| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113476124
Identifier: 113476124
GI number: 113476124
Start: 3866500
End: 3868455
Strand: Direct
Name: 113476124
Synonym: Tery_2505
Alternate gene names: NA
Gene position: 3866500-3868455 (Clockwise)
Preceding gene: 113476123
Following gene: 113476125
Centisome position: 49.89
GC content: 30.21
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AGGAAGAAAAATATCTGAGTATAGTTTTTATAGTGCTTCTCAAATTTAGGTTGTGGAGTCTGTATTTAACTGAGATATAA GGTTGATAATTTCCGAGCCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 651
Protein sequence:
>651_residues MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTIAELKTLVQKQELEYIEKVGI CLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDSEIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHL INQHISQDKSQNSEIKITSKILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKIPFWSIHYLESQNLKSTYKTE NEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQEAIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEE EANQKLIAAKKLAQLAETREVIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTLLKVAQSNQRLLDTLAKANQD LNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAVKNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQ GLKIASHFPNS
Sequences:
>Translated_651_residues MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTIAELKTLVQKQELEYIEKVGI CLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDSEIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHL INQHISQDKSQNSEIKITSKILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKIPFWSIHYLESQNLKSTYKTE NEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQEAIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEE EANQKLIAAKKLAQLAETREVIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTLLKVAQSNQRLLDTLAKANQD LNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAVKNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQ GLKIASHFPNS >Mature_651_residues MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTIAELKTLVQKQELEYIEKVGI CLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDSEIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHL INQHISQDKSQNSEIKITSKILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKIPFWSIHYLESQNLKSTYKTE NEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQEAIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEE EANQKLIAAKKLAQLAETREVIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTLLKVAQSNQRLLDTLAKANQD LNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAVKNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQ GLKIASHFPNS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74529; Mature: 74529
Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEECEEEEEEECCCCEEECCHHHH AELKTLVQKQELEYIEKVGICLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC EIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHLINQHISQDKSQNSEIKITSK CEEECHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHH ILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI HHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKI HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC PFWSIHYLESQNLKSTYKTENEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQE CCEEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH AIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEEEANQKLIAAKKLAQLAETRE HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHH LKVAQSNQRLLDTLAKANQDLNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH KNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQGLKIASHFPNS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEECEEEEEEECCCCEEECCHHHH AELKTLVQKQELEYIEKVGICLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC EIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHLINQHISQDKSQNSEIKITSK CEEECHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHH ILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI HHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKI HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC PFWSIHYLESQNLKSTYKTENEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQE CCEEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH AIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEEEANQKLIAAKKLAQLAETRE HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHH LKVAQSNQRLLDTLAKANQDLNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH KNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQGLKIASHFPNS HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA