Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113474899

Identifier: 113474899

GI number: 113474899

Start: 1771236

End: 1772108

Strand: Direct

Name: 113474899

Synonym: Tery_1125

Alternate gene names: NA

Gene position: 1771236-1772108 (Clockwise)

Preceding gene: 113474896

Following gene: 113474907

Centisome position: 22.85

GC content: 34.48

Gene sequence:

>873_bases
ATGTTTAAGAAAATAATTTGGGGCATAATTAGTGGAACTGTTTGGGGGGTAGTATTTTGTGCTGTTTTAGCTGGTCTATT
TATCGGAATTAATCAAAATTTACTCACTATTGTAAGTTCATTATTAATGGGTATTTTGTGGTGTACAATCATCAGCCTAA
TTTGGAAATCATTAATGGGTAAAAATGATGAATCTAACAAAAATTATATAATAGCAGGAATTATTGGTGGTTTTTTTCTC
GGCAGTGCTATTGGAGGCTTGATGTTAGCAATATTAAATCGGGATGCTAATTTTGGTAATACTTATATATTAGGAGCATT
TTTGGGAGGAAGTTTTGGTTTTGTTTGGAGTTTGTTTAAACCTCCTATGTTTTTGGGAGGTGTGAGAATTTGGGGTAAGT
ATGGAGCAATTTTAGGTGCAATTTGGGGGTCATTTTTCGGTACAATTATAGGTATCGTTGCCACACTTTACTTGTTGTTT
TCGAGTCAAGGAAATATTGATGCTAGTACTAGTAACTTACCTCAATTATTACTAGCTGTTTTGATTTTTGGTAGTGGAAA
TGGTGCTATTGGTGGAATTATATCAGGAATTATATTCGGCGGATTAATTAGGGCTTATCCTTTGCCTTTAGCATTAGAAT
TAATTGGGATAAGAGGTGCAATTGTTGGAGCAATTTGGGGTTCTTTTTTGATGGCGATCGCTTTAGGAATTATTGGCGGG
ATTTCATCTATAGTTATTGGTGATGATTTGTTTTTAAATGTAATAATTAGTGGTCCAGTTACTTTGCTGAAAGGAGTAAT
TATTGGTACAGGTATTGGCTCAATTTGGGGAATAATTTCTGGTGCTTTTTGGGGTGGTTGTGGGAAATGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGGAGAGTTGATTCTGCTGCTATTGTTAATATCCTAAACTTTGCTTCGATTTCTATACAAACTCATTCAAAAGAAAAT
TACTTAATAGTCAAATCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTACCAATAAAAATTAAAAATCAATCAAATAACTTTCATTTCTGAATTTACTGAGGCAAAGTTATTGTTTTCTTTTTGAT
TCCCACCAAAACTGAATTAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 290; Mature: 290

Protein sequence:

>290_residues
MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMGKNDESNKNYIIAGIIGGFFL
GSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFKPPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLF
SSQGNIDASTSNLPQLLLAVLIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG
ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW

Sequences:

>Translated_290_residues
MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMGKNDESNKNYIIAGIIGGFFL
GSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFKPPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLF
SSQGNIDASTSNLPQLLLAVLIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG
ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW
>Mature_290_residues
MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMGKNDESNKNYIIAGIIGGFFL
GSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFKPPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLF
SSQGNIDASTSNLPQLLLAVLIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG
ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 30228; Mature: 30228

Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KNDESNKNYIIAGIIGGFFLGSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFK
CCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHC
PPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLFSSQGNIDASTSNLPQLLLAV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW
HHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KNDESNKNYIIAGIIGGFFLGSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFK
CCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHC
PPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLFSSQGNIDASTSNLPQLLLAV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW
HHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA