Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113474870

Identifier: 113474870

GI number: 113474870

Start: 1712154

End: 1715477

Strand: Reverse

Name: 113474870

Synonym: Tery_1092

Alternate gene names: NA

Gene position: 1715477-1712154 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474871

Following gene: 113474869

Centisome position: 22.13

GC content: 38.48

Gene sequence:

>3324_bases
ATGCAAAAATCTCCTAATATTGATGCTGAAATTGTAGCAGGACTAAATGACATTCAAGCTTTTATTAATTTAATTCAGAC
AGAGTTTTTATTTGATGATGTTAGTTTAAATACCATTGATATCTTTACTCTTAGGCAAGCAAGCTGCACCCAAGATCAGA
ACAATTTTACTTTTACGTTAGGTGTTACCATTGCCATTGAACAAGATGAGGGCCAGGGCTTAACCACTAAAGAACTCAGT
GGTAGCCTGGTAATTGAGATCAAAACTGATGATAATGGAAATAATTACAAAGGTGTATATGGGGGATCTTTATCAATTCC
AATAAAACCAACAGGAGCTCTTGTCTTTCGTTTAGATTATCAAACTAAAACTGAATCCGGTAAAAATACTAAATTAGTGG
TAGGTTCATTAGATGCTAATGCTAACCAAAATCTGGGTAATGTTAATTTATCAAATTTAGTTAGTGAAATTTGTCCATCA
TTAACTGATCTATTTCCTGATGAATTGTTGAATTTTTCTTTGGGTTCGGATGTTATTTTTGTTATTAATAGCACAAATAA
TGGTCAAAGAAATCAAAATAAAATGCTATTTAGCATTGGCTTTGATGCAGAAATTGCCTTGAGTGATATTCCATTAGCCG
GGTCTTTACTTCCCCCTAATTCCCTAGAAGGTGAATTTGCTTTTGAATTTTTAGTTTCCTTCCAAAAATTTACACAAAAA
GAAGTTAAAACCATTAATAGCTTACTAGAAGAACTGGGTACCAAGTTACTAATTAAACCCCCTTGTAGTTCTATTAACAA
TCTAGAAAGAGGGGCAAGTATTGGCGCACACTTCAAAATTGCTCAGTTTGTTCAAGCTTGGTTATTACCTTTAGTTAAAA
CGCCTCCCACTGCTGCAGGGGGTAGTCGTAGTTTGAGCACAACAACAAATAATGTCAGTGGTAAGGTCAGTTCAGATGAA
GTAATTACCCCTACAGATAATGGAGCTTGGTTAAATACTCAAAAACTCTTTAGACGGCTTTACTTCCAAAAGGTAGGACT
GGTTTATAAAAAAATTGCTCAGTTTGTTCAAGCTTGGTTATTACCTTTAGTTAAAACGCCTCCCACTGCTGCAGGGGGTA
GTCGTAGTTTGACCACAACAACAAATAATGACAGTGGTAACGTCAGCTCAGATGGAGTAATTACCCTAGCAGATAATGGG
GTTTGGTTAAATATTCAAAAATCTTTTGGACCGCTTTACTTCGATAAAGTAGGACTAGTTTACACAAAAGGCGAAATGCG
TCTGACCCCGAAATTTATTATTGAGGTCTCTCGCTTTACTCTGGCACTAAATGGACTGTATATTAGTAGTGGTTTAACTG
CTTTTAAGCCTCACTTTAATCTTGATGGCTTTGGTTTGGAATTAAAAACCCGCAGTTTGGAAATGGGGGGTGCTTTCCTA
GTAGCACATGGAGCAGAAGGGCAGAACAACTATGATGAATATTTAGGAATAGTCACTGTAAGTTTTCAAAAGAAAGTTGG
CCCTGCCTTAGCCCTTTCTGCTATTGGTTCTTTTACTGATTATCAGAATAGTGACCAATTTGCCCTATTTCTCTATTTAG
CAGCAGATTATCCCTTCGGTGGTCCCCCATTCTTCTTTGTTACCGGAATCTCTGGTGGGTTTGGCTATAACCATGACTTA
ATTATTCCGCCCCTTGAAGATATTAAAAAGTTTCCCCTAGTTACTGAAGCTCTAAAAGGACCTCAAAAAATTGATCCTGA
TCAAACAGGAGAAATTATTACTGAAAAATTGGAGGCCTTAAATAAATATATTCCCCCCTCTATTGGCTCTGGGTTTGGGG
CGCTCGGACTGAAATTTACTGGCTGTAAAATTGTCGATGGGTTTGGGTTAATTACTCTGGGAATAAGTCAGAATGAGTTT
GAAATTAACTTACTGGGTATTGCCACAATGATGTTACCCACTAAACTAAAAGACAATTATGAACCGATCGCTATGGCGGA
ATTAGCGATCGCTGGCCGCTTCAACCCAATGGAAGGGGTGATTCTAATTCAAGGACAACTGACGGAAAATTCCTACATCT
TTAGTCGCAATTGTCGGTTAACGGGTGGCTTTGCTTACGGGTTATGGTTTTTGGGTGATTTTGTATTTACTCAAGGGGGT
TATCATCCTCGCTTTCAAGTGCCTGATTATTACCCTAATGTGCCTCGACTGGGCTTGAATTGGCAAATTGACAGTCATTC
CCATATTACTGCTCAGGCTTATTTTGCTATCTGTGGTCACGGGATCATGGCCGGAGGACTGATGGACATTCGCTATCAAC
TGGGGTCAGTTTGGGCCCATTTTGAGGCAGGACTTGATTTACTCCTCGGTTGGGCACCCTATCATTATGATGTGAATGTT
TACTGCTCTGTCAGGGTAGGTGTTGGTGCACTTTCGGTAGGTTTAGGTATGGGGGTTCATATCTGGGGCCCTGACTTTGG
CGGTAAATTAGAGCTTCGTGTTTTTGTGTGCAAAGTTACTATTAAAATTGGGGATCAAAGTTCCATTTATCCAGTGCCCA
TTAAATGGGATGAGTTTGAGGACACCTTTTTACCTGAACCCGAAAATGTTTGTAGTCTCACCTCTATTAATGGGTTAGTC
AAACAAGTTCTTGAACCAACAAGAAAAGAAGAACAAAAGGAAGTTTGGATTATTAATCCCACTGTTTTTGAAATGAGTAC
TGATAGCTTAGTTCCTACAAAACAAGCGTTTGTTGGAGAACAGAAGAAAGAAATTAATACAGATACTAATTTTGGTATTA
ATTCAATGGGAGTGGATAATAATGAATTGGACACTACCCATAAGGTGACAATTTGTAAAGACTCCAGAGAAAGAGCAGAA
GACAAGTTTAAGTTTGAACCTATCACTAAACTTGCATCCACTTCTACTTGGGGAGAACCTAATATGGTGAATGGTCATAT
TAAACCCCCTGAAGTCAATGGGAAGCAATTTATAGAGAATGTGTTCTTTGGTTTCCGCATTCTACCAGCAGAACTCCCTA
AAGCAGGTAAAACTCATGAAATTGGAGTTGAACATTTACAGTATGAGACTGAAAAGGTTGAGGATGCTTATCTTTGGGAG
TCTTGTACCCCCTTTGTGCCTAATCCCAACTTAGATGAAGAAAATAAACGAAATAAAATTATGCAAACAGTAGGCAGTAA
TGAACAACGTAACAAGATTTTAGCCGCTTTGGGCTGGGATGTTTATCAAGTGGATATGAATGAGGATGAGGCTGAGGCGA
TCGCTAATAGTTTCGTCTTTGCCCCCCTCATTAAATTAACCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGCTATTGAGCCTCACACCAAATGGTGTGAGATGAATCAGACAGGCTAATAATGTGATACAAATGAACAATCAAAACATG
CTTTTTGGGGAACTAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATTCTAATGCTGCTGTCAACTTAGAGTACTATGTATTTTATTTGGCTTAAGTTAAGAGCAATTTAAAGCCTAGATTAT
AGAATAGGTAAGCTATAGAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1107; Mature: 1107

Protein sequence:

>1107_residues
MQKSPNIDAEIVAGLNDIQAFINLIQTEFLFDDVSLNTIDIFTLRQASCTQDQNNFTFTLGVTIAIEQDEGQGLTTKELS
GSLVIEIKTDDNGNNYKGVYGGSLSIPIKPTGALVFRLDYQTKTESGKNTKLVVGSLDANANQNLGNVNLSNLVSEICPS
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EVKTINSLLEELGTKLLIKPPCSSINNLERGASIGAHFKIAQFVQAWLLPLVKTPPTAAGGSRSLSTTTNNVSGKVSSDE
VITPTDNGAWLNTQKLFRRLYFQKVGLVYKKIAQFVQAWLLPLVKTPPTAAGGSRSLTTTTNNDSGNVSSDGVITLADNG
VWLNIQKSFGPLYFDKVGLVYTKGEMRLTPKFIIEVSRFTLALNGLYISSGLTAFKPHFNLDGFGLELKTRSLEMGGAFL
VAHGAEGQNNYDEYLGIVTVSFQKKVGPALALSAIGSFTDYQNSDQFALFLYLAADYPFGGPPFFFVTGISGGFGYNHDL
IIPPLEDIKKFPLVTEALKGPQKIDPDQTGEIITEKLEALNKYIPPSIGSGFGALGLKFTGCKIVDGFGLITLGISQNEF
EINLLGIATMMLPTKLKDNYEPIAMAELAIAGRFNPMEGVILIQGQLTENSYIFSRNCRLTGGFAYGLWFLGDFVFTQGG
YHPRFQVPDYYPNVPRLGLNWQIDSHSHITAQAYFAICGHGIMAGGLMDIRYQLGSVWAHFEAGLDLLLGWAPYHYDVNV
YCSVRVGVGALSVGLGMGVHIWGPDFGGKLELRVFVCKVTIKIGDQSSIYPVPIKWDEFEDTFLPEPENVCSLTSINGLV
KQVLEPTRKEEQKEVWIINPTVFEMSTDSLVPTKQAFVGEQKKEINTDTNFGINSMGVDNNELDTTHKVTICKDSRERAE
DKFKFEPITKLASTSTWGEPNMVNGHIKPPEVNGKQFIENVFFGFRILPAELPKAGKTHEIGVEHLQYETEKVEDAYLWE
SCTPFVPNPNLDEENKRNKIMQTVGSNEQRNKILAALGWDVYQVDMNEDEAEAIANSFVFAPLIKLT

Sequences:

>Translated_1107_residues
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GSLVIEIKTDDNGNNYKGVYGGSLSIPIKPTGALVFRLDYQTKTESGKNTKLVVGSLDANANQNLGNVNLSNLVSEICPS
LTDLFPDELLNFSLGSDVIFVINSTNNGQRNQNKMLFSIGFDAEIALSDIPLAGSLLPPNSLEGEFAFEFLVSFQKFTQK
EVKTINSLLEELGTKLLIKPPCSSINNLERGASIGAHFKIAQFVQAWLLPLVKTPPTAAGGSRSLSTTTNNVSGKVSSDE
VITPTDNGAWLNTQKLFRRLYFQKVGLVYKKIAQFVQAWLLPLVKTPPTAAGGSRSLTTTTNNDSGNVSSDGVITLADNG
VWLNIQKSFGPLYFDKVGLVYTKGEMRLTPKFIIEVSRFTLALNGLYISSGLTAFKPHFNLDGFGLELKTRSLEMGGAFL
VAHGAEGQNNYDEYLGIVTVSFQKKVGPALALSAIGSFTDYQNSDQFALFLYLAADYPFGGPPFFFVTGISGGFGYNHDL
IIPPLEDIKKFPLVTEALKGPQKIDPDQTGEIITEKLEALNKYIPPSIGSGFGALGLKFTGCKIVDGFGLITLGISQNEF
EINLLGIATMMLPTKLKDNYEPIAMAELAIAGRFNPMEGVILIQGQLTENSYIFSRNCRLTGGFAYGLWFLGDFVFTQGG
YHPRFQVPDYYPNVPRLGLNWQIDSHSHITAQAYFAICGHGIMAGGLMDIRYQLGSVWAHFEAGLDLLLGWAPYHYDVNV
YCSVRVGVGALSVGLGMGVHIWGPDFGGKLELRVFVCKVTIKIGDQSSIYPVPIKWDEFEDTFLPEPENVCSLTSINGLV
KQVLEPTRKEEQKEVWIINPTVFEMSTDSLVPTKQAFVGEQKKEINTDTNFGINSMGVDNNELDTTHKVTICKDSRERAE
DKFKFEPITKLASTSTWGEPNMVNGHIKPPEVNGKQFIENVFFGFRILPAELPKAGKTHEIGVEHLQYETEKVEDAYLWE
SCTPFVPNPNLDEENKRNKIMQTVGSNEQRNKILAALGWDVYQVDMNEDEAEAIANSFVFAPLIKLT
>Mature_1107_residues
MQKSPNIDAEIVAGLNDIQAFINLIQTEFLFDDVSLNTIDIFTLRQASCTQDQNNFTFTLGVTIAIEQDEGQGLTTKELS
GSLVIEIKTDDNGNNYKGVYGGSLSIPIKPTGALVFRLDYQTKTESGKNTKLVVGSLDANANQNLGNVNLSNLVSEICPS
LTDLFPDELLNFSLGSDVIFVINSTNNGQRNQNKMLFSIGFDAEIALSDIPLAGSLLPPNSLEGEFAFEFLVSFQKFTQK
EVKTINSLLEELGTKLLIKPPCSSINNLERGASIGAHFKIAQFVQAWLLPLVKTPPTAAGGSRSLSTTTNNVSGKVSSDE
VITPTDNGAWLNTQKLFRRLYFQKVGLVYKKIAQFVQAWLLPLVKTPPTAAGGSRSLTTTTNNDSGNVSSDGVITLADNG
VWLNIQKSFGPLYFDKVGLVYTKGEMRLTPKFIIEVSRFTLALNGLYISSGLTAFKPHFNLDGFGLELKTRSLEMGGAFL
VAHGAEGQNNYDEYLGIVTVSFQKKVGPALALSAIGSFTDYQNSDQFALFLYLAADYPFGGPPFFFVTGISGGFGYNHDL
IIPPLEDIKKFPLVTEALKGPQKIDPDQTGEIITEKLEALNKYIPPSIGSGFGALGLKFTGCKIVDGFGLITLGISQNEF
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KQVLEPTRKEEQKEVWIINPTVFEMSTDSLVPTKQAFVGEQKKEINTDTNFGINSMGVDNNELDTTHKVTICKDSRERAE
DKFKFEPITKLASTSTWGEPNMVNGHIKPPEVNGKQFIENVFFGFRILPAELPKAGKTHEIGVEHLQYETEKVEDAYLWE
SCTPFVPNPNLDEENKRNKIMQTVGSNEQRNKILAALGWDVYQVDMNEDEAEAIANSFVFAPLIKLT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121794; Mature: 121794

Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQKSPNIDAEIVAGLNDIQAFINLIQTEFLFDDVSLNTIDIFTLRQASCTQDQNNFTFTL
CCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEE
GVTIAIEQDEGQGLTTKELSGSLVIEIKTDDNGNNYKGVYGGSLSIPIKPTGALVFRLDY
EEEEEEECCCCCCCCHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEC
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CCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCEEE
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EEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
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CCCEEEECCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCEEEEEECCCCCCCCCCEECCCHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
NKYIPPSIGSGFGALGLKFTGCKIVDGFGLITLGISQNEFEINLLGIATMMLPTKLKDNY
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
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EEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCEEEECC
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EEEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHH
DKFKFEPITKLASTSTWGEPNMVNGHIKPPEVNGKQFIENVFFGFRILPAELPKAGKTHE
HCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEEEHHHCCCCCCCCC
IGVEHLQYETEKVEDAYLWESCTPFVPNPNLDEENKRNKIMQTVGSNEQRNKILAALGWD
CCHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHCEEEEEECCE
VYQVDMNEDEAEAIANSFVFAPLIKLT
EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHEECC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEE
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CCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCEEE
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HHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEECEEEE
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EECCCEEECHHHEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCEECCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEE
VAHGAEGQNNYDEYLGIVTVSFQKKVGPALALSAIGSFTDYQNSDQFALFLYLAADYPFG
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
FEAGLDLLLGWAPYHYDVNVYCSVRVGVGALSVGLGMGVHIWGPDFGGKLELRVFVCKVT
HHCCCEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCEEEHHCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEE
IKIGDQSSIYPVPIKWDEFEDTFLPEPENVCSLTSINGLVKQVLEPTRKEEQKEVWIINP
EEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCEEEECC
TVFEMSTDSLVPTKQAFVGEQKKEINTDTNFGINSMGVDNNELDTTHKVTICKDSRERAE
EEEEECCCCCCCCHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHH
DKFKFEPITKLASTSTWGEPNMVNGHIKPPEVNGKQFIENVFFGFRILPAELPKAGKTHE
HCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEEEHHHCCCCCCCCC
IGVEHLQYETEKVEDAYLWESCTPFVPNPNLDEENKRNKIMQTVGSNEQRNKILAALGWD
CCHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHCEEEEEECCE
VYQVDMNEDEAEAIANSFVFAPLIKLT
EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA