Definition Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence.
Accession NC_008508
Length 3,614,446

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The map label for this gene is 116329535

Identifier: 116329535

GI number: 116329535

Start: 3585246

End: 3588428

Strand: Direct

Name: 116329535

Synonym: LBL_3012

Alternate gene names: NA

Gene position: 3585246-3588428 (Clockwise)

Preceding gene: 116329532

Following gene: 116329536

Centisome position: 99.19

GC content: 37.67

Gene sequence:

>3183_bases
ATGGGATTAGATTTTCTGAGATCGGATTTAGTTTTATTCAATTATTATTCTTTTGGAAGTCTTCTAGTAACGATTACGAC
CTTTTTTCTCGCCGTTTTTTTTCTCAGTTTAAAAAGGAAGACTGTTGCTACATATCATCTCGGAGTTGCCTTTCTCGTGT
TTGGTCTTTTTGAGATCGGATATTTTATGGCGGCGTTTTACTATCATCCAATTGCCGCTTATCACAGGTGGTTGACCGGT
TGTTTGATTTTACCTACGATCACTCACTTTACTCAGTTTTTTATTCGTTATCCGAATAACTACAATAAGAAATTTGGGTT
TTGGATGATGGTCTTTCAACATCTTCTCGGATTCGTTGTTGCTTGCTTTTTTATTTATCTTACTTTTATTTCGGAAAAGA
TCTATCACTTTACTGCGCATCATTGGGATTTCAACGCTCTGATTGCAAGTAAATACCTTGCATTACTTATCGCTCTTTAT
TCCGTTATCGCTTTTATCATTGTTCCATCTTGGAGAATCATTACCGATAAGGAAAGGAAAAGGTGCGCAATCTTTTTATT
TTCTCTCGGATTTATGATAGCGGCTTTCTATCCGAATATCGCCAACGTTTTGAGCCGAGATGGTTATATGGAGAGATCCA
CATATATGACTTCGAACGTCATTTTTTTTATTGCGGCGTTCTCGGTTGTGGTGATCGTTTTTATCAATAGCAGTACCGAA
AAAACCACCTTCATGGTTAAAATTGTAGGGGTCACCTTATTTACGATCTGTTTGATCATGCAGGCTCTCGTCTTTATTTC
TAATCAGGACAAGGAGTCGGAATACGATAGTTTGCATATCGTAAATAGTGAAAGAGTTTTGGAAAGTGGTCGAAGTAATG
GTGATGTGCAGTATGCGCTTCGGTATGACGGAAAAACCGGCGAACTAATCACCGATAATTATGACTCCAAGTATGGATTA
GATCTTTCTCTTGTAAAAGTGGATTTACAAAACACTTTGATTTATGAAGAGATTGCCGCTCTGAAAGAAAATAATTTCCG
TGAACATCTTAAAGTCATTTTGGATGGCTCTCCGGAATACTTTGCGGGTCATAGGGGCACGATTTACAAGTTCGTAAAAG
AGAATTCTTCACTAAGCTCCGGAGATCTTAAAAAAGCTCTTTTAAAATATGCAGAAGACTTGAATAGAGATGCTTTCGTA
AATACCAACAAACTACAGGGAATCAATTCCGATTCTTTTTGCGAACAAGGAAAGTCTTATTTGGAAAAAAATAAGGACTT
GGAATCGTATAAAAATGGGATTTTGAAAAATTTGGAAGAATGTATCTGGAAGGGAAAAAAAATTTCAGGTAAGGAATTAA
AAGCGGAGTTTTTGAAATACTTCAGTTATTTTAAACCTGCGGAAACAAGACACTATAGAAGAAGTGTAGACGGCTTTGGA
CATCACGTTGCGTTTATGAAATACGTTCCTTCTAAAAAGCAGGTGGTGGAACTTGGATTCTCTTATAAAAAATATAGGGA
ATTTGTACATCCTACTTCCGTGAAACAAACGATCATTCTTTTTGTAGTGATTTTTGTGGTTCTTGTGTTATTCCCCTTGT
TTTTTAAGAGCAGTCTTGTCAATCCGTTGAACAATTTATTATCCGGAGTGGAAAAGGTAAACAAAGGCGATCTTGACGTC
CGCGTTCCCGTAAAGGTAAGAGATGAGATTGGATTTTTAGCTGATTCGTTTAACTCAATGGTTTCTTCCATCAAACAAGC
AGGAAGGGAACTTCAGGATTATGCGGAGAACTTGGAAGAAAAGGTAAAAGAAAGGACTCAGGAAGTTCAGGAAAAAATGG
AAGAAGTCCAAAAACTGAAAATTCAGCAGGACGGGGATTATTTTCTTACTTCTCTTTTAGCAAAACCACTTTTTTACAAT
GCGAACAAATCGAAACTCGTTCATACCGAATTTATGCTCAAACAAAAAAAACAATTCGAATTCCGTGGAAAACATTCCGA
TCTTGGTGGAGATATTTGTATTACTGGAAATTTACGTTTGGGTGTACCTGGTAACTATAAACGTTATACTATGGTGATGA
ACGGAGACGCTATGGGAAAATCCATGCAGGGCGCGGGAGGCGCTCTGGTTATGGGTGTTGTGATGAATTCCATTATGGCG
CGTTCGGCCACAAATAATAGAATTTTGGATAAGACTCCTTCCGAATGGTTGAAAGATGTGTATAACGAAATTCACTCCGT
TTTTAAATCATTCAATGGGAGTATGGTAATTTCCGCGGCGATCTTTTTGATTGAAGAGGAGACAGGGAAGTGTTTTTACT
TCAATGCGGAACACCCGTTTACGGTTTTATATCGAGACGGAAAGGCCAGCTTTTTAGAAACTGGACTTCAACTTCGTAAA
TTGGGATTGGATTCGGAATTCGATTTTCAGGTGCAAAATTTCGAATTAAAAAAAGGAGACGTCTTAATTCTCGGATCGGA
CGGCCGAGACGATATCGATCTTACTTCTGAAGATACGGTGAGAATAATCAACGAAGACGAGAATTTATTCCTTTTAAACG
TGGAAAACGGAAAAGGGAACTTAGAAGACATTGAAACTGAAATTTGCAAGCATGGAGAATTAACGGACGATCTTTCCCTT
TTAAAGGTCGAATTTCAAGCTGAAGCTAAAAAGGACGAGTTGGATGAAATGTTCACCTCCGGCGATAGGATCGACGTCGC
TTTAAATCCGGATGTGATCTATGAAGACGCAAAACAGTTATATAAAAATGGTAAAATAGATCAGGCTCTCGAACTTCTCA
AAACAGGATATACGAACGATACTGCAAATCAAAAAATCAATAAACTTTTGGGTCTTTTGAGTTTTAAGGGTAAGGATTAT
ACGACAGCGATCGAAGTCTTAAATAACTATCTCAAAACTGATCCGGGATTGCATGAGTATTGGTTTTATCTTTCCATTGC
AAATAAAAAAGTGGGAAAGTATGAACAAGCCCTTGAAGCGAGTTTGAAACTAAACGACATTCAACCGGATAATCTGTCTA
ATTTAGTTAATCTTTCCGATATCTATCGTTTAATGGACCAATTTGATCTCGCCGAAAAGATGGCTCGAAAGCTAATACAC
TTAGATCCCGGGAATCAAAACGGGGAAAGACTTTTGAAACTCATCGAAAGAGATCGTGCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAGTTTTAGTGTGAATTATTGAAGCCGTTTTCGAGATTTTTTAATGAAGTCTTACTTTTGCGAACAAATAAAGAATTA
AAAAAACGGAATTGGGGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTTATTAGGAATTTTATTCTTAACTTCTATTAATCTTTATTCTGATAAGAATAAGTGGATTCGAAGAATTCCTCTAA
GTCGAGGGGACCTTATACTT

Product: Serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1060; Mature: 1059

Protein sequence:

>1060_residues
MGLDFLRSDLVLFNYYSFGSLLVTITTFFLAVFFLSLKRKTVATYHLGVAFLVFGLFEIGYFMAAFYYHPIAAYHRWLTG
CLILPTITHFTQFFIRYPNNYNKKFGFWMMVFQHLLGFVVACFFIYLTFISEKIYHFTAHHWDFNALIASKYLALLIALY
SVIAFIIVPSWRIITDKERKRCAIFLFSLGFMIAAFYPNIANVLSRDGYMERSTYMTSNVIFFIAAFSVVVIVFINSSTE
KTTFMVKIVGVTLFTICLIMQALVFISNQDKESEYDSLHIVNSERVLESGRSNGDVQYALRYDGKTGELITDNYDSKYGL
DLSLVKVDLQNTLIYEEIAALKENNFREHLKVILDGSPEYFAGHRGTIYKFVKENSSLSSGDLKKALLKYAEDLNRDAFV
NTNKLQGINSDSFCEQGKSYLEKNKDLESYKNGILKNLEECIWKGKKISGKELKAEFLKYFSYFKPAETRHYRRSVDGFG
HHVAFMKYVPSKKQVVELGFSYKKYREFVHPTSVKQTIILFVVIFVVLVLFPLFFKSSLVNPLNNLLSGVEKVNKGDLDV
RVPVKVRDEIGFLADSFNSMVSSIKQAGRELQDYAENLEEKVKERTQEVQEKMEEVQKLKIQQDGDYFLTSLLAKPLFYN
ANKSKLVHTEFMLKQKKQFEFRGKHSDLGGDICITGNLRLGVPGNYKRYTMVMNGDAMGKSMQGAGGALVMGVVMNSIMA
RSATNNRILDKTPSEWLKDVYNEIHSVFKSFNGSMVISAAIFLIEEETGKCFYFNAEHPFTVLYRDGKASFLETGLQLRK
LGLDSEFDFQVQNFELKKGDVLILGSDGRDDIDLTSEDTVRIINEDENLFLLNVENGKGNLEDIETEICKHGELTDDLSL
LKVEFQAEAKKDELDEMFTSGDRIDVALNPDVIYEDAKQLYKNGKIDQALELLKTGYTNDTANQKINKLLGLLSFKGKDY
TTAIEVLNNYLKTDPGLHEYWFYLSIANKKVGKYEQALEASLKLNDIQPDNLSNLVNLSDIYRLMDQFDLAEKMARKLIH
LDPGNQNGERLLKLIERDRA

Sequences:

