Definition Shewanella frigidimarina NCIMB 400, complete genome.
Accession NC_008345
Length 4,845,257

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Identifier: 114564926

GI number:

Start: 4487323

End: 4491786

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: Sfri_3774

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 114564927

Following gene: 114564925

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4464_bases
ATGACCAGAGCTGTATTGGTAAGCCTAGGCTGTTTTATATTATCCTTATTTACGGTATTACCTGCATGTAGTGCAGACAT
TGTTCAGCGAGTATTTAACGCCAAAGATGGTTTAGCTAATGCGACTATTCAAGACATTAGTTTTGACGGTTATGGTCACG
TATGGCTAGCGACTCAACAAGGTATTTATCGCGTTAGTAATAGCAAGGTAAGGCGTATTGATAAAGTGGGGTTTGATTCG
GTACTTGATGATGAACTGATTACAACAGTCGTTAATTCTGGCCAAGACCATTTGCTTGTTGGCACTAATTCCTCGTCATA
TCTTTACAGTATTTTAGACAATCACTTCAGCTTATTGCTTAAACCTGAAGATAATGATGCGACTAATATCAATAAAAGTA
TTCGCGTGGCGGCAACTCAGCGTCAGCTTGATGGACGGTTGCTGATGCTCGCTTACTCTGGCCAAGTGTATTATTTTGAT
GATGCTTCTCAGCAATTGTCTTTATCTCCAAGCCATTCATTAGACCACAATTTACCTTGGCGCAATGCGCTTGAGTTACA
CAACTCCCAGTATTTGTTTTCGACTAATCACGAACTTCAGCTGCACCAGGCCGATGGAACCTTCATTGGCACATTTCCGT
GGTCTGATAAAAACGATTCCATCAGAAAGTTGTTCCAAGATAAACAACAAAGAGTGTGGATGCTGACATCGAAAGGGTTA
TTTAAGGTCGATACTGAGACGCTTACCGTGCAATCGGTGCCTGAAATCCCCTATTATGTTGATCAAATGGAACAAGATCT
TAATGGTGATTTGTGGATTTCAAGCCGAGCAGGATTGATATTTTGGAGTCCAGAAAACAACAAATTAACCGTACACCGTG
ACGAGCTTAAGCAGCGAGCCAATATTGATTACATTCATGATATGGCGGTGGATTCTGATGGTTTATTGTGGGTTGGTGGT
TCTGGTGATGGGTTGGCGGTGATTGCTGGTAAACCTCATTTTTTAATTGAAGATTATTCTAAAAAGCCACCCTATCAACT
TGATAATGAAATGGTGTGGTCGGTATACAGCGAAGGCGATAAGGTGTGGCTAGGTACCGATGGTGGTTTGTCTGTAGTTA
ACACTCAGAACCAAACTTCAACCATGGTTATTCCCACAGGTTTTGCACTGAGCGACAGTATTTACCGGATTGAATCCTTG
AACGCGGAGCATCTTGTATTGGCCACTACCAGTGGCTTATATGTAGTCAATAAAAAGACTAATGTCAGAACCGATTTCGC
TACTTGGAGCGGTGGTAACGAGTCACTAAACGATAGAATTGTTATTGGGATTTATCGTGATGAGCTACACAAAGATGTTA
TTTGGTTTACCACCAATAAAGGTCTGTATTATTGGCAAGATGGTAATGCTGATTTAACGTTACAAGTTTTATCAGATGGG
CAGCAGTCATTGAGTAATACCTTTTATAAAGCTTTATTAAGGGATGATGCTGGCCATTTATGGATTAGTGGCGGTAAACA
TTTTGGCTATTTGACGACCTCTGGCGAATATATTTCTAAAGTGGATGTATTTGCTGATTTTACTAATGTCCCAACCATGA
ATAGTCTTATGCAAGTGTCACCGGGTGTTATCTGGTTAGGTACGTCCCAGCAAGGGATTTATCAATTCAATACTCAAACC
GATGAGGTTATTTCGCTGGATCAACAGTGGAAGATCGATTGTAAAGTGGTGTTCTTTTTACAAGATACTGAAACAGATCA
TATCGTTGGCTGTGCCAGTGCCATTATTAAGGTTAATAAGGCGACAGGTAAAGTCAGCTCGTATAGCCATAAAGACGGTT
TTATTTCCGATGAATTTAATGAGTCGGCAAAATTTTATGATCCTGCTAAAGGCTTTTTTGTGGGTACACCAGACGGAGCG
ATGTTAATCGACCTCGATAAACTGGCGCCGCGCACTGTTAATGACAAAGTGATACTTGAATCTGTATCGGTGTTTTATGA
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CCGTACTCGATTACCTTGATGATAAGCCGATGACCATACAGTATCGTTTGGTTAAAGATGGCGCAGACTCTGGCAATTAC
GTGCTATTAGAGGGCCAGTCACAGATTAATATTACCGGTTTAAGCGCTGGGGCGTATGCACTTGAGCTTTTATATAAAAG
AAATGGTGTGTGGTCGAATGAGCCATTTCAATATCGATTTACGGTAAAGCAGTTTTGGTGGCGCTCGCAACAATTTACTG
GTGCATTGATTTTTAGCATTTTGCTGATAGCCGCCATTATATTGTTATACAGACAGAGACAAATTCATCGTTTTAAGCAA
ATGAATCATGCATTGGTTGAAAGTGACGAACGCCTACGTCAATCGTTAAAAGGCAGTGACTCTGACCTATGGGAATGGCA
TGCATCAACACAAGTGCTGTCACTCGATAACCGAGGTGGGGTATTAGGACCAGACACGCACATTAACGTTAAATTAGAAG
ATATCCCAATACATCAAGACGATGTTGAGAGAATCACATCTGTGTGGCAGGACCTTGTTAACGGTAAAGTGGAGATGATT
GATGCCGAGTATCGATATCGTAATCAGCATGATCATCAGTGGCATTGGTTACGCATTAAAGGCCGCGCTATTGAGGTAGA
TATTAACAATGGAAGGTTAATTTATGCTGCAGGGATGTATACCGACATCACTCAACAAAGAACCCTTGAAAGTGAAGCCA
ATTTATTAGCTCAAGCATTTGAAAATACCTCCGAAGGCATGTTGATATTAGACATGAAAAAGAACATAAAAATTAGCAAC
GCAGCGGCTAATTTAATTCTAGCGGCTAAAAAGAGTGATTTAGCTGGCAAACCTTTTTCCGATTTAGTGTTTGAGACTGT
AGAGCCTTTTGACATGGAAGAGGTGTTCGATAAGGAACGTTTTTGGACTGGAGAATGTGAGTTTAATTGTAGTGATGGTA
GCCGATGCCCTGTTTGGGTAAATGTATCGACCATGTTTAATATGAATGGTTCGGCATTACATTATGTGGTGGTATTTTCA
GATATCACTGAACGTAAGCATAATGAGTTACATCTGCGCCGTTTAGCAAACAATGACATGTTAACTGGCTTAGCTAATCG
AGCGATGTTTTCGCGTCGATTGGGCCAAGTTATTGAAACGGCAAAGCAGCAGAAAGAAACCCTAGCGTTGTTATTTTTAG
ATCTCGACAGATTTAAACATGTTAATGACTCATATGGCCACAGTATGGGTGATGCATTACTCGTTGAAGCTGCAAGTAGG
CTGCAGTCTTGTTTGTCTGAAGAGCATTTGTTGTGTCGCTTTGGCGGTGATGAATTTGTTATTTTGCTGCGTGATGCAAA
AGACGTCGACACCATTAACCACATTGCAAAACAGTTATTAAAACAAATAGAAACTCCTTTTAAATTATACGGAAGAGAAT
TTTTCATTTCGACCAGCATTGGTATTAGCATTTGGTCTGATGATGATCAAACGCCTGAAACCTTGATTAAAAACGCCGAT
TTAGCCATGTACCACGCTAAAGAAGAAGGCCGTGGTCATTTTCAATATTATTCAGCAGAACGTAATGCAGAAGCGTTGTA
TCACTTGCGCATAGAGGCTGATTTACATCGAGCGATACTGTGCAATGAATTTGAATTGTATTATCAGCCTCAGATAGATG
TCGACCAACAAAATAGTATTGTTGGCGTTGAAGCATTAATTCGTTGGAAACACCCAAAAGATGGCATGGTTAACCCCGAT
GTGTTCATTGGTATTGCAGAATCTTGCGGCTTGATTGTTGAGATTGATCGTTGGGTACTTACCCAAGCTTGTCTCGACGG
TGCAGATTGGCATCAGCGATATCAAAGCGAGATAACAGTGTCGGTTAATGTGTCTGCAATGCATTTTAGACAACCAGATT
TTATCGACTTTTTGACTGCGACATTGCATCAAACTGGTATGCCTGCTAGATGTTTGTCGGTAGAAATTACCGAAGGCGTA
TTGATGAAAGAAATTGATATTGCCAGCCAGCATTTACGCGCGTTAGAGCAGTTAGGTATTGATGTTGCCATCGATGATTT
CGGTACCGGTTATTCGTCGCTTGCGTATTTACGTTCATTCCAAGTCAATATTCTGAAAATTGATCGCTCGTTTTTAATCC
ATATTGACACCCATCAAGCCGATCAAGCCATTGTGAGCAGTATTATTGAATTAGCTCGTAACCTATCCCTTGAGGTCGTT
GCTGAAGGCGTGGAAACATCTGAACAGCTTGCACAAGTCGTTCAGCGTGGCTGCCACATTATTCAGGGATATTATTTTGC
CAAGCCGATGCCCAAAGCCGAACTTGAGCTCGATATTAAGCGACAAATGGGGATTAATGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCACAACACCAAGATGATTAATGTGTGGATGACGATAAACCTGTTTTTACTACGTGTGGGGCTTGCCTGCATTTGATCAC
GTAAAGGATAAATTGAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTGTTCATTGATGATGCCAAGGTAATCTTCTTGCTGCTATCCATTAGTATGGGTATTGGTTAAATTTTGTTAGAATAAG
TTGTTTTTACTTACTTTCGG

Product: diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1487_residues
MTRAVLVSLGCFILSLFTVLPACSADIVQRVFNAKDGLANATIQDISFDGYGHVWLATQQGIYRVSNSKVRRIDKVGFDS
VLDDELITTVVNSGQDHLLVGTNSSSYLYSILDNHFSLLLKPEDNDATNINKSIRVAATQRQLDGRLLMLAYSGQVYYFD
DASQQLSLSPSHSLDHNLPWRNALELHNSQYLFSTNHELQLHQADGTFIGTFPWSDKNDSIRKLFQDKQQRVWMLTSKGL
FKVDTETLTVQSVPEIPYYVDQMEQDLNGDLWISSRAGLIFWSPENNKLTVHRDELKQRANIDYIHDMAVDSDGLLWVGG
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NAEHLVLATTSGLYVVNKKTNVRTDFATWSGGNESLNDRIVIGIYRDELHKDVIWFTTNKGLYYWQDGNADLTLQVLSDG
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DEVISLDQQWKIDCKVVFFLQDTETDHIVGCASAIIKVNKATGKVSSYSHKDGFISDEFNESAKFYDPAKGFFVGTPDGA
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VLLEGQSQINITGLSAGAYALELLYKRNGVWSNEPFQYRFTVKQFWWRSQQFTGALIFSILLIAAIILLYRQRQIHRFKQ
MNHALVESDERLRQSLKGSDSDLWEWHASTQVLSLDNRGGVLGPDTHINVKLEDIPIHQDDVERITSVWQDLVNGKVEMI
DAEYRYRNQHDHQWHWLRIKGRAIEVDINNGRLIYAAGMYTDITQQRTLESEANLLAQAFENTSEGMLILDMKKNIKISN
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AEGVETSEQLAQVVQRGCHIIQGYYFAKPMPKAELELDIKRQMGINE

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG5001

COG function: function code T; Predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA