Definition Shewanella frigidimarina NCIMB 400, complete genome.
Accession NC_008345
Length 4,845,257

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Identifier: 114564891

GI number:

Start: 4444252

End: 4448850

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: Sfri_3739

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 114564892

Following gene: 114564890

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4599_bases
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TGATATTATTGATGAGTCTGTAATGTGGCCTGACGTAGCTCAAGGGCATCACCAGTACAATAATAATAGTTGTCATAAAA
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TTATTGGATCGATTCTTTAATATTAAATCAAAATGCAGAAATCGTATTACAAGGGGATGTTAGATTATTTATCGGTAGTG
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AATACTGGTTCTGTTATTGGTGGGTATATTTATAGCGATGAAAAATTGACTCTTAATAACAACTCAATTATTAACGGGCG
CGTAACATCTAAATATTTATGGCTTAATTCTAACAATCAAATTAATGATACCGTTTCAACACCTGCTGTGTTCCATATTC
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AAAAAAAGAGCCTGAATCACCTAATAACCGTTATGTAGCATCAAAGGAAATGGCTGAAATTCACTGGATAGCTGTCACTC
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TCACCTTATACACCTGTTGCTTTACCTTCTACTCAAGATGTTTTGTTAAATCAAATCCAAACTAAAAATAATAACTGTTG
GTTCACTAGCACGTCGGAATTTACCAAGTCAGGTATACAACTTGCGTTAGATACTTCAGAGGTCAGAAGTAACAATAGAA
AATGTCAACCAGGTGATTTGAACAATAATCAAATTCAAAATGAAACCATTGGCTATTTATCATTTAAATCGGGTAGTGGC
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TAGGTGGCGATGGCGGCTGGCTTCGTCGTTGTCAGTTGACTAACGACAAAGTGAGTATGGTCGTTGACGAAGATACTTTT
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TACCGACGATTTTAATCGCACTGATGTCGGTGATGATTGGGCTCTTAAGGTATTAGGCTCTTCATTACCGCCCTCAATAA
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AATAATTTAGTTGAGCTGGAGTTTGACTATTATGCTTGGTCGAGTCTAAGTGGCACAGGGGCTGACGGCATTGCAATTAT
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TGGCTCTAACAATAATCATGAGATGGATAACTTTAAGGTTTGTGCCCTTAAATCCAATCCGGTCGGTCAACAAATTCATC
ATTTTGAGTTTGACTATACCAGCTCGCCATTTACCTGTAAGGCCGAAACCATGACGGTCAGAGCCTGTAAAGATGCGGTA
TGTAATTTGTTTACTGATCCCGTAGAGGCTAATTTGTCGCTTGCTCCTAATTCAAATGGTGCTTGGTATGTCGACAGTAG
TAAAACAAATGTAGTGAGGTTTGAAAATGGTAGTGCAACGGTCGCTTTACGCAACAATGTGACTACGCCAACCACTATTG
GGGTAACATCTTCCATTCCTTCAACCATAGCAGGCAGTAACACCTTGTGCCGCCGTGGTTCGGGAGGGCTAACTACAGCA
AGTTGTACCTTAAGCTTTGCCGAGAGCGGTTTTATTTTTGTTGTGCCAGATAAGCTGGCAAACAAGCCTACTGACAACAT
TACTATTAGTGCAGTGAAAACCTCAGATATCACTCAACAGTGCGTACCTCTGTTTTCCAAAACCACTAAAAATGTCAATT
TTTGGAGCTCTTATATCGACCCCATCAATCCAATTAATGGCCAGTCATTAACAGTAAATAGTACCGTGGTGGGTAAACAG
AGTAGTGCAGCAACCACGCTTGCGTTGGCATTTGATGCAGAAGGTAAAGCAGATATTATTGTTAACTATCCAGATGCAGG
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AAAAAAGCAGGCGAGTCATTTGATCTAATTATTCAAGGCAAAGCATGGCAAGTGGATGGTGACACAAATTACTGTGATAA
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CTGTGGGCTCATCGCGATACAATCATGTTGCGCAAACCACTAACAGTAATACCGTGTCTCAGTCGGTAACCGAAGTTGGT
GTGTTTCAGTTTACAGCTAACCCACCACTTGGCTATTTGGGTTCGAATTTTCATGATATTCCACTCGCTGTATCACCTAC
CATGGGTCGCTTTGTGCCAGACCGATTTGTTGTGAGTAGTTCAAGTGTGTTGCCATCTTGCGGTAGCTTTACTTATATGG
ATCAACCTTTTGGCCTGACGTTGACTTTGAGCGCATTTAATACCGGTACTTATATCACCAAAAATTATCAAGGTGCTTTT
GCTAAAGGTACTGCAAACCTTGTGGGTGAAAACATTAACAATGGTGTAGATTTGAGTGGCAGATTAAGCACTCTACCTAT
TAATGCTGGGTCTTGGGCGTTGGGTGAAGCAAACGTAGGATTATCTTATCAAGCTAATTTTAGTCGTACAGTGTCCCCAA
GTGTTGATGGACCATTTAGTCAGTTAGCTATTGGTGTGCAAGCTTTTGATAATGATGGTGACTGGTCGTTTATTGCATCA
CCAGATATGCGAGCCAACAGCAGTGCTATTTGTGCTGATAATAGTAACTGCAACGCGAAACTGTTGTCGACTCAGGATTT
TCGTCATGGCAGAGTGGTGATGGACAATACTTATGGCCCTGAAAATGAAATTTTACGCATGCCAACGTATGCCCAATATT
GGAATGGTAGTACTTGGGTAACGAACATTAGTGATAGCTGTACTCAAGTTATCGATCCGCTTGATGGCAGCGAAATATAC
ACACCATTATTAACTTTTGGCCAAACGGTTACCCGCAGTGATGGCAACAGTACCGTCAACATTCCGATGACCAGTGGTCA
GCTCCCTTTATTATGGCAAAACACTGGTTCTGCAGCATATCGGGGTCAAGTGACTGCACCGCTACAAGTGGAGGATTGGC
TTAAGTGGTATTGGGACCAAGCAAGTCCGACTCAACTCTATGATCCAAGAGCAAGTGCGTACTTTGGTCGCTACCGAGGA
CATGATAAGATCATTTATTGGCGTGAGGTGAATCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGAATTAATAGTTTAGCGGTATGCGAAACAGCTAACTGTGTAGGAAACTCAAACAGTTCAACATGTTTGCGAGTCAGTCG
CCAAGTGGAGGTAGAAGCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCGAATAAAAAAGCATCTCTTTTACGCTTTTTAGGATTAAATTTGACCGATTAGCATTTTTTTAGATACTTTTATAAAA
AAAAACGTCAGATTAGCAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1532_residues
MGINSISRFVASSFVVMALLVQSVFAFDIIDESVMWPDVAQGHHQYNNNSCHKITNPQLMMQSGSRINGTLGDSLAFCSI
NTGSGLPSDSCDTATGGDRYCDVMKSDISGLQLTGGNKFQSSKGTSGGLGSCTGNQNIVLGNTGLNQFNSITLYSACTVT
MSSTQQEYYFNKIEAGNGAKLIFPAGDYWIDSLILNQNAEIVLQGDVRLFIGSDSELNNGKINAVNSSALQLIAYKNLTL
NTGSVIGGYIYSDEKLTLNNNSIINGRVTSKYLWLNSNNQINDTVSTPAVFHIQYGKATANSITFDKQFPTGVTPLVFLM
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SPYTPVALPSTQDVLLNQIQTKNNNCWFTSTSEFTKSGIQLALDTSEVRSNNRKCQPGDLNNNQIQNETIGYLSFKSGSG
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HDKIIYWREVNQ

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA