| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is dnaE-N [H]
Identifier: 113475557
GI number: 113475557
Start: 2888237
End: 2896291
Strand: Direct
Name: dnaE-N [H]
Synonym: Tery_1889
Alternate gene names: 113475557
Gene position: 2888237-2896291 (Clockwise)
Preceding gene: 113475556
Following gene: 113475563
Centisome position: 37.27
GC content: 36.09
Gene sequence:
>8055_bases ATGTCATTTGTTGGCCTACATATTCATAGCGACTATAGCCTATTAGACGGAGCATCTCAATTACCACAATTAATAGATAG AGCAGTAGAACTAGGAATGCCAGCCATTGCCCTGACAGACCACGGAGTTATGTATGGGGCTATTCAATTAATTAAACTGT GTAGAAACAAAAATATTAAACCCATAATTGGGAATGAAATGTATGTGATAAAAGGAGATATTGAGAAACAACAAAGAGGG AAAAAATTTCATCAGGTCGTATTAGCAAAAAATACTCAAGGCTATAAAAATTTAGTCAAATTAACAACTCTTTCTCATCT CCATGGTTTTCAAGGAAAAGGTATATTTGCTCGGCCTTGTATTAATAAAGAATTGTTAGAAAAATATCACGAAGGTCTCA TAGTAACTAGCGGGTGTTTGGCGGGAGAAGTACCTCAAAATATTATGCGGGGAGAATTAGAAGAAGCCAAGAAAATAGCT AAATGGTACAAAGATTTATTTGGGGAAGATTATTATCTAGAAATACAAGACCATGGCTTCCAGGAAGATAGAGTTGTAAA TACTGGAATTGTCACAATTGCTAAAAAATTAAAGATAAAAATAGTAGCAACAAACGACTCTCATTTTATTTCTTGTAGAG ATGTAGAAGCACACGACGCTTTGTTGTGTATTAACACTCAAAAATTAATTGCTGAAGAAAAGCGGATGCGCTATAGTGGC ACCGAATATTTAAAGTCTGCTGAAGAAATGAAGCAACTGTTTAGAGACCACTTAGAAAATGAAGTTATAGAAGAGGCGAT CGCTAATACATTAGAAGTAGCAAATAAAGTTAAAGCTTATGAAGGAATTTTAGGAGAACCAAGAATTCCTGATTATCCAA TTCCACCAGATCATAATGCTGATACTTACCTGGAAAAACTAGCTTGGTCAGGATTATTAGAAAGGCTAAAACTGAAACAA 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Upstream 100 bases:
>100_bases ACCTTGCAGCAATTAGTTTTCAGTCAAACTAATAGTTAAATGCTGACCGTTAATATATAAAATAAAGCTATCTCAAATAT TTAATCTAAAATCTAAAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTGCCTATTGTTAGTTAATATTATTCAACAAGGTAGTCCTATAGTATAACCTGGTAGGGAGTCTAAGTATCTATGAC TCTAAGGGTTTTTAGGATTA
Product: DNA polymerase III subunit alpha / intein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2684; Mature: 2683
Protein sequence:
>2684_residues MSFVGLHIHSDYSLLDGASQLPQLIDRAVELGMPAIALTDHGVMYGAIQLIKLCRNKNIKPIIGNEMYVIKGDIEKQQRG KKFHQVVLAKNTQGYKNLVKLTTLSHLHGFQGKGIFARPCINKELLEKYHEGLIVTSGCLAGEVPQNIMRGELEEAKKIA KWYKDLFGEDYYLEIQDHGFQEDRVVNTGIVTIAKKLKIKIVATNDSHFISCRDVEAHDALLCINTQKLIAEEKRMRYSG TEYLKSAEEMKQLFRDHLENEVIEEAIANTLEVANKVKAYEGILGEPRIPDYPIPPDHNADTYLEKLAWSGLLERLKLKQ KSEISPIYKERMETELKVLQDKGFSTYFLVVWDYIKYARDNNIPVGPGRGSAAGSLVAYSLRITNIDPVHHGLLFERFLN PERKSMPDIDTDFCIENRDVMIKYVTQRYGEERVAQIITFNRMTSKAVLKDVGRVLGISFGEANKMAKLIPVARGKPAKL KVMISDETPSPEFKKAYDNQETPIEDNKAGKISTISVRQWIDMAIRIEGTNKTFGVHAAGVVISKEPLDEIVPLQRNNDG SVITQYHMEDIESLGLLKMDFLGLKNLTIIQNTAELIKKNHHLPLVPDDLPANERKAIEILAKGNTKKMPEDVKKTYDLI KSGDLEGVFQLESSGMVDVVKKLKPTSIEDISSILALYRPGPLDAGLIPKFIDRKHGSEKIEYQHPKLEPILKETYGVLC LPKGTLIDQPDGSREAIENIKSGEVILTSDGRKVWEAKVAKQWRSGVREILKITLSSGTVIYSGKNHRFLTPEGDKFAWE LQPQVGRVKNALIYGSAVYEKWQVSSNQKQLRKNDAYLLGLLVGKSNLISSTPNVSFSTQGAITWGKNLIDETWGGEAKH YFDTSRRQVYLNFNTQSKPTALTEFLDGIYGAQNWQVESVAKHLPEDILDYSEKDRIDLLRGLWDSGGFDGKKLLYYPGS SPQLLSQVCQLLGSLKIDYYLADNSVRISDRSRFIDILENYQMSSQQKEEISESYLPASSWFLKGGSENNIQKTDSSSRK TGEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWEKVGENHLLSSWFLTDASENNIQKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSAQTPA ENWEKVRENHLLSSWFLTNASEIYLQRIDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSVQTPAENWEKVRENHLLSSWFLTDASEN NIQKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWEKVRENHLLSSWFLTNASENNIQKTDSSSRKTGEASQQKATLF TQNLFSAQTPAENWKKSRKNHLPSSWFLKGGSENNIQKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWEKVRENHLL SSWFLKDASENNIQKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWEKVRENHLLSSWFLTDASENNIQKTDSSSRKT GEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWEKVRENHLLSSWFLTDASENNIQKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSAQTPAE NWEKVRENHLLSSWFLTNASENNIQKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWKKARENHLLSSWFLTNASEIY LQRTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSVQTPAENWKKARENHLLSSWFLTNASEIYLQRTDSSSRKTGGASQQKATLFN QNLFSVQTPAENWEKVRENYLLSSWFLTNASEIYLQRTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSVQTPAENWKKARENHLLS SWFLTNASEIYLQRTDSSSRKTGGASQQKATLFNQNLFSVQTPAENWKKARENHLLSSWFLTNASEIYLQRTDSSSRKTV EASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWEKVRENYLLSSWFLTNASEIYLQRIDSSSRKTGEACQQKATLFNQNLFSAQTPAEN WKKVRENHLLSSWFLTDASENNIQKTDSSSRKTVEASQQKATLFTQNLFSAQTPAENWKKSRKNHLPSSWFLTDASENNI QKTDSSSRKTGEASQQKATLFTQNLFSVQTPELENWECEKTYLQDVRVVHVVSVEEVGEAECFDLEMEDQSSPYFLAEGV VVHNCYQEQIMKMAQDLAGYSLGEADLLRRCLSGSTKVIDAATGNLFSLKEIAAQPEYWLSRKVFSLDLKSQQVVQQPIT EIHPNGVRDVWQITTRTNRKVCATDDHLFYTVLGWKPLKDFSVGDRLGLPNKIPINYRSQISDSKVKFTAYLIGEGYLYT NSFSCSYFCNSDGELIADFYGCAEELFGSSAPIEKQLHLGNKSVIYVRIGLISGLKNWVDSYLQCANSRVQEIPNWIFSL SQSQLQLFLGILWSTSGIFDETIGYTYYSSNSEVLVRQVQHLFLRLGIVSLFNVNKVKGQGELDVSYVVEVRGREDMLKF YKLIKPYLSSYKQGLCESCYLVIKYQQSYQFKYFLTPDFFDLIVKAKKASSMTRALGVCGGEISSVWNFQNTSNRSLSFD KFNNFSTVLADEELTAIANSDVFWDEIISIEYIGKEEVFDLTIPETHNFIANDFIVHNCMGKKKVSEMEKHREKFIDGAA QRGVSSVVAKDLFEQMIKFAEYCLTYETEIMTVEYGPLPIGKIVEYRIECTVYTVDKNGYIYTQPIAQWHNRGMQEVYEY SLEDGTVIRATPEHKFMTEDGQMLPIDEIFERNLDLKCLGTLEL
Sequences:
>Translated_2684_residues MSFVGLHIHSDYSLLDGASQLPQLIDRAVELGMPAIALTDHGVMYGAIQLIKLCRNKNIKPIIGNEMYVIKGDIEKQQRG KKFHQVVLAKNTQGYKNLVKLTTLSHLHGFQGKGIFARPCINKELLEKYHEGLIVTSGCLAGEVPQNIMRGELEEAKKIA KWYKDLFGEDYYLEIQDHGFQEDRVVNTGIVTIAKKLKIKIVATNDSHFISCRDVEAHDALLCINTQKLIAEEKRMRYSG TEYLKSAEEMKQLFRDHLENEVIEEAIANTLEVANKVKAYEGILGEPRIPDYPIPPDHNADTYLEKLAWSGLLERLKLKQ KSEISPIYKERMETELKVLQDKGFSTYFLVVWDYIKYARDNNIPVGPGRGSAAGSLVAYSLRITNIDPVHHGLLFERFLN PERKSMPDIDTDFCIENRDVMIKYVTQRYGEERVAQIITFNRMTSKAVLKDVGRVLGISFGEANKMAKLIPVARGKPAKL KVMISDETPSPEFKKAYDNQETPIEDNKAGKISTISVRQWIDMAIRIEGTNKTFGVHAAGVVISKEPLDEIVPLQRNNDG SVITQYHMEDIESLGLLKMDFLGLKNLTIIQNTAELIKKNHHLPLVPDDLPANERKAIEILAKGNTKKMPEDVKKTYDLI KSGDLEGVFQLESSGMVDVVKKLKPTSIEDISSILALYRPGPLDAGLIPKFIDRKHGSEKIEYQHPKLEPILKETYGVLC LPKGTLIDQPDGSREAIENIKSGEVILTSDGRKVWEAKVAKQWRSGVREILKITLSSGTVIYSGKNHRFLTPEGDKFAWE LQPQVGRVKNALIYGSAVYEKWQVSSNQKQLRKNDAYLLGLLVGKSNLISSTPNVSFSTQGAITWGKNLIDETWGGEAKH YFDTSRRQVYLNFNTQSKPTALTEFLDGIYGAQNWQVESVAKHLPEDILDYSEKDRIDLLRGLWDSGGFDGKKLLYYPGS 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Specific function: DNA polymerase III is a complex, multichain enzyme responsible for most of the replicative synthesis in bacteria. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity. The alpha chain is the DNA polymerase [H]
COG id: COG0587
COG function: function code L; DNA polymerase III, alpha subunit
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [H]
Metaboloic importance: Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the DNA polymerase type-C family. DnaE subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786381, Length=732, Percent_Identity=38.6612021857923, Blast_Score=497, Evalue=1e-141,
Paralogues:
None
Copy number: NA
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