTCAGAAAATCCTTGGAAAGCTGTCAGAAGCCGAATTCCTTGGTTAGTAACTATGCTGTTTTTAG GATTAATTAGTGCAATGGTTATTAGCCAATTTCAAAATGTACTCGATAAATTTGGCGTGTTGGCAGTATTTATCACTTTA ATTACAGGTACTGCAGGGAACGCCGGTACACAAAGTTTAGCTGTAGCAATCCGCCGACTAGCTAATGATGAAGAAGGCGA TAGTGTTTTTAAACTAATTTTGAATGAAGTTATTACCGGTATTTTAATTGGTCTATTAACAGGAATTGCTATTTTTGCGG TGATTTTATTCTGGCAAAAAAACATGGTTTTAGGAATTATCGTTGGGGCGGCGATGAGTGGGGCAATCTTTGTTGCTAAC CTTGTCGGAACTTTAATACCGATTATTATGGAAAAGTTAGGAATGGATCCGGTTGTAGCCAGTGGTCCGTTCATCTCAAC TTTAAGTGATATAACTTCAATTTTGATTTACTTTAATATTGCTACAATATGTTTAGCAAACTTTTACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTAACTTTTAAAAATGTTTTTACGGAAAAAATGATCGATATCAAAACGTCTATTCCAGATGATATGCTTGAATATTGGAA TAAAGAGAAGGACGAAGAGC
Downstream 100 bases:
>100_bases AACAAAAAGACATGGATCACGTAACAGTGATTGCATGTCTTTTTGTTTTAGATTAATTTTGAACCATGGAGTTCATGAAC CCCTAACTCATTTTGAATAC
Product: transcriptional regulator
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 449; Mature: 449
Protein sequence:
>449_residues MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELADTFDELDDEPDLIAEYLDEM APSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVDAARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVK QEAQYAETISYIYVVNESNQLIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMVISQFQNVLDKFGVLAVFITL ITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITGILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVAN LVGTLIPIIMEKLGMDPVVASGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY
Sequences:
>Translated_449_residues MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELADTFDELDDEPDLIAEYLDEM APSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVDAARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVK QEAQYAETISYIYVVNESNQLIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMVISQFQNVLDKFGVLAVFITL ITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITGILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVAN LVGTLIPIIMEKLGMDPVVASGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY >Mature_449_residues MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELADTFDELDDEPDLIAEYLDEM APSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVDAARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVK QEAQYAETISYIYVVNESNQLIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMVISQFQNVLDKFGVLAVFITL ITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITGILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVAN LVGTLIPIIMEKLGMDPVVASGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY
Specific function: Acts as a magnesium transporter [H]
COG id: COG2239
COG function: function code P; Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 CBS domains [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013785 - InterPro: IPR000644 - InterPro: IPR006668 - InterPro: IPR006667 - InterPro: IPR006669 [H]
Pfam domain/function: PF00571 CBS; PF01769 MgtE; PF03448 MgtE_N [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49985; Mature: 49985
Theoretical pI: Translated: 4.16; Mature: 4.16
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHH DTFDELDDEPDLIAEYLDEMAPSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVD HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC AARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVKQEAQYAETISYIYVVNESNQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCC LIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM EEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCE LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMV EEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH ISQFQNVLDKFGVLAVFITLITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVANLVGTLIPIIMEKLGMDPVVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEC SGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MDNTQAIFEKLKIELLKHHSKKFKEDFLDLHNYDQGRFFGELTREERLLVYKYLDPDELA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHH DTFDELDDEPDLIAEYLDEMAPSYAAALLNGMYDDNEADILGAVRNDKLHKLLSYMQPVD HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC AARVRQLLKYEEKTAGALMTTEFISVAVDTTVGSAMNQVKQEAQYAETISYIYVVNESNQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCC LIGVISVKDLIVNPDDVFIKRIMNTNVVSVRDDEDQTEIAAQIRDYNFIAIPVVDERNKM EEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCE LGIITVDDIIDVIDEESAQDYSRLAGVNSEDMSENPWKAVRSRIPWLVTMLFLGLISAMV EEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH ISQFQNVLDKFGVLAVFITLITGTAGNAGTQSLAVAIRRLANDEEGDSVFKLILNEVITG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ILIGLLTGIAIFAVILFWQKNMVLGIIVGAAMSGAIFVANLVGTLIPIIMEKLGMDPVVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEC SGPFISTLSDITSILIYFNIATICLANFY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12663927 [H]