>Translated_1060_residues
MGLDFLRSDLVLFNYYSFGSLLVTITTFFLAVFFLSLKRKTVATYHLGVAFLVFGLFEIGYFMAAFYYHPIAAYHRWLTG
CLILPTITHFTQFFIRYPNNYNKKFGFWMMVFQHLLGFVVACFFIYLTFISEKIYHFTAHHWDFNALIASKYLALLIALY
SVIAFIIVPSWRIITDKERKRCAIFLFSLGFMIAAFYPNIANVLSRDGYMERSTYMTSNVIFFIAAFSVVVIVFINSSTE
KTTFMVKIVGVTLFTICLIMQALVFISNQDKESEYDSLHIVNSERVLESGRSNGDVQYALRYDGKTGELITDNYDSKYGL
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NTNKLQGINSDSFCEQGKSYLEKNKDLESYKNGILKNLEECIWKGKKISGKELKAEFLKYFSYFKPAETRHYRRSVDGFG
HHVAFMKYVPSKKQVVELGFSYKKYREFVHPTSVKQTIILFVVIFVVLVLFPLFFKSSLVNPLNNLLSGVEKVNKGDLDV
RVPVKVRDEIGFLADSFNSMVSSIKQAGRELQDYAENLEEKVKERTQEVQEKMEEVQKLKIQQDGDYFLTSLLAKPLFYN
ANKSKLVHTEFMLKQKKQFEFRGKHSDLGGDICITGNLRLGVPGNYKRYTMVMNGDAMGKSMQGAGGALVMGVVMNSIMA
RSATNNRILDKTPSEWLKDVYNEIHSVFKSFNGSMVISAAIFLIEEETGKCFYFNAEHPFTVLYRDGKASFLETGLQLRK
LGLDSEFDFQVQNFELKKGDVLILGSDGRDDIDLTSEDTVRIINEDENLFLLNVENGKGNLEDIETEICKHGELTDDLSL
LKVEFQAEAKKDELDEMFTSGDRIDVALNPDVIYEDAKQLYKNGKIDQALELLKTGYTNDTANQKINKLLGLLSFKGKDY
TTAIEVLNNYLKTDPGLHEYWFYLSIANKKVGKYEQALEASLKLNDIQPDNLSNLVNLSDIYRLMDQFDLAEKMARKLIH
LDPGNQNGERLLKLIERDRA
>Mature_1059_residues
GLDFLRSDLVLFNYYSFGSLLVTITTFFLAVFFLSLKRKTVATYHLGVAFLVFGLFEIGYFMAAFYYHPIAAYHRWLTGC
LILPTITHFTQFFIRYPNNYNKKFGFWMMVFQHLLGFVVACFFIYLTFISEKIYHFTAHHWDFNALIASKYLALLIALYS
VIAFIIVPSWRIITDKERKRCAIFLFSLGFMIAAFYPNIANVLSRDGYMERSTYMTSNVIFFIAAFSVVVIVFINSSTEK
TTFMVKIVGVTLFTICLIMQALVFISNQDKESEYDSLHIVNSERVLESGRSNGDVQYALRYDGKTGELITDNYDSKYGLD
LSLVKVDLQNTLIYEEIAALKENNFREHLKVILDGSPEYFAGHRGTIYKFVKENSSLSSGDLKKALLKYAEDLNRDAFVN
TNKLQGINSDSFCEQGKSYLEKNKDLESYKNGILKNLEECIWKGKKISGKELKAEFLKYFSYFKPAETRHYRRSVDGFGH
HVAFMKYVPSKKQVVELGFSYKKYREFVHPTSVKQTIILFVVIFVVLVLFPLFFKSSLVNPLNNLLSGVEKVNKGDLDVR
VPVKVRDEIGFLADSFNSMVSSIKQAGRELQDYAENLEEKVKERTQEVQEKMEEVQKLKIQQDGDYFLTSLLAKPLFYNA
NKSKLVHTEFMLKQKKQFEFRGKHSDLGGDICITGNLRLGVPGNYKRYTMVMNGDAMGKSMQGAGGALVMGVVMNSIMAR
SATNNRILDKTPSEWLKDVYNEIHSVFKSFNGSMVISAAIFLIEEETGKCFYFNAEHPFTVLYRDGKASFLETGLQLRKL
GLDSEFDFQVQNFELKKGDVLILGSDGRDDIDLTSEDTVRIINEDENLFLLNVENGKGNLEDIETEICKHGELTDDLSLL
KVEFQAEAKKDELDEMFTSGDRIDVALNPDVIYEDAKQLYKNGKIDQALELLKTGYTNDTANQKINKLLGLLSFKGKDYT
TAIEVLNNYLKTDPGLHEYWFYLSIANKKVGKYEQALEASLKLNDIQPDNLSNLVNLSDIYRLMDQFDLAEKMARKLIHL
DPGNQNGERLLKLIERDRA

Specific function: Unknown

COG id: COG0840

COG function: function code NT; Methyl-accepting chemotaxis protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121406; Mature: 121275

Theoretical pI: Translated: 6.91; Mature: 6.91

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GLDFLRSDLVLFNYYSFGSLLVTITTFFLAVFFLSLKRKTVATYHLGVAFLVFGLFEIG
CCHHHHHCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFMAAFYYHPIAAYHRWLTGCLILPTITHFTQFFIRYPNNYNKKFGFWMMVFQHLLGFVV
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ACFFIYLTFISEKIYHFTAHHWDFNALIASKYLALLIALYSVIAFIIVPSWRIITDKERK
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KVKERTQEVQEKMEEVQKLKIQQDGDYFLTSLLAKPLFYNANKSKLVHTEFMLKQKKQFE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
FRGKHSDLGGDICITGNLRLGVPGNYKRYTMVMNGDAMGKSMQGAGGALVMGVVMNSIMA
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RSATNNRILDKTPSEWLKDVYNEIHSVFKSFNGSMVISAAIFLIEEETGKCFYFNAEHPF
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCE
TVLYRDGKASFLETGLQLRKLGLDSEFDFQVQNFELKKGDVLILGSDGRDDIDLTSEDTV
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCE
RIINEDENLFLLNVENGKGNLEDIETEICKHGELTDDLSLLKVEFQAEAKKDELDEMFTS
EEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEHHHHCCHHHHHHHHCC
GDRIDVALNPDVIYEDAKQLYKNGKIDQALELLKTGYTNDTANQKINKLLGLLSFKGKDY
CCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
TTAIEVLNNYLKTDPGLHEYWFYLSIANKKVGKYEQALEASLKLNDIQPDNLSNLVNLSD
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCHHHHHHHHH
IYRLMDQFDLAEKMARKLIHLDPGNQNGERLLKLIERDRA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA