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The map label for this gene is 110834623

Identifier: 110834623

GI number: 110834623

Start: 2009972

End: 2012302

Strand: Direct

Name: 110834623

Synonym: ABO_1762

Alternate gene names: NA

Gene position: 2009972-2012302 (Clockwise)

Preceding gene: 110834622

Following gene: 110834624

Centisome position: 64.42

GC content: 52.38

Gene sequence:

>2331_bases
ATGGACAAGCCTTCGTTAACTGTTGCAAACCGTTCCGTCGCGGAATGGCTATCCTCACTTCCTACACTGATTCTTCTTCT
GCTGACCATTTTTCTGGCTTCCGGCGAAGTAATTCACTCGCAGCTACTGAAGATCGGCGAGAATACCTGGGAGGGCTATT
TCCTTTTGCGTGGCGCTGGAGTGGTGGAACAGCCCACCTGTAACCGTGATCCAGACCTGGATCAGGAGCTGGCAAAAGCC
ATTAAGCAGAAAAAACAGCAAATGGCTGACGATCCTCTAGCCTCCATCTTTGGAACCGACGTGGACGAAGCGGCCTTGCG
TCAGTCCTTGGAATCTTCCAGGCATAACTGTCGCGGCAGATGGGAACGCTATGAGTTGATTCAGGACAAAGCCACCCCCG
GCGTGATTGCCTTCCGTACCTTGGAAGGCGGCGTAGCCAAAGTGGTAACTACCCTGGGCAACTACAAGCGTCTACTGCTT
TGTTTGCTGGTAATGATCTGTGCCGCGACCGCCACATTAACGCGCCACCACATTTCGCTACGTCCCGCTCATACACGTAA
AGACCACTTTGTTTCTAGCTTGGGCCAGCTCGCCGCCAACATAATGCTACTCCTCTCTGCTTGGCTATACCGAGGCGAAG
AAATCAGCGCCATTGCCGACGGAGTTCAGGTCAATCACTTTTACTTGCACCAGTTCTGGATTGCCGGCTTCCTGCTGCTC
TCTTTCGCTGCTTTCTACCAGCTGATTCGCCCGCCCAAAGACCTTGAGGAAGGAGGTACTTGGGGCAAGGCAATGTTGAC
CATCCCGCTATACAGCTTCATGTGCCTTACCGCTGGCGCACAATTTATCAGCCAAGGCTACTACCACGGGATTAGCGTTT
ATCTTGGCATGATGATGGAACTGTCCACCCTGTTCCTGAGCTTGGCACTGTATATCTGGATCGGCATGCTGCTGCGTCAA
ACCAAGATGGCTCACCTAGTTTTCGACGTGCTACGTCCTTGGAAAATGTCACCGGAGTTGATGTGTTTTGTGGTGCTTGC
TGTTGCAGCGGTTCCTACAGCCTACACTGGCGCCTCCGGTATCTTCGTTATTGCTGCCGGTGCCACCATCTATAACGAGT
TGGTTCGCGCTGGGGCTCGTAAACAACTGGCGCTGGCCGCCACCGCCATGTCTGGCTCCATGGGCGTGGTTTTACGTCCC
TGCCTGCTGGTCGTGATCATCGCCGCTTTGAACAATAGCGTGACCACAGATGAGCTATTCACTTCCGGCCTGAAAATCTT
TGGTTTGTCGCTGTTCCTGTTCTTCATTTACAGCCAATTTGCCCGTACTGCTCCGGCACGCATTGCTCCGTTCTCTGAAG
CAGTACCGCAAAGCTTGAAACGTCTCATCCCTCTACTGCCCTATGTGATTATCATGGGGACCGTAGTGGTGTTCTTCCGT
GATCTACTCGACACCGAGTTAAACGAAAACTACGCACCCATTATCCTGCCGGTAATGCTGCTAGCCATTCTGGCCTACGA
GAAACTGAGCACAAAATCCCTGCACGTTTTCACGATCGTCCTGTTGCCCCTTTTGATCTACTCCTGCTACAACCTGTGGG
GCATCAACAATGCGCTAGACGCTGGTGCTATTCCTACCGGCACCTCCGCTGAGGAATTGAACGATCTGTTTTGGGGACTT
TTCTGGCGTAATGCTATTCTCGGCGCTTGTCTGGCAATTTATTACCTTGTAAAAACACCGGATATGGACCCGCATTACCA
ACCAGAGCCCGGTGTGGGTGAGAAGATGGAAAGCTCATTGCGGTTTGCCACTAACGAAACCACCGGGCACATTGGCGCGT
TGCTGATGCTGATGGCTCTATCGGTAAGCGTCGGCGGTATCATCGAGCGTTCCGGGGTCATGGAAATGCTGCCTGAGACG
TTCCCGAGTATCTGGGTAGCCATGACACTGCTGGTGGTCACCATGGTGATTATCGGCATGATTATGGACCCCTATGGCGC
AGTAATTTTGGTGAACGCAACCCTTGCACAAATTGCCTTCGATAATGGGATTGACCCACTACACTTCTGGATGATTACCC
TGGTAGCTTTTGAGCTGGGTTATCTATCACCTCCAGTGGCGCTAAACCACTTGCTAACAAGGCAAGTAGTGGGAGACGAA
GAAGTGGAATCCGCAAAAGTGCCGGGTGGCAACTTCTACCGTCGCTATGAGAAATTCCTACTGCCTATTGCGGTGATGCT
GACCGCACTGCTGCTGGTATCTTACGTACCGCTGATGTCGGACTCGCTCCACGAGTTCCTGTTCCAGAAAATTCAGGCTG
GCGCCCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTACATCGCCCTAAAAAGGCGGGGGCAAAAGCGCTACCCTACCCCCCAAAGCGCCCCCCCCCTCCGTAGCTCAGGCGGTA
TAACAATAACCGGGTGCACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCGCCAAACTGAACATGAAAAGGGCCCAATCGGGCCCTTTTTTATTTCAGCAACAAAAACTATTTAACTGGAAAAAGAA
GCCCCTACTAACCGGACATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 776

Protein sequence:

>776_residues
MDKPSLTVANRSVAEWLSSLPTLILLLLTIFLASGEVIHSQLLKIGENTWEGYFLLRGAGVVEQPTCNRDPDLDQELAKA
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EVESAKVPGGNFYRRYEKFLLPIAVMLTALLLVSYVPLMSDSLHEFLFQKIQAGAH

Sequences:

>Translated_776_residues
MDKPSLTVANRSVAEWLSSLPTLILLLLTIFLASGEVIHSQLLKIGENTWEGYFLLRGAGVVEQPTCNRDPDLDQELAKA
IKQKKQQMADDPLASIFGTDVDEAALRQSLESSRHNCRGRWERYELIQDKATPGVIAFRTLEGGVAKVVTTLGNYKRLLL
CLLVMICAATATLTRHHISLRPAHTRKDHFVSSLGQLAANIMLLLSAWLYRGEEISAIADGVQVNHFYLHQFWIAGFLLL
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FPSIWVAMTLLVVTMVIIGMIMDPYGAVILVNATLAQIAFDNGIDPLHFWMITLVAFELGYLSPPVALNHLLTRQVVGDE
EVESAKVPGGNFYRRYEKFLLPIAVMLTALLLVSYVPLMSDSLHEFLFQKIQAGAH
>Mature_776_residues
MDKPSLTVANRSVAEWLSSLPTLILLLLTIFLASGEVIHSQLLKIGENTWEGYFLLRGAGVVEQPTCNRDPDLDQELAKA
IKQKKQQMADDPLASIFGTDVDEAALRQSLESSRHNCRGRWERYELIQDKATPGVIAFRTLEGGVAKVVTTLGNYKRLLL
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FPSIWVAMTLLVVTMVIIGMIMDPYGAVILVNATLAQIAFDNGIDPLHFWMITLVAFELGYLSPPVALNHLLTRQVVGDE
EVESAKVPGGNFYRRYEKFLLPIAVMLTALLLVSYVPLMSDSLHEFLFQKIQAGAH

Specific function: Unknown

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 85710; Mature: 85710

Theoretical pI: Translated: 6.46; Mature: 6.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKPSLTVANRSVAEWLSSLPTLILLLLTIFLASGEVIHSQLLKIGENTWEGYFLLRGAG
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCC
VVEQPTCNRDPDLDQELAKAIKQKKQQMADDPLASIFGTDVDEAALRQSLESSRHNCRGR
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
WERYELIQDKATPGVIAFRTLEGGVAKVVTTLGNYKRLLLCLLVMICAATATLTRHHISL
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RPAHTRKDHFVSSLGQLAANIMLLLSAWLYRGEEISAIADGVQVNHFYLHQFWIAGFLLL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFAAFYQLIRPPKDLEEGGTWGKAMLTIPLYSFMCLTAGAQFISQGYYHGISVYLGMMME
HHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSTLFLSLALYIWIGMLLRQTKMAHLVFDVLRPWKMSPELMCFVVLAVAAVPTAYTGASG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
IFVIAAGATIYNELVRAGARKQLALAATAMSGSMGVVLRPCLLVVIIAALNNSVTTDELF
EEEEECCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
AGAIPTGTSAEELNDLFWGLFWRNAILGACLAIYYLVKTPDMDPHYQPEPGVGEKMESSL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
RFATNETTGHIGALLMLMALSVSVGGIIERSGVMEMLPETFPSIWVAMTLLVVTMVIIGM
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMDPYGAVILVNATLAQIAFDNGIDPLHFWMITLVAFELGYLSPPVALNHLLTRQVVGDE
HHCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCH
EVESAKVPGGNFYRRYEKFLLPIAVMLTALLLVSYVPLMSDSLHEFLFQKIQAGAH
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MDKPSLTVANRSVAEWLSSLPTLILLLLTIFLASGEVIHSQLLKIGENTWEGYFLLRGAG
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VVEQPTCNRDPDLDQELAKAIKQKKQQMADDPLASIFGTDVDEAALRQSLESSRHNCRGR
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
WERYELIQDKATPGVIAFRTLEGGVAKVVTTLGNYKRLLLCLLVMICAATATLTRHHISL
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RPAHTRKDHFVSSLGQLAANIMLLLSAWLYRGEEISAIADGVQVNHFYLHQFWIAGFLLL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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IFVIAAGATIYNELVRAGARKQLALAATAMSGSMGVVLRPCLLVVIIAALNNSVTTDELF
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IMDPYGAVILVNATLAQIAFDNGIDPLHFWMITLVAFELGYLSPPVALNHLLTRQVVGDE
HHCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCH
EVESAKVPGGNFYRRYEKFLLPIAVMLTALLLVSYVPLMSDSLHEFLFQKIQAGAH
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA