Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 113475698

Identifier: 113475698

GI number: 113475698

Start: 3187425

End: 3189575

Strand: Direct

Name: 113475698

Synonym: Tery_2045

Alternate gene names: NA

Gene position: 3187425-3189575 (Clockwise)

Preceding gene: 113475697

Following gene: 113475699

Centisome position: 41.13

GC content: 38.77

Gene sequence:

>2151_bases
ATGCTGGATAATATTTCTGAAATCAAAATGCATCGAGTACGATGGGTAGTTACACTGAGTTGGTGTCTCCTAATTATTTC
ATTATTCTATGATCCACTATCCACTCAGCTTACAGAACCTTCCAATGCAGTAAGCCCATTCAGACTCAATACAGAAAACT
GTGTCCTGTTACAAGGAAAATGTATTGAAGAGACACCCTATGCAATGGGAGCTGCTATTTTTTGGGGCATGGTCGTACCA
ACTTCAATTTTGATTTTGCTTGTGTTAGGACACGAATTTTGGCGACGCATTTGTCCCCTATCCTTTATTTCACAAATTCC
TCGTGCTTTGGGATGGGAACGTAAACGCGATCGCATCAGTAAAACAGGTAAGGTACGCAAGGAATTGGTCAAAGTTTCCA
AAAATTCATGGCTAGCTCAGAATCATCTTTACCTACAATTTGGCCTTTTCTTTGTAGGGCTGTGTAGCCGTATTCTTTTT
GTTAACTCTAATCGTTTTGCTTTAGGTTTGTTTTTAATACTTACCATTATTGCAGCAATAACAGTCGGTTTCCTCTATGG
GGGTAAGGCTTGGTGTCAGTATATTTGTCCGATGGCTCCGGTACAAAAAATTTATGCAGAACCAAGAGGACTTTTTAATA
GTACTGCTCACAAGGGCGATCGCAAACGCATTACCCAATCTATGTGTCGTACAGTAACTCAAGACGGCAAAGAATTGAGT
GCTTGTGTTGCCTGTCAAAGCCCTTGTATTGATATAGACGCCGAATCTTCCTATTGGCATGGTATAAGTAACCCACGGCA
GAAATGGCTCTACTATGCCTATGTTGGTCTTGTAGTTGGATATTTTGTTTATTACTATCTTTATGCGGGGAACTGGGATT
ATTATTTATCGGGTGCTTGGGCTCATGAAGAAAACCAACTGGCTAATTTGCTTAAACCCGGGTATTATTTGTTAGATAAG
CCTTTAGACATTCCTAAACTCGCAGCAGTACCTATAACTCTGAGTTTATTTACCTTTGGTGCTATAGGCATTGGTGATAC
TTTAGAAAAGACTTATAAAGCCTATCATCATCGCCATCATAGACATACAGACCCCCTAATCATTCGACATCGAATGTTTA
CTTTGTGTACATTTTTCATTTTTAATTTCTTTTTTGTTTTTGCAGGGCACAATTTTGTTCACTTGTTGCCATTACCCTTA
CCCAATCTTTTTTCAGTTTTAATAGCTGTATCCAGTAGCTTGTGGCTCTTCAGAACTTGGCAGCGCACTCCTAGTTCTTA
TCACCGAGAAAGTCTTGCCGGTCGGTTGCGAAAACAGCTTAAAAAACTCAATTTGGATAGGGCAAAGTTTTTGGAAGGGC
GATCTATTGAGGACCTTAGTACAAATGAAGTCTATATTATGGCTAAAGTTTGGCCTGATTTTTGCCAAGAGCAACGCCTC
AAAACTTACAAAATTATACTGCGAGATACCATTAATGAGGGTTATGTAAACCCAGCTAATAGTCTGGAAAGCTTCAAGCA
TATGCGGCAAGAACTGGGTGCCTCAGATAAAGATCACAATGCTATCTTAACGGAACTAGGTCAGCAATATCCTGAGCTTT
TCTATTCTCATAAGCTGCGGAATAAAGAAAACACTTCGCGCTTAGAAAGCTATCAAGAAACTCTGCTGGAAATTATCTTA
CTTGCTCAGAAAGCTAACCCAGATAAAACCTGGGTGACTGACTTGATGAAAGTATTTTCTAGGGAAACATCCTTAGAAGT
CTTAGAAGACCTTTTGAAAAGTTTATCTCCAAAAGCTCGTAATTTAGTTCAAGAACTTCGCCAAGAATATAGCATTACTG
CAAATGACGAAGCAGATGCTCTTAAAAACACTGACCCCTATCAGTTGTGGAAGGCGATCGCTGAACGTATTGGTTTGCTA
GAATACATTAGTACTGGGGGAGAAAAAGAAGTCCGCAAAATTTTTGAACAAATTGATACAGATGCTTCAGGGGATATAAG
TTTGTATGAATTAAAAACTTATATCCGTACTATCGATCCCCATGTTACTAATTTTCAAATTGAAAATATGTTGACAGCAG
CAGACACCAATGGAGACTATGTAATTAGTTATGATGAGTTTCAAGAACTCTTTAAATCCTTGAAATATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATATCAGTTGGATACAAAATCCATATGAGCCTACCAGTGTCAAGAAAAAATAGTCTTTTGCTAAAACTGAAGTAATATC
TTGAGAAAAAAACTTTAGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTCTTAATCATTTTTTGTGCATTAATGCTACCTTTGGAAAGCAATAATGCATGAAAAATTACAGGGGTTATCTAAAAAT
AAAACTGTGTCAATAAATAG

Product: signal transduction protein

Products: NA

Alternate protein names: EF Hand Domain Protein; Signal Transduction Protein

Number of amino acids: Translated: 716; Mature: 716

Protein sequence:

>716_residues
MLDNISEIKMHRVRWVVTLSWCLLIISLFYDPLSTQLTEPSNAVSPFRLNTENCVLLQGKCIEETPYAMGAAIFWGMVVP
TSILILLVLGHEFWRRICPLSFISQIPRALGWERKRDRISKTGKVRKELVKVSKNSWLAQNHLYLQFGLFFVGLCSRILF
VNSNRFALGLFLILTIIAAITVGFLYGGKAWCQYICPMAPVQKIYAEPRGLFNSTAHKGDRKRITQSMCRTVTQDGKELS
ACVACQSPCIDIDAESSYWHGISNPRQKWLYYAYVGLVVGYFVYYYLYAGNWDYYLSGAWAHEENQLANLLKPGYYLLDK
PLDIPKLAAVPITLSLFTFGAIGIGDTLEKTYKAYHHRHHRHTDPLIIRHRMFTLCTFFIFNFFFVFAGHNFVHLLPLPL
PNLFSVLIAVSSSLWLFRTWQRTPSSYHRESLAGRLRKQLKKLNLDRAKFLEGRSIEDLSTNEVYIMAKVWPDFCQEQRL
KTYKIILRDTINEGYVNPANSLESFKHMRQELGASDKDHNAILTELGQQYPELFYSHKLRNKENTSRLESYQETLLEIIL
LAQKANPDKTWVTDLMKVFSRETSLEVLEDLLKSLSPKARNLVQELRQEYSITANDEADALKNTDPYQLWKAIAERIGLL
EYISTGGEKEVRKIFEQIDTDASGDISLYELKTYIRTIDPHVTNFQIENMLTAADTNGDYVISYDEFQELFKSLKY

Sequences:

>Translated_716_residues
MLDNISEIKMHRVRWVVTLSWCLLIISLFYDPLSTQLTEPSNAVSPFRLNTENCVLLQGKCIEETPYAMGAAIFWGMVVP
TSILILLVLGHEFWRRICPLSFISQIPRALGWERKRDRISKTGKVRKELVKVSKNSWLAQNHLYLQFGLFFVGLCSRILF
VNSNRFALGLFLILTIIAAITVGFLYGGKAWCQYICPMAPVQKIYAEPRGLFNSTAHKGDRKRITQSMCRTVTQDGKELS
ACVACQSPCIDIDAESSYWHGISNPRQKWLYYAYVGLVVGYFVYYYLYAGNWDYYLSGAWAHEENQLANLLKPGYYLLDK
PLDIPKLAAVPITLSLFTFGAIGIGDTLEKTYKAYHHRHHRHTDPLIIRHRMFTLCTFFIFNFFFVFAGHNFVHLLPLPL
PNLFSVLIAVSSSLWLFRTWQRTPSSYHRESLAGRLRKQLKKLNLDRAKFLEGRSIEDLSTNEVYIMAKVWPDFCQEQRL
KTYKIILRDTINEGYVNPANSLESFKHMRQELGASDKDHNAILTELGQQYPELFYSHKLRNKENTSRLESYQETLLEIIL
LAQKANPDKTWVTDLMKVFSRETSLEVLEDLLKSLSPKARNLVQELRQEYSITANDEADALKNTDPYQLWKAIAERIGLL
EYISTGGEKEVRKIFEQIDTDASGDISLYELKTYIRTIDPHVTNFQIENMLTAADTNGDYVISYDEFQELFKSLKY
>Mature_716_residues
MLDNISEIKMHRVRWVVTLSWCLLIISLFYDPLSTQLTEPSNAVSPFRLNTENCVLLQGKCIEETPYAMGAAIFWGMVVP
TSILILLVLGHEFWRRICPLSFISQIPRALGWERKRDRISKTGKVRKELVKVSKNSWLAQNHLYLQFGLFFVGLCSRILF
VNSNRFALGLFLILTIIAAITVGFLYGGKAWCQYICPMAPVQKIYAEPRGLFNSTAHKGDRKRITQSMCRTVTQDGKELS
ACVACQSPCIDIDAESSYWHGISNPRQKWLYYAYVGLVVGYFVYYYLYAGNWDYYLSGAWAHEENQLANLLKPGYYLLDK
PLDIPKLAAVPITLSLFTFGAIGIGDTLEKTYKAYHHRHHRHTDPLIIRHRMFTLCTFFIFNFFFVFAGHNFVHLLPLPL
PNLFSVLIAVSSSLWLFRTWQRTPSSYHRESLAGRLRKQLKKLNLDRAKFLEGRSIEDLSTNEVYIMAKVWPDFCQEQRL
KTYKIILRDTINEGYVNPANSLESFKHMRQELGASDKDHNAILTELGQQYPELFYSHKLRNKENTSRLESYQETLLEIIL
LAQKANPDKTWVTDLMKVFSRETSLEVLEDLLKSLSPKARNLVQELRQEYSITANDEADALKNTDPYQLWKAIAERIGLL
EYISTGGEKEVRKIFEQIDTDASGDISLYELKTYIRTIDPHVTNFQIENMLTAADTNGDYVISYDEFQELFKSLKY

Specific function: Unknown

COG id: COG5126

COG function: function code TZDR; Ca2+-binding protein (EF-Hand superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82743; Mature: 82743

Theoretical pI: Translated: 8.42; Mature: 8.42

Prosite motif: PS00018 EF_HAND_1 ; PS50222 EF_HAND_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLDNISEIKMHRVRWVVTLSWCLLIISLFYDPLSTQLTEPSNAVSPFRLNTENCVLLQGK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEEECC
CIEETPYAMGAAIFWGMVVPTSILILLVLGHEFWRRICPLSFISQIPRALGWERKRDRIS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
KTGKVRKELVKVSKNSWLAQNHLYLQFGLFFVGLCSRILFVNSNRFALGLFLILTIIAAI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TVGFLYGGKAWCQYICPMAPVQKIYAEPRGLFNSTAHKGDRKRITQSMCRTVTQDGKELS
HHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
ACVACQSPCIDIDAESSYWHGISNPRQKWLYYAYVGLVVGYFVYYYLYAGNWDYYLSGAW
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEE
AHEENQLANLLKPGYYLLDKPLDIPKLAAVPITLSLFTFGAIGIGDTLEKTYKAYHHRHH
CCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
RHTDPLIIRHRMFTLCTFFIFNFFFVFAGHNFVHLLPLPLPNLFSVLIAVSSSLWLFRTW
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QRTPSSYHRESLAGRLRKQLKKLNLDRAKFLEGRSIEDLSTNEVYIMAKVWPDFCQEQRL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHH
KTYKIILRDTINEGYVNPANSLESFKHMRQELGASDKDHNAILTELGQQYPELFYSHKLR
HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKENTSRLESYQETLLEIILLAQKANPDKTWVTDLMKVFSRETSLEVLEDLLKSLSPKAR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHH
NLVQELRQEYSITANDEADALKNTDPYQLWKAIAERIGLLEYISTGGEKEVRKIFEQIDT
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
DASGDISLYELKTYIRTIDPHVTNFQIENMLTAADTNGDYVISYDEFQELFKSLKY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLDNISEIKMHRVRWVVTLSWCLLIISLFYDPLSTQLTEPSNAVSPFRLNTENCVLLQGK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCEEEEECC
CIEETPYAMGAAIFWGMVVPTSILILLVLGHEFWRRICPLSFISQIPRALGWERKRDRIS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
KTGKVRKELVKVSKNSWLAQNHLYLQFGLFFVGLCSRILFVNSNRFALGLFLILTIIAAI
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TVGFLYGGKAWCQYICPMAPVQKIYAEPRGLFNSTAHKGDRKRITQSMCRTVTQDGKELS
HHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
ACVACQSPCIDIDAESSYWHGISNPRQKWLYYAYVGLVVGYFVYYYLYAGNWDYYLSGAW
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEE
AHEENQLANLLKPGYYLLDKPLDIPKLAAVPITLSLFTFGAIGIGDTLEKTYKAYHHRHH
CCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
RHTDPLIIRHRMFTLCTFFIFNFFFVFAGHNFVHLLPLPLPNLFSVLIAVSSSLWLFRTW
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QRTPSSYHRESLAGRLRKQLKKLNLDRAKFLEGRSIEDLSTNEVYIMAKVWPDFCQEQRL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHH
KTYKIILRDTINEGYVNPANSLESFKHMRQELGASDKDHNAILTELGQQYPELFYSHKLR
HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NKENTSRLESYQETLLEIILLAQKANPDKTWVTDLMKVFSRETSLEVLEDLLKSLSPKAR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHH
NLVQELRQEYSITANDEADALKNTDPYQLWKAIAERIGLLEYISTGGEKEVRKIFEQIDT
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
DASGDISLYELKTYIRTIDPHVTNFQIENMLTAADTNGDYVISYDEFQELFKSLKY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA