Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113474736

Identifier: 113474736

GI number: 113474736

Start: 1461792

End: 1464824

Strand: Reverse

Name: 113474736

Synonym: Tery_0929

Alternate gene names: NA

Gene position: 1464824-1461792 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474737

Following gene: 113474735

Centisome position: 18.9

GC content: 37.22

Gene sequence:

>3033_bases
ATGGAAGTGAGAAATTTAAAAAGTTATACAGGATTAGGAGATAAACTGCTAATATCTCTCAATCTCCGTTCTGAAGAAGT
AGAGCGAACCTTACTAATGTTTGTGGTATATACTCTTACTTCTATAGGGTTAATTTGGTTAGAACTGAGTACAGTTAGTT
TATTCTTAGACCAATATGGTGCTGAGAAATTACCTTGGATATATATTGCTAGTGCTGGCATAGGTTCAGGTCTTGGGTTT
GTCTACTCCTGGCTACAAAAAATCATGCCTCTGCGCCGAGTAATAGTAGTAATTTTATTACTAATGGCAATTCCTTTATT
CTTATTTAGACTTGGTATTGGCATTGAGAATATCAAGATAGCTGGTCTAAGTTTAGCTTTTCTCACTACTTTTATGATGT
GGTTATGGGTAGAGGCTTGTTACTTACTTAACGATTTGAATAGTTCAATCACAGGTAACCAATTATTTAATATTAGAGAA
ATTAAACGGACATATCCAATAATAAGTAGTGGTTTTTTAGTAGCAGGAGTAATTAGTGGATTTTCTTTACCTCTAATAAT
ATCATTTGTGTCGCTGAATAACGTTACAATAGTATCGGGCTTAATGGTATTATTTGGGTCAGGAATACTGTTATATTTAT
CAGAGAGATATCAACAATCTTTTCCTGATTCTAGCCGTTGGATACCAGAAGATGAGGAGCAGGAGTTTTCTACTCGGATA
GTAAAAGGACCTCTACAAGGTTATATATTGCCGTTAATCATATTCTTTGTAATAGCAGAGGTACTATATGTATTAGTAGA
CTTTCAATTTTTTTATCAACTAGAATTGGAAAACCGGTCTCTTAATGGGGCAAATCAAATAGCAAGTTTCCTGGGTTTGT
TTGAAGGAATTTTGAGTACTTGTCAAGTAGTAACTCAATGGTTTGCCTCTAGTCGTCTGGTAGAAAGAATAGGAGTTTTT
GGTACAGCAATGGTACTACCATTAGGGGCAATAGCTTTAGGGTTATTTTCTTTGACGGGGGCAATAACAGGATTACTTTC
AGTATTTATAGGATTAGTAATCCTGAGATTTCTAGATGAGTTACTACACTATACATTAATAGAAACTACTGGGCCTGTTT
TATTCCAACCTTTACCAGAGAATATTCGTAGTGATGTTCAAACAATGGTAAATGGGGTAGCAGAACCCTTTTCTACAGGC
TTAAGTGGATTAATAATACTAGCAATTCTTGGGGTAAGTAGATTAATATTAGACTCCAATCAACGTTTGTTTTCAGACCA
GCAGGGTCTAGTCTTTGTGATCGCAATAATCATATCAGCTCTGGTATGGTTAGGAGTAATATTATTAATTAGAACTCAAT
ATGTAAACTTATTGGTAAGGAGTGCAGGTAAAGGTAGATTTGCTGTTTTAGATGTAGATATGAGGGCATTGAAACGCTCA
GTAGTAGAAACTTTGGAAAGAGGAACGGCAGAAGAAGATAAGCGTTCCTGTATTGAGTTATTAAGTCAAATAGATAAAAA
AAATATAGGTGAAATATTGGCTCCACTACTCGGGGTAATGTCACCGGCATTACAATCTCAAAGTTTGGAAGTAATGTTGA
ATCACCCTAATCCAGCTTATCTCCAACAAGTGCGCTCGTTAACTCAAACATCACTACCAGCACAAGTTTTAGCTTTGGCT
TTACGTTATATCTGGCTTACAGAATCAAAATCAGATGTTAGTCAACTTCGGCCTTATTTACAACCTTCAGTAGATCCAGT
AGTAAGAGGTACAGCAGCAGCTTTAATTATGCGTAGAGGAGACAGAGAGCAAAAAGCTGAGGCTACTAATGTTTTACGCA
GGATGATTACTTCTAAACTGGAAAAGGAAAGAGTCATGGGTGTTCGTGCCTTGGGAGAAGCAGATTATTTGCAAGGGTTA
CGATTATATATTCCGAGTTTATTACAAGATGAATCCTTACGAGTACGAAAGTATTGTATGGATGTGATTGCTGCTACTCA
TTTGGAAGGTTACTACCCCTCACTGTTACGGGGTTTATCCTACAAATCAACCAGAGAATCTGCATTGCAAGCATTAGTAA
GATTAGGTAATGATGCGATTCCAATGTTGGTGAAGTTAGCCGATGATGCTCATAAGTCAGATCTAGTTCGATTACAAGCT
TGGACTGCTATTAGTGAAATTGGTACAATAGAAGCACTAGATTCTCTGGTAAATAGAATGATGACAACTTGGGGTACAAC
ACGTCGTAATATTCTACGCAGATTATTGAAAATGCCGGAAGAAATAGGAATTGAAGGGGTCCTGGAACGAGTAGGCCGCA
GTGGAGTTGAAATTCTAGTAGAGCAAGAGTTGATGTTCTTGGGACAGATTTATGCGGGTATAGTAGACTTGTCTGGGGTA
AGTATTAATTCAGAGAATTCTCTCTCTAGTGCTTTAGAGAAAAGTAATGGAAAACTAACTACTGATTATACAGAAATATT
GTTGCGGTCTTTACAATTGTTGGAGTTAGATGCTATAGAACAGTGTTTTTTGTTAATGAAGTTTCTTTATCCATTGGGTT
CTATTAAGGCAGCAGCTCTTAATATTAACTCAGATTCCCGTTCAAATGTGGCTCGCGGTTTGGAAATTTTGGATAATACT
GTAGATATTTCTTGTAAGCGATCGCTGATTGATATTTTGGATCAAAAGAGCTATGAAGAAAAATTAAATAGTTTATCTGA
AATGGTGATTTATCAACCAATGGCTCCTAGCGATCGCTTACGACACCTGCTAGATTTTCGCCATTTTCTTTCTGAGTGGG
CTTTAGCTTGTTGTTTACAGATGGCTCGTGCAGCTCGTTGGAGTTTAACGGCAGAACAAACTTTAGTTTGTTTACGTCAT
CCTACTGGTTTTGTACGGGAGGCAGCTCTGGCTTACTTACGAATGGCATCTCAACGGGCATTAGTTGAATTATTGCCTCA
TTTGAGGAATGACCCAGACCCTCTGGTCGCTGCTCAGGTAGAGCAAATGATTGTTGAGTTTGGTATTAGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATATATATTGTTATATATGACAATATTTGACGATCTTGATATAGAAAGTTTACGATATTTCATTAACTATATAATTTA
GTAAAAATTCAGTAAACCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTGAAAAATATTCAGAGTGGGTCTACTTATTCCTTAAGCTGTTTTACCATTTAAACTAGATTACAGAAGTAGACAAAGT
CTTGAAGGTGCAATTAAATT

Product: HEAT repeat-containing PBS lyase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1010; Mature: 1010

Protein sequence:

>1010_residues
MEVRNLKSYTGLGDKLLISLNLRSEEVERTLLMFVVYTLTSIGLIWLELSTVSLFLDQYGAEKLPWIYIASAGIGSGLGF
VYSWLQKIMPLRRVIVVILLLMAIPLFLFRLGIGIENIKIAGLSLAFLTTFMMWLWVEACYLLNDLNSSITGNQLFNIRE
IKRTYPIISSGFLVAGVISGFSLPLIISFVSLNNVTIVSGLMVLFGSGILLYLSERYQQSFPDSSRWIPEDEEQEFSTRI
VKGPLQGYILPLIIFFVIAEVLYVLVDFQFFYQLELENRSLNGANQIASFLGLFEGILSTCQVVTQWFASSRLVERIGVF
GTAMVLPLGAIALGLFSLTGAITGLLSVFIGLVILRFLDELLHYTLIETTGPVLFQPLPENIRSDVQTMVNGVAEPFSTG
LSGLIILAILGVSRLILDSNQRLFSDQQGLVFVIAIIISALVWLGVILLIRTQYVNLLVRSAGKGRFAVLDVDMRALKRS
VVETLERGTAEEDKRSCIELLSQIDKKNIGEILAPLLGVMSPALQSQSLEVMLNHPNPAYLQQVRSLTQTSLPAQVLALA
LRYIWLTESKSDVSQLRPYLQPSVDPVVRGTAAALIMRRGDREQKAEATNVLRRMITSKLEKERVMGVRALGEADYLQGL
RLYIPSLLQDESLRVRKYCMDVIAATHLEGYYPSLLRGLSYKSTRESALQALVRLGNDAIPMLVKLADDAHKSDLVRLQA
WTAISEIGTIEALDSLVNRMMTTWGTTRRNILRRLLKMPEEIGIEGVLERVGRSGVEILVEQELMFLGQIYAGIVDLSGV
SINSENSLSSALEKSNGKLTTDYTEILLRSLQLLELDAIEQCFLLMKFLYPLGSIKAAALNINSDSRSNVARGLEILDNT
VDISCKRSLIDILDQKSYEEKLNSLSEMVIYQPMAPSDRLRHLLDFRHFLSEWALACCLQMARAARWSLTAEQTLVCLRH
PTGFVREAALAYLRMASQRALVELLPHLRNDPDPLVAAQVEQMIVEFGIS

Sequences:

>Translated_1010_residues
MEVRNLKSYTGLGDKLLISLNLRSEEVERTLLMFVVYTLTSIGLIWLELSTVSLFLDQYGAEKLPWIYIASAGIGSGLGF
VYSWLQKIMPLRRVIVVILLLMAIPLFLFRLGIGIENIKIAGLSLAFLTTFMMWLWVEACYLLNDLNSSITGNQLFNIRE
IKRTYPIISSGFLVAGVISGFSLPLIISFVSLNNVTIVSGLMVLFGSGILLYLSERYQQSFPDSSRWIPEDEEQEFSTRI
VKGPLQGYILPLIIFFVIAEVLYVLVDFQFFYQLELENRSLNGANQIASFLGLFEGILSTCQVVTQWFASSRLVERIGVF
GTAMVLPLGAIALGLFSLTGAITGLLSVFIGLVILRFLDELLHYTLIETTGPVLFQPLPENIRSDVQTMVNGVAEPFSTG
LSGLIILAILGVSRLILDSNQRLFSDQQGLVFVIAIIISALVWLGVILLIRTQYVNLLVRSAGKGRFAVLDVDMRALKRS
VVETLERGTAEEDKRSCIELLSQIDKKNIGEILAPLLGVMSPALQSQSLEVMLNHPNPAYLQQVRSLTQTSLPAQVLALA
LRYIWLTESKSDVSQLRPYLQPSVDPVVRGTAAALIMRRGDREQKAEATNVLRRMITSKLEKERVMGVRALGEADYLQGL
RLYIPSLLQDESLRVRKYCMDVIAATHLEGYYPSLLRGLSYKSTRESALQALVRLGNDAIPMLVKLADDAHKSDLVRLQA
WTAISEIGTIEALDSLVNRMMTTWGTTRRNILRRLLKMPEEIGIEGVLERVGRSGVEILVEQELMFLGQIYAGIVDLSGV
SINSENSLSSALEKSNGKLTTDYTEILLRSLQLLELDAIEQCFLLMKFLYPLGSIKAAALNINSDSRSNVARGLEILDNT
VDISCKRSLIDILDQKSYEEKLNSLSEMVIYQPMAPSDRLRHLLDFRHFLSEWALACCLQMARAARWSLTAEQTLVCLRH
PTGFVREAALAYLRMASQRALVELLPHLRNDPDPLVAAQVEQMIVEFGIS
>Mature_1010_residues
MEVRNLKSYTGLGDKLLISLNLRSEEVERTLLMFVVYTLTSIGLIWLELSTVSLFLDQYGAEKLPWIYIASAGIGSGLGF
VYSWLQKIMPLRRVIVVILLLMAIPLFLFRLGIGIENIKIAGLSLAFLTTFMMWLWVEACYLLNDLNSSITGNQLFNIRE
IKRTYPIISSGFLVAGVISGFSLPLIISFVSLNNVTIVSGLMVLFGSGILLYLSERYQQSFPDSSRWIPEDEEQEFSTRI
VKGPLQGYILPLIIFFVIAEVLYVLVDFQFFYQLELENRSLNGANQIASFLGLFEGILSTCQVVTQWFASSRLVERIGVF
GTAMVLPLGAIALGLFSLTGAITGLLSVFIGLVILRFLDELLHYTLIETTGPVLFQPLPENIRSDVQTMVNGVAEPFSTG
LSGLIILAILGVSRLILDSNQRLFSDQQGLVFVIAIIISALVWLGVILLIRTQYVNLLVRSAGKGRFAVLDVDMRALKRS
VVETLERGTAEEDKRSCIELLSQIDKKNIGEILAPLLGVMSPALQSQSLEVMLNHPNPAYLQQVRSLTQTSLPAQVLALA
LRYIWLTESKSDVSQLRPYLQPSVDPVVRGTAAALIMRRGDREQKAEATNVLRRMITSKLEKERVMGVRALGEADYLQGL
RLYIPSLLQDESLRVRKYCMDVIAATHLEGYYPSLLRGLSYKSTRESALQALVRLGNDAIPMLVKLADDAHKSDLVRLQA
WTAISEIGTIEALDSLVNRMMTTWGTTRRNILRRLLKMPEEIGIEGVLERVGRSGVEILVEQELMFLGQIYAGIVDLSGV
SINSENSLSSALEKSNGKLTTDYTEILLRSLQLLELDAIEQCFLLMKFLYPLGSIKAAALNINSDSRSNVARGLEILDNT
VDISCKRSLIDILDQKSYEEKLNSLSEMVIYQPMAPSDRLRHLLDFRHFLSEWALACCLQMARAARWSLTAEQTLVCLRH
PTGFVREAALAYLRMASQRALVELLPHLRNDPDPLVAAQVEQMIVEFGIS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112724; Mature: 112724

Theoretical pI: Translated: 5.85; Mature: 5.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEVRNLKSYTGLGDKLLISLNLRSEEVERTLLMFVVYTLTSIGLIWLELSTVSLFLDQYG
CCCCCCCHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
AEKLPWIYIASAGIGSGLGFVYSWLQKIMPLRRVIVVILLLMAIPLFLFRLGIGIENIKI
CCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
AGLSLAFLTTFMMWLWVEACYLLNDLNSSITGNQLFNIREIKRTYPIISSGFLVAGVISG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHC
FSLPLIISFVSLNNVTIVSGLMVLFGSGILLYLSERYQQSFPDSSRWIPEDEEQEFSTRI
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
VKGPLQGYILPLIIFFVIAEVLYVLVDFQFFYQLELENRSLNGANQIASFLGLFEGILST
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
CQVVTQWFASSRLVERIGVFGTAMVLPLGAIALGLFSLTGAITGLLSVFIGLVILRFLDE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLHYTLIETTGPVLFQPLPENIRSDVQTMVNGVAEPFSTGLSGLIILAILGVSRLILDSN
HHHHHHHHCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QRLFSDQQGLVFVIAIIISALVWLGVILLIRTQYVNLLVRSAGKGRFAVLDVDMRALKRS
CHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHH
VVETLERGTAEEDKRSCIELLSQIDKKNIGEILAPLLGVMSPALQSQSLEVMLNHPNPAY
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHH
LQQVRSLTQTSLPAQVLALALRYIWLTESKSDVSQLRPYLQPSVDPVVRGTAAALIMRRG
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
DREQKAEATNVLRRMITSKLEKERVMGVRALGEADYLQGLRLYIPSLLQDESLRVRKYCM
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
DVIAATHLEGYYPSLLRGLSYKSTRESALQALVRLGNDAIPMLVKLADDAHKSDLVRLQA
HHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
WTAISEIGTIEALDSLVNRMMTTWGTTRRNILRRLLKMPEEIGIEGVLERVGRSGVEILV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHH
EQELMFLGQIYAGIVDLSGVSINSENSLSSALEKSNGKLTTDYTEILLRSLQLLELDAIE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QCFLLMKFLYPLGSIKAAALNINSDSRSNVARGLEILDNTVDISCKRSLIDILDQKSYEE
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH
KLNSLSEMVIYQPMAPSDRLRHLLDFRHFLSEWALACCLQMARAARWSLTAEQTLVCLRH
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC
PTGFVREAALAYLRMASQRALVELLPHLRNDPDPLVAAQVEQMIVEFGIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEVRNLKSYTGLGDKLLISLNLRSEEVERTLLMFVVYTLTSIGLIWLELSTVSLFLDQYG
CCCCCCCHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
AEKLPWIYIASAGIGSGLGFVYSWLQKIMPLRRVIVVILLLMAIPLFLFRLGIGIENIKI
CCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
AGLSLAFLTTFMMWLWVEACYLLNDLNSSITGNQLFNIREIKRTYPIISSGFLVAGVISG
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FSLPLIISFVSLNNVTIVSGLMVLFGSGILLYLSERYQQSFPDSSRWIPEDEEQEFSTRI
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CQVVTQWFASSRLVERIGVFGTAMVLPLGAIALGLFSLTGAITGLLSVFIGLVILRFLDE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLHYTLIETTGPVLFQPLPENIRSDVQTMVNGVAEPFSTGLSGLIILAILGVSRLILDSN
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WTAISEIGTIEALDSLVNRMMTTWGTTRRNILRRLLKMPEEIGIEGVLERVGRSGVEILV
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EQELMFLGQIYAGIVDLSGVSINSENSLSSALEKSNGKLTTDYTEILLRSLQLLELDAIE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QCFLLMKFLYPLGSIKAAALNINSDSRSNVARGLEILDNTVDISCKRSLIDILDQKSYEE
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH
KLNSLSEMVIYQPMAPSDRLRHLLDFRHFLSEWALACCLQMARAARWSLTAEQTLVCLRH
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC
PTGFVREAALAYLRMASQRALVELLPHLRNDPDPLVAAQVEQMIVEFGIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA