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The map label for this gene is 113477794

Identifier: 113477794

GI number: 113477794

Start: 6769455

End: 6772010

Strand: Reverse

Name: 113477794

Synonym: Tery_4394

Alternate gene names: NA

Gene position: 6772010-6769455 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113477799

Following gene: 113477792

Centisome position: 87.38

GC content: 34.15

Gene sequence:

>2556_bases
ATGGGGTATCGCAGGCTAAATTTATCTAGGTTGGGGTGTGCTATTTTAATTGGTATTTCTTTGTCTTTGTTGATGAATAG
AAATACTTGGTCACAAGAGGCGATCGCTCCTAATATTCAACCATATATTGACCAGTTAAATGATGATAACCCTAGCAACG
ATAAAGAAGCAATCCAAAAAATCAAGAAAACTAATGATATTGATGGATTAATCATAATATTAAATAGGGGTCAATTAAGA
GATAGTCAAGCTGCTATTAAAGTTTTAGGAGAAATAGGCCCTTCAGCTAAAAAAGCTGTTCAACCTTTGACTAAGGTACT
ACAAGATGACCAAAAAGATGTAAAAAGTCGTTGGTTTGCTGCTAGAACTTTGGGTCAAATTGGTTCAGAAGCTAAAGCTG
CTGTTAAACCTTTGATTCAGGAATTAAAAACAAATCAGTATCAGCCTATTGTTTTTTATAGCATTCATGCTCTAATGCAA
ATTTCGCCAACAGAGCCAGAAACTGTTGAAGCTGTAATTTATACTTTAGAAAATTATGATGATGATGATGTGCGTCTTCG
TGCTACTAGTGCTATTGCCTCTGCTATTGAAAAAATAGAAAGTTCAGAAAGGTTAAATAAAACTCTTGTTAAACTTAAAA
AACTAACTAACAAAACAAATAATTGGCAGGTAAGATTAGGAGCAGCTCATTCACTAGGAAGTAGTGGTAGAGATGTTAAA
CTAGCGGTAGAAACTCTGATCAATCTTTTACAAGAAACTGATGAAGAAGTTCTGAAAAAATCCCTTGAATCTCTAAAAAA
AATAGCCAATTTACTTCCTAGCAGAGCACCATTGCTTATTTCCCAAGAAAGGAAAGATGCTATAAGTGGCTTAGAAACAG
TTTTAAAGTTTTTTCAGGATAATCAAGATAAATTCTCCAAAATAGAAGAAATAAATCAATTAGAAGTTGATTTAAAAAAT
ACGCTTACAATTATTAAAAAAACAACACCAAATCTGCCATTTGAAATAATTGTTAATTTAATAGCTACTCACCGGACAAT
ATCTATTCCGTTATTTGTTTTATTCCTATGGTTTTTATCAATTTCATTTTTATTTTTGATTAATCCGATTCAGTTGTTGC
GAATTAATAACTTTTTACAACGTTACACTGATATTCCATTGCCTGAAATTTTGGGAGGAATCAAGATTTCATTAAGAAAA
TTTTTGTTTGATATTCACTACCATCCTAGGGTGCTTGATGAATGGGTTAAATTAAAAATTGACAAAGCTAATCATGAATT
TGAAAAGAAGCCTACTGTTGAGCAGCGAAAAGTTCATATTCGAATACCTGTTGATATAGGTAAAAAATCTATTTCACAAT
TAACTGGAAAAGACTTGCAACGAAACTTTGCAGAACAAAAAGAATGCATACTTATTTACGGAGAAGGGGGCTCAGGAAAA
ACAAGTTTGGCTTGTCAGATAGCTCATTGGGCAATGTCTAATATTCCAGAAGAACGTTTATGTAAACACCAGATGTTGCC
AATTTTACTAGAAGAAGAATTGAATTTTGAAGTCAAAAAAGGAAAAAAGGTTTTTCTTGAAGCAATTCGTGGTGCCCTAC
GAGATTTAGTTGATGAGGAAGATACCTTGTCTGAAGAATTGTTGGAACAGCTTCTGAGAAAGCGACGCCTTCTAGTTATT
GTTGACCGCTTTTCAGAAATGAGCGAAACCACTAGAAATCAGATACGACCAGAATTACCTGATTTTCCTGTTAATGCTTT
AGTTGTTACATCTCGCCGTGACGAAAGCTTAGGAAGTGTAAACAAAACAACAATCAAATTAAAGCCTATTGAAGGTAATA
GACTTTCCGATTTTATGGACACATACTTAGTACATCGGGGAAAAAGAGATTTATTCGACAATCAAGAATTTTTTGAAGGC
TGTAGCAAGCTTTCAGCAATGGCAGGTAATAGTCACATGACTGTTATGTTGGCTAAACTCTACGCTGAACAAATGATTGC
AGTTAAAACGAATGAAATTTTAGATGATCTACCAAGTAATATTCCTGACATTATGCTATATTATTTAAGCGGGCTAAATA
ATATAGCAGAGAATCACTTGGATAATCCGTCTGTACACCGTGATGCTAAAGTTGTTGCTTGGGAATGTATCAGACAAAAA
TATCAACCAGGAAGGGCTACACGAGATATTGTAATCGCTCAACTGGCTCAACTGGGTGGAGATGAGCCAGAAGCCAGGTT
AAAATATTTGGAATATCGCCTTGGTATTATTAAGACAATTAAACCAGAGGAAAATGAAATTCGTTATTCTCTCGATCCTT
TAGCTGAGTATCTTGCAAGTCTTTACCTAGTCGACACTTACCAGGATAATGGCAATTTATGGCGTGACTTTTTGACACAG
GTACATACTTTATCAGGTCAACCTAATTCTAGCGTAGGCTTTCTAAAAGCTTTGCATGAATGCTGTTTAGCTAAAAAAGA
TAAAGTTCAAATACCTGATTTTTTCTTGGAGGAACTTGTTTCGATAATTGATTATTTAGATGCGGACTATAGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGAGTAAAATTTTATAAAGCTAGTTAGTTAGAATAAATGTCCATAAAATTGTTGACTATATAAAATTATGGATTAAT
TGAAATTGGAGAATTTAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCTAATTTATTGTTTTCAATCCTCGCATATCGGGTAGCAGTTTCCTTGTTCATCCGTTTCACAGTAACATCTTCCTCCA
TCTAATATAGTTTTAGGGAT

Product: HEAT repeat-containing PBS lyase

Products: NA

Alternate protein names: PBS Lyase HEAT Domain Protein Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 851; Mature: 850

Protein sequence:

>851_residues
MGYRRLNLSRLGCAILIGISLSLLMNRNTWSQEAIAPNIQPYIDQLNDDNPSNDKEAIQKIKKTNDIDGLIIILNRGQLR
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TLTIIKKTTPNLPFEIIVNLIATHRTISIPLFVLFLWFLSISFLFLINPIQLLRINNFLQRYTDIPLPEILGGIKISLRK
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TSLACQIAHWAMSNIPEERLCKHQMLPILLEEELNFEVKKGKKVFLEAIRGALRDLVDEEDTLSEELLEQLLRKRRLLVI
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YQPGRATRDIVIAQLAQLGGDEPEARLKYLEYRLGIIKTIKPEENEIRYSLDPLAEYLASLYLVDTYQDNGNLWRDFLTQ
VHTLSGQPNSSVGFLKALHECCLAKKDKVQIPDFFLEELVSIIDYLDADYS

Sequences:

>Translated_851_residues
MGYRRLNLSRLGCAILIGISLSLLMNRNTWSQEAIAPNIQPYIDQLNDDNPSNDKEAIQKIKKTNDIDGLIIILNRGQLR
DSQAAIKVLGEIGPSAKKAVQPLTKVLQDDQKDVKSRWFAARTLGQIGSEAKAAVKPLIQELKTNQYQPIVFYSIHALMQ
ISPTEPETVEAVIYTLENYDDDDVRLRATSAIASAIEKIESSERLNKTLVKLKKLTNKTNNWQVRLGAAHSLGSSGRDVK
LAVETLINLLQETDEEVLKKSLESLKKIANLLPSRAPLLISQERKDAISGLETVLKFFQDNQDKFSKIEEINQLEVDLKN
TLTIIKKTTPNLPFEIIVNLIATHRTISIPLFVLFLWFLSISFLFLINPIQLLRINNFLQRYTDIPLPEILGGIKISLRK
FLFDIHYHPRVLDEWVKLKIDKANHEFEKKPTVEQRKVHIRIPVDIGKKSISQLTGKDLQRNFAEQKECILIYGEGGSGK
TSLACQIAHWAMSNIPEERLCKHQMLPILLEEELNFEVKKGKKVFLEAIRGALRDLVDEEDTLSEELLEQLLRKRRLLVI
VDRFSEMSETTRNQIRPELPDFPVNALVVTSRRDESLGSVNKTTIKLKPIEGNRLSDFMDTYLVHRGKRDLFDNQEFFEG
CSKLSAMAGNSHMTVMLAKLYAEQMIAVKTNEILDDLPSNIPDIMLYYLSGLNNIAENHLDNPSVHRDAKVVAWECIRQK
YQPGRATRDIVIAQLAQLGGDEPEARLKYLEYRLGIIKTIKPEENEIRYSLDPLAEYLASLYLVDTYQDNGNLWRDFLTQ
VHTLSGQPNSSVGFLKALHECCLAKKDKVQIPDFFLEELVSIIDYLDADYS
>Mature_850_residues
GYRRLNLSRLGCAILIGISLSLLMNRNTWSQEAIAPNIQPYIDQLNDDNPSNDKEAIQKIKKTNDIDGLIIILNRGQLRD
SQAAIKVLGEIGPSAKKAVQPLTKVLQDDQKDVKSRWFAARTLGQIGSEAKAAVKPLIQELKTNQYQPIVFYSIHALMQI
SPTEPETVEAVIYTLENYDDDDVRLRATSAIASAIEKIESSERLNKTLVKLKKLTNKTNNWQVRLGAAHSLGSSGRDVKL
AVETLINLLQETDEEVLKKSLESLKKIANLLPSRAPLLISQERKDAISGLETVLKFFQDNQDKFSKIEEINQLEVDLKNT
LTIIKKTTPNLPFEIIVNLIATHRTISIPLFVLFLWFLSISFLFLINPIQLLRINNFLQRYTDIPLPEILGGIKISLRKF
LFDIHYHPRVLDEWVKLKIDKANHEFEKKPTVEQRKVHIRIPVDIGKKSISQLTGKDLQRNFAEQKECILIYGEGGSGKT
SLACQIAHWAMSNIPEERLCKHQMLPILLEEELNFEVKKGKKVFLEAIRGALRDLVDEEDTLSEELLEQLLRKRRLLVIV
DRFSEMSETTRNQIRPELPDFPVNALVVTSRRDESLGSVNKTTIKLKPIEGNRLSDFMDTYLVHRGKRDLFDNQEFFEGC
SKLSAMAGNSHMTVMLAKLYAEQMIAVKTNEILDDLPSNIPDIMLYYLSGLNNIAENHLDNPSVHRDAKVVAWECIRQKY
QPGRATRDIVIAQLAQLGGDEPEARLKYLEYRLGIIKTIKPEENEIRYSLDPLAEYLASLYLVDTYQDNGNLWRDFLTQV
HTLSGQPNSSVGFLKALHECCLAKKDKVQIPDFFLEELVSIIDYLDADYS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96944; Mature: 96813

Theoretical pI: Translated: 6.80; Mature: 6.80

Prosite motif: PS50837 NACHT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGYRRLNLSRLGCAILIGISLSLLMNRNTWSQEAIAPNIQPYIDQLNDDNPSNDKEAIQK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
IKKTNDIDGLIIILNRGQLRDSQAAIKVLGEIGPSAKKAVQPLTKVLQDDQKDVKSRWFA
HHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
ARTLGQIGSEAKAAVKPLIQELKTNQYQPIVFYSIHALMQISPTEPETVEAVIYTLENYD
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCCCC
DDDVRLRATSAIASAIEKIESSERLNKTLVKLKKLTNKTNNWQVRLGAAHSLGSSGRDVK
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCHH
LAVETLINLLQETDEEVLKKSLESLKKIANLLPSRAPLLISQERKDAISGLETVLKFFQD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NQDKFSKIEEINQLEVDLKNTLTIIKKTTPNLPFEIIVNLIATHRTISIPLFVLFLWFLS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISFLFLINPIQLLRINNFLQRYTDIPLPEILGGIKISLRKFLFDIHYHPRVLDEWVKLKI
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEE
DKANHEFEKKPTVEQRKVHIRIPVDIGKKSISQLTGKDLQRNFAEQKECILIYGEGGSGK
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCC
TSLACQIAHWAMSNIPEERLCKHQMLPILLEEELNFEVKKGKKVFLEAIRGALRDLVDEE
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
DTLSEELLEQLLRKRRLLVIVDRFSEMSETTRNQIRPELPDFPVNALVVTSRRDESLGSV
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCC
NKTTIKLKPIEGNRLSDFMDTYLVHRGKRDLFDNQEFFEGCSKLSAMAGNSHMTVMLAKL
CCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
YAEQMIAVKTNEILDDLPSNIPDIMLYYLSGLNNIAENHLDNPSVHRDAKVVAWECIRQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
YQPGRATRDIVIAQLAQLGGDEPEARLKYLEYRLGIIKTIKPEENEIRYSLDPLAEYLAS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHH
LYLVDTYQDNGNLWRDFLTQVHTLSGQPNSSVGFLKALHECCLAKKDKVQIPDFFLEELV
HHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
SIIDYLDADYS
HHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GYRRLNLSRLGCAILIGISLSLLMNRNTWSQEAIAPNIQPYIDQLNDDNPSNDKEAIQK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH
IKKTNDIDGLIIILNRGQLRDSQAAIKVLGEIGPSAKKAVQPLTKVLQDDQKDVKSRWFA
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DDDVRLRATSAIASAIEKIESSERLNKTLVKLKKLTNKTNNWQVRLGAAHSLGSSGRDVK
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCHH
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CCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
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HHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
SIIDYLDADYS
HHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA