Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yebA [H]

Identifier: 113474062

GI number: 113474062

Start: 230297

End: 232696

Strand: Reverse

Name: yebA [H]

Synonym: Tery_0156

Alternate gene names: 113474062

Gene position: 232696-230297 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113474064

Following gene: 113474061

Centisome position: 3.0

GC content: 34.25

Gene sequence:

>2400_bases
ATGTCTAATTATTTTTCTGGATGGAAAGTGCGAAATCTACCTATATTAGGACTTCTGTGGAAACAAGTACAAGCAGCACC
TAAACCTATTGCTGAAGATTCTATTCTATTACGAGTAATGGTACAGGCATTGGTAATAGTAGGTATTATAGCAATTGACG
TGGCTGCTGGGGTAGCAACAGATGAACTACCTTTAACTGTTTGGGCAGGACCACTAAGTATTATAGGAGCAATTTGGAGT
TGGTATAATCGCTACAAAAGAAATGTGCTAGCTAAATTCTGCTTGGCGATCGGAATGTTATTAATTTTTGCTGCTTTTTT
GAGTAGATTATTTGGTGAGCTAAATGATACACGACTGGTATTGGCTGAATTATTAATTCAACTTCAAGTCTTACATAGCT
TCGATCTACCTAGGCGAAAAGACTTAGGTTATTCAATGGTTATAGGGCTAATTTTGTTGGGGGTTGCAGGCACTATTAGC
CAAACTTTAACTTATGGACCTGTATTAATAGTGTTTACTATATTTGCTATTCCTTGTCTTGTTTTAGATTACCGTTCTAG
GTTAGGTTTGTACTCAAGATTGTCCAGTAATAAATTAGAGCTTCGAAGGCAAAAACAGCAAAAAAAAATATCTCTGTTAA
ATGCTACTTTGTCTCCCAAGCGATTAACAATATTATTGTTAGTAATTCTTGGTTTGGGCATGACAATTTTTGCTTTTTTA
CCAAGGTTACCTGGATATCAAATACGAACTTTTCCTGTGAGCAGTACGATTAATTTTGATTTAGAAAATTTCGATGGGCG
AACAATTACAAATCCTGGTTATATTAGTCAAGGTAGGGGAAATAGAGATGGTTCTGGAAATAGTAATGGAACTAACCAAG
AATCAGGTCCTGGAAGTTTAAATGATACTTATTATTACGGGTTTAATACTAAAATTAACCAAAATTTGCGTGGGCAATTA
GTGCCTCAAGTTGTGATGCGAGTTAGGTCGCAAGCTGAAGGTTTTTGGAGAGTTTTAGCATTTGATAAATATACTGGTGA
AGGTTGGGAAATTTCTCGAAATGATAAGACTATTACTTTAGATCGTAGCAGTTTTTCTTATCAATTTTCTGTGGGTTTAC
AGAGAAAGAATTATAAAAATGAAACTAAAGAAGTCATTCAAAATTATACAGTAGTTTCTCCGCTACCAAATTTAATTCCA
GCTTTATATCAGGCCAAAGAAGTATATTTTCCTACTAAAAAAGTAGCCATTGACCTTGATGGAAATTTACGTTCTCCTCT
TGAACTTAGAGAAGGTTTAACCTATACAGTAATTTCTAATGTTCCTTATCGAAATCGTAGTATTTTGAGTCAAGCGGGAA
CAAATTATCCAGAAAGTATTAGTGAATATTATTTACAGATTCCTTCTGAAATACTAGAAAAAGTCAGACAAAAAACAGAA
GATATTTTAGCAAATAAAAATAAAGTTGCTCAAGAAATTAAACCTATTATTTCTCCTTACGAAAAAGCTCTTTATTTAGC
TCAATACCTTAAGCAAAACCCAAATTATAAACTTCAAAAAGCACCACCATTTTTAGCAGAAGATGAAGATTTAGTCTCAG
CTTTTTTATTTGGTTACCAAAATAGCCGGGAAGGGGAAAAAATTACGGGTGGTTATGGCGATCATTTTTCTACTGTTTTG
ACAATAATGTTACGTTCTATTGGAATTCCTGCGAGATTAGTTGCCGGTTATGCTCCTGGTGAATTTAATCCTTTTACTGG
TTTATATGTGGTCAAAAATACAGATGCCTATATGATGACGGAGGTATATTTTCCGGGGTATGGGTGGTTTGCTTTTAATC
CTATTCCGGGAATGCCATTAATTCCTCCTTCCATTGAAAAAAATCAAAGTTTTACTGGGTTAATGGTTTTTTGGAAGTGG
GTAGCTGGTTGGTTACCTTCTCCTGTAACTGGTTTTTTGGAGAGGTTTATTGGTGGAATATTCCTTTGGATATTGGGAGT
TATTGCTTGGTTTTTTGCTTTATTTTCTCAAGGTTGGCAAGGCATATTTACTGGTTTAATATTATTTACTGCTTTAGGTT
TTTTGGGTTGGTTATTATATATTTTTTGGCAAAAATGGCATTATGGTCGTTGGTTAGGAAGGTTATATCCTATGGAGAGT
ATCTATCAACAAATGTTGAATTTGATGGCGAGTAAGGGATTAGTTAAACATGGTTTTCAGACCCCTTTTGAATATACTAA
GGCTATTAAGGGATATAACTCTAGGAATGAAGCAGAAATAATAGAAGAAATTTCGCAAGCTTATGTAGAATGGCGTTATG
GTGGTAAGGAGGTTAATTTGAATAGATTAAAAGGTTTACTGCGGAATTTAAAGAGTAGTATCAGGCGGAAATTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATTATCAGTTTTCTAGTATATTAGACTCTTATTTTTTAGTAATAGTGAATGATCTTAATCAAAAACTAATATTCCCT
CAGTTTCTACCAATAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAGTTAGGAATAAAGAAGTCAATAAGGTGAATTACAAAGTGATTCTTTTTTGATTTGTTAATAAATAAGTTTATGGGCTG
CACAGCAGAAGTTATATCAA

Product: transglutaminase-like

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 799; Mature: 798

Protein sequence:

>799_residues
MSNYFSGWKVRNLPILGLLWKQVQAAPKPIAEDSILLRVMVQALVIVGIIAIDVAAGVATDELPLTVWAGPLSIIGAIWS
WYNRYKRNVLAKFCLAIGMLLIFAAFLSRLFGELNDTRLVLAELLIQLQVLHSFDLPRRKDLGYSMVIGLILLGVAGTIS
QTLTYGPVLIVFTIFAIPCLVLDYRSRLGLYSRLSSNKLELRRQKQQKKISLLNATLSPKRLTILLLVILGLGMTIFAFL
PRLPGYQIRTFPVSSTINFDLENFDGRTITNPGYISQGRGNRDGSGNSNGTNQESGPGSLNDTYYYGFNTKINQNLRGQL
VPQVVMRVRSQAEGFWRVLAFDKYTGEGWEISRNDKTITLDRSSFSYQFSVGLQRKNYKNETKEVIQNYTVVSPLPNLIP
ALYQAKEVYFPTKKVAIDLDGNLRSPLELREGLTYTVISNVPYRNRSILSQAGTNYPESISEYYLQIPSEILEKVRQKTE
DILANKNKVAQEIKPIISPYEKALYLAQYLKQNPNYKLQKAPPFLAEDEDLVSAFLFGYQNSREGEKITGGYGDHFSTVL
TIMLRSIGIPARLVAGYAPGEFNPFTGLYVVKNTDAYMMTEVYFPGYGWFAFNPIPGMPLIPPSIEKNQSFTGLMVFWKW
VAGWLPSPVTGFLERFIGGIFLWILGVIAWFFALFSQGWQGIFTGLILFTALGFLGWLLYIFWQKWHYGRWLGRLYPMES
IYQQMLNLMASKGLVKHGFQTPFEYTKAIKGYNSRNEAEIIEEISQAYVEWRYGGKEVNLNRLKGLLRNLKSSIRRKLN

Sequences:

>Translated_799_residues
MSNYFSGWKVRNLPILGLLWKQVQAAPKPIAEDSILLRVMVQALVIVGIIAIDVAAGVATDELPLTVWAGPLSIIGAIWS
WYNRYKRNVLAKFCLAIGMLLIFAAFLSRLFGELNDTRLVLAELLIQLQVLHSFDLPRRKDLGYSMVIGLILLGVAGTIS
QTLTYGPVLIVFTIFAIPCLVLDYRSRLGLYSRLSSNKLELRRQKQQKKISLLNATLSPKRLTILLLVILGLGMTIFAFL
PRLPGYQIRTFPVSSTINFDLENFDGRTITNPGYISQGRGNRDGSGNSNGTNQESGPGSLNDTYYYGFNTKINQNLRGQL
VPQVVMRVRSQAEGFWRVLAFDKYTGEGWEISRNDKTITLDRSSFSYQFSVGLQRKNYKNETKEVIQNYTVVSPLPNLIP
ALYQAKEVYFPTKKVAIDLDGNLRSPLELREGLTYTVISNVPYRNRSILSQAGTNYPESISEYYLQIPSEILEKVRQKTE
DILANKNKVAQEIKPIISPYEKALYLAQYLKQNPNYKLQKAPPFLAEDEDLVSAFLFGYQNSREGEKITGGYGDHFSTVL
TIMLRSIGIPARLVAGYAPGEFNPFTGLYVVKNTDAYMMTEVYFPGYGWFAFNPIPGMPLIPPSIEKNQSFTGLMVFWKW
VAGWLPSPVTGFLERFIGGIFLWILGVIAWFFALFSQGWQGIFTGLILFTALGFLGWLLYIFWQKWHYGRWLGRLYPMES
IYQQMLNLMASKGLVKHGFQTPFEYTKAIKGYNSRNEAEIIEEISQAYVEWRYGGKEVNLNRLKGLLRNLKSSIRRKLN
>Mature_798_residues
SNYFSGWKVRNLPILGLLWKQVQAAPKPIAEDSILLRVMVQALVIVGIIAIDVAAGVATDELPLTVWAGPLSIIGAIWSW
YNRYKRNVLAKFCLAIGMLLIFAAFLSRLFGELNDTRLVLAELLIQLQVLHSFDLPRRKDLGYSMVIGLILLGVAGTISQ
TLTYGPVLIVFTIFAIPCLVLDYRSRLGLYSRLSSNKLELRRQKQQKKISLLNATLSPKRLTILLLVILGLGMTIFAFLP
RLPGYQIRTFPVSSTINFDLENFDGRTITNPGYISQGRGNRDGSGNSNGTNQESGPGSLNDTYYYGFNTKINQNLRGQLV
PQVVMRVRSQAEGFWRVLAFDKYTGEGWEISRNDKTITLDRSSFSYQFSVGLQRKNYKNETKEVIQNYTVVSPLPNLIPA
LYQAKEVYFPTKKVAIDLDGNLRSPLELREGLTYTVISNVPYRNRSILSQAGTNYPESISEYYLQIPSEILEKVRQKTED
ILANKNKVAQEIKPIISPYEKALYLAQYLKQNPNYKLQKAPPFLAEDEDLVSAFLFGYQNSREGEKITGGYGDHFSTVLT
IMLRSIGIPARLVAGYAPGEFNPFTGLYVVKNTDAYMMTEVYFPGYGWFAFNPIPGMPLIPPSIEKNQSFTGLMVFWKWV
AGWLPSPVTGFLERFIGGIFLWILGVIAWFFALFSQGWQGIFTGLILFTALGFLGWLLYIFWQKWHYGRWLGRLYPMESI
YQQMLNLMASKGLVKHGFQTPFEYTKAIKGYNSRNEAEIIEEISQAYVEWRYGGKEVNLNRLKGLLRNLKSSIRRKLN

Specific function: Unknown

COG id: COG1305

COG function: function code E; Transglutaminase-like enzymes, putative cysteine proteases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002931 [H]

Pfam domain/function: PF01841 Transglut_core [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90673; Mature: 90541

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNYFSGWKVRNLPILGLLWKQVQAAPKPIAEDSILLRVMVQALVIVGIIAIDVAAGVAT
CCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DELPLTVWAGPLSIIGAIWSWYNRYKRNVLAKFCLAIGMLLIFAAFLSRLFGELNDTRLV
CCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LAELLIQLQVLHSFDLPRRKDLGYSMVIGLILLGVAGTISQTLTYGPVLIVFTIFAIPCL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLDYRSRLGLYSRLSSNKLELRRQKQQKKISLLNATLSPKRLTILLLVILGLGMTIFAFL
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PRLPGYQIRTFPVSSTINFDLENFDGRTITNPGYISQGRGNRDGSGNSNGTNQESGPGSL
HCCCCCEEEEEECCCEEEECEECCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
NDTYYYGFNTKINQNLRGQLVPQVVMRVRSQAEGFWRVLAFDKYTGEGWEISRNDKTITL
CCCEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCEEECCCCEEEE
DRSSFSYQFSVGLQRKNYKNETKEVIQNYTVVSPLPNLIPALYQAKEVYFPTKKVAIDLD
ECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEC
GNLRSPLELREGLTYTVISNVPYRNRSILSQAGTNYPESISEYYLQIPSEILEKVRQKTE
CCCCCCHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DILANKNKVAQEIKPIISPYEKALYLAQYLKQNPNYKLQKAPPFLAEDEDLVSAFLFGYQ
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC
NSREGEKITGGYGDHFSTVLTIMLRSIGIPARLVAGYAPGEFNPFTGLYVVKNTDAYMMT
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEE
EVYFPGYGWFAFNPIPGMPLIPPSIEKNQSFTGLMVFWKWVAGWLPSPVTGFLERFIGGI
EEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
FLWILGVIAWFFALFSQGWQGIFTGLILFTALGFLGWLLYIFWQKWHYGRWLGRLYPMES
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
IYQQMLNLMASKGLVKHGFQTPFEYTKAIKGYNSRNEAEIIEEISQAYVEWRYGGKEVNL
HHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
NRLKGLLRNLKSSIRRKLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SNYFSGWKVRNLPILGLLWKQVQAAPKPIAEDSILLRVMVQALVIVGIIAIDVAAGVAT
CCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DELPLTVWAGPLSIIGAIWSWYNRYKRNVLAKFCLAIGMLLIFAAFLSRLFGELNDTRLV
CCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LAELLIQLQVLHSFDLPRRKDLGYSMVIGLILLGVAGTISQTLTYGPVLIVFTIFAIPCL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLDYRSRLGLYSRLSSNKLELRRQKQQKKISLLNATLSPKRLTILLLVILGLGMTIFAFL
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PRLPGYQIRTFPVSSTINFDLENFDGRTITNPGYISQGRGNRDGSGNSNGTNQESGPGSL
HCCCCCEEEEEECCCEEEECEECCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
NDTYYYGFNTKINQNLRGQLVPQVVMRVRSQAEGFWRVLAFDKYTGEGWEISRNDKTITL
CCCEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCEEECCCCEEEE
DRSSFSYQFSVGLQRKNYKNETKEVIQNYTVVSPLPNLIPALYQAKEVYFPTKKVAIDLD
ECCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEC
GNLRSPLELREGLTYTVISNVPYRNRSILSQAGTNYPESISEYYLQIPSEILEKVRQKTE
CCCCCCHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DILANKNKVAQEIKPIISPYEKALYLAQYLKQNPNYKLQKAPPFLAEDEDLVSAFLFGYQ
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC
NSREGEKITGGYGDHFSTVLTIMLRSIGIPARLVAGYAPGEFNPFTGLYVVKNTDAYMMT
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEE
EVYFPGYGWFAFNPIPGMPLIPPSIEKNQSFTGLMVFWKWVAGWLPSPVTGFLERFIGGI
EEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
FLWILGVIAWFFALFSQGWQGIFTGLILFTALGFLGWLLYIFWQKWHYGRWLGRLYPMES
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
IYQQMLNLMASKGLVKHGFQTPFEYTKAIKGYNSRNEAEIIEEISQAYVEWRYGGKEVNL
HHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
NRLKGLLRNLKSSIRRKLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969499; 9384377 [H]