| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is pkn1 [H]
Identifier: 113475782
GI number: 113475782
Start: 3334629
End: 3340364
Strand: Direct
Name: pkn1 [H]
Synonym: Tery_2136
Alternate gene names: 113475782
Gene position: 3334629-3340364 (Clockwise)
Preceding gene: 113475781
Following gene: 113475787
Centisome position: 43.03
GC content: 32.1
Gene sequence:
>5736_bases ATGTTTGAAAAATTCATAGCTTTTATAAAGACAAAAGAATGGCAACTTGATTCGATGCAAATAGCAGAGGTTTTATGGTT TGTGCACCAAGTTAGTGAACAAAAACAGGAAGAAAATAATTCTCAAAATTTAGTTTCAAGTAATACGGAGGAGCTAGCTG AAAACTTTGATCAATCTTATGACTTTCAACTTTCAAAAACAGCTAGTATTCAACAACCAAAAAAAACGCCTACTAGGTCT TCGTCTTCTCAATATCCTTTAACTACTTCATCATCAAATAAATCTCAAAATACAGAAATTCAACCAACATCTTTGACTAC TGAAAAATTGCCTATCAAATTACCAGACATAGCAATTTTGCGTAATACTCTAGAATTAAGTCGCCTTATTAAACCCTTCA AACAAAAGGTAAACTCTCGAGTTGCTCAGGAATTAGATGTTAATGAAACTGCCAAAATAAGTGCAGAACTTAGTACCCTG AATTTTCCCCGTTATTTTCCAGTTTTAACTCCTAAAAAAGAACGTTGGTTAGATGTTGTTTTGCTCATAGAAGATAGTGA TTCAATGATTCTTTGGCAGTCTTTATTGCCAGAAGTTAGAGATTTTCTAGAACATTTAGGAGCATTTCGAGATATCAAAC TTTATCGCATAAAATGGGATAATAATTCAGAAAATTTACAAATTTATCCTTTTCATTCTCCTTCTCTGACTCTATCTCCT CAAGAATTAAATTCATCCGATCATAGACGGTTAATTTTGATGCTTAGTGATTGTATTTCCCTAGCTTGGATTAATCAGAA ATTTATTAATATTCTTCAAAAATGGGCAACAAAAGAAAAGTTGACTATCCTCAATCCTTTTCCTGAAAGAATGTGGGAAA ATACAAATCTTTGTTATGCAATTAGACTGCGATTAGGAAATAATAAAAAGCAAAATTCGACTCAAAAATGGGATGCAATT 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1911; Mature: 1911
Protein sequence:
>1911_residues MFEKFIAFIKTKEWQLDSMQIAEVLWFVHQVSEQKQEENNSQNLVSSNTEELAENFDQSYDFQLSKTASIQQPKKTPTRS SSSQYPLTTSSSNKSQNTEIQPTSLTTEKLPIKLPDIAILRNTLELSRLIKPFKQKVNSRVAQELDVNETAKISAELSTL NFPRYFPVLTPKKERWLDVVLLIEDSDSMILWQSLLPEVRDFLEHLGAFRDIKLYRIKWDNNSENLQIYPFHSPSLTLSP QELNSSDHRRLILMLSDCISLAWINQKFINILQKWATKEKLTILNPFPERMWENTNLCYAIRLRLGNNKKQNSTQKWDAI PIEYWQEKYLNQQTVKLPILNLEPKSMAAWVNVMVGKGISWCAGAGLGLELMGPEPEEEEEPLTPREQINNFYATFSKEA WQLIQWLSAIPINLSTIRLIQRALLPKSTQINVAEVLMGGLLSPVKPFNSYRFPHQIEFEFQPGIREIFLDRLGGKEFCI GVIGRLTEKIASHFGYETIREFEAILLNEPWNFRDDQDIRLIHTFATISISTLRQYGDKYTDYIPKLDRSRAQLYLMSEV PGESINWRDFLEKVAQKYRLSSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYS RLEALHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSIS ELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFENKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQTLENDQIEENLQDLNSEVPGES VKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEA LHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQ KLLSSASVIKGRLNHIFPKFENKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQTLENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWR DFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLF LSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQKYRLSSSQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLSL STSAIRGRLTNIFRKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLE KVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISQAAQKLSLSTSAIRGRLTNIFRKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSE YKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLNSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASV IKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQ EYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISQAAQKLSLSTSAIRGRLTNIFRKFENKNPGLFESRKGSKLEALQSFLFSQYVNL DIPQTIKNNQFQIGEKLQHWSFKTPTVNRRGNIINTRTYTASYFIEILGPDINLEMVAIPGGTFTMGSPESEKYSEDNER PQHQVTVPSFFMGKYPVTQGQWKAIASRTDIKVEGDLDPEPSYFKEPYENIDRWHRPVERVSWNQAVEFCQRLSKLTGRK YRLPSEAEWEYACRAGTSTPFYFGETITPELANYDGKYTYSDGPKGEYRGQTTPVGKFPPNAFGLYDMHGNVHEWCADDR HDNYVGAPTDGSAWINSNTHSDTKSRKILRSGSWYGYPWWCRSGDRNSYFSVEANNIIFGFRLVSVPPQDF
Sequences:
>Translated_1911_residues MFEKFIAFIKTKEWQLDSMQIAEVLWFVHQVSEQKQEENNSQNLVSSNTEELAENFDQSYDFQLSKTASIQQPKKTPTRS SSSQYPLTTSSSNKSQNTEIQPTSLTTEKLPIKLPDIAILRNTLELSRLIKPFKQKVNSRVAQELDVNETAKISAELSTL NFPRYFPVLTPKKERWLDVVLLIEDSDSMILWQSLLPEVRDFLEHLGAFRDIKLYRIKWDNNSENLQIYPFHSPSLTLSP QELNSSDHRRLILMLSDCISLAWINQKFINILQKWATKEKLTILNPFPERMWENTNLCYAIRLRLGNNKKQNSTQKWDAI PIEYWQEKYLNQQTVKLPILNLEPKSMAAWVNVMVGKGISWCAGAGLGLELMGPEPEEEEEPLTPREQINNFYATFSKEA WQLIQWLSAIPINLSTIRLIQRALLPKSTQINVAEVLMGGLLSPVKPFNSYRFPHQIEFEFQPGIREIFLDRLGGKEFCI GVIGRLTEKIASHFGYETIREFEAILLNEPWNFRDDQDIRLIHTFATISISTLRQYGDKYTDYIPKLDRSRAQLYLMSEV PGESINWRDFLEKVAQKYRLSSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYS RLEALHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSIS ELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFENKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQTLENDQIEENLQDLNSEVPGES VKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEA LHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQ KLLSSASVIKGRLNHIFPKFENKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQTLENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWR DFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLF LSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQKYRLSSSQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLSL STSAIRGRLTNIFRKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLE KVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISQAAQKLSLSTSAIRGRLTNIFRKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSE YKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLNSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASV IKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQ EYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISQAAQKLSLSTSAIRGRLTNIFRKFENKNPGLFESRKGSKLEALQSFLFSQYVNL DIPQTIKNNQFQIGEKLQHWSFKTPTVNRRGNIINTRTYTASYFIEILGPDINLEMVAIPGGTFTMGSPESEKYSEDNER PQHQVTVPSFFMGKYPVTQGQWKAIASRTDIKVEGDLDPEPSYFKEPYENIDRWHRPVERVSWNQAVEFCQRLSKLTGRK YRLPSEAEWEYACRAGTSTPFYFGETITPELANYDGKYTYSDGPKGEYRGQTTPVGKFPPNAFGLYDMHGNVHEWCADDR HDNYVGAPTDGSAWINSNTHSDTKSRKILRSGSWYGYPWWCRSGDRNSYFSVEANNIIFGFRLVSVPPQDF >Mature_1911_residues MFEKFIAFIKTKEWQLDSMQIAEVLWFVHQVSEQKQEENNSQNLVSSNTEELAENFDQSYDFQLSKTASIQQPKKTPTRS SSSQYPLTTSSSNKSQNTEIQPTSLTTEKLPIKLPDIAILRNTLELSRLIKPFKQKVNSRVAQELDVNETAKISAELSTL NFPRYFPVLTPKKERWLDVVLLIEDSDSMILWQSLLPEVRDFLEHLGAFRDIKLYRIKWDNNSENLQIYPFHSPSLTLSP QELNSSDHRRLILMLSDCISLAWINQKFINILQKWATKEKLTILNPFPERMWENTNLCYAIRLRLGNNKKQNSTQKWDAI PIEYWQEKYLNQQTVKLPILNLEPKSMAAWVNVMVGKGISWCAGAGLGLELMGPEPEEEEEPLTPREQINNFYATFSKEA WQLIQWLSAIPINLSTIRLIQRALLPKSTQINVAEVLMGGLLSPVKPFNSYRFPHQIEFEFQPGIREIFLDRLGGKEFCI GVIGRLTEKIASHFGYETIREFEAILLNEPWNFRDDQDIRLIHTFATISISTLRQYGDKYTDYIPKLDRSRAQLYLMSEV PGESINWRDFLEKVAQKYRLSSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYS RLEALHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSIS ELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFENKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQTLENDQIEENLQDLNSEVPGES VKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEA LHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQ KLLSSASVIKGRLNHIFPKFENKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQTLENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWR DFLEKVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASVIKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLF LSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQKYRLSSSQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLSL STSAIRGRLTNIFRKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLE KVAQEYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISQAAQKLSLSTSAIRGRLTNIFRKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSE YKNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQEYDLNSIQKEILINLFPSSQEFLSISELAQKLLSSASV IKGRLNHIFPKFESKNPDLFASQKYSRLEALHLFLSSEYVNSYIPQILENDQIEENLQDLNSEVPGESVKWRDFLEKVAQ EYDLTSIQKEILINLFPSSQEFLSISQAAQKLSLSTSAIRGRLTNIFRKFENKNPGLFESRKGSKLEALQSFLFSQYVNL DIPQTIKNNQFQIGEKLQHWSFKTPTVNRRGNIINTRTYTASYFIEILGPDINLEMVAIPGGTFTMGSPESEKYSEDNER PQHQVTVPSFFMGKYPVTQGQWKAIASRTDIKVEGDLDPEPSYFKEPYENIDRWHRPVERVSWNQAVEFCQRLSKLTGRK YRLPSEAEWEYACRAGTSTPFYFGETITPELANYDGKYTYSDGPKGEYRGQTTPVGKFPPNAFGLYDMHGNVHEWCADDR HDNYVGAPTDGSAWINSNTHSDTKSRKILRSGSWYGYPWWCRSGDRNSYFSVEANNIIFGFRLVSVPPQDF
Specific function: Together with the serine/threonine kinase pknD, may play a role in the specific interactions with host proteins during intracellular growth [H]
COG id: COG1262
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI257470975, Length=199, Percent_Identity=34.1708542713568, Blast_Score=113, Evalue=2e-24, Organism=Homo sapiens, GI38202250, Length=223, Percent_Identity=30.4932735426009, Blast_Score=105, Evalue=3e-22, Organism=Homo sapiens, GI257470977, Length=223, Percent_Identity=30.4932735426009, Blast_Score=105, Evalue=4e-22, Organism=Homo sapiens, GI194248087, Length=254, Percent_Identity=29.5275590551181, Blast_Score=94, Evalue=1e-18, Organism=Homo sapiens, GI194248088, Length=269, Percent_Identity=28.2527881040892, Blast_Score=90, Evalue=3e-17, Organism=Homo sapiens, GI226437577, Length=151, Percent_Identity=34.4370860927152, Blast_Score=75, Evalue=5e-13, Organism=Drosophila melanogaster, GI20130397, Length=303, Percent_Identity=29.042904290429, Blast_Score=88, Evalue=5e-17,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR016187 - InterPro: IPR011009 - InterPro: IPR000719 - InterPro: IPR017442 - InterPro: IPR005532 [H]
Pfam domain/function: PF03781 DUF323; PF00069 Pkinase [H]
EC number: =2.7.11.1 [H]
Molecular weight: Translated: 220896; Mature: 220896
Theoretical pI: Translated: 5.11; Mature: 5.11
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 1.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFEKFIAFIKTKEWQLDSMQIAEVLWFVHQVSEQKQEENNSQNLVSSNTEELAENFDQSY CHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCCC DFQLSKTASIQQPKKTPTRSSSSQYPLTTSSSNKSQNTEIQPTSLTTEKLPIKLPDIAIL CCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH RNTLELSRLIKPFKQKVNSRVAQELDVNETAKISAELSTLNFPRYFPVLTPKKERWLDVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE LLIEDSDSMILWQSLLPEVRDFLEHLGAFRDIKLYRIKWDNNSENLQIYPFHSPSLTLSP EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCEEECH QELNSSDHRRLILMLSDCISLAWINQKFINILQKWATKEKLTILNPFPERMWENTNLCYA HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHCCCCCEEEE IRLRLGNNKKQNSTQKWDAIPIEYWQEKYLNQQTVKLPILNLEPKSMAAWVNVMVGKGIS EEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCH WCAGAGLGLELMGPEPEEEEEPLTPREQINNFYATFSKEAWQLIQWLSAIPINLSTIRLI HHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH QRALLPKSTQINVAEVLMGGLLSPVKPFNSYRFPHQIEFEFQPGIREIFLDRLGGKEFCI 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