| Definition | Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008508 |
| Length | 3,614,446 |
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The map label for this gene is tolB [H]
Identifier: 116327580
GI number: 116327580
Start: 930825
End: 938588
Strand: Direct
Name: tolB [H]
Synonym: LBL_0811
Alternate gene names: 116327580
Gene position: 930825-938588 (Clockwise)
Preceding gene: 116327579
Following gene: 116327582
Centisome position: 25.75
GC content: 40.43
Gene sequence:
>7764_bases ATGATTCGATTTTCCTTCCTCCTCTGTTTTTTCTTTCTTTATCATTGTTCTATCTTTCGTGCATCCTCCAGGATTAAACC CATAGAGTTCAATTATTCCTCCATCGCCGTAAATTATTTCACACCGGAAAACGAAAAACCGTTTCCTCTTACCGTACAGA GGGGAAATAATTTATACAATTCTACGACGGCCGATGGGAGGTATCTTTTTTATACGACCGGTCAAAAGGGAAATTACGAC ATTTGGTTTCGTGATTTGAAAAGTTCAATCACGGTTCCGGTTACCGCGCATCCTGCGCCGGAGTTTAAACCGGCGATTAG TCCGGACGGAACAAAATTGGTCTTCGTATCTGAACAATACGACTCTTCCGGGGACTTGGTTTTGCTTGAGATGAATCCGG GTTTGTGGGCTGAAAAAATCTTAGAGGGAAAACGGTTTATAAATTCTGATTTTATAATATTAACAAACAGTAATTTTGAT GTTCCCGGGAAAAAGGATTCAAACGTGGATACGGATCCTTTTTTTGCCCCTGATTGCCGTCATTTGGTGTTTTCCACGGA TCGTTTGACTCCTGGAATCCAGAATTTAGTTGTCCTGGATACGGAAGGCAAGGAACCGATGAAATTATTGACTCAAAATG GCGGGGCTTCGCCGGTATGGTCTTCCGACGGTAAATCAATCGTCTATCTTTCGTATCAGGAAAACCCTTCCGGTGACGTA TATCTTTTGGATCTTATGTCCGGAAAAAGTGAAAGGCTTACAAAAGATTCATACCTTAATTTTTCTCCTTCTCTTTCGGA CGATAAGCGGTATTTATATTATACTTCGATTCAAAACGACACGAATAAAAACGGACGTTTGGACGAAAGGGATAATAGTC TCATTATAAGAAAGGATTTGAGGACGGGAGAGGTTCGTCGGTTGACTTCCGGAAACGATTCGTTATTCGATTCCAGATTT 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Upstream 100 bases:
>100_bases ACACCTAAAAATTCATCTCGAACAGACTTGGTATCGTCTTGTGGAAAAAGGGGAATACTACGAGAAGTCGCCCGGTAAAT GGGTGCGTAAGGAATAGGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGCGATTCTCATTTTATAGGATCTATTTGAATCCAAGTCGAGTTTTGAAGTTTTAATTTCTACGTACGACATGGGTCA TTACTCGTTTTTTAACGGAT
Product: Tol transport system component
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2587; Mature: 2587
Protein sequence:
>2587_residues MIRFSFLLCFFFLYHCSIFRASSRIKPIEFNYSSIAVNYFTPENEKPFPLTVQRGNNLYNSTTADGRYLFYTTGQKGNYD IWFRDLKSSITVPVTAHPAPEFKPAISPDGTKLVFVSEQYDSSGDLVLLEMNPGLWAEKILEGKRFINSDFIILTNSNFD VPGKKDSNVDTDPFFAPDCRHLVFSTDRLTPGIQNLVVLDTEGKEPMKLLTQNGGASPVWSSDGKSIVYLSYQENPSGDV YLLDLMSGKSERLTKDSYLNFSPSLSDDKRYLYYTSIQNDTNKNGRLDERDNSLIIRKDLRTGEVRRLTSGNDSLFDSRF SSFNGGSILFTAAYYNTLNIYFIPASGAVPKEKNIISQYELALQYKDKQSFENFLLAIDAIEFYFSKDPIYPLIRSKALL LKYEEAKNSGRFAIAESTKKEISASRFNSVTGLGYGLLLAQERKNSIPLAIRELREYYEQIRTVSKVENNLLASLLEEEG DLARKSGNFQHSLKVYNEILNYYPDYYRIRDIYRKSGDLQYKNASLHGYKIPESFFQVANDPQTGKEELKLLYEQIDREV VVGKNFLERMNAAEISIVSNSLEKKSPRLFRYFLYVKSLGLNGKSSFEESNSLLNTFLSNVVETDPLFLKVHLLKSDNFK GLGEVQKSFDELRIYLEKYDPLLGVDLDEKEIERSFVYFENKARDHDRRGNLQDAAFHYFYNTENMFLVKNRNLFIETLY KEYAIYYQRMMVDSVFKLSGFLSEEKQKALLNKLNVIDIAGVDPLSEEGLGYINQYYKVAVPRSRPVLDLATLYGYSYYL VNRSVIRETYYNAANSMTPARKEEILRDFKQAEYELRWIIFADPRYYEAYQLLGWMYQYVDILKSRKSEEDQPNDEERYA SIYKKYFPEKNFEENIELYSQVLELLGENFENKKALSDLRLNLGNNYFLLKNYPKANEQYSKVDSLADYIISKTQFEDYR QKVIFLFNSARSSIYVADYKSAVQKLKTASDLYFENESKKTLVGKGSAEKLQRYKLKLALLFTLTGLSYIESGEYTNAIF YYKDALSLNGENGWIDPVNLHNGLALCYQKLGKYKLSESHLVEAEQILANRSGSGWISKGVKLKFWDYIWDWIWEAALPD GVRISGEGRFPEAISPKFQPLMTSGIRVNNLVASMEIERAIEEINSRLVYVKSKNLGSTLAASFIRSNSFNDLGYLHFKR NEFKTATEAYEQAEKFEVEKGFTSKARTSFKRGLYSYFGHLENTEEDPELELQNLRSASERLISSKYNFVKDCLGDTRYQ EEVIHSETKKCILKFYNSFPDHDPTLALVYYYQGEQFFRIGDVLSGFELFGRAAGLLENPSMIPKEVVGLAEDPYTRKER LSYSISRANLYVRLGDTEKAISTLNLTSESANEFYYIQEWIETLVTQAEIYRKEKSHSKAKEKVDRAVTLLLSHPHLINE LKYFLIYKLFKIRSELDFESGRFPEGFQSLNLLHKLNLYRQFIRIPHESEDPSFTADVIRLQNIVRKQKFVYAAIQNALE KKEKSEGLLKEYQDLSKDLEKELGVINRKNPSLDGYLGIFSKEPSVTALLNPDEGYLRIEFVGDKVRIYRATASNEEYLN QTGKLEEVLSRISNSGKIPFVSRKIWFVQLGDHIDFERIRNILPERFSLIFRPSHLRPLQEKDKRIARNVAIVEGSPNYD STLPVRKIAANRILTRLLDTDMLVAPFPSISGDNSFGESFSAQNLSIRDLFHNRSEISSALFYEKTKFDLGKISEVYEVL NASGIRNVSICLLNTSCEAVAPEKVLSDFVPGSLFLGSSVLRKKETHRTSENLHVLARNNERKENLREAYTYAFSYRSFQ KTESADLFGELDMLRLRWKLSPGTTMKEIYGDLLNNAGEDSVKDSILFSALLTCYLDKNLSDCNSYTFENVVDSSKKDLL KTLYSFKNGVPVAPLALKVLDISPFYDPYLYYKNILKIARANYEQEIGEFAGKLALERSGDSEEIRGVEEILQGLYAQKY FLQGVALSKNQIHRKEELYMILSGNWKDALEVLKRKEDDTGRFRERLLLNWKREITGAWFSPYSLYSAVYGNSSKLFESL EAEERSLLYRLILYSVPFQENEEVDLLAESLVEYEWNTGAKSRALRMTLGYAQALFSRGEMSKSKDWMNKIGSRFAADSE YEKIFKDKNILMNKYLFHRGEISSLEGRGEKTEWLSLYEKASVKAPRDFIEFLNSTIRSKRGKHFSYEERIELLDLITYL QKICFQKNNSEVFFDLAVAKDLLSLTRPLILNSNPDYKDIPVFVSVAGKIKEKLPPNQEFLAVMDLGLESFYIRFINGKS KGDLAFKDNRKLRVSLFQYLEEAARGGYEVLLREELENEYRKNIKLAKNKLTYLYLSSYHFRIPLVPRTEDRFYLVNDPK SLVTNPVFSTKEEFSPEYQIQFLASSKSKESWKKSLKDLEVYEAGSGRLGSDTKSRLYILQEPLEIVNQVNLSFGGNTLP NSYGTPKKGNWIFTSSFLEEERYDIRNYRDSFYWIGQNFLSPGVVFIGDQTDTAHVDFLKRFTKRSGTKVPLYNRFQETL DAIREIYPLDRIWNGYRLYTNSFISEE
Sequences:
>Translated_2587_residues MIRFSFLLCFFFLYHCSIFRASSRIKPIEFNYSSIAVNYFTPENEKPFPLTVQRGNNLYNSTTADGRYLFYTTGQKGNYD IWFRDLKSSITVPVTAHPAPEFKPAISPDGTKLVFVSEQYDSSGDLVLLEMNPGLWAEKILEGKRFINSDFIILTNSNFD VPGKKDSNVDTDPFFAPDCRHLVFSTDRLTPGIQNLVVLDTEGKEPMKLLTQNGGASPVWSSDGKSIVYLSYQENPSGDV YLLDLMSGKSERLTKDSYLNFSPSLSDDKRYLYYTSIQNDTNKNGRLDERDNSLIIRKDLRTGEVRRLTSGNDSLFDSRF SSFNGGSILFTAAYYNTLNIYFIPASGAVPKEKNIISQYELALQYKDKQSFENFLLAIDAIEFYFSKDPIYPLIRSKALL LKYEEAKNSGRFAIAESTKKEISASRFNSVTGLGYGLLLAQERKNSIPLAIRELREYYEQIRTVSKVENNLLASLLEEEG DLARKSGNFQHSLKVYNEILNYYPDYYRIRDIYRKSGDLQYKNASLHGYKIPESFFQVANDPQTGKEELKLLYEQIDREV VVGKNFLERMNAAEISIVSNSLEKKSPRLFRYFLYVKSLGLNGKSSFEESNSLLNTFLSNVVETDPLFLKVHLLKSDNFK GLGEVQKSFDELRIYLEKYDPLLGVDLDEKEIERSFVYFENKARDHDRRGNLQDAAFHYFYNTENMFLVKNRNLFIETLY KEYAIYYQRMMVDSVFKLSGFLSEEKQKALLNKLNVIDIAGVDPLSEEGLGYINQYYKVAVPRSRPVLDLATLYGYSYYL VNRSVIRETYYNAANSMTPARKEEILRDFKQAEYELRWIIFADPRYYEAYQLLGWMYQYVDILKSRKSEEDQPNDEERYA SIYKKYFPEKNFEENIELYSQVLELLGENFENKKALSDLRLNLGNNYFLLKNYPKANEQYSKVDSLADYIISKTQFEDYR 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Specific function: Involved in the tonB-independent uptake of proteins [H]
COG id: COG0823
COG function: function code U; Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system
Gene ontology:
Cell location: Periplasm (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the tolB family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011659 - InterPro: IPR014167 - InterPro: IPR007195 [H]
Pfam domain/function: PF07676 PD40; PF04052 TolB_N [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 299220; Mature: 299220
Theoretical pI: Translated: 7.06; Mature: 7.06
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
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