Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113475156

Identifier: 113475156

GI number: 113475156

Start: 2198110

End: 2201106

Strand: Direct

Name: 113475156

Synonym: Tery_1454

Alternate gene names: NA

Gene position: 2198110-2201106 (Clockwise)

Preceding gene: 113475155

Following gene: 113475162

Centisome position: 28.36

GC content: 34.1

Gene sequence:

>2997_bases
ATGAAAGTAGTTAAAATAACTACCCTCCATTATCAAGACGATCGCTCAGATAAAATTTATGAAGTCGAGCTATTTGAAGT
TACCAAAAATCAGCATTATATGGTAAATTTTCACTACGGTCGTCGCGGTTCACGATTAAGAAATGGTATCAAAACAGATG
GCTATGTTCCCTTGGTAGAAGCTGAAAAAGTTTTCCAGAAATTAGTACAAGAAAAAATTAAAGGTGGTTATCGTGACATT
ACTGGAGTTTCCCTAAATTCTCTCCCCAAAAAAACAGAAATTCCATCTCAATATCACCTCCGCAAACAAGCAATTTTGCA
ACATTTAGCTAGAGAAAAAACTAGTCGTCCTCTGGAAAAAATTATTTGGCGAGCCGGAGAATTAAAAATAGCTGAAGCTA
CTCCCATGTTAATTAATTTTATCGGTACTGGTACAAATTTCAGAGATTATTGTATTGCTTGGTCTTTGGGTTGGTGTGGT
GGAAAAGATGCCCTCGCAGCTTTAATTAAACTGTATGAAAATCCAGCAACTTCAGGGTTTGTTAGTCGGATAGTTTTTGA
AGGAATTTTGAAATTGTCTGACCCTGAAGTTAGAGTAAAATTGCAGACAGAAATAATCAATTTTTTATCCCCAGAATTAA
GAGATTTGGCTCGTCATGGAACGGCAGAAAAATTTGAGGAAGTATTTAACCAACTTCTGGGGGAAGGTAACAGTTTCTCT
GACATAGAAAGGCTATATCAAATAGATAATAAATATGTGCGACCTGCACTTTTAAATTTTCTCCGCACCGCTCCATTTGA
AGAAAACTTTTTTCAACCTATTCGTCATATTTTTAAAATAGCTGAATATCGTCGAGACCCAGATGTTTTTGCCATTCTTA
CTTATAGATTTGACAAAGAAAATACAACTGGCTGGAAAGTTTATACTGAAAAAACTCGTAATTATTTACGTAAACGAATT
TGGCGAACTTTAGAGAAACTTGGCATAGATAATGATATTGAATATATTAATTTGGCGGTAGGTGTTTTACTGCAATATTC
TGATACTGATGCTATCTATTATTCTCAACTAGAAAATAAATTTGTTCATTTTTTAATCTTATCTCATATTCTTTACACAA
ATCATTCTCGTTATTATTTATCTTATGATCGACTAAATTGGTCCTTTGGTGGCTACTTTGGAAGAAGTAATAAGGAGGTA
AAACAACGGGGAGAAGCTTTTCCAGAATTATGGGAACAACAACCGGAAATATTGGTAAAATTATTATTGGAAAGTAACTG
TCACGCCGTACATAATTTTGCTGTCAGAATATTGGAAAATTGCCACAGTTTTCATCCCAAATTTGATATTAAAACTCTCA
TAGAATTTATCAAAAAACCTTATGATGTTACAGCTAGATTTGGATTTGAATTAGCTATAGAAAGATATAAAAAAATAGAA
CCAGATATTGACTTAGTTTTAGCATCAGCAAATAGTGTTTTACCTAAAGCACATACAGCAGCTTATCGCTGGATAAATGC
ACAACCAAATAGATTTATGAATGCTAATTTTCTGGCGGGTTTAATCACTAGTCAAGAACCAGAAACTCGTGAATTTTCTG
AAACATTACTCAGGTCACATAGTCTTACGGAGGGTACTGCTAAAGTATTAATTGGCAAGGTTATTGCTGAGTTATTAACT
TTCAAAGAAGAAACCCCCTGGATAGAAGAAGTCGCCCTAGAAATTGCTAATATATTGTTGAGTTATTTCAGCGATCGCCT
AAAACAATTAGGGATGGGAGTTATTATAGATTTACTCCAACATCCACTAGTAGAAATTAAAGAATTAGGAGCAAATATTC
TAGAAAAACATGAAACTCCTCCGGCTGAATTACCTACTAATTTAATTGAATCATTGATTGAATCTCCCTATCCAAAAATT
CGGGAAATTGGAATTAGAATATTTTGGCAGTTACCAGAGGAAGTTTTGATAAGTTCTCAAAGAGATTTAATTATTGCTAT
GGCAGTTAGTTATGAGGAGGATATTCGGAGTTTAACTCAACCTATTATTCAGGATTTGACAAATAAATATTCAAATTTTG
CCAATCACTTAGCCAGGGAATTTATTGATATTTTGGTAATACCAGAAAAGTCAGAAGGAGTTCACGATTATTTAGTGAAT
TTATTGAGGAATGATATTCCGGGATGGCAAGAGAATATTAGTTTAGAAAAAAATCTGCAGTTATTAAGAACTAAATCTGA
ACTCGCTCAAGAATTAGCAGGTTTAATATTAAAGGCAAATTATCGGCAATGGGCAGGAGATTTTAAAGCAATTGAAATTG
TGAAGTTGGCAAATTATAAAGTTGTAGCAGTTAGACAAGCTGCATGGCAAATATTTTTGGAAAATATTCCTCATTTTCGG
AGCAATTCTCAGGAGATGTTAGCTGCAGTTAAATTGTTAGAATCTGATTGGGAAGATTCTCGTAATTTTGCTTGGGAAAT
ATTTCAATCTTATTTTGATAAAATTGATTGGTCTCCGGAAATAATGGTGAGTATTTGTGATAGTTTACGAGATGATGTAA
GAGAGTTTGGGCGTCAATTAGTGATTCGTTATTTTGAGGATAGTTACGGTCAAGATTATTTGTTAAAGTTTAGCGAACAT
CCTTCAGGAGATATGCAGGTTTTTGCGACGAACTTTTTGTCAGATTATGCAGCAGATAATCTGGAAAGATTACGAGATTT
ACAACCTTATTTTATTAGTGTTTTGTGTCAGGTAAATAAGGGTCGGGTAGCAAAGCAGCGAGTATTTACTTTTTTAGAGC
AGGAGGCAGAAAAAAGTGAGGCTGCGGCGCGAACTGTGGCTGAAATTTTAACTAGGCAATCTCTGACTATTGCTATTGGG
GATAAGGCAAAGGCGATCGAAATTATGTTGAAAATTCATAATAGTTATCCAGAGGTTTCTTTGCCAATTTCTGTTAAGTC
TGTTTCTGAGGTTCGGGGTTATAAAAGAAGTCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATTAACAACTAATTCTATTTTTGCGAGGACATCAGTTACTATATATAAATTATTGATTCAATCTACCCATCTTTACC
AATAAAACTTAAAAAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGCTCAAAAGATGTTGAACCAGGACTTAGCGTTGGGAAGTAAAATTGACTTCGGAACTGAACTTGGAGAGATTCGAGTT
GAAATTTCCTTTCAAATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 998; Mature: 998

Protein sequence:

>998_residues
MKVVKITTLHYQDDRSDKIYEVELFEVTKNQHYMVNFHYGRRGSRLRNGIKTDGYVPLVEAEKVFQKLVQEKIKGGYRDI
TGVSLNSLPKKTEIPSQYHLRKQAILQHLAREKTSRPLEKIIWRAGELKIAEATPMLINFIGTGTNFRDYCIAWSLGWCG
GKDALAALIKLYENPATSGFVSRIVFEGILKLSDPEVRVKLQTEIINFLSPELRDLARHGTAEKFEEVFNQLLGEGNSFS
DIERLYQIDNKYVRPALLNFLRTAPFEENFFQPIRHIFKIAEYRRDPDVFAILTYRFDKENTTGWKVYTEKTRNYLRKRI
WRTLEKLGIDNDIEYINLAVGVLLQYSDTDAIYYSQLENKFVHFLILSHILYTNHSRYYLSYDRLNWSFGGYFGRSNKEV
KQRGEAFPELWEQQPEILVKLLLESNCHAVHNFAVRILENCHSFHPKFDIKTLIEFIKKPYDVTARFGFELAIERYKKIE
PDIDLVLASANSVLPKAHTAAYRWINAQPNRFMNANFLAGLITSQEPETREFSETLLRSHSLTEGTAKVLIGKVIAELLT
FKEETPWIEEVALEIANILLSYFSDRLKQLGMGVIIDLLQHPLVEIKELGANILEKHETPPAELPTNLIESLIESPYPKI
REIGIRIFWQLPEEVLISSQRDLIIAMAVSYEEDIRSLTQPIIQDLTNKYSNFANHLAREFIDILVIPEKSEGVHDYLVN
LLRNDIPGWQENISLEKNLQLLRTKSELAQELAGLILKANYRQWAGDFKAIEIVKLANYKVVAVRQAAWQIFLENIPHFR
SNSQEMLAAVKLLESDWEDSRNFAWEIFQSYFDKIDWSPEIMVSICDSLRDDVREFGRQLVIRYFEDSYGQDYLLKFSEH
PSGDMQVFATNFLSDYAADNLERLRDLQPYFISVLCQVNKGRVAKQRVFTFLEQEAEKSEAAARTVAEILTRQSLTIAIG
DKAKAIEIMLKIHNSYPEVSLPISVKSVSEVRGYKRSQ

Sequences:

>Translated_998_residues
MKVVKITTLHYQDDRSDKIYEVELFEVTKNQHYMVNFHYGRRGSRLRNGIKTDGYVPLVEAEKVFQKLVQEKIKGGYRDI
TGVSLNSLPKKTEIPSQYHLRKQAILQHLAREKTSRPLEKIIWRAGELKIAEATPMLINFIGTGTNFRDYCIAWSLGWCG
GKDALAALIKLYENPATSGFVSRIVFEGILKLSDPEVRVKLQTEIINFLSPELRDLARHGTAEKFEEVFNQLLGEGNSFS
DIERLYQIDNKYVRPALLNFLRTAPFEENFFQPIRHIFKIAEYRRDPDVFAILTYRFDKENTTGWKVYTEKTRNYLRKRI
WRTLEKLGIDNDIEYINLAVGVLLQYSDTDAIYYSQLENKFVHFLILSHILYTNHSRYYLSYDRLNWSFGGYFGRSNKEV
KQRGEAFPELWEQQPEILVKLLLESNCHAVHNFAVRILENCHSFHPKFDIKTLIEFIKKPYDVTARFGFELAIERYKKIE
PDIDLVLASANSVLPKAHTAAYRWINAQPNRFMNANFLAGLITSQEPETREFSETLLRSHSLTEGTAKVLIGKVIAELLT
FKEETPWIEEVALEIANILLSYFSDRLKQLGMGVIIDLLQHPLVEIKELGANILEKHETPPAELPTNLIESLIESPYPKI
REIGIRIFWQLPEEVLISSQRDLIIAMAVSYEEDIRSLTQPIIQDLTNKYSNFANHLAREFIDILVIPEKSEGVHDYLVN
LLRNDIPGWQENISLEKNLQLLRTKSELAQELAGLILKANYRQWAGDFKAIEIVKLANYKVVAVRQAAWQIFLENIPHFR
SNSQEMLAAVKLLESDWEDSRNFAWEIFQSYFDKIDWSPEIMVSICDSLRDDVREFGRQLVIRYFEDSYGQDYLLKFSEH
PSGDMQVFATNFLSDYAADNLERLRDLQPYFISVLCQVNKGRVAKQRVFTFLEQEAEKSEAAARTVAEILTRQSLTIAIG
DKAKAIEIMLKIHNSYPEVSLPISVKSVSEVRGYKRSQ
>Mature_998_residues
MKVVKITTLHYQDDRSDKIYEVELFEVTKNQHYMVNFHYGRRGSRLRNGIKTDGYVPLVEAEKVFQKLVQEKIKGGYRDI
TGVSLNSLPKKTEIPSQYHLRKQAILQHLAREKTSRPLEKIIWRAGELKIAEATPMLINFIGTGTNFRDYCIAWSLGWCG
GKDALAALIKLYENPATSGFVSRIVFEGILKLSDPEVRVKLQTEIINFLSPELRDLARHGTAEKFEEVFNQLLGEGNSFS
DIERLYQIDNKYVRPALLNFLRTAPFEENFFQPIRHIFKIAEYRRDPDVFAILTYRFDKENTTGWKVYTEKTRNYLRKRI
WRTLEKLGIDNDIEYINLAVGVLLQYSDTDAIYYSQLENKFVHFLILSHILYTNHSRYYLSYDRLNWSFGGYFGRSNKEV
KQRGEAFPELWEQQPEILVKLLLESNCHAVHNFAVRILENCHSFHPKFDIKTLIEFIKKPYDVTARFGFELAIERYKKIE
PDIDLVLASANSVLPKAHTAAYRWINAQPNRFMNANFLAGLITSQEPETREFSETLLRSHSLTEGTAKVLIGKVIAELLT
FKEETPWIEEVALEIANILLSYFSDRLKQLGMGVIIDLLQHPLVEIKELGANILEKHETPPAELPTNLIESLIESPYPKI
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LLRNDIPGWQENISLEKNLQLLRTKSELAQELAGLILKANYRQWAGDFKAIEIVKLANYKVVAVRQAAWQIFLENIPHFR
SNSQEMLAAVKLLESDWEDSRNFAWEIFQSYFDKIDWSPEIMVSICDSLRDDVREFGRQLVIRYFEDSYGQDYLLKFSEH
PSGDMQVFATNFLSDYAADNLERLRDLQPYFISVLCQVNKGRVAKQRVFTFLEQEAEKSEAAARTVAEILTRQSLTIAIG
DKAKAIEIMLKIHNSYPEVSLPISVKSVSEVRGYKRSQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 115716; Mature: 115716

Theoretical pI: Translated: 6.63; Mature: 6.63

Prosite motif: PS00392 DDC_GAD_HDC_YDC ; PS00237 G_PROTEIN_RECEP_F1_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKVVKITTLHYQDDRSDKIYEVELFEVTKNQHYMVNFHYGRRGSRLRNGIKTDGYVPLVE
CCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCCCEEHHH
AEKVFQKLVQEKIKGGYRDITGVSLNSLPKKTEIPSQYHLRKQAILQHLAREKTSRPLEK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
IIWRAGELKIAEATPMLINFIGTGTNFRDYCIAWSLGWCGGKDALAALIKLYENPATSGF
HHHCCCCEEEECCCHHHHHEECCCCCCCHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
VSRIVFEGILKLSDPEVRVKLQTEIINFLSPELRDLARHGTAEKFEEVFNQLLGEGNSFS
HHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
DIERLYQIDNKYVRPALLNFLRTAPFEENFFQPIRHIFKIAEYRRDPDVFAILTYRFDKE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCC
NTTGWKVYTEKTRNYLRKRIWRTLEKLGIDNDIEYINLAVGVLLQYSDTDAIYYSQLENK
CCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHH
LLLESNCHAVHNFAVRILENCHSFHPKFDIKTLIEFIKKPYDVTARFGFELAIERYKKIE
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDIDLVLASANSVLPKAHTAAYRWINAQPNRFMNANFLAGLITSQEPETREFSETLLRSH
CCHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHC
SLTEGTAKVLIGKVIAELLTFKEETPWIEEVALEIANILLSYFSDRLKQLGMGVIIDLLQ
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HPLVEIKELGANILEKHETPPAELPTNLIESLIESPYPKIREIGIRIFWQLPEEVLISSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCHHHHHCCC
RDLIIAMAVSYEEDIRSLTQPIIQDLTNKYSNFANHLAREFIDILVIPEKSEGVHDYLVN
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHH
LLRNDIPGWQENISLEKNLQLLRTKSELAQELAGLILKANYRQWAGDFKAIEIVKLANYK
HHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHEEEEEECCEE
VVAVRQAAWQIFLENIPHFRSNSQEMLAAVKLLESDWEDSRNFAWEIFQSYFDKIDWSPE
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IMVSICDSLRDDVREFGRQLVIRYFEDSYGQDYLLKFSEHPSGDMQVFATNFLSDYAADN
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LERLRDLQPYFISVLCQVNKGRVAKQRVFTFLEQEAEKSEAAARTVAEILTRQSLTIAIG
HHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
DKAKAIEIMLKIHNSYPEVSLPISVKSVSEVRGYKRSQ
CCHHHHHHHHHHHCCCCCEECCEEHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKVVKITTLHYQDDRSDKIYEVELFEVTKNQHYMVNFHYGRRGSRLRNGIKTDGYVPLVE
CCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCCCEEHHH
AEKVFQKLVQEKIKGGYRDITGVSLNSLPKKTEIPSQYHLRKQAILQHLAREKTSRPLEK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
IIWRAGELKIAEATPMLINFIGTGTNFRDYCIAWSLGWCGGKDALAALIKLYENPATSGF
HHHCCCCEEEECCCHHHHHEECCCCCCCHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
VSRIVFEGILKLSDPEVRVKLQTEIINFLSPELRDLARHGTAEKFEEVFNQLLGEGNSFS
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CCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHH
FVHFLILSHILYTNHSRYYLSYDRLNWSFGGYFGRSNKEVKQRGEAFPELWEQQPEILVK
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LLLESNCHAVHNFAVRILENCHSFHPKFDIKTLIEFIKKPYDVTARFGFELAIERYKKIE
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCHHHHHCCC
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HHHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHEEEEEECCEE
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EEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IMVSICDSLRDDVREFGRQLVIRYFEDSYGQDYLLKFSEHPSGDMQVFATNFLSDYAADN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LERLRDLQPYFISVLCQVNKGRVAKQRVFTFLEQEAEKSEAAARTVAEILTRQSLTIAIG
HHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
DKAKAIEIMLKIHNSYPEVSLPISVKSVSEVRGYKRSQ
CCHHHHHHHHHHHCCCCCEECCEEHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA