| Definition | Shewanella frigidimarina NCIMB 400, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008345 |
| Length | 4,845,257 |
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Identifier: 114564891
GI number:
Start: 4444252
End: 4448850
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: Sfri_3739
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 114564892
Following gene: 114564890
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>4599_bases GTGGGAATTAATTCAATTAGTCGCTTTGTTGCTAGTTCTTTTGTGGTCATGGCTTTACTGGTTCAGAGTGTTTTTGCGTT TGATATTATTGATGAGTCTGTAATGTGGCCTGACGTAGCTCAAGGGCATCACCAGTACAATAATAATAGTTGTCATAAAA TTACGAATCCCCAGCTAATGATGCAAAGCGGTTCAAGAATCAATGGTACGTTAGGGGATAGTTTAGCGTTTTGTTCAATT AATACCGGTTCAGGTTTACCTAGTGATAGTTGTGACACTGCTACTGGAGGCGATCGCTATTGTGATGTAATGAAAAGTGA TATAAGTGGATTGCAATTAACTGGTGGCAATAAATTTCAAAGTAGTAAAGGGACAAGTGGTGGATTGGGCTCTTGTACAG GCAATCAAAACATTGTTTTGGGAAATACTGGTCTAAACCAATTTAATTCAATTACGCTATATTCTGCTTGTACTGTAACA ATGTCTTCGACACAACAAGAATATTATTTTAACAAAATAGAAGCTGGAAATGGGGCTAAATTAATTTTTCCAGCCGGTGA TTATTGGATCGATTCTTTAATATTAAATCAAAATGCAGAAATCGTATTACAAGGGGATGTTAGATTATTTATCGGTAGTG ATTCTGAATTAAATAACGGTAAAATAAATGCTGTAAATTCGAGTGCTTTACAACTAATCGCGTATAAAAATTTAACTTTG AATACTGGTTCTGTTATTGGTGGGTATATTTATAGCGATGAAAAATTGACTCTTAATAACAACTCAATTATTAACGGGCG CGTAACATCTAAATATTTATGGCTTAATTCTAACAATCAAATTAATGATACCGTTTCAACACCTGCTGTGTTCCATATTC AATATGGTAAAGCGACGGCAAATAGTATTACTTTTGACAAACAATTTCCTACAGGTGTGACGCCCTTAGTCTTTTTAATG CCGACTGTAGAGAATAGTAATAACGACGGCCCCGCATCAGTATTTATTGATAGTGTATCGGAACAAGGGTTTACCTGGTC AAAAAAAGAGCCTGAATCACCTAATAACCGTTATGTAGCATCAAAGGAAATGGCTGAAATTCACTGGATAGCTGTCACTC CTGGAACCTATAAATTACCAAACGACACAAAACTTATCGCCGGTGCTGTTGACTACGATCAGGCTTTAATTGGTTCGAAT TCACCTTATACACCTGTTGCTTTACCTTCTACTCAAGATGTTTTGTTAAATCAAATCCAAACTAAAAATAATAACTGTTG GTTCACTAGCACGTCGGAATTTACCAAGTCAGGTATACAACTTGCGTTAGATACTTCAGAGGTCAGAAGTAACAATAGAA AATGTCAACCAGGTGATTTGAACAATAATCAAATTCAAAATGAAACCATTGGCTATTTATCATTTAAATCGGGTAGTGGC ACAATGAAATTAAATGGTGTCGACACTAATTATCATTTTGGCAAAGCGCAAACCTTTACAGATAATGGTACCAAAGATAT TAGTGATCAATGTCGTTATACCACGCCTTTAATTGGCTTTAAGGGAGTCCCTATATTAGTTGCGGGTAAAAACAGCCGCT TAGGTGGCGATGGCGGCTGGCTTCGTCGTTGTCAGTTGACTAACGACAAAGTGAGTATGGTCGTTGACGAAGATACTTTT AGAGATAACGACCGCAAACATCGTTGGGAGAATTACAGTTTTGTGGCTTTTGAGAAAAAAGTAGACACCTTAACGTGTTT TACCGACGATTTTAATCGCACTGATGTCGGTGATGATTGGGCTCTTAAGGTATTAGGCTCTTCATTACCGCCCTCAATAA AGGAAGGGCGTCTGCGTTTTACCTCTGCTAGCGGTAATCAAGCGACATCCAGTACTTATCAGCGATTATTCCCTGCTGCG AATAATTTAGTTGAGCTGGAGTTTGACTATTATGCTTGGTCGAGTCTAAGTGGCACAGGGGCTGACGGCATTGCAATTAT CTTGTCCGATGCCAGTATTACTCCTCAGCCTGGCAGTTTTGGTGGTGCCTTAGGATATGCCCAGCGTAACAACGGCACTC CCGGTTTTGCTGGTGGTTGGTTAGGTATCGCACTGGATGAGTATGGTAATTTTTCTAGCCCCAATGAAGGTAAAGTGGGT GGACCAGGCTTTAGAAGTCAGGCGGTGGCTATCCGTGGTTCCTCAGGCACAAATTACCAATATCTAACAGGTACTAATGC CAACATTTCCCCCAGAATTGATGTGCGCAATACGGCCAGTGCTCAGCCAAACCATAAATATAAAATCATCATCGATTCGC GAACACCAGGCAAAGCCATGGTATCAGTGCTGCGTGATACGTTAAATAGAGATAATCCAGCTGACTTCGTGACTTTAATC GCTCCTTTTGATGCATTAAGTTTCTCTGGGCAAGCTCCTGTCCCTAAAGATTTTTACTTATCTATAACTGGCTCTACGGG TGGCTCTAACAATAATCATGAGATGGATAACTTTAAGGTTTGTGCCCTTAAATCCAATCCGGTCGGTCAACAAATTCATC ATTTTGAGTTTGACTATACCAGCTCGCCATTTACCTGTAAGGCCGAAACCATGACGGTCAGAGCCTGTAAAGATGCGGTA TGTAATTTGTTTACTGATCCCGTAGAGGCTAATTTGTCGCTTGCTCCTAATTCAAATGGTGCTTGGTATGTCGACAGTAG TAAAACAAATGTAGTGAGGTTTGAAAATGGTAGTGCAACGGTCGCTTTACGCAACAATGTGACTACGCCAACCACTATTG GGGTAACATCTTCCATTCCTTCAACCATAGCAGGCAGTAACACCTTGTGCCGCCGTGGTTCGGGAGGGCTAACTACAGCA AGTTGTACCTTAAGCTTTGCCGAGAGCGGTTTTATTTTTGTTGTGCCAGATAAGCTGGCAAACAAGCCTACTGACAACAT TACTATTAGTGCAGTGAAAACCTCAGATATCACTCAACAGTGCGTACCTCTGTTTTCCAAAACCACTAAAAATGTCAATT TTTGGAGCTCTTATATCGACCCCATCAATCCAATTAATGGCCAGTCATTAACAGTAAATAGTACCGTGGTGGGTAAACAG AGTAGTGCAGCAACCACGCTTGCGTTGGCATTTGATGCAGAAGGTAAAGCAGATATTATTGTTAACTATCCAGATGCAGG AAAAATGCAGCTAGATGCAAAGTTTACTGGCACAGGTGATGAACAAGGCTTGGTGATGGTTGGTTCAGATCAGTTTGTGA GCTTTCCGGTAGGTTTATGCGTTACCCCCAAAGATAATGCTGCACAGTGGTCTAAAAATAACGGTATTTATAATCCATAT AAAAAAGCAGGCGAGTCATTTGATCTAATTATTCAAGGCAAAGCATGGCAAGTGGATGGTGACACAAATTACTGTGATAA TTTAAATACCCCTAATTACGCCCATGAAAAAATTGAGTTAGGCCATCAATTGATTGATCCGCTCGGAGGAGTGTTGGGTG CTGTGGGCTCATCGCGATACAATCATGTTGCGCAAACCACTAACAGTAATACCGTGTCTCAGTCGGTAACCGAAGTTGGT GTGTTTCAGTTTACAGCTAACCCACCACTTGGCTATTTGGGTTCGAATTTTCATGATATTCCACTCGCTGTATCACCTAC CATGGGTCGCTTTGTGCCAGACCGATTTGTTGTGAGTAGTTCAAGTGTGTTGCCATCTTGCGGTAGCTTTACTTATATGG ATCAACCTTTTGGCCTGACGTTGACTTTGAGCGCATTTAATACCGGTACTTATATCACCAAAAATTATCAAGGTGCTTTT GCTAAAGGTACTGCAAACCTTGTGGGTGAAAACATTAACAATGGTGTAGATTTGAGTGGCAGATTAAGCACTCTACCTAT TAATGCTGGGTCTTGGGCGTTGGGTGAAGCAAACGTAGGATTATCTTATCAAGCTAATTTTAGTCGTACAGTGTCCCCAA GTGTTGATGGACCATTTAGTCAGTTAGCTATTGGTGTGCAAGCTTTTGATAATGATGGTGACTGGTCGTTTATTGCATCA CCAGATATGCGAGCCAACAGCAGTGCTATTTGTGCTGATAATAGTAACTGCAACGCGAAACTGTTGTCGACTCAGGATTT TCGTCATGGCAGAGTGGTGATGGACAATACTTATGGCCCTGAAAATGAAATTTTACGCATGCCAACGTATGCCCAATATT GGAATGGTAGTACTTGGGTAACGAACATTAGTGATAGCTGTACTCAAGTTATCGATCCGCTTGATGGCAGCGAAATATAC ACACCATTATTAACTTTTGGCCAAACGGTTACCCGCAGTGATGGCAACAGTACCGTCAACATTCCGATGACCAGTGGTCA GCTCCCTTTATTATGGCAAAACACTGGTTCTGCAGCATATCGGGGTCAAGTGACTGCACCGCTACAAGTGGAGGATTGGC TTAAGTGGTATTGGGACCAAGCAAGTCCGACTCAACTCTATGATCCAAGAGCAAGTGCGTACTTTGGTCGCTACCGAGGA CATGATAAGATCATTTATTGGCGTGAGGTGAATCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CGAATTAATAGTTTAGCGGTATGCGAAACAGCTAACTGTGTAGGAAACTCAAACAGTTCAACATGTTTGCGAGTCAGTCG CCAAGTGGAGGTAGAAGCCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCGAATAAAAAAGCATCTCTTTTACGCTTTTTAGGATTAAATTTGACCGATTAGCATTTTTTTAGATACTTTTATAAAA AAAAACGTCAGATTAGCAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>1532_residues MGINSISRFVASSFVVMALLVQSVFAFDIIDESVMWPDVAQGHHQYNNNSCHKITNPQLMMQSGSRINGTLGDSLAFCSI NTGSGLPSDSCDTATGGDRYCDVMKSDISGLQLTGGNKFQSSKGTSGGLGSCTGNQNIVLGNTGLNQFNSITLYSACTVT MSSTQQEYYFNKIEAGNGAKLIFPAGDYWIDSLILNQNAEIVLQGDVRLFIGSDSELNNGKINAVNSSALQLIAYKNLTL NTGSVIGGYIYSDEKLTLNNNSIINGRVTSKYLWLNSNNQINDTVSTPAVFHIQYGKATANSITFDKQFPTGVTPLVFLM PTVENSNNDGPASVFIDSVSEQGFTWSKKEPESPNNRYVASKEMAEIHWIAVTPGTYKLPNDTKLIAGAVDYDQALIGSN SPYTPVALPSTQDVLLNQIQTKNNNCWFTSTSEFTKSGIQLALDTSEVRSNNRKCQPGDLNNNQIQNETIGYLSFKSGSG TMKLNGVDTNYHFGKAQTFTDNGTKDISDQCRYTTPLIGFKGVPILVAGKNSRLGGDGGWLRRCQLTNDKVSMVVDEDTF RDNDRKHRWENYSFVAFEKKVDTLTCFTDDFNRTDVGDDWALKVLGSSLPPSIKEGRLRFTSASGNQATSSTYQRLFPAA NNLVELEFDYYAWSSLSGTGADGIAIILSDASITPQPGSFGGALGYAQRNNGTPGFAGGWLGIALDEYGNFSSPNEGKVG GPGFRSQAVAIRGSSGTNYQYLTGTNANISPRIDVRNTASAQPNHKYKIIIDSRTPGKAMVSVLRDTLNRDNPADFVTLI APFDALSFSGQAPVPKDFYLSITGSTGGSNNNHEMDNFKVCALKSNPVGQQIHHFEFDYTSSPFTCKAETMTVRACKDAV CNLFTDPVEANLSLAPNSNGAWYVDSSKTNVVRFENGSATVALRNNVTTPTTIGVTSSIPSTIAGSNTLCRRGSGGLTTA SCTLSFAESGFIFVVPDKLANKPTDNITISAVKTSDITQQCVPLFSKTTKNVNFWSSYIDPINPINGQSLTVNSTVVGKQ SSAATTLALAFDAEGKADIIVNYPDAGKMQLDAKFTGTGDEQGLVMVGSDQFVSFPVGLCVTPKDNAAQWSKNNGIYNPY KKAGESFDLIIQGKAWQVDGDTNYCDNLNTPNYAHEKIELGHQLIDPLGGVLGAVGSSRYNHVAQTTNSNTVSQSVTEVG VFQFTANPPLGYLGSNFHDIPLAVSPTMGRFVPDRFVVSSSSVLPSCGSFTYMDQPFGLTLTLSAFNTGTYITKNYQGAF AKGTANLVGENINNGVDLSGRLSTLPINAGSWALGEANVGLSYQANFSRTVSPSVDGPFSQLAIGVQAFDNDGDWSFIAS PDMRANSSAICADNSNCNAKLLSTQDFRHGRVVMDNTYGPENEILRMPTYAQYWNGSTWVTNISDSCTQVIDPLDGSEIY TPLLTFGQTVTRSDGNSTVNIPMTSGQLPLLWQNTGSAAYRGQVTAPLQVEDWLKWYWDQASPTQLYDPRASAYFGRYRG HDKIIYWREVNQ
Sequences:
NA
Specific function: NA
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: NA
Metaboloic importance: NA
Operon status: NA
Operon components: NA
Similarity: NA
Homologues:
NA
Paralogues:
NA
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
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Molecular weight: NA
Theoretical pI: NA
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Important sites: NA
Signals:
NA
Transmembrane regions:
NA
Cys/Met content:
NA
Secondary structure: NA
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: NA
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: NA
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA