Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113476124

Identifier: 113476124

GI number: 113476124

Start: 3866500

End: 3868455

Strand: Direct

Name: 113476124

Synonym: Tery_2505

Alternate gene names: NA

Gene position: 3866500-3868455 (Clockwise)

Preceding gene: 113476123

Following gene: 113476125

Centisome position: 49.89

GC content: 30.21

Gene sequence:

>1956_bases
ATGAAAACAGAAGTCAGAAACATTAATACAGAAATATTAGAACATAATTTACAACGAAACTGGCAAGATTTAAAAAAATC
TAATGATGTTTGTGAAATTAAATGCGACTTAAAGGTAGGAACATTATTGGTTATTTTTCAACATCCAGCAAATGTAGTGA
TAGATAAGCAAAAAACAATTGCAGAGTTAAAAACTCTAGTTCAAAAACAGGAGTTAGAATATATAGAAAAAGTAGGTATT
TGCTTGAATATAATAGGTCATACATATCCTTATGCTTATCATTCATTTTTTACCAAGGATACCTCAGAAGAATCTATGTT
CACTTTTCTGCCCAAATGGGTAGATAGAAATATAGATTCTGAAATAAAAATTACACCAGAATTACTAGATTCCTTAGATA
ATCCATTTAGTTTAAAAGATTTAGAAGCAATATCTATGAGACTAGAATCTGAGGGTATGTCTGATACAAATCCTCATCTA
ATCAATCAGCATATCTCTCAGGATAAAAGTCAAAATTCAGAAATTAAAATCACTTCAAAAATACTGGATGATTTAGATAA
TCCTTTTGATATGGAAGGATTAGATTTATCCCCAAAAAAAATTAATAGAAAAACTAGGAATTATGTAGAAAAAACATCGC
CTATAATCAAAGAATCAACTATTAATTTAGCTGCCTTTTCTCAAGTAGAATTGATTAGCGCTAGTTTAAGTTTAGCAATT
TTAATAGGCTGTTTTTTTGCAATAACTCAACCCTGTGTGATTGGAAAATGTATGATAATATCAACGGCAAAAGAATTAAA
TCAACAATCACTAGAAACAATTAAAAATGTCAAAAATTCTTTGGCTCCAAAGTGGGCACAAGAAAATTTAGAAACAGCAA
TTAAAAATTTAGAAAAGATTCCATTTTGGTCAATACATTACTTAGAATCACAAAATTTAAAGTCTACTTACAAAACAGAA
AATGAGCATTTGGAAACAATTAGACAAGCTTTGCGTAATGGTGCACAAGCAGCTCAAAAAAGCAAAGGTTTACCACTACC
AATAGAAGAATGGATAGAAATTCAATCACTTTGGCAAGAAGCGATCGCTCTATTAGAAAAAGTACCAGAAGATAGTAGAG
CTTATCCTTTTGCTAAAAATAAACTACAGCAATATCGCAAGTATTTAGTTGCTATTAAAGGAAGATTAACTAGTGAAGAA
GAAGCTAATCAAAAGTTAATAGCGGCGAAAAAATTAGCTCAGTTAGCAGAGACCAGAGAGGTAATAGCTCAATTTCCTGA
AAGCTGGAAAAGTGTACATTCAAACTGGAAAGATGCCTTAGATAAAGTATCTAAGATTCCTCAACAAACAACTGCTTATT
TAAAAGCCAAAAATTTACTTTCTCAGTATAAACAAAAACTTCAGCAAGCAGAGGAACGTAGAATCGTAGAAGAAATTGGT
CAAGAGGCTTATAATCAAGCTATTAGTTACTCTAAACAAGCTGAAGTGTTTGAGGCAAAAGATAATTGGAGAGATGCTGC
AAAATATTGGCAAAAAGCTCTAAATTATGCTGAAGACATACCAACTAATTCAAGTTATTTTATTTCAGCAAAACCTCTGA
TTAAATCTTATGATACTTTGCTAAAAGTAGCACAATCAAACCAAAGGTTATTAGATACTTTAGCAAAAGCTAATCAGGAC
TTAAATAAGACTTGCAAGGGAAAACAAAAAATTTGTCAATATAGTGTTACTAAGGATTTAATTACTGTACGTTTGACTTT
TGATTATGTAGATAAAATCAAAAAAACAGCTAAAGCAGTGAAAAATAGTAAAGACAAAAAGAGTCGTACTGAACTCGAAA
AACATTTGAAAACTTTAGAGGTTGCTTTAAAGGCTATTAGTAATAATTCTAAGATTCCTTTAGAACTTTATAACCCACAA
GGTTTAAAAATTGCTTCTCATTTTCCCAATAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATATGTTTTAAGGTTAAATTTGTACATCAGATAATTTGAAATTTAATTACATAATTACCAAAAAATATAAATAAACT
AATCAAGTATCAATATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGAAGAAAAATATCTGAGTATAGTTTTTATAGTGCTTCTCAAATTTAGGTTGTGGAGTCTGTATTTAACTGAGATATAA
GGTTGATAATTTCCGAGCCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 651

Protein sequence:

>651_residues
MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTIAELKTLVQKQELEYIEKVGI
CLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDSEIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHL
INQHISQDKSQNSEIKITSKILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI
LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKIPFWSIHYLESQNLKSTYKTE
NEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQEAIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEE
EANQKLIAAKKLAQLAETREVIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG
QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTLLKVAQSNQRLLDTLAKANQD
LNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAVKNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQ
GLKIASHFPNS

Sequences:

>Translated_651_residues
MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTIAELKTLVQKQELEYIEKVGI
CLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDSEIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHL
INQHISQDKSQNSEIKITSKILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI
LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKIPFWSIHYLESQNLKSTYKTE
NEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQEAIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEE
EANQKLIAAKKLAQLAETREVIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG
QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTLLKVAQSNQRLLDTLAKANQD
LNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAVKNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQ
GLKIASHFPNS
>Mature_651_residues
MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTIAELKTLVQKQELEYIEKVGI
CLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDSEIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHL
INQHISQDKSQNSEIKITSKILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI
LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKIPFWSIHYLESQNLKSTYKTE
NEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQEAIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEE
EANQKLIAAKKLAQLAETREVIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG
QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTLLKVAQSNQRLLDTLAKANQD
LNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAVKNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQ
GLKIASHFPNS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74529; Mature: 74529

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEECEEEEEEECCCCEEECCHHHH
AELKTLVQKQELEYIEKVGICLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHLINQHISQDKSQNSEIKITSK
CEEECHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHH
ILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI
HHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIGCFFAITQPCVIGKCMIISTAKELNQQSLETIKNVKNSLAPKWAQENLETAIKNLEKI
HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
PFWSIHYLESQNLKSTYKTENEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQE
CCEEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
AIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEEEANQKLIAAKKLAQLAETRE
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHH
LKVAQSNQRLLDTLAKANQDLNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
KNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQGLKIASHFPNS
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKTEVRNINTEILEHNLQRNWQDLKKSNDVCEIKCDLKVGTLLVIFQHPANVVIDKQKTI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCEECEEEEEEECCCCEEECCHHHH
AELKTLVQKQELEYIEKVGICLNIIGHTYPYAYHSFFTKDTSEESMFTFLPKWVDRNIDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EIKITPELLDSLDNPFSLKDLEAISMRLESEGMSDTNPHLINQHISQDKSQNSEIKITSK
CEEECHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHH
ILDDLDNPFDMEGLDLSPKKINRKTRNYVEKTSPIIKESTINLAAFSQVELISASLSLAI
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PFWSIHYLESQNLKSTYKTENEHLETIRQALRNGAQAAQKSKGLPLPIEEWIEIQSLWQE
CCEEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
AIALLEKVPEDSRAYPFAKNKLQQYRKYLVAIKGRLTSEEEANQKLIAAKKLAQLAETRE
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIAQFPESWKSVHSNWKDALDKVSKIPQQTTAYLKAKNLLSQYKQKLQQAEERRIVEEIG
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QEAYNQAISYSKQAEVFEAKDNWRDAAKYWQKALNYAEDIPTNSSYFISAKPLIKSYDTL
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LKVAQSNQRLLDTLAKANQDLNKTCKGKQKICQYSVTKDLITVRLTFDYVDKIKKTAKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
KNSKDKKSRTELEKHLKTLEVALKAISNNSKIPLELYNPQGLKIASHFPNS
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA