| Definition | Shewanella sp. MR-7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008322 |
| Length | 4,792,610 |
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Identifier: 114046630
GI number:
Start: 1301496
End: 1308701
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: Shewmr7_1124
Alternate gene names: NA
Gene position: NA
Preceding gene: 114046629
Following gene: 114046631
Centisome position: NA
GC content: NA
Gene sequence:
>7206_bases ATGTTGCCTCTGTGGACACCGCACCGTCACTCATCTTTTGCCGCTTTTATATTGCTATTGGGGTTGTCTGTGGGGGCACC GAGTGAGGCGGCGCTGACAAAACCTGATGTTGAAATTGACCCTATATTGCCAAGTATTCCTTTACCTGTAGCAATACCTT CTCTTTCCGGTAGTCGTTTTTCGTCAAGTGTCGAATTACGCTGGAGTATTGATTGCTCTGTCACTGCCGTTAATATCCAA GAATCCATCAATAATCAGTCTTGGACAACAATCTATACTGGATTAGGTCAAGCGGATAATACAGCTGCCTATGCTACGTT TGCTGTTGGGGGGGATGTTTGCAGTGGTGATTGGTCAAGCAAACGATTATTGCAACTCCCTAATAAGACCCTCCCAGGTT ATTACTACCGCATCAATGCTTGCAAAGGTTCATTGTGTAGCGCTTATAGCCCTTCTATTCTTGTTGGCACTCCTTCTGCG CCTTCTACCCCCTCGGCTCCAGCCTCTATCTCGACTCCTGCAACCAATACAACAGGGGCGTTTAGCGTTTCTTGGGCTGG CGTCAGTGGCGCTACGCGTTATGAGTTACAGCAACGCATTAATGGTGGCGTATGGGTTGCGAAATATTCTGGTACGGCCA CCAGTTATGCATTGTCGGGACTCGCTTCGGGCACCTATCAATATCAAGCGCGGGCTTGCTCAACGGCGTGCAGTGCCTGG AAGTTATCAAGTAATACTCAGGTCAGTTTGCCCGTGCTTGGTAGTGATTGGAAAAACCTATCGCGGGTGACGGTTGCCGA TGCGGGCGGTAGTGATATCGAGCCCGCTGAAGTTGTTGATTTAAATGCAGCAGCGGTTAAGGGGCAAGCTGGCGTCTCGG GTGGCCAAGCAAGTTATCACATTCCTATCGATTTACCGCCAGGACGTAATGGTGTTCAGCCTTCTATATCGCTTAGCTAT 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATAGGTGAATAATAAATGAATTTAGAAGATAGCACATTTATAAAGAAGCTTATTAGCTGCCTTGGTAGTTCACCATTCTC AGCGGAAAGGTTTACTATTG
Product: YD repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: NA
Protein sequence:
>2401_residues MLPLWTPHRHSSFAAFILLLGLSVGAPSEAALTKPDVEIDPILPSIPLPVAIPSLSGSRFSSSVELRWSIDCSVTAVNIQ ESINNQSWTTIYTGLGQADNTAAYATFAVGGDVCSGDWSSKRLLQLPNKTLPGYYYRINACKGSLCSAYSPSILVGTPSA PSTPSAPASISTPATNTTGAFSVSWAGVSGATRYELQQRINGGVWVAKYSGTATSYALSGLASGTYQYQARACSTACSAW KLSSNTQVSLPVLGSDWKNLSRVTVADAGGSDIEPAEVVDLNAAAVKGQAGVSGGQASYHIPIDLPPGRNGVQPSISLSY NSQGGNGILGVGWSLNAGSSISRCGATFAQDGFTRAVTFNASTDRLCLDGQRLIVASGSYGASNAEYRTEMDSFVKVVQH GNINDSNSSFTVYKPDGSRATYGANANSRFVPSGLSTALSWKVTQESYSNGANTIDYQYDTSVAGEHLLSQILYTGSLGA LGDRNITFYYQPRTDKRKSYLAGGLTTSTRLLSELKVNGAGGQSVHQYQFDYQLSPASGRHLLRALAQCDALGHCTPQTQ LTWRDSASTVKADELLIGGQAVFSGELDINKVTPHGDANGDGSTDFPGYDSNAEQDMLGQNGFTHEKACYNDYVSDGWIC VAFDADHDGKVDPFKSINNILHIQLSASGAASYVSTGIPFNPNRFPSPDRLMSATDLNGDGDVDLMVFTVVSGKGYWRAY LNTGNASTPYSANSFQLIHETAIDPKLGSWPARPEVDVTMAGDIDGNGMVDFVVSSLGGSGAANAPVPVLRSFILNNSTP QQWSVQWSSAPTYPFHTGDGFHFFQKLIDINGDELADIISWRMVNNDRVIGYELNQGRATFAPWVAFAGNLHLKERFHSV VVTAQEPMDVIYPQYFDSMQTADIDLDGIEEILLPGQRVITGCAYVMFPGGTSGSGIKRTLCGDALYGDLPVNSFNTVPS KPITSSDFDDSIYQYDAIKFVLQVDGRWGLVKQSTPYYGSAHESRLVDTFGDGLVDMLTTYGPRVPGTGQFNETWIQNPG SSMWGTRYGAYLSRNYGSGNGQTTNDYAATDYLQAVTDGLGNRSEWRYRPLSTGEGSADQAKLYTTDHNEVGSGYVHFAS SMYVVQSFKQSNGQSGENETQYAYKGAMYNLQGRGFTGFNQIWEKDMQRDKTVHSVFKQKFPEVGLLMSQTVVAPNKNGV KGTVVELKNTWVDNPQHKASLVRSKGVHHNIQTSSLQKSWDLDDGSLMSEIKQTVGTSPTDVDEWGNIKKQTQKVTDYIK GQANTYTSVTETGFVPDVNNWWLNKFNWIKTSHNTAQRNWGDDPVGTMDKAQWQLQTVNTWDSNHKLPTKVTYTGSNSSC NRVEETELNSYGLPRWTKTTGQSSTCSAMTARQTSFTYTKDGTTQVDDGYLPYKVINAKGHITTTEYDMGLGLPTKVIAP NNIVTQTEYDGIGRPVQVKQTGSPTRYLRYLLANEGNNPPQDNDNIPVMMTRTSGAGMPETEQYFDGQGRLLRTATQGFD GGYQYQDKHYDALGRLTRESTPYGNGTAADYTEFSNFDALDRPGRRTIPNGRSGGLESLYSYNGLTTDINVEGRLMSRTY GSQGWLYETVDAQNGTNRFAYDSAGRPLVIRDANNCDIKATYNGFGHKTQVIDPNQGTTNFGYNSVGELDKQTDANGVVQ TYVLDVLGRVTSKTTTGGSAPGTATFVWDTPKQGLLTSETENGVARTYAYTTALQLAQTTVTVDGVSRTVKHQYDGFYGR PKALEYPNGLTLKYAYNDYGYLEQTSNAASGYLYRQVTAMDEAGHTTGADLANRVMSESRSYYSEGTMASVAVDGPLGRI HAHYYDGYDDFMNLTSERDGVTGLTKSYRYDTLNRLTEYQFSNTNPTFSATVNYGYDKVGNFLKKTDYSANSSTAYRYGG SACGYKPNAVCQLDKLNGTTVSFQYDNRGNLRVGDGLTMTYNAMDKPLSVSGRGATTSFVYGSDNMRAKQSRTVGSATTT TYYVDKYYEADSDGSWRAYLDDIAVLSYTSQRGHLLQFTLKDRLGSATTLADQNGNIVSQRYFDPFGRTASTGGGHRTDI VNKNTLQSKLQDLDITNKNRRGFTDHEHLNEQQLIHMNGRIYDYNLGRFMSVDPLIQSPTSTQSVNPYSYIMNNPLAGTD PTGYAADYIAGVSFGYNAGLTTTQLELLNNAESCSYCTGEFAAGVNLGSDFKSAKREAGSLFAGALFLAKAKLPALPNSG ADSSIKTETGEAADIGSKPDSRVDSRPKFWASTNNDAVEESKDQDGVMRCSKCDTGLTGERQSNGKRDYQLGHPEDSPWV EQQDEWREKSKNGEDFTRRDVTEKYQEGVKVECVGCNASHGGRLGNQRKSGSSGRGQSTGIKVVRVTGRLDSMKLDKLEK K
Sequences:
NA
Specific function: NA
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COG function: function code M; Rhs family protein
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