| Definition | Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008508 |
| Length | 3,614,446 |
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The map label for this gene is cya [H]
Identifier: 116326869
GI number: 116326869
Start: 22058
End: 24292
Strand: Reverse
Name: cya [H]
Synonym: LBL_0018
Alternate gene names: 116326869
Gene position: 24292-22058 (Counterclockwise)
Preceding gene: 116326870
Following gene: 116326868
Centisome position: 0.67
GC content: 34.18
Gene sequence:
>2235_bases ATGATTCGAACCCTGAAATTTTTTGCAGTTTTATCGATTTTATCCGTTCTATTTTCGTGCGAATATGATTGGGATTCGGA GGTTTTGGATCTCACACACGTTGAATGGAAGGCGAGTTTAGGAAACCATCTCAAGACTAGATTAGAAAAATCGAATATTT CTAGTTCTTTTTCTCAGAATAAAAAAGGAAATAAGGGAAAGGAGCCCAAGAGTTCGGAAAATTGGAAATTGATTTCCAAT TTTCCGGTGAGCTTTAATTCTCTTTTTGAAATACCGGAGCGGTCCGGGTTCCACGAAGTGACTGTAAAAACGGAATTTTC TATAAATCCGGATTCTGTGCTCTTGAAATTGCCGACCGCGATTTATTTTCCAAGCATAGGGGAAAATTGGGAGCTTTATC TCAATGGTTTTTTAATTCGAAAAGAAAAATTTCTAATACAGACTAATGGAAGAGATGTGACTCCTGCGATTCGAAGATCT CTAAGATCCATAACTTTACCTATTCCTTTCGGTGTTTTAAAGCAAGGCAAGAATACGATTCTTTTAAGTATAGTGGGCGG ATCGAATCAGACTCCTTATATTCAAAACGATCATTTCGGATTTTATCACGCAGACGGATATAAAATTTCACTACTTCAGA GAATTTATCAATCTAATTCCGAACATTTTAATGTTTTTTTATGTGCAATCTATTTTATATTTGGAGTTTATTATATACTC TTTTATACGATACGGAAGCATGATTTGTATTATCTTTATTTCGGACTATTTTTATTCATTTCTTCCGTCTATTTTTTTTC ATCCTCGGATTTAATCTTTAAAAAGTTTATTAATCTAAATTCTCAAATCGATAGTTCTCCGTTTTTTAGAGCCGAATATT CTTCTTTGACTTTAATTCTTCTTTTTTTCTATTATTTTTTGAAGCACTACTTTTACTGGAAAGAAAGATCGAACGTAATT CCAAACTTTCTCGTAGTTCTTTTAATCGGATTGTTTTTCGCGATTCTTATTTCCCCGTTTTCCTGGGTGCAAGTTGCTCT TAAAATCTCTCAAATTTCGATGGTTTTCTTTTTGGTTTATATTCTGTCCTTTTTGGTTCAAGCAGTAAGAAAAAAGAAAC AAGACTCAGGTAAAATATTAACGGGAGTTTTCGTATGTATCATTTTTGGAATATGGGATTTATTGAATTCGATTTTTGAA ATTTTTGGATTTCATTATTCTTTTTTTCCGATCGTTTATTTATTCTTTGTCTTAACAATCATAAACATTTTGATTTTGAA GTACGTTCGACTATACAAGGATATGGAGCTTATTAACGAAGAACTTTCCAATCAAAAAAACGCTTTTTATCGGTTTGTTC CCGTGGATTTTATCAGAATTATAGATAAGGAATCTCCCATATCAATTTCGATCGGGAACAACAAAGAAAAGTCGATGACT ATTTTGTCTTCCGATATTCGGAATTTTACAAATATTTTAGAAACGATTTCCTCGAATCAGACGATCGCATTCTTAAATTC TTATCTATCTGAGATGGAGAAGATTGTTTATGAAGCCGCCGGTTTTGTGGATCAATATTCGGGGGATGCAATACTTGCGC TTTTTGCGGATTATAGCGAAAGGGTGGAAAAGGAGAATTTCAATTCCGCCGACAATGCCGTTGAAGCTGCGCTAAAAATG ATGAGTGTGGTTCGATCGAAAAGAATACAAAAAAATTTTTCGATTCCTTGGAATTTGGAAATCGGAATCGGAATCAATAC GGGTTCTTTGATTTTAGGAACGGTGGGAAACGAAAGAAGGATCGATACCAACGTGGTCGGTGATGCGATCCACCTTACGT CCAAACTTCAATCTCTTACCTATTTGTATCAAGGTAGAATATTAATTTCTCATCATACTTATCTTCGGCTTCATAGAATG AGTGAGATTGGAATTCGGATGATCGATTCGGCGTTTCTAAAAGGAAAAAGTCGACCTGTGGATATCTACGAGGTGTTTGA ATCCGATCCGGAAGAGATAAAGGAATTTAAACTGAGAACATTGGATCTATTATCTCAGGGAATTTTTGAATATAGATCCG GAAAATTTGGGGAAGCTACTAAAATTTTCAAACAACTTTATCATGAAGAACCCAGGGATAATCTTTCCAAAATTTATCTA AAACGTTGTAAATTATATTCTTCTAAACCTCCGGAAAAAAATTGGGATGGTATTTTTCGATTTCAAACGAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCGCCCGTGCCGGTGAAGACGAACTCGTTATGTGATCTAATCTTTCGTTTTTGGAAAAATTTCCTTCGCTTCTAATTCTT CTTGAATGGAATTTGGTTGA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTAATTTAACGTGAGTTCGGCGTAAGAAAGTTTGAGCGAATAAAAAACTCAATGCAACGACTCCCTATGAGTCGTCGT CGCAGCTCGCGAATTTCATA
Product: adenylate or guanylate cyclase
Products: NA
Alternate protein names: ATP pyrophosphate-lyase; Adenylyl cyclase [H]
Number of amino acids: Translated: 744; Mature: 744
Protein sequence:
>744_residues MIRTLKFFAVLSILSVLFSCEYDWDSEVLDLTHVEWKASLGNHLKTRLEKSNISSSFSQNKKGNKGKEPKSSENWKLISN FPVSFNSLFEIPERSGFHEVTVKTEFSINPDSVLLKLPTAIYFPSIGENWELYLNGFLIRKEKFLIQTNGRDVTPAIRRS LRSITLPIPFGVLKQGKNTILLSIVGGSNQTPYIQNDHFGFYHADGYKISLLQRIYQSNSEHFNVFLCAIYFIFGVYYIL FYTIRKHDLYYLYFGLFLFISSVYFFSSSDLIFKKFINLNSQIDSSPFFRAEYSSLTLILLFFYYFLKHYFYWKERSNVI PNFLVVLLIGLFFAILISPFSWVQVALKISQISMVFFLVYILSFLVQAVRKKKQDSGKILTGVFVCIIFGIWDLLNSIFE IFGFHYSFFPIVYLFFVLTIINILILKYVRLYKDMELINEELSNQKNAFYRFVPVDFIRIIDKESPISISIGNNKEKSMT ILSSDIRNFTNILETISSNQTIAFLNSYLSEMEKIVYEAAGFVDQYSGDAILALFADYSERVEKENFNSADNAVEAALKM MSVVRSKRIQKNFSIPWNLEIGIGINTGSLILGTVGNERRIDTNVVGDAIHLTSKLQSLTYLYQGRILISHHTYLRLHRM SEIGIRMIDSAFLKGKSRPVDIYEVFESDPEEIKEFKLRTLDLLSQGIFEYRSGKFGEATKIFKQLYHEEPRDNLSKIYL KRCKLYSSKPPEKNWDGIFRFQTK
Sequences:
>Translated_744_residues MIRTLKFFAVLSILSVLFSCEYDWDSEVLDLTHVEWKASLGNHLKTRLEKSNISSSFSQNKKGNKGKEPKSSENWKLISN FPVSFNSLFEIPERSGFHEVTVKTEFSINPDSVLLKLPTAIYFPSIGENWELYLNGFLIRKEKFLIQTNGRDVTPAIRRS LRSITLPIPFGVLKQGKNTILLSIVGGSNQTPYIQNDHFGFYHADGYKISLLQRIYQSNSEHFNVFLCAIYFIFGVYYIL FYTIRKHDLYYLYFGLFLFISSVYFFSSSDLIFKKFINLNSQIDSSPFFRAEYSSLTLILLFFYYFLKHYFYWKERSNVI PNFLVVLLIGLFFAILISPFSWVQVALKISQISMVFFLVYILSFLVQAVRKKKQDSGKILTGVFVCIIFGIWDLLNSIFE IFGFHYSFFPIVYLFFVLTIINILILKYVRLYKDMELINEELSNQKNAFYRFVPVDFIRIIDKESPISISIGNNKEKSMT ILSSDIRNFTNILETISSNQTIAFLNSYLSEMEKIVYEAAGFVDQYSGDAILALFADYSERVEKENFNSADNAVEAALKM MSVVRSKRIQKNFSIPWNLEIGIGINTGSLILGTVGNERRIDTNVVGDAIHLTSKLQSLTYLYQGRILISHHTYLRLHRM SEIGIRMIDSAFLKGKSRPVDIYEVFESDPEEIKEFKLRTLDLLSQGIFEYRSGKFGEATKIFKQLYHEEPRDNLSKIYL KRCKLYSSKPPEKNWDGIFRFQTK >Mature_744_residues MIRTLKFFAVLSILSVLFSCEYDWDSEVLDLTHVEWKASLGNHLKTRLEKSNISSSFSQNKKGNKGKEPKSSENWKLISN FPVSFNSLFEIPERSGFHEVTVKTEFSINPDSVLLKLPTAIYFPSIGENWELYLNGFLIRKEKFLIQTNGRDVTPAIRRS LRSITLPIPFGVLKQGKNTILLSIVGGSNQTPYIQNDHFGFYHADGYKISLLQRIYQSNSEHFNVFLCAIYFIFGVYYIL FYTIRKHDLYYLYFGLFLFISSVYFFSSSDLIFKKFINLNSQIDSSPFFRAEYSSLTLILLFFYYFLKHYFYWKERSNVI PNFLVVLLIGLFFAILISPFSWVQVALKISQISMVFFLVYILSFLVQAVRKKKQDSGKILTGVFVCIIFGIWDLLNSIFE IFGFHYSFFPIVYLFFVLTIINILILKYVRLYKDMELINEELSNQKNAFYRFVPVDFIRIIDKESPISISIGNNKEKSMT ILSSDIRNFTNILETISSNQTIAFLNSYLSEMEKIVYEAAGFVDQYSGDAILALFADYSERVEKENFNSADNAVEAALKM MSVVRSKRIQKNFSIPWNLEIGIGINTGSLILGTVGNERRIDTNVVGDAIHLTSKLQSLTYLYQGRILISHHTYLRLHRM SEIGIRMIDSAFLKGKSRPVDIYEVFESDPEEIKEFKLRTLDLLSQGIFEYRSGKFGEATKIFKQLYHEEPRDNLSKIYL KRCKLYSSKPPEKNWDGIFRFQTK
Specific function: May function as a membrane-localized receptor protein [H]
COG id: COG2114
COG function: function code T; Adenylate cyclase, family 3 (some proteins contain HAMP domain)
Gene ontology:
Cell location: Cellular thylakoid membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 HAMP domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001054 - InterPro: IPR003660 [H]
Pfam domain/function: PF00211 Guanylate_cyc; PF00672 HAMP [H]
EC number: =4.6.1.1 [H]
Molecular weight: Translated: 86470; Mature: 86470
Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN ; PS50125 GUANYLATE_CYCLASES_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIRTLKFFAVLSILSVLFSCEYDWDSEVLDLTHVEWKASLGNHLKTRLEKSNISSSFSQN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KKGNKGKEPKSSENWKLISNFPVSFNSLFEIPERSGFHEVTVKTEFSINPDSVLLKLPTA CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCHH IYFPSIGENWELYLNGFLIRKEKFLIQTNGRDVTPAIRRSLRSITLPIPFGVLKQGKNTI HCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHCCCCEE LLSIVGGSNQTPYIQNDHFGFYHADGYKISLLQRIYQSNSEHFNVFLCAIYFIFGVYYIL EEEEECCCCCCCEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYTIRKHDLYYLYFGLFLFISSVYFFSSSDLIFKKFINLNSQIDSSPFFRAEYSSLTLIL HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LFFYYFLKHYFYWKERSNVIPNFLVVLLIGLFFAILISPFSWVQVALKISQISMVFFLVY HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILSFLVQAVRKKKQDSGKILTGVFVCIIFGIWDLLNSIFEIFGFHYSFFPIVYLFFVLTI HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH INILILKYVRLYKDMELINEELSNQKNAFYRFVPVDFIRIIDKESPISISIGNNKEKSMT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHH ILSSDIRNFTNILETISSNQTIAFLNSYLSEMEKIVYEAAGFVDQYSGDAILALFADYSE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHH RVEKENFNSADNAVEAALKMMSVVRSKRIQKNFSIPWNLEIGIGINTGSLILGTVGNERR HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCC IDTNVVGDAIHLTSKLQSLTYLYQGRILISHHTYLRLHRMSEIGIRMIDSAFLKGKSRPV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DIYEVFESDPEEIKEFKLRTLDLLSQGIFEYRSGKFGEATKIFKQLYHEEPRDNLSKIYL HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH KRCKLYSSKPPEKNWDGIFRFQTK HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC >Mature Secondary Structure MIRTLKFFAVLSILSVLFSCEYDWDSEVLDLTHVEWKASLGNHLKTRLEKSNISSSFSQN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KKGNKGKEPKSSENWKLISNFPVSFNSLFEIPERSGFHEVTVKTEFSINPDSVLLKLPTA CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEEEECCHH IYFPSIGENWELYLNGFLIRKEKFLIQTNGRDVTPAIRRSLRSITLPIPFGVLKQGKNTI HCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHCCCCEE LLSIVGGSNQTPYIQNDHFGFYHADGYKISLLQRIYQSNSEHFNVFLCAIYFIFGVYYIL EEEEECCCCCCCEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYTIRKHDLYYLYFGLFLFISSVYFFSSSDLIFKKFINLNSQIDSSPFFRAEYSSLTLIL HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LFFYYFLKHYFYWKERSNVIPNFLVVLLIGLFFAILISPFSWVQVALKISQISMVFFLVY HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILSFLVQAVRKKKQDSGKILTGVFVCIIFGIWDLLNSIFEIFGFHYSFFPIVYLFFVLTI HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH INILILKYVRLYKDMELINEELSNQKNAFYRFVPVDFIRIIDKESPISISIGNNKEKSMT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHH ILSSDIRNFTNILETISSNQTIAFLNSYLSEMEKIVYEAAGFVDQYSGDAILALFADYSE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHH RVEKENFNSADNAVEAALKMMSVVRSKRIQKNFSIPWNLEIGIGINTGSLILGTVGNERR HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCC IDTNVVGDAIHLTSKLQSLTYLYQGRILISHHTYLRLHRMSEIGIRMIDSAFLKGKSRPV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DIYEVFESDPEEIKEFKLRTLDLLSQGIFEYRSGKFGEATKIFKQLYHEEPRDNLSKIYL HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH KRCKLYSSKPPEKNWDGIFRFQTK HHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7601856 [H]