| Definition | Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008508 |
| Length | 3,614,446 |
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The map label for this gene is pksC [H]
Identifier: 116329323
GI number: 116329323
Start: 3274820
End: 3280030
Strand: Direct
Name: pksC [H]
Synonym: LBL_2769
Alternate gene names: 116329323
Gene position: 3274820-3280030 (Clockwise)
Preceding gene: 116329322
Following gene: 116329324
Centisome position: 90.6
GC content: 38.76
Gene sequence:
>5211_bases ATGAAACTCCAGCTCCACGGTTTTAAGACGCTTGGATATTTTTCCGTAGATCATCAATTTCTAATATACAGATCTCTGGA TCAAAGATCGGGAAAACGCGTTCTTCTCAAACTCCTTCGTCAAAAAAAACCAACCATTAAGGATATTCAAAAAGTTTATC ACGATTTTAGAATTTCCAATTTTGTTAAAGGACTGAGAATTCAGAATTCCCTGGAATTAATACGACATGAAGGCATTCCA ATTCTCGTAATCGAAGACTGCGACTCCGTTCCTCTTTCGAGATTGTTTCCTAACGGCGTGAATTCCATTGAGAAATTTTT TGAGATTGCCATGGGTATCTCTCTAGCGCTCAAAGAAATCCACGAAAAAAAAATTCTCCATCAAGCGCTCCGTCCAGACA ACATTTGGGTTCAAGCAAAAACAGGGATAGTTAAAATTACTGATTTTTCATCCGCAACTTTCTCAGACAAAGAAATCTCA ATTTCTATTACGCCGGATTTGCCCGTCGAAATCCTTTCCTACATCTCTCCGGAACTAACCGGAAGACTCTCACGTATTCC GAGTTTTCGCACGGATTTTTATTCCTTGGGAGTCGTTTTTTATCAGATGATTACCGGAATTCTCCCGTTTATTTCCAGGA ACGGCAATGAAATTTTACACGCCCATCTTGCAAGAAAACCGACTCCCGTACACATAATTCGGAAAGAATTGCCTATTACG ATTTCACTCGTTATTTCTAAATTACTTAAGAAAGATCCGGATCAACGTTATGCATCCATTGACGGATTGATATACGACTT AAAACTCTGCCTTCAAAATTTTCAAAAAAGAGGAATCGATTCAACGTTCATTCCCGGCTCCAGAGACATCCCGGAACTAA TATTTGATTCCTCCATTCTTCACGGAAGAGATAAGGAGAAGGCCGTTTTAGAATCCTCTTTTAATAAAGTACTTCAAGGA 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Upstream 100 bases:
>100_bases GTAAGTGGTATCGAAGCGGCTCGATGTTTTTCTTAAATTTCGGAAATGAAATCTTTTCTTTTCGATTTTGACCTTAGAAA GGGAATTCAATTGTTTTAGG
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATGTGAGTTCGACGTAAGGAAACTGGACAGAACCTCTTGTACATATTTCATGAGGAATTCTCTCTTGCTCTAAACGA TTTTTTGAATCTAAAGTACC
Product: serine/threonine kinase protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1736; Mature: 1736
Protein sequence:
>1736_residues MKLQLHGFKTLGYFSVDHQFLIYRSLDQRSGKRVLLKLLRQKKPTIKDIQKVYHDFRISNFVKGLRIQNSLELIRHEGIP ILVIEDCDSVPLSRLFPNGVNSIEKFFEIAMGISLALKEIHEKKILHQALRPDNIWVQAKTGIVKITDFSSATFSDKEIS ISITPDLPVEILSYISPELTGRLSRIPSFRTDFYSLGVVFYQMITGILPFISRNGNEILHAHLARKPTPVHIIRKELPIT ISLVISKLLKKDPDQRYASIDGLIYDLKLCLQNFQKRGIDSTFIPGSRDIPELIFDSSILHGRDKEKAVLESSFNKVLQG DTELVFITGDSGCGKSALAKIFLKSISERGGIIIQGKFDQYERSIPFGGLMHSLRDLVPILLSKEEKEIRKLKRLINQYI GDNGKILLDQLPELEFILGPQPELSELPPDENRNRFYYTFHNFIRTLSEMSRPLVLYMDDLQWADPASLNLIETFFIHSK IKNFLCILSFRPEAVESPNPFSGILKSIETNKIQKSLITIDSLDKKSVYRLIQDLVPSPEEQIRSVASILHKKTLGNPLA IIQLLRTCKKTNIISYEFESQLWKWDLEKVDSLSAADNVVDFLCDRIKELTPEIQELLGICSCLGEQFTLEFISKLSFFD IPKLNQTLWEAVKEGLLVPFHNQNQSIFEKSLSSERTFGFSHDRVRQAAYSLLKESKRKKFHKQAGLTLLAIHGPQPKNR ILFEITNHLNQALDQIEEETLRNNLTILNYKTGLQAKSLGSYESSLQYLNSALKNQEICIKDLEFYSNVILETAETEYLL NNYERAISLLGLLENLSISNLQYIRANMIRVRLYSKMNKVEKAVSAGLCAMKRCKIHIPSSRFKINLALFKELFLSLILS KGKSDFELAHLKENSEPEYQALIDLFADLGPSAFTYNQNLFVLLALKIFNISLTKGISRSSPIAYSGYGMIVNQILKDPN QGIRYSKIAMDLNERIPFDLVKWKVQYVYSAYLCHWKKHITPDIKLLDEVHKGALQNGDILYAGFSLQAKIQKKIFSSYP IEELLIHADFAERYFRTTRDNFAFTIAKSSHQLLKALAGKTSSPNSLNDSEFQTENFERKILRDKNYTALFYYYHDLTKL HYFSGQFSKALSYGQKGEDLIQNAFGLIPFAEFWFYYGLTILANFEEFPFSYRIIYSKKLNLIFSYFTQWSKNCPENFMG LLELLHAERERVRKKTSEAITGYEKAIKLFQEAGFVSFQALSSEIAARFHYKIGNFSLGNHYIRLAINFYSEWGASAKVI DLKNRFAKRLNPTFYHETTQKKLNNPNTSLDQEVVLKTYNVLSEEIVLDNLLKKLIQIAIETAGATRAIYFHLHNKNLTV YLTGQSGETEIIVENFPEIDETQYPVSYLNYVFRTHRIISTRELDSSLIKDFTDPYIKEKKPQSMICIPLLHTGELKGIL YLENQLVKGVFTENNIQTLKLIAGQAAILIENANLYAELETKVEKRTAELNNTINLLQKDLLYAQKIQDKILPKPEATLD KIYILTKYVPMTQVGGDIYDYAEISPGKVRIFLADATGHGVQAALVTMLIKSEYESLKYLDLPPGKIISELNQEIIAKYK TLKSFFSCLVADIDVEQGILSYSAAGHPDQFYLSGNTIIRLPRSGPIIGILENTKYNSQFLEISKGNKLFFFSDGMTEEF NPFHEEFGDRRLSESILKQASKPVSEIVQFVFEDLQSFLSGQKIQDDITFLSVEIL
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG3899
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]
Homologues:
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71989911, Length=262, Percent_Identity=25.9541984732824, Blast_Score=67, Evalue=8e-11, Organism=Caenorhabditis elegans, GI71989900, Length=236, Percent_Identity=26.271186440678, Blast_Score=67, Evalue=9e-11, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322297, Length=182, Percent_Identity=30.7692307692308, Blast_Score=69, Evalue=5e-12, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322682, Length=182, Percent_Identity=32.4175824175824, Blast_Score=67, Evalue=2e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011009 - InterPro: IPR005543 - InterPro: IPR000719 - InterPro: IPR017441 - InterPro: IPR017442 - InterPro: IPR008271 [H]
Pfam domain/function: PF03793 PASTA; PF00069 Pkinase [H]
EC number: =2.7.11.1 [H]
Molecular weight: Translated: 198841; Mature: 198841
Theoretical pI: Translated: 8.50; Mature: 8.50
Prosite motif: PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKLQLHGFKTLGYFSVDHQFLIYRSLDQRSGKRVLLKLLRQKKPTIKDIQKVYHDFRISN CEEEEECCCEEEEEECCCEEEEEECHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH FVKGLRIQNSLELIRHEGIPILVIEDCDSVPLSRLFPNGVNSIEKFFEIAMGISLALKEI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HEKKILHQALRPDNIWVQAKTGIVKITDFSSATFSDKEISISITPDLPVEILSYISPELT HHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCHHHH GRLSRIPSFRTDFYSLGVVFYQMITGILPFISRNGNEILHAHLARKPTPVHIIRKELPIT HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCH ISLVISKLLKKDPDQRYASIDGLIYDLKLCLQNFQKRGIDSTFIPGSRDIPELIFDSSIL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHH HGRDKEKAVLESSFNKVLQGDTELVFITGDSGCGKSALAKIFLKSISERGGIIIQGKFDQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHH YERSIPFGGLMHSLRDLVPILLSKEEKEIRKLKRLINQYIGDNGKILLDQLPELEFILGP HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCEEEECC QPELSELPPDENRNRFYYTFHNFIRTLSEMSRPLVLYMDDLQWADPASLNLIETFFIHSK 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