| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113474899
Identifier: 113474899
GI number: 113474899
Start: 1771236
End: 1772108
Strand: Direct
Name: 113474899
Synonym: Tery_1125
Alternate gene names: NA
Gene position: 1771236-1772108 (Clockwise)
Preceding gene: 113474896
Following gene: 113474907
Centisome position: 22.85
GC content: 34.48
Gene sequence:
>873_bases ATGTTTAAGAAAATAATTTGGGGCATAATTAGTGGAACTGTTTGGGGGGTAGTATTTTGTGCTGTTTTAGCTGGTCTATT TATCGGAATTAATCAAAATTTACTCACTATTGTAAGTTCATTATTAATGGGTATTTTGTGGTGTACAATCATCAGCCTAA TTTGGAAATCATTAATGGGTAAAAATGATGAATCTAACAAAAATTATATAATAGCAGGAATTATTGGTGGTTTTTTTCTC GGCAGTGCTATTGGAGGCTTGATGTTAGCAATATTAAATCGGGATGCTAATTTTGGTAATACTTATATATTAGGAGCATT TTTGGGAGGAAGTTTTGGTTTTGTTTGGAGTTTGTTTAAACCTCCTATGTTTTTGGGAGGTGTGAGAATTTGGGGTAAGT ATGGAGCAATTTTAGGTGCAATTTGGGGGTCATTTTTCGGTACAATTATAGGTATCGTTGCCACACTTTACTTGTTGTTT TCGAGTCAAGGAAATATTGATGCTAGTACTAGTAACTTACCTCAATTATTACTAGCTGTTTTGATTTTTGGTAGTGGAAA TGGTGCTATTGGTGGAATTATATCAGGAATTATATTCGGCGGATTAATTAGGGCTTATCCTTTGCCTTTAGCATTAGAAT TAATTGGGATAAGAGGTGCAATTGTTGGAGCAATTTGGGGTTCTTTTTTGATGGCGATCGCTTTAGGAATTATTGGCGGG ATTTCATCTATAGTTATTGGTGATGATTTGTTTTTAAATGTAATAATTAGTGGTCCAGTTACTTTGCTGAAAGGAGTAAT TATTGGTACAGGTATTGGCTCAATTTGGGGAATAATTTCTGGTGCTTTTTGGGGTGGTTGTGGGAAATGGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGGAGAGTTGATTCTGCTGCTATTGTTAATATCCTAAACTTTGCTTCGATTTCTATACAAACTCATTCAAAAGAAAAT TACTTAATAGTCAAATCAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTACCAATAAAAATTAAAAATCAATCAAATAACTTTCATTTCTGAATTTACTGAGGCAAAGTTATTGTTTTCTTTTTGAT TCCCACCAAAACTGAATTAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 290; Mature: 290
Protein sequence:
>290_residues MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMGKNDESNKNYIIAGIIGGFFL GSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFKPPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLF SSQGNIDASTSNLPQLLLAVLIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW
Sequences:
>Translated_290_residues MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMGKNDESNKNYIIAGIIGGFFL GSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFKPPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLF SSQGNIDASTSNLPQLLLAVLIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW >Mature_290_residues MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMGKNDESNKNYIIAGIIGGFFL GSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFKPPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLF SSQGNIDASTSNLPQLLLAVLIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 30228; Mature: 30228
Theoretical pI: Translated: 9.74; Mature: 9.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KNDESNKNYIIAGIIGGFFLGSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFK CCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHC PPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLFSSQGNIDASTSNLPQLLLAV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW HHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFKKIIWGIISGTVWGVVFCAVLAGLFIGINQNLLTIVSSLLMGILWCTIISLIWKSLMG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC KNDESNKNYIIAGIIGGFFLGSAIGGLMLAILNRDANFGNTYILGAFLGGSFGFVWSLFK CCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHC PPMFLGGVRIWGKYGAILGAIWGSFFGTIIGIVATLYLLFSSQGNIDASTSNLPQLLLAV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH LIFGSGNGAIGGIISGIIFGGLIRAYPLPLALELIGIRGAIVGAIWGSFLMAIALGIIGG HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISSIVIGDDLFLNVIISGPVTLLKGVIIGTGIGSIWGIISGAFWGGCGKW HHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